BioJS

BioJS es un proyecto de código abierto para datos bioinformáticos en la web. ^{[ 1 ]} Su objetivo es desarrollar una biblioteca de código abierto de componentes JavaScript para visualizar datos biológicos. ^{[ 2 ]} BioJS desarrolla y mantiene pequeños bloques de construcción (componentes) que pueden ser reutilizados por otros. Para descubrir los componentes disponibles, BioJS mantiene un registro Archivado el 13/03/2018 en Wayback Machine .

Historia

La primera versión de BioJS fue lanzada en 2012 por John Gomez Carvajal. Se desarrolló como una biblioteca JavaScript de componentes web para representar datos biológicos en aplicaciones web. La versión 2.0 incluyó un rediseño completo de la biblioteca y se lanzó en 2014 como un proyecto de Google Summer of Code liderado por Manuel Corpas y desarrollado por David Dao y Sebastian Wilzbach. Desde entonces, más de 100 personas han contribuido al proyecto. Actualmente, más de 150 componentes están disponibles en el registro de BioJS.

Lista seleccionada de componentes publicados

Visor DAG ^{[ 3 ]}
Visor de contenido de ADN ^{[ 4 ]}
FeatureViewer ^{[ 5 ]}
HeatMapViewer ^{[ 6 ]}
Análisis intermedio ^{[ 7 ]}
Puntos finales intermedios ^{[ 8 ]}
KEGGViewer ^{[ 9 ]}
Interacciones PPI ^{[ 10 ]}
PsicquicGraph ^{[ 11 ]}
Secuencia ^{[ 12 ]}
wigExplorer ^{[ 13 ]}
treeWidget ^{[ 14 ]}

Instituciones que utilizan BioJS

Véase también

BioJava , Biopython , BioRuby , BioPHP , BioPerl , Bioconductor
Fundación Abierta de Bioinformática

Referencias

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Enlaces externos

Sitio web oficial
Biojs en GitHub

[CorpasJimenez2014-1] Cuerpos ; Jiménez, Rafael; Carbono, Seth J; García, Alex; García, Leyla; Goldberg, Tatiana; Gómez, Juan; Kalderimis, Alexis; Lewis, Suzanna E; Mulvany, Ian; Pawlik, Aleksandra; Rowland, Francisco; Salazar, Gustavo; Schreiber, Fabián; Sillitoe, Ian; Spooner, William H; Gracias, Anil; Villaveces, José M; Yachdav, Guy; Hermjakob, Henning (2014). "BioJS: un estándar de código abierto para visualización biológica: su estado en 2014" . F1000Investigación . 3 : 55. doi : 10.12688/f1000research.3-55.v1 . ISSN 2046-1402 . PMC 4103492 . PMID 25075290 .

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