E2F es un grupo de genes que codifica una familia de factores de transcripción (FT) en eucariotas superiores . Tres de ellos son activadores : E2F1, E2F2 y E2F3a. Otros seis actúan como represores : E2F3b, E2F4-8. Todos ellos participan en la regulación del ciclo celular y la síntesis de ADN en células de mamíferos . Los E2F, como FT, se unen al sitio de unión consenso TTTCCCGC (o ligeras variaciones de esta secuencia) en la secuencia promotora diana . Con la excepción de E2F6, E2F7 y E2F8, la mayoría de los miembros poseen un dominio de unión a proteínas de bolsillo , cuyo socio de unión más conocido es la proteína del retinoblastoma (pRb), y un dominio de transactivación . [ 1 ]
Familia E2F
Diagrama esquemático de las secuencias de aminoácidos de los miembros de la familia E2F ( extremo N a la izquierda, extremo C a la derecha) que resalta las ubicaciones relativas de los dominios funcionales dentro de cada miembro:
Genes
Los genes E2F humanos incluyen:
Estructura
El análisis cristalográfico de rayos X ha demostrado que la familia de factores de transcripción E2F tiene un plegamiento similar al motivo de unión al ADN de hélice alada . [ 2 ]
Función en el ciclo celular


Los miembros de la familia E2F desempeñan un papel fundamental durante la transición G1/S en el ciclo celular de mamíferos y plantas (véase la vía del ciclo celular de KEGG ). El análisis de microarrays de ADN revela conjuntos únicos de promotores diana entre los miembros de la familia E2F, lo que sugiere que cada proteína tiene una función específica en el ciclo celular. [ 3 ] Entre las dianas transcripcionales de E2F se encuentran las ciclinas , las CDK , los reguladores de puntos de control y las proteínas de reparación y replicación del ADN. No obstante, existe una gran redundancia entre los miembros de la familia. Los embriones de ratón que carecen de E2F1, E2F2 y una de las isoformas de E2F3 pueden desarrollarse con normalidad cuando se expresa E2F3a o E2F3b. [ 4 ]
La familia E2F se divide generalmente por su función en dos grupos: activadores y represores de la transcripción. Los activadores, como E2F1, E2F2 y E2F3a, promueven y ayudan a llevar a cabo el ciclo celular, mientras que los represores lo inhiben. Sin embargo, ambos conjuntos de E2F tienen dominios similares. E2F1-6 tienen un dominio de heterodimerización DP1,2 que les permite unirse a DP1 o DP2, proteínas distantemente relacionadas con E2F. La unión con DP1,2 proporciona un segundo sitio de unión al ADN, aumentando la estabilidad de la unión de E2F. [ 5 ] La mayoría de E2F tienen un dominio de unión a proteínas de bolsillo . Las proteínas de bolsillo, como pRB y las proteínas relacionadas p107 y p130, pueden unirse a E2F cuando están hipofosforiladas. En los activadores, se ha demostrado que la unión de E2F con pRB enmascara el dominio de transactivación responsable de la activación de la transcripción. [ 1 ] En los represores E2F4 y E2F5, la unión a proteínas de bolsillo (más frecuentemente p107 y p130 que pRB) media el reclutamiento de complejos de represión para silenciar genes diana. [ 6 ] E2F6, E2F7 y E2F8 no tienen sitios de unión a proteínas de bolsillo y su mecanismo para el silenciamiento génico no está claro. Cdk4(6)/ciclina D y cdk2/ciclina E fosforilan pRB y proteínas de bolsillo relacionadas, lo que permite que se disocien de E2F. Las proteínas activadoras E2F pueden entonces transcribir genes que promueven la fase S. En células REF52, la sobreexpresión del activador E2F1 es capaz de empujar a las células quiescentes a la fase S. [ 7 ] Si bien los represores E2F4 y 5 no alteran la proliferación celular, median la detención en G1. [ 3 ]
Los niveles del activador E2F son cíclicos, con una expresión máxima durante la fase G1/S. Por el contrario, los represores E2F permanecen constantes, especialmente porque suelen expresarse en células quiescentes. En concreto, E2F5 solo se expresa en células terminalmente diferenciadas en ratones. [ 3 ] El equilibrio entre los represores y activadores E2F regula la progresión del ciclo celular. Cuando se eliminan las proteínas activadoras de la familia E2F, los represores se activan para inhibir los genes diana de E2F. [ 8 ]
complejos E2F/pRb
