Hispanopedia Wiki
Articulo de referencia

CTBP2

La proteína de unión al extremo C 2, también conocida como CtBP2 , es una proteína que en humanos está codificada por el gen CTBP2 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Función Las CtBP ( CtBP1 y...

Hispanopedia WikiContenido en espanolLectura gratuita

La proteína de unión al extremo C 2, también conocida como CtBP2 , es una proteína que en humanos está codificada por el gen CTBP2 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

Función

Las CtBP ( CtBP1 y CtBP2 en mamíferos) se encuentran entre los correpresores transcripcionales mejor caracterizados . [ 8 ] Generalmente, desactivan sus genes diana. Lo hacen uniéndose a proteínas de unión al ADN específicas de secuencia que portan un motivo corto de la forma general Prolina-Isoleucina-Aspartato-Leucina-Serina (el motivo PIDLS). Luego, reclutan enzimas modificadoras de histonas, histona desacetilasas , histona metilasas e histona desmetilasas . Se cree que estas enzimas trabajan juntas para eliminar marcas de histonas activadoras y agregar marcas represoras. Por ejemplo, la histona desacetilasa 1 ( HDAC1 ) y la HDAC2 pueden eliminar la marca activadora de la histona 3 acetil lisina 9 (H3K9Ac), luego la histona metilasa G9a puede agregar grupos metilo, mientras que la histona desmetilasa lisina específica desmetilasa 1 ( LSD1 ) puede eliminar la marca activadora H3K4me. [ 9 ]

Las CtBP se unen a muchas proteínas de unión al ADN diferentes y también a correpresores que, a su vez, están unidos a proteínas de unión al ADN, como Friend of GATA ( Fog ). [ 10 ] Las CtBP también pueden dimerizarse y multimerizarse para formar complejos transcripcionales más grandes. Parecen ser principalmente proteínas de andamiaje que permiten el ensamblaje de complejos de represión génica.

Un aspecto interesante de las CtBP es su capacidad para unirse al NADH y, en menor medida, al NAD + . Se ha propuesto que esto les permite detectar el estado metabólico de la célula y regular genes en respuesta a cambios en la relación NADH/NAD + . En consecuencia, se ha descubierto que las CtBP son importantes en la biología de las grasas, uniéndose a proteínas clave como PRDM16 , NRIP y FOG2 . [ 11 ]

Las funciones completas de las proteínas CtBP en mamíferos han sido difíciles de evaluar debido a la redundancia parcial entre CtBP1 y CtBP2. [ 12 ] De manera similar, la letalidad temprana de los ratones knockout de CtBP2 y de los ratones knockout dobles ha impedido un análisis detallado de los efectos celulares de la eliminación de estas proteínas. Han surgido resultados importantes de organismos modelo donde solo hay un gen CtBP. En Drosophila , CtBP está involucrado en el desarrollo y en los ritmos circadianos . [ 13 ] En el gusano C. elegans, CtBP está involucrado en la longevidad. [ 14 ] Tanto los ritmos circadianos como la longevidad parecen estar vinculados al metabolismo, lo que apoya el papel de las CtBP en la detección metabólica.

El gen CtBP2 de los mamíferos produce transcritos alternativos que codifican dos proteínas distintas. Además del represor transcripcional ( correpresor ) mencionado anteriormente, existe una isoforma más larga que es un componente principal de las sinapsis especializadas conocidas como cintas sinápticas . Ambas proteínas contienen un dominio de unión a NAD + similar a las 2-hidroxiácido deshidrogenasas dependientes de NAD + . Se utilizó una porción de la región 3' no traducida para mapear este gen en el cromosoma 21q21.3; sin embargo, se observó que es probable que existan loci similares en otras partes del genoma. El análisis BLAST muestra que este gen está presente en el cromosoma 10. [ 7 ]

