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SOX6

El factor de transcripción SOX-6 es una proteína que en humanos está codificada por el gen SOX6 . [ 5 ] [ 6 ] Función La familia de genes SOX codifica un grupo de factores de tr...

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El factor de transcripción SOX-6 es una proteína que en humanos está codificada por el gen SOX6 . [ 5 ] [ 6 ]

Función

La familia de genes SOX codifica un grupo de factores de transcripción definidos por el dominio de unión al ADN del grupo de alta movilidad (HMG), que está conservado. A diferencia de la mayoría de los factores de transcripción, los factores de transcripción SOX se unen al surco menor del ADN, provocando una curvatura de 70 a 85 grados e introduciendo cambios conformacionales locales. [suministrado por OMIM] [ 6 ]

Interacciones

Se ha demostrado que SOX6 interactúa con CTBP2 [ 7 ] y CENPK . [ 8 ]

También se ha demostrado que la proteína SOX6 se acumula en los eritrocitos humanos en diferenciación y, posteriormente, es capaz de regular negativamente su propia transcripción mediante la unión directa a secuencias consenso conservadas evolutivamente, ubicadas cerca del sitio de inicio de la transcripción de SOX6 . [ 9 ]

Sox6 parece desempeñar un papel crucial en la regulación transcripcional de los genes de globina y en la dirección de la diferenciación terminal de los glóbulos rojos. [ 10 ] Además, SOX6 podría estar implicado en el crecimiento tumoral del sarcoma de Ewing. [ 11 ] Se estudió una nueva función de Sox6 en la regulación de la renina y la prorrenina utilizando un modelo de ratón Sox KO, en el que Sox6 solo se inactiva en las células que expresan renina. Este estudio demostró que el promotor de la renina posee el sitio de unión para Sox6. El hallazgo más relevante del estudio fue que Sox6 es uno de los reguladores clave de la regulación de la renina y la prorrenina, así como de la expansión de las células yuxtaglomerulares durante la hiposalinidad y la deshidratación en ratones. PMID 31760770; DOI: 10.1152/ajprenal.00095.2019

Véase también

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000110693 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000051910 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Cohen-Barak O, Hagiwara N, Arlt MF, Horton JP, Brilliant MH (marzo de 2001). "Clonación, caracterización y mapeo cromosómico del gen SOX6 humano". Gene . 265 ( 1–2 ): 157–164 . doi : 10.1016/S0378-1119(01)00346-8 . PMID 11255018 . 
  6. 1 2 "Gen Entrez: SOX6 SRY (región determinante del sexo Y)-caja 6" .
  7. ↑ Murakami A, Ishida S, Thurlow J, Revest JM, Dickson C (agosto de 2001). "SOX6 se une a CtBP2 para reprimir la transcripción del promotor Fgf-3" . Nucleic Acids Research . 29 (16): 3347–3355 . doi : 10.1093 / nar/29.16.3347 . PMC 55854. PMID 11504872 .  
  8. ↑ Yamashita A, Ito M, Takamatsu N, Shiba T (septiembre de 2000). "Caracterización de Solt, una nueva proteína de unión a SoxLZ/Sox6 expresada en el testículo de ratón adulto" . FEBS Letters . 481 (2): 147– 151. Bibcode : 2000FEBSL.481..147Y . doi : 10.1016 / S0014-5793(00)01987-6 . PMID 10996314. S2CID 20831354 .  
  9. ↑ Cantu' C, Grande V, Alborelli I, Cassinelli L, Cantu' I, Colzani MT, et al. (enero de 2011). "Un sitio de unión doble de SOX6 altamente conservado media la regulación negativa del gen SOX6 en células eritroides" . Nucleic Acids Research . 39 (2): 486– 501. doi : 10.1093/nar/gkq819 . PMC 3025548. PMID 20852263 .   
  10. ↑ Cantù C, Ierardi R, Alborelli I, Fugazza C, Cassinelli L, Piconese S, et al. (marzo de 2011). "Sox6 mejora la diferenciación eritroide en progenitores eritroides humanos" . Blood . 117 (13): 3669–3679 . doi : 10.1182/blood-2010-04-282350 . PMID 21263153 .  
  11. ↑ Marchetto A, Ohmura S, Orth MF, Knott MM, Colombo MV, Arrigoni C, et al. (mayo de 2020). "El secuestro oncogénico de un factor de transcripción del desarrollo provoca vulnerabilidad al estrés oxidativo en el sarcoma de Ewing" . Nature Communications . 11 (1) 2423. Bibcode : 2020NatCo..11.2423M . doi : 10.1038/ s41467-020-16244-2 . PMC 7228971. PMID 32415069 .   

