Hispanopedia Wiki
Articulo de referencia

RaTG13

{{Cite web|title=Taxonomy browser (Bat coronavirus RaTG13)|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=2709072|access-date=2021-01-02|website=www.ncbi.nlm.ni...

Hispanopedia WikiContenido en espanolLectura gratuita
Artículo con protección extendida

El coronavirus de murciélago RaTG13 es un betacoronavirus similar al SARS identificado en las heces del murciélago de herradura Rhinolophus affinis . [ 2 ] [ 3 ] Fue descubierto en 2013 en heces de murciélago de una cueva minera cerca de la ciudad de Tongguan en el condado de Mojiang en Yunnan , China . [ 4 ] En febrero de 2020, [ 5 ] fue identificado como el pariente conocido más cercano del SARS-CoV-2 , el virus que causa la COVID-19 , compartiendo una identidad de nucleótidos del 96,1 % . [ 6 ] [ 7 ] Sin embargo, en 2022, los científicos encontraron tres coincidencias más cercanas en murciélagos encontrados 530  km al sur, en Feuang , Laos, designados como BANAL-52 (96,8 % de identidad), BANAL-103 y BANAL-236 . [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]

Historia

En la primavera de 2012, tres mineros que limpiaban excremento de murciélago en una mina de cobre abandonada cerca de la ciudad de Tongguan en el condado autónomo Hani de Mojiang desarrollaron neumonía mortal . [ 11 ] Ante la preocupación de que los casos de los mineros pudieran representar una nueva enfermedad, [ 12 ] se enviaron muestras de suero recolectadas de los mineros al Instituto de Virología de Wuhan y Shi Zhengli y su grupo las analizaron para detectar el virus del Ébola , el virus Nipah y el SARSr-CoV Rp3 de murciélago. Las muestras dieron negativo. [ 3 ] [ 2 ] [ 11 ]

Para descubrir una posible causa de la infección, también se tomaron muestras de diferentes animales (incluidos murciélagos, ratas y musarañas almizcleras ) dentro y alrededor de la cueva minera. Entre 2012 y 2015, Shi Zhengli y su grupo aislaron 293 coronavirus diferentes (284 alfacoronavirus y 9 betacoronavirus ) de muestras de heces de murciélago en la cueva. Una de las muestras recolectadas en 2013 de Rhinolophus affinis (el murciélago de herradura intermedio) contenía una nueva secuencia de ácidos ribonucleicos que más tarde se identificó como "RaTG13". [ 3 ] [ 2 ]

En 2020, Shi y su grupo volvieron a analizar las muestras de suero de los mineros para detectar el SARS-CoV-2. Las muestras dieron negativo. [ 3 ]

En 2020, la cepa identificada en la muestra fue renombrada del original Ra4991 (muestra número 4991 recolectada de Rhinolophus affinis ) a "RaTG13", para reflejar la especie de murciélago de origen (Ra de Rhinolophus affinis ), la ubicación geográfica (TG de Tongguan) y el año de recolección (13 de 2013). [ 13 ] El cambio de nombre ha sido considerado una insinuación por los defensores de la teoría de la fuga de laboratorio para la pandemia de COVID-19 . [ 13 ]

Virología

Un ejemplar de Rhinolophus affinis

La secuencia de RaTG13 se reconstruyó a partir de muestras metagenómicas (una práctica común en virología ambiental) [ 14 ] y, como tal, podría ser potencialmente una quimera in silico [ 15 ] . No se ha confirmado la existencia de RaTG13 en la naturaleza, ni su cultivo o aislamiento en ningún laboratorio [ 12 ] , ni que sea un patógeno humano viable [ 15 ] . Nunca se ha detectado un virus vivo "RaTG13" en ninguna muestra de laboratorio del WIV ni de ningún otro lugar [ 15 ] .

Según su secuencia, RaTG13 es un virus de ARN monocatenario positivo con membrana externa. Su genoma tiene aproximadamente 29.800 nucleótidos. El genoma codifica una replicasa (ORF1a/1b) y cuatro proteínas estructurales, incluyendo una proteína de espícula (S), una proteína de membrana (M), una proteína de envoltura (E) y una proteína de nucleocápside (N); y cinco proteínas accesorias virales , incluyendo ORF3a (NS3), ORF6 (NS6), ORF7a (NS7a), ORF7b (NS7b) y ORF8 (NS8). [ 3 ] [ 16 ]

RaTG13 guarda un fuerte parecido con el genoma del SARS-CoV-2 (comparte un 96,1 % de similitud de nucleótidos), y su identificación en excrementos de animales es una prueba que respalda el origen natural del SARS-CoV-2. [ 7 ] La principal área de divergencia entre RaTG13 y SARS-CoV-2 se encuentra en el dominio de unión al receptor (RBD) de la proteína de la espícula (S), que es la porción que se une a la proteína receptora en la superficie de la célula huésped y causa la infección. La divergencia en este dominio indica que, a diferencia del SARS-CoV-2, el virus RaTG13 podría no utilizar la enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2) como su sitio de entrada en la célula. [ 17 ] Además, la proteína S del virus RaTG13 carece del motivo de escisión de furina RRAR↓S. [ 17 ]

La afinidad de unión entre RATG13 y hACE2 es menor que la que existe entre el RBD del SARS-CoV-2 y hACE2. [ 18 ]

Filogenética

Árbol filogenético

Un árbol filogenético basado en secuencias del genoma completo del SARS-CoV-2 y coronavirus relacionados es: [ 19 ] [ 20 ]