Uso de promotores alternativos

En la retina de los vertebrados , el gen CtBP2 se transcribe a partir de promotores alternativos durante el desarrollo de la retina, lo que produce el corregulador transcripcional CTBP2, así como la proteína de andamiaje de la sinapsis de cinta más grande RIBEYE. [ 15 ] La funcionalidad de uso múltiple del locus CtBP2 parece estar conservada entre las retinas de aves y primates, con la producción del ARNm de RIBEYE retrasada en el desarrollo por un mecanismo de silenciamiento epigenético . [ 16 ] En la retina humana en desarrollo, la transcripción de la isoforma de ARNm de RIBEYE está regulada epigenéticamente por la metilación del ADN . Las secuencias de ADN que comprenden el promotor proximal de RIBEYE están enriquecidas en metilación del ADN y retrasan la transcripción de esta isoforma, posiblemente al inhibir la unión del factor de transcripción homeobox de conos y bastones (CRX) . [ 16 ] El análisis de transcripción global de organoides retinianos 3D derivados de células madre pluripotentes humanas (hPSC) demuestra una expresión temprana y persistente de la isoforma CTPB2 seguida de una expresión tardía de RIBEYE en el ojo humano en desarrollo. [ 17 ]

Interacciones

Se ha demostrado que CTBP2 interactúa con:

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000175029 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000030970 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. 1 2 Turner J, Crossley M (septiembre de 1998). "Clonación y caracterización de mCtBP2, un correpresor que se asocia con el factor básico similar a Krüppel y otros reguladores transcripcionales de mamíferos" . EMBO J. 17 ( 17): 5129– 40. doi : 10.1093/emboj/17.17.5129 . PMC 1170841. PMID 9724649 .  
  6. ↑ Chinnadurai G (febrero de 2002). "CtBP, un correpresor transcripcional no convencional en el desarrollo y la oncogénesis" . Mol. Cell . 9 (2): 213–24 . doi : 10.1016/S1097-2765(02)00443-4 . PMID 11864595 . 
  7. 1 2 "Entrez Gene: CTBP2 Proteína de unión al extremo C-terminal 2" .
  8. ↑ Turner J, Crossley M (agosto de 2001). " La familia CtBP: correpresores transcripcionales enigmáticos y enzimáticos" . BioEssays . 23 (8): 683–90 . doi : 10.1002/bies.1097 . PMID 11494316. S2CID 22273095 .  
  9. ↑ Shi Y, Lan F, Matson C, Mulligan P, Whetstine JR, Cole PA, Casero RA, Shi Y (diciembre de 2004). " Desmetilación de histonas mediada por el homólogo de la aminooxidasa nuclear LSD1" . Cell . 119 (7): 941– 53. doi : 10.1016/j.cell.2004.12.012 . PMID 15620353. S2CID 10847230 .  
  10. ↑ Fox AH, Liew C, Holmes M, Kowalski K, Mackay J, Crossley M (mayo de 1999). "Los cofactores transcripcionales de la familia FOG interactúan con las proteínas GATA mediante múltiples dedos de zinc" . EMBO J. 18 ( 10): 2812–22 . doi : 10.1093/ emboj /18.10.2812 . PMC 1171362. PMID 10329627 .  
  11. ↑ Jack BH, Pearson RC, Crossley M (mayo de 2011). "Proteína de unión al extremo C: un sensor metabólico implicado en la regulación de la adipogénesis". Int. J. Biochem. Cell Biol . 43 (5): 693–6 . doi : 10.1016/j.biocel.2011.01.017 . hdl : 1959.4/unsworks_13482 . PMID 21281737 . 
  12. ↑ Hildebrand JD, Soriano P (agosto de 2002). "Funciones superpuestas y únicas de la proteína de unión al extremo C 1 (CtBP1) y CtBP2 durante el desarrollo del ratón" . Mol . Cell. Biol . 22 (15): 5296–307 . doi : 10.1128/mcb.22.15.5296-5307.2002 . PMC 133942. PMID 12101226 .  
  13. ↑ Itoh TQ, Matsumoto A, Tanimura T (2013). "La proteína de unión al extremo C (CtBP) activa la expresión de genes del reloj E-box con CLOCK/CYCLE en Drosophila" . PLOS ONE . 8 (4) e63113. Bibcode : 2013PLoSO...863113I . doi : 10.1371/ journal.pone.0063113 . PMC 3640014. PMID 23646183 .  
  14. ↑ Chen S, Whetstine JR, Ghosh S, Hanover JA, Gali RR, Grosu P, Shi Y (febrero de 2009). "El correpresor CTBP-1, dependiente de NAD(H) conservado, regula la longevidad de Caenorhabditis elegans" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 106 (5): 1496– 501. Bibcode : 2009PNAS..106.1496C . doi : 10.1073 / pnas.0802674106 . PMC 2635826. PMID 19164523 .  
  15. ↑ Schmitz F, Konigstorfer A y Sudhof TC (2000). "RIBEYE, un componente de las cintas sinápticas: el viaje de una proteína a través de la evolución proporciona información sobre la función de la cinta sináptica" . Neuron . 28 (3): 857–872 . doi : 10.1016/s0896-6273(00)00159-8 . PMID 11163272 . 
  16. 1 2 Gage E, Agarwal D, Chenault C, Washington-Brown K, Szvetecz S, Jahan N, Wang Z, Jones M, Zack, Enke RA, Wahlin KJ (enero de 2022). "La expresión temporal y específica de isoformas de CTBP2 se conserva evolutivamente entre la retina del pollo en desarrollo y la retina humana" . Front . Mol. Neurosci . 14 773356. doi : 10.3389/fnmol.2021.773356 . PMC 8793361. PMID 35095414 .  
  17. ↑ Agarwal D, Kuhns R, Dimitriou C, Barlow E, Wahlin KJ, Enke RA (diciembre de 2022). "Análisis de secuenciación masiva de ARN de organoides retinianos derivados de células madre pluripotentes inducidas humanas en desarrollo" . Sci . Data . 9 (1): 759. doi : 10.1038/s41597-022-01853-x . PMC 9734101. PMID 36494376 .  
  18. 1 2 Turner J, Nicholas H, Bishop D, Matthews JM, Crossley M (2003). "La proteína LIM FHL3 se une al factor básico similar a Krüppel/factor similar a Krüppel 3 y a su correpresor, la proteína 2 de unión al extremo C" . J. Biol. Chem . 278 (15): 12786–95 . doi : 10.1074/jbc.M300587200 . PMID 12556451 . 
  19. ↑ van Vliet J, Turner J, Crossley M (2000). "Factor 8 similar a Krüppel humano: una proteína de unión a la caja CACCC que se asocia con CtBP y reprime la transcripción" . Nucleic Acids Res . 28 (9): 1955– 62. doi : 10.1093/nar/28.9.1955 . PMC 103308. PMID 10756197 .  
  20. ↑ Mirnezami AH, Campbell SJ, Darley M, Primrose JN, Johnson PW, Blaydes JP (2003). "Hdm2 recluta un correpresor sensible a la hipoxia para regular negativamente la transcripción dependiente de p53" (PDF) . Curr. Biol . 13 (14): 1234– 9. Bibcode : 2003CBio...13.1234M . doi : 10.1016/S0960-9822( 03 )00454-8 . PMID 12867035. S2CID 2451241 .  
  21. ^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). "Hacia un mapa a escala de proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Naturaleza . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .  
  22. ^ Castet A, Boulahtouf A, Versini G, Bonnet S, Augereau P, Vignon F, Khochbin S, Jalaguier S, Cavaillès V (2004). "Múltiples dominios de la proteína 140 que interactúa con el receptor contribuyen a la inhibición de la transcripción" . Ácidos nucleicos Res . 32 (6): 1957– 66. doi : 10.1093/nar/gkh524 . PMC 390375 . PMID 15060175 .  
  23. ↑ Murakami A, Ishida S, Thurlow J, Revest JM, Dickson C (2001). "SOX6 se une a CtBP2 para reprimir la transcripción del promotor Fgf-3" . Nucleic Acids Res . 29 (16): 3347–55 . doi : 10.1093 / nar/29.16.3347 . PMC 55854. PMID 11504872 .  
  24. ↑ Holmes M, Turner J, Fox A, Chisholm O, Crossley M, Chong B (1999). "hFOG-2, una nueva proteína de dedo de zinc, se une al correpresor mCtBP2 y modula la activación mediada por GATA" . J. Biol. Chem . 274 (33): 23491–8 . doi : 10.1074/jbc.274.33.23491 . PMID 10438528 . 

