Articulo de referencia

Estadísticas direccionales

La estadística direccional (también llamada estadística circular o estadística esférica ) es la subdisciplina de la estadística que se ocupa de las direcciones ( vectores unitar...

La estadística direccional (también llamada estadística circular o estadística esférica ) es la subdisciplina de la estadística que se ocupa de las direcciones ( vectores unitarios en el espacio euclidiano , R n ), los ejes ( líneas que pasan por el origen en R n ) o las rotaciones en R n . De forma más general, la estadística direccional se ocupa de las observaciones en variedades riemannianas compactas, incluida la variedad de Stiefel .

La forma general de una proteína puede parametrizarse como una secuencia de puntos en la esfera unitaria . Se muestran dos vistas del histograma esférico de dichos puntos para una amplia colección de estructuras proteicas. El tratamiento estadístico de estos datos se enmarca en el ámbito de la estadística direccional. [ 1 ]

El hecho de que 0 grados y 360 grados sean ángulos idénticos , de modo que, por ejemplo, 180 grados no sea una media razonable de 2 grados y 358 grados, ilustra la necesidad de utilizar métodos estadísticos especiales para el análisis de ciertos tipos de datos (en este caso, datos angulares). Otros ejemplos de datos que pueden considerarse direccionales incluyen estadísticas relacionadas con periodos temporales (por ejemplo, hora del día, semana, mes, año, etc.), direcciones cardinales, ángulos diedros en moléculas, orientaciones, rotaciones, etc.

Distribuciones circulares

Cualquier función de densidad de probabilidad (pdf) pag(incógnita){\displaystyle \ p(x)}en la línea se puede "envolver" alrededor de la circunferencia de un círculo de radio unitario. [ 2 ] Es decir, la pdf de la variable envuelta θ=incógnitaw=incógnitamod2π  (π,π]{\displaystyle \theta =x_{w}=x{\bmod {2}}\pi \ \ \in (-\pi ,\pi ]} es pagw(θ)=k=pag(θ+2πk).{\displaystyle p_{w}(\theta )=\sum _{k=-\infty }^{\infty }{p(\theta +2\pi k)}.}

Este concepto puede extenderse al contexto multivariado mediante una extensión de la suma simple a un número deF{\displaystyle F}sumas que cubren todas las dimensiones en el espacio de características: pagw(θ)=k1=kF=pag(θ+2πk1mi1++2πkFmiF){\displaystyle p_{w}({\boldsymbol {\theta }})=\sum _{k_{1}=-\infty }^{\infty }\cdots \sum _{k_{F}=-\infty }^{\infty }{p({\boldsymbol {\theta }}+2\pi k_{1}\mathbf {e} _{1}+\dots +2\pi k_{F}\mathbf {e} _{F})}} dóndemik=(0,,0,1,0,,0)T{\displaystyle \mathbf {e} _ {k}=(0,\dots,0,1,0,\dots,0)^{\mathsf {T}}}es elk{\displaystyle k}Vector base euclidiano -ésimo.

Las siguientes secciones muestran algunas distribuciones circulares relevantes.

Distribución circular de von Mises

La distribución de von Mises es una distribución circular que, como cualquier otra distribución circular, puede considerarse como una envoltura de una determinada distribución de probabilidad lineal alrededor del círculo. La distribución de probabilidad lineal subyacente a la distribución de von Mises es matemáticamente intratable; sin embargo, para fines estadísticos, no es necesario tratar con dicha distribución. La utilidad de la distribución de von Mises radica en dos aspectos: es la más manejable matemáticamente