Véase también

Referencias

  1. ↑ "Navegador de taxonomía (coronavirus de murciélago RaTG13)" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 2 de enero de 2021 .
  2. 1 2 3 Ge XY, Wang N, Zhang W, Hu B, Li B, Zhang YZ, et al. (febrero de 2016). "Coexistencia de múltiples coronavirus en varias colonias de murciélagos en un pozo minero abandonado" . Virologica Sinica . 31 (1): 31– 40. doi : 10.1007/s12250-016-3713-9 . PMC 7090819. PMID 26920708 .   
  3. 1 2 3 4 5 Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, et al. (diciembre de 2020). "Adenda: Un brote de neumonía asociado con un nuevo coronavirus de probable origen en murciélagos" . Nature . 588 (7836): E6. Bibcode : 2020Natur.588E...6Z . doi : 10.1038/s41586-020-2951- z . PMC 9744119. PMID 33199918 .   
  4. ↑ Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, et al. (diciembre de 2020). "Adenda: Un brote de neumonía asociado con un nuevo coronavirus de probable origen en murciélagos" . Nature . 588 (7836): E6. Bibcode : 2020Natur.588E...6Z . doi : 10.1038/s41586-020-2951- z . PMC 9744119. PMID 33199918 .   
  5. ↑ Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, et al. (marzo de 2020). "Un brote de neumonía asociado con un nuevo coronavirus de probable origen en murciélagos" . Nature . 579 (7798): 270–273 . Bibcode : 2020Natur.579..270Z . doi : 10.1038/ s41586-020-2012-7 . PMC 7095418. PMID 32015507 .   
  6. ^ Poudel U, Subedi D, Pantha S, Dhakal S (octubre de 2020). "Coronavirus animales y enfermedad por coronavirus 2019: lección para el enfoque Una salud" . Revista Veterinaria Abierta . 10 (3): 239– 251. doi : 10.4314/ovj.v10i3.1 . PMC 7703617 . PMID 33282694 .  
  7. 1 2 Hakim MS (noviembre de 2021). "SARS-CoV-2, Covid-19 y la desmitificación de las teorías de la conspiración" . Reviews in Medical Virology (Revisión). 31 (6) e2222. doi : 10.1002/rmv.2222 . PMC 7995093. PMID 33586302 .  
  8. ^ Temmam S, Vongphayloth K, Baquero E, Munier S, Bonomi M, Regnault B, et al. (abril de 2022). «Coronavirus de murciélago relacionados con el SARS-CoV-2 e infecciosos para las células humanas» . Naturaleza . 604 (7905): 330– 336. Bibcode : 2022Natur.604..330T . doi : 10.1038/s41586-022-04532-4 . PMID 35172323 . S2CID 246902858 .   
  9. ↑ Mallapaty S (septiembre de 2021). "Parientes conocidos más cercanos del virus detrás de la COVID-19 encontrados en Laos" . Nature . 597 ( 7878): 603. Bibcode : 2021Natur.597..603M . doi : 10.1038/d41586-021-02596-2 . PMID 34561634. S2CID 237626322 .  
  10. ↑ "Nuevos virus de murciélagos dan pistas sobre los orígenes de la COVID" . New York Times . 14 de octubre de 2021.
  11. 1 2 Wu Z, Yang L, Yang F, Ren X, Jiang J, Dong J, et al. (junio de 2014). "Nuevo virus similar al Henipa, Mojiang Paramyxovirus, en ratas, China, 2012" . Emerging Infectious Diseases . 20 (6): 1064– 1066. doi : 10.3201/eid2006.131022 . PMC 4036791. PMID 24865545 .   
  12. 1 2 "El argumento de la 'navaja de Occam' no ha cambiado a favor de una fuga de laboratorio" . Snopes.com . Snopes. 16 de julio de 2021. Consultado el 18 de julio de 2021 .
  13. 1 2 "El argumento de la 'navaja de Occam' no ha cambiado a favor de una fuga de laboratorio de COVID" . Snopes.com . Snopes. 16 de julio de 2021.
  14. ↑ Harvey E, Holmes EC (junio de 2022). " Diversidad y evolución del viroma animal" . Nature Reviews. Microbiology . 20 (6): 321– 334. doi : 10.1038/s41579-021-00665-x . PMID 34983966. S2CID 245703661 .  
  15. 1 2 3 Frutos R, Pliez O, Gavotte L, Devaux CA (mayo de 2022). "No hay un "origen" para el SARS-CoV-2" . Environmental Research . 207 112173. Elsevier. Bibcode : 2022ER....20712173F . doi : 10.1016/j.envres.2021.112173 . PMC 8493644. PMID 34626592 .  
  16. ↑ "Coronavirus de murciélago RaTG13, genoma completo" . NCBI . Consultado el 28 de marzo de 2020 .