Lecturas adicionales

  • Schaeper U, Boyd JM, Verma S, Uhlmann E, Subramanian T, Chinnadurai G (noviembre de 1995). "Clonación molecular y caracterización de una fosfoproteína celular que interactúa con un dominio C-terminal conservado de la E1A del adenovirus implicado en la modulación negativa de la transformación oncogénica" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 92 (23): 10467–71 . Bibcode : 1995PNAS...9210467S . doi : 10.1073/pnas.92.23.10467 . PMC 40632. PMID 7479821 .  
  • Sewalt RG, Gunster MJ, van der Vlag J, Satijn DP, Otte AP (enero de 1999). "La proteína de unión al extremo C es un represor transcripcional que interactúa con una clase específica de proteínas Polycomb de vertebrados" . Mol . Cell. Biol . 19 (1): 777–87 . doi : 10.1128/MCB.19.1.777 . PMC 83934. PMID 9858600 .  
  • Furusawa T, Moribe H, Kondoh H, Higashi Y (diciembre de 1999). "Identificación de CtBP1 y CtBP2 como correpresores del factor deltaEF1 con dominio homeótico y dedo de zinc" . Mol . Cell. Biol . 19 (12): 8581–90 . doi : 10.1128/mcb.19.12.8581 . PMC 84984. PMID 10567582 .  
  • Yu X, Baer R (junio de 2000). "Localización nuclear y expresión específica del ciclo celular de CtIP, una proteína que se asocia con el supresor tumoral BRCA1" . J. Biol. Chem . 275 (24): 18541–9 . doi : 10.1074/jbc.M909494199 . PMID 10764811 . 
  • Schmitz F, Königstorfer A, Südhof TC (diciembre de 2000). "RIBEYE, un componente de las cintas sinápticas: el viaje de una proteína a través de la evolución proporciona información sobre la función de la cinta sináptica" . Neuron . 28 ( 3): 857–72 . doi : 10.1016/S0896-6273(00)00159-8 . PMID 11163272. S2CID 15695695 .  
  • Valenta T, Lukas J, Korinek V (mayo de 2003). "La interacción del factor de transcripción de caja HMG TCF-4 con CtBP1 controla la expresión del objetivo Wnt Axin2/Conductin en células de riñón embrionario humano" . Nucleic Acids Res . 31 (9): 2369–80 . doi : 10.1093/nar/ gkg346 . PMC 154232. PMID 12711682 .  
  • Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (junio de 2004). "La caracterización del transcriptoma dilucida las redes de señalización que controlan el crecimiento y la diferenciación de las células ES humanas". Nat . Biotechnol . 22 (6): 707–16 . doi : 10.1038/nbt971 . PMID 15146197. S2CID 27764390 .  
  • Alpatov R, Munguba GC, Caton P, Joo JH, Shi Y, Shi Y, Hunt ME, Sugrue SP (diciembre de 2004). "La proteína Pnn/DRS asociada a las manchas nucleares se une al correpresor transcripcional CtBP y alivia la represión del gen de la E-cadherina mediada por CtBP" . Mol . Cell. Biol . 24 (23): 10223–35 . doi : 10.1128/MCB.24.23.10223-10235.2004 . PMC 529029. PMID 15542832 .