La proteína supresora de tumores Rb (pRb) se une al factor de transcripción E2F1, impidiendo su interacción con la maquinaria de transcripción celular. En ausencia de pRb, E2F1 (junto con su proteína de unión DP1) media la transactivación de los genes diana de E2F1 que facilitan la transición G1/S y la fase S. E2F actúa sobre genes que codifican proteínas implicadas en la replicación del ADN (por ejemplo, ADN polimerasa , timidina quinasa , dihidrofolato reductasa y cdc6 ) y la replicación cromosómica (proteína de unión al origen de replicación HsOrc1 y MCM5 ). Cuando las células no proliferan, los sitios de unión de E2F al ADN contribuyen a la represión transcripcional. Los experimentos de huella de ADN in vivo obtenidos en los promotores de Cdc2 y B-myb demostraron la ocupación de los sitios de unión de E2F al ADN durante G0 y G1 temprano, cuando E2F se encuentra en complejos represores transcripcionales con las proteínas de bolsillo.
pRb es uno de los objetivos de la proteína E7 del virus del papiloma humano oncogénico y de la proteína E1A del adenovirus humano . Al unirse a pRb, detienen la regulación de los factores de transcripción E2F e impulsan el ciclo celular para permitir la replicación del genoma viral.
Activadores: E2F1, E2F2, E2F3a
Los activadores se expresan al máximo al final de G1 y se pueden encontrar asociados con promotores regulados por E2F durante la transición G1/S. La activación de los genes E2F-3a se produce tras la estimulación por factores de crecimiento y la posterior fosforilación de la proteína del retinoblastoma, pRB , inhibidora de E2F . La fosforilación de pRB es iniciada por el complejo ciclina D / cdk4 , cdk6 y continuada por la ciclina E/cdk2. La ciclina D/cdk4,6 se activa a su vez mediante la vía de señalización MAPK .
Cuando se une a E2F-3a, pRb puede reprimir directamente los genes diana de E2F-3a reclutando complejos de remodelación de la cromatina y actividades modificadoras de histonas (por ejemplo, histona deacetilasa, HDAC ) al promotor.
Inhibidores: E2F3b, E2F4, E2F5, E2F6, E2F7, E2F8
- E2F3b, E2F4 y E2F5 se expresan en células quiescentes y pueden encontrarse asociados a elementos de unión a E2F en los promotores diana de E2F durante la fase G0. E2F-4 y 5 se unen preferentemente a p107/p130.
- E2F-6 actúa como represor transcripcional, pero a través de un mecanismo distinto e independiente de la proteína de bolsillo. E2F-6 ejerce la represión mediante la unión directa a proteínas del grupo Polycomb o mediante la formación de un gran complejo multimérico que contiene proteínas Mga y Max.
- Los genes represores E2F7/E2F8, ubicados en el cromosoma 7, son factores de transcripción responsables de la regulación del ciclo celular mediante la codificación de proteínas. Juntos, son esenciales para el desarrollo de una estructura placentaria intacta, organizada y funcional durante el desarrollo embrionario. Si bien las vías moleculares específicas aún se desconocen, los investigadores han utilizado ratones Cre específicos del linaje placentario y fetal para determinar las funciones de los genes sinérgicos E2F7 y E2Fhe8. Los ratones knockout, con deficiencia de E2F7 y E2F8, presentan una proliferación trofoblástica anormal acompañada de apoptosis celular avanzada. Fenotípicamente, la placenta presenta alteraciones en la arquitectura celular, incluyendo grandes cúmulos de células trofoblásticas indiferenciadas que no han logrado invadir la decidua materna. [ 9 ] Las proteínas E2F7 y E2F8 pueden funcionar como represores independientemente de la interacción con DP. Son únicas por tener un dominio de unión al ADN similar a E2F duplicado y conservado, y por carecer de un dominio de dimerización DP1,2. También parecen desempeñar un papel en la angiogénesis a través de la activación del factor de crecimiento endotelial vascular A. Utilizando pez cebra, se descubrieron graves defectos vasculares en la cabeza y los vasos somáticos cuando los animales presentaban deficiencia de E2F7 y E2F8. [ 10 ] Antagonizado por E2F3a, se ha descubierto un programa transcripcional que funciona mediante la coordinación de múltiples genes de la familia E2F para asegurar el desarrollo adecuado de la placenta.