Lecturas adicionales

  • Denny P, Swift S, Brand N, Dabhade N, Barton P, Ashworth A (junio de 1992). "Una familia conservada de genes relacionados con el gen determinante de los testículos, SRY" . Nucleic Acids Research . 20 (11): 2887. doi : 10.1093 / nar/20.11.2887 . PMC 336939. PMID 1614875 .  
  • Lefebvre V, Li P, de Crombrugghe B (octubre de 1998). "Una nueva forma larga de Sox5 (L-Sox5), Sox6 y Sox9 se coexpresan en la condrogénesis y activan cooperativamente el gen del colágeno tipo II" . The EMBO Journal . 17 (19): 5718– 5733. doi : 10.1093/ emboj /17.19.5718 . PMC 1170900. PMID 9755172 .  
  • Hagiwara N, Klewer SE, Samson RA, Erickson DT, Lyon MF, Brilliant MH (abril de 2000). "Sox6 es un gen candidato para la miopatía p100H, el bloqueo cardíaco y la muerte neonatal súbita" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 97 (8): 4180– 4185. Bibcode : 2000PNAS ...97.4180H . doi : 10.1073/pnas.97.8.4180 . PMC 18189. PMID 10760285 .  
  • Yamashita A, Ito M, Takamatsu N, Shiba T (septiembre de 2000). "Caracterización de Solt, una nueva proteína de unión a SoxLZ/Sox6 expresada en el testículo de ratón adulto" . FEBS Letters . 481 (2): 147– 151. Bibcode : 2000FEBSL.481..147Y . doi : 10.1016 / S0014-5793(00)01987-6 . PMID 10996314. S2CID 20831354 .  
  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (noviembre de 2000). "Clonación de ADN mediante recombinación sitio-específica in vitro" . Genome Research . 10 (11): 1788– 1795. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948. PMID 11076863 .  
  • Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, et  al. (marzo de 2001). " Hacia un catálogo de genes y proteínas humanas: secuenciación y análisis de 500 nuevos cDNA humanos completos que codifican proteínas" . Genome Research . 11 (3): 422– 435. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072. PMID 11230166 .  
  • Murakami A, Ishida S, Thurlow J, Revest JM, Dickson C (agosto de 2001). "SOX6 se une a CtBP2 para reprimir la transcripción del promotor Fgf-3" . Nucleic Acids Research . 29 (16): 3347–3355 . doi : 10.1093/nar/29.16.3347 . PMC 55854. PMID 11504872 .  
  • Cohen-Barak O, Yi Z, Hagiwara N, Monzen K, Komuro I, Brilliant MH (octubre de 2003). "Regulación Sox6 del desarrollo de miocitos cardíacos" . Investigación de ácidos nucleicos . 31 (20): 5941– 5948. doi : 10.1093/nar/gkg807 . PMC 219484 . PMID 14530442 .  
  • Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, et  al. (octubre de 2004). " Del ORFeoma a la biología: una vía de genómica funcional" . Genome Research . 14 (10B): 2136–2144 . doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930. PMID 15489336 .  
  • Ueda R, Yoshida K, Kawakami Y, Kawase T, Toda M (2005). "Expresión de un factor de transcripción, SOX6, en gliomas humanos". Brain Tumor Pathology . 21 (1): 35– 38. doi : 10.1007/BF02482175 . PMID 15696967. S2CID 23632021 .  
  • Ueda R, Yoshida K, Kawakami Y, Kawase T, Toda M (2005). "Análisis inmunohistoquímico de la expresión de SOX6 en tumores cerebrales humanos". Brain Tumor Pathology . 21 (3): 117– 120. doi : 10.1007/BF02482186 . PMID 15696972. S2CID 27841927 .  
  • Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, et  al. (enero de 2006). " La base de datos LIFEdb en 2006" . Nucleic Acids Research . 34 (número especial sobre bases de datos): D415– D418. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501. PMID 16381901 .  
  • Fernández-Lloris R, Osses N, Jaffray E, Shen LN, Vaughan OA, Girwood D, et  al. (febrero de 2006). "Represión de la actividad transcripcional de SOX6 por modificación de SUMO" . FEBS Letters . 580 (5): 1215– 1221. Bibcode : 2006FEBSL.580.1215F . doi : 10.1016/ j.febslet.2006.01.031 . PMID 16442531. S2CID 38625057 .  
  • Ikeda T, Saito T, Ushita M, Yano F, Kan A, Itaka K, et  al. (junio de 2007). "Identificación y caracterización del promotor SOX6 humano". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 357 (2): 383– 390. Bibcode : 2007BBRC..357..383I . doi : 10.1016/j.bbrc.2007.03.133 . PMID 17433257 . 

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .