ORF6 es un gen que codifica una proteína accesoria viral en los coronavirus del subgénero Sarbecovirus , incluidos el SARS-CoV y el SARS-CoV-2 . No está presente en el MERS-CoV . Se cree que reduce la respuesta del sistema inmunitario a la infección viral mediante el antagonismo del interferón . [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]
Estructura
La proteína ORF6 es bastante pequeña, compuesta por 63 residuos de aminoácidos en el SARS-CoV [ 3 ] y 61 en el SARS-CoV-2 [ 4 ] . La secuencia de ORF6 no está bien conservada , compartiendo solo alrededor del 66% de la secuencia entre los dos virus [ 5 ] . Sin embargo, desde la aparición del SARS-CoV-2 en 2019 hasta 2025, la secuencia de ORF6 solo ha conservado de forma estable una mutación: el último aspartato ha mutado a leucina (D61L) [ 6 ] .
Su cola C-terminal de aproximadamente 20 residuos es polar y se extiende hacia el citosol . Esta región contiene la metionina 58 conservada, necesaria para la interacción con RAE1 y NUP98 [ 7 ] , y secuencias señal para el tráfico de proteínas [ 2 , 3 ] . El resto de la proteína es anfipático: los primeros 10 residuos N-terminales actúan como un ancla de membrana, mientras que los residuos 11-45 forman una hélice alfa anfifílica que se asocia a la membrana como una proteína de membrana integral monotópica [ 1 ] .
Expresión y localización
Al igual que los genes de otras proteínas accesorias, el gen ORF6 se encuentra cerca de los que codifican las proteínas estructurales , en el extremo 5' del genoma de ARN del coronavirus. Junto con ORF7a , ORF7b y ORF8 , ORF6 se encuentra entre los genes de la membrana (M) y la nucleocápside (N). [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] Se localiza en el retículo endoplasmático y el aparato de Golgi , [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] y estudios en SARS-CoV-2 también indican asociación con vesículas como autofagosomas y lisosomas . [ 4 ]
Función
Se cree que la función principal de la proteína ORF6 es la inmunomodulación y el antagonismo del interferón . No es esencial para la replicación viral , aunque su ausencia parece reducir la eficiencia de la replicación. [ 2 ] [ 3 ]
Interacciones de proteínas virales
Estudios sobre el SARS-CoV sugieren que la proteína ORF6 presenta interacciones proteína-proteína con otra proteína accesoria viral, la proteína ORF9b . [ 2 ] [ 8 ] En el SARS-CoV, pero no en el virus de la hepatitis murina recombinante , la proteína ORF6 se ha detectado en partículas similares a virus y viriones maduros , lo que sugiere que puede ser una proteína estructural viral menor . [ 2 ] [ 3 ]
Efectos inmunológicos
La proteína ORF6 del SARS-CoV y del SARS-CoV-2 es un antagonista del interferón y se cree que participa en la evasión inmunitaria . Se han descrito varias interacciones proteína-proteína con proteínas de la célula huésped que median este efecto. Se ha informado que inhibe la importación nuclear del factor de transcripción STAT , inhibiendo la activación del interferón. [ 2 ] [ 4 ] Estudios sobre el SARS-CoV informan que esto puede estar mediado por la unión de la proteína ORF6 a las carioferinas . [ 2 ] [ 5 ] En el SARS-CoV-2, se informa que la proteína ORF6 interactúa con RAE1 y NUP98 , bloqueando las interacciones de las carioferinas. [ 4 ] [ 9 ]
Referencias
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