Objetivos transcripcionales
- Ciclo celular: CCNA1,2, CCND1,2, CDK2 , MYB, E2F1,2,3, TFDP1, CDC25A
- Reguladores negativos: E2F7, RB1 , TP107, TP21
- Puntos de control: TP53 , BRCA1 , 2, BUB1
- Apoptosis: TP73, APAF1, CASP3 , 7, 8, MAP3K5, 14
- Síntesis de nucleótidos: timidina quinasa (tk), timidilato sintasa (ts), DHFR
- Reparación del ADN: BARD1, RAD51, UNG1,2, FANCA, FANCC, FANCJ
- Replicación del ADN: PCNA , histona H2A, ADN polimerasay, RPA1,2,3, CDC6, MCM2,3,4,5,6,7
Véase también
Referencias
- 1 2 3 Maiti B, Li J, de Bruin A, Gordon F, Timmers C, Opavsky R, Patil K, Tuttle J, Cleghorn W, Leone G (mayo de 2005). "Clonación y caracterización de E2F8 de ratón, un nuevo miembro de la familia E2F de mamíferos capaz de bloquear la proliferación celular" . The Journal of Biological Chemistry . 280 (18): 18211– 20. doi : 10.1074/jbc.M501410200 . PMID 15722552 .
- ^ Zheng N, Fraenkel E, Pabo CO, Pavletich NP (marzo de 1999). "Base estructural del reconocimiento del ADN por el factor de transcripción del ciclo celular heterodimérico E2F-DP" . Genes y desarrollo . 13 (6): 666– 74. doi : 10.1101/gad.13.6.666 . PMC 316551 . PMID 10090723 .
- 1 2 3 Gaubatz S, Lindeman GJ, Ishida S, Jakoi L, Nevins JR, Livingston DM, Rempel RE (septiembre de 2000). "E2F4 y E2F5 desempeñan un papel esencial en el control de G1 mediado por proteínas de bolsillo" . Molecular Cell . 6 (3): 729–35 . doi : 10.1016/S1097-2765(00)00071-X . PMID 11030352 .
- ^ Tsai SY, Opavsky R, Sharma N, Wu L, Naidu S, Nolan E, Feria-Arias E, Timmers C, Opavska J, de Bruin A, Chong JL, Trikha P, Fernandez SA, Stromberg P, Rosol TJ, Leone G (agosto de 2008). «Desarrollo de ratón con un único activador E2F» . Naturaleza . 454 (7208): 1137– 41. Bibcode : 2008Natur.454.1137T . doi : 10.1038/naturaleza07066 . PMC 4288824 . PMID 18594513 .
- ↑ Sozzani R, Maggio C, Varotto S, Canova S, Bergounioux C, Albani D, Cella R (abril de 2006). "Interacción entre los factores activadores E2Fb y E2Fa de Arabidopsis en la progresión del ciclo celular y el desarrollo" . Plant Physiology . 140 (4): 1355– 66. doi : 10.1104/pp.106.077990 . PMC 1435807. PMID 16514015 .
- ↑ Chen HZ, Tsai SY, Leone G (noviembre de 2009). "Funciones emergentes de los E2F en el cáncer: una salida del control del ciclo celular" . Nature Reviews. Cancer . 9 (11): 785– 97. doi : 10.1038/nrc2696 . PMC 3616489. PMID 19851314 .