  17. 1 2 Andersen KG, Rambaut A, Lipkin WI, Holmes EC, Garry RF (abril de 2020). "El origen proximal del SARS-CoV-2" . Nature Medicine . 26 (4): 450– 452. doi : 10.1038 / s41591-020-0820-9 . PMC 7095063. PMID 32284615 .  
  18. ↑ Liu K, Pan X, Li L, Yu F, Zheng A, Du P, et al. (junio de 2021). " Unión y base molecular del coronavirus de murciélago RaTG13 al ACE2 en humanos y otras especies" . Cell . 184 (13): 3438–3451.e10. doi : 10.1016/j.cell.2021.05.031 . PMC 8142884. PMID 34139177 .   
  19. 1 2 Zhou H, Ji J, Chen X, Bi Y, Li J, Wang Q, et al. (agosto de 2021). " La identificación de nuevos coronavirus de murciélago arroja luz sobre los orígenes evolutivos del SARS-CoV-2 y virus relacionados" . Cell . 184 (17): 4380–4391.e14. doi : 10.1016/j.cell.2021.06.008 . PMC 8188299. PMID 34147139 .   
  20. ^ Wacharapluesadee S, Tan CW, Maneeorn P, Duengkae P, Zhu F, Joyjinda Y, et al. (febrero de 2021). "Evidencia de coronavirus relacionados con el SARS-CoV-2 que circulan en murciélagos y pangolines en el sudeste asiático" . Comunicaciones de la naturaleza . 12 (1): 972. Bibcode : 2021NatCo..12..972W . doi : 10.1038/s41467-021-21240-1 . PMC 7873279 . PMID 33563978 .   
  21. ↑ Murakami S, Kitamura T, Suzuki J, Sato R, Aoi T, Fujii M, et al. (diciembre de 2020). " Detección y caracterización de sarbecovirus de murciélago filogenéticamente relacionado con el SARS-CoV-2, Japón" . Enfermedades infecciosas emergentes . 26 (12): 3025– 3029. doi : 10.3201/eid2612.203386 . PMC 7706965. PMID 33219796 .   
  22. 1 2 Zhou H, Chen X, Hu T, Li J, Song H, Liu Y, et al. (junio de 2020). "Un nuevo coronavirus de murciélago estrechamente relacionado con el SARS-CoV-2 contiene inserciones naturales en el sitio de escisión S1/S2 de la proteína Spike" . Current Biology . 30 (11): 2196–2203.e3. doi : 10.1016/j.cub.2020.05.023 . PMC 7211627. PMID 32416074 .   
  23. ^ Lam TT, Jia N, Zhang YW, Shum MH, Jiang JF, Zhu HC y col. (julio de 2020). "Identificación de coronavirus relacionados con el SARS-CoV-2 en pangolines malayos". Naturaleza . 583 (7815): 282– 285. Bibcode : 2020Natur.583..282L . doi : 10.1038/s41586-020-2169-0 . PMID 32218527 . S2CID 214683303 .   
  24. ^ Xiao K, Zhai J, Feng Y, Zhou N, Zhang X, Zou JJ y col. (julio de 2020). "Aislamiento de coronavirus relacionado con el SARS-CoV-2 de pangolines malayos". Naturaleza . 583 (7815): 286– 289. Bibcode : 2020Natur.583..286X . doi : 10.1038/s41586-020-2313-x . PMID 32380510 . S2CID 256822274 .   
  25. ^ Delaune D, Hul V, Karlsson EA, Hassanin A, Ou TP, Baidaliuk A, et al. (noviembre de 2021). "Un nuevo coronavirus relacionado con el SARS-CoV-2 en murciélagos de Camboya" . Comunicaciones de la naturaleza . 12 (1): 6563. Bibcode : 2021NatCo..12.6563D . doi : 10.1038/s41467-021-26809-4 . PMC 8578604 . PMID 34753934 .   
  26. ↑ Zhou H, Chen X, Hu T, Li J, Song H, Liu Y, et al. (junio de 2020). "Un nuevo coronavirus de murciélago estrechamente relacionado con el SARS-CoV-2 contiene inserciones naturales en el sitio de escisión S1/S2 de la proteína Spike" . Current Biology . 30 (11): 2196–2203.e3. doi : 10.1016/j.cub.2020.05.023 . PMC 7211627. PMID 32416074 .   
  27. ↑ Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, et al. (marzo de 2020). "Un brote de neumonía asociado con un nuevo coronavirus de probable origen en murciélagos" . Nature . 579 (7798): 270–273 . Bibcode : 2020Natur.579..270Z . doi : 10.1038/ s41586-020-2012-7 . PMC 7095418. PMID 32015507 .   
  28. ^ Temmam S, Vongphayloth K, Baquero E, Munier S, Bonomi M, Regnault B, et al. (abril de 2022). "Coronavirus de murciélago relacionados con el SARS-CoV-2 e infecciosos para las células humanas". Naturaleza . 604 (7905): 330– 336. Bibcode : 2022Natur.604..330T . doi : 10.1038/s41586-022-04532-4 . PMID 35172323 . S2CID 246902858 .