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Articulo de referencia

Sitio de entrada ribosómica interna del virus de la hepatitis C

El sitio de entrada ribosómica interna del virus de la hepatitis C , o IRES del VHC , es una estructura de ARN dentro de la región 5'UTR del genoma del VHC que media la iniciaci...

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El sitio de entrada ribosómica interna del virus de la hepatitis C , o IRES del VHC , es una estructura de ARN dentro de la región 5'UTR del genoma del VHC que media la iniciación de la traducción independiente de la caperuza.

La traducción de proteínas de la mayoría de los ARNm eucariotas ocurre mediante un mecanismo dependiente de la caperuza y requiere la asociación del Met- ARNt i Met , varios factores de iniciación eucariotas y GTP con la subunidad ribosómica 40S, el reclutamiento a la caperuza 5' y el escaneo a lo largo de la región 5' UTR para alcanzar el codón de inicio. En contraste, la traducción del ARNm del virus de la hepatitis C (VHC) se inicia mediante un mecanismo diferente al modelo habitual de unión a la caperuza 5'. [ 1 ] Este mecanismo alternativo se basa en la unión directa de la subunidad ribosómica 40S al sitio de entrada ribosómica interna (IRES) en la región 5' UTR del ARN del VHC. El IRES del VHC adopta una estructura compleja y puede diferir significativamente de los elementos IRES identificados en picornavirus . Se ha demostrado que un pequeño número de ARNm eucariotas se traducen mediante la entrada ribosómica interna. [ 2 ] [ 3 ]

Estructura IRES

Se cree que los nucleótidos 1 a 40 del ARNm del VHC no contribuyen a la traducción, sino que son necesarios para la replicación del ARN genómico . El resto de la región 5'-UTR del VHC consta de tres dominios, denominados dominios II-IV (el dominio I se encuentra en el extremo 5' del ARNm).

Mecanismo de acción

El IRES del VHC se une de forma independiente a dos componentes de la maquinaria de iniciación de la traducción eucariota: el factor de iniciación multiproteico eIF3 y la subunidad ribosómica pequeña 40S . Además, se une a la 40S de tal manera que el codón de iniciación AUG se posiciona en el sitio P ribosómico, por lo que no se requiere el escaneo ribosómico. En consecuencia, los factores de escaneo eIF1 y eIF1A son prescindibles para la traducción del VHC, al igual que los componentes del complejo eIF4F ( eIF4A , eIF4E y eIF4G ) y eIF4B , que generalmente son necesarios para la unión del ARNm y el desenrollamiento de la región 5'UTR . El ARNt iniciador es entregado por eIF2 o, en condiciones de estrés cuando eIF2 está inactivado, por eIF2A , eIF2D o posiblemente eIF5B , un homólogo de la proteína IF2 procariota .

Véase también

Referencias

  1. ↑ Lytle JR, Wu L, Robertson HD (agosto de 2002). "Dominios en el sitio de entrada ribosómica interna del virus de la hepatitis C para la unión de la subunidad 40s" . RNA . 8 ( 8): 1045– 1055. doi : 10.1017/S1355838202029965 . PMC 1370315. PMID 12212848 .  
  2. ↑ Beales LP, Rowlands DJ, Holzenburg A (mayo de 2001). "El sitio de entrada interna del ribosoma (IRES) del virus de la hepatitis C visualizado mediante microscopía electrónica" . RNA . 7 ( 5): 661– 670. doi : 10.1017/S1355838201001406 . PMC 1370118. PMID 11350030 .  
  3. ↑ Gallego J, Varani G (abril de 2002). "El sitio de entrada ribosómica interna del virus de la hepatitis C: un nuevo objetivo para la investigación antiviral". Biochemical Society Transactions . 30 (2): 140– 145. doi : 10.1042/BST0300140 . PMID 12023841 . 

Lecturas adicionales

  • Malygin AA, Kossinova OA, Shatsky IN, Karpova GG (octubre de 2013). "El IRES del VHC interactúa con el ARNr 18S para activar el ribosoma 40S para los pasos subsiguientes de la iniciación de la traducción" . Nucleic Acids Research . 41 (18): 8706– 8714. doi : 10.1093/nar/gkt632 . PMC 3794592. PMID 23873958 .  
  • Página del sitio de entrada ribosómica interna del virus de la hepatitis C en Rfam