- ↑ Johnson DG, Schwarz JK, Cress WD, Nevins JR (septiembre de 1993). "La expresión del factor de transcripción E2F1 induce a las células quiescentes a entrar en la fase S". Nature . 365 ( 6444): 349– 52. Bibcode : 1993Natur.365..349J . doi : 10.1038/365349a0 . PMID 8377827. S2CID 4308877 .
- ↑ Timmers C, Sharma N, Opavsky R, Maiti B, Wu L, Wu J, Orringer D, Trikha P, Saavedra HI, Leone G (enero de 2007). "E2f1, E2f2 y E2f3 controlan la expresión del objetivo de E2F y la proliferación celular a través de un bucle de retroalimentación negativa dependiente de p53" . Biología Molecular y Celular . 27 (1): 65–78 . doi : 10.1128/MCB.02147-06 . PMC 1800646. PMID 17167174 .
- ↑ Ouseph, M., Li, J., Chen, H., Pecot, T., Wensel, P., Thompson, J., Comstock, G., Chokshi, V., Byrne, M., Forde, B., Chong, J., Huang, K., Machiraju, R., Bruin, A. y Leone, G. "Los represores y activadores atípicos de E2F coordinan el desarrollo placentario". Developmental Cell 22, 849–862, 17 de abril de 2012.
- ^ Weijts, B., Bakker, W., Cornelissen, P., Liang, K., Schaftenaar, F., Westendorp, B., De Wolf, C., Paciejewska, M., Scheele, C., Kent, L., Leone, G., Schulte-Merker, S. y Bruin, A. "E2F7 y E2F8 promueven la angiogénesis mediante la activación transcripcional de VEGFA en cooperación con HIF-1 The EMBO Journal (2012) 31, 3871-3884.
- ↑ Cobrinik D (abril de 2005). "Proteínas de bolsillo y control del ciclo celular" . Oncogene . 24 (17): 2796–809 . doi : 10.1038/sj.onc.1208619 . PMID 15838516 .
- ↑ Ogawa H, Ishiguro K, Gaubatz S, Livingston DM, Nakatani Y (mayo de 2002). "Un complejo con modificadores de la cromatina que ocupa genes sensibles a E2F y Myc en células G0". Science . 296 ( 5570): 1132– 6. Bibcode : 2002Sci...296.1132O . doi : 10.1126/science.1069861 . PMID 12004135. S2CID 34863978 .
- ↑ Tommasi S, Pfeifer GP (diciembre de 1995). "Estructura in vivo del promotor humano cdc2: la liberación de un complejo p130-E2F-4 de secuencias inmediatamente anteriores al sitio de inicio de la transcripción coincide con la inducción de la expresión de cdc2" . Biología Molecular y Celular . 15 (12): 6901–13 . doi : 10.1128/mcb.15.12.6901 . PMC 230945. PMID 8524257 .
- ↑ Zwicker J, Liu N, Engeland K, Lucibello FC, Müller R (marzo de 1996). "Regulación del ciclo celular de la ocupación del sitio E2F in vivo". Science . 271 ( 5255): 1595– 7. Bibcode : 1996Sci...271.1595Z . doi : 10.1126/science.271.5255.1595 . PMID 8599118. S2CID 6810784 .
- ↑ Tategu M, Arauchi T, Tanaka R, Nakagawa H, Yoshida K (2007). "Identificación basada en biología de sistemas de la comunicación cruzada entre los factores de transcripción E2F y la vía de la anemia de Fanconi" . Regulación genética y biología de sistemas . 1 (1) 117762500700100001: 1– 7. doi : 10.1177/117762500700100001 . PMC 2759144 . PMID 19936073 .
Enlaces externos
- Factores de transcripción E2F en los encabezamientos de materias médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.
- Factor de transcripción E2F de Drosophila - La mosca interactiva
- Factor de transcripción E2F 2 de Drosophila - La mosca interactiva
- ciclo celular
- Factores de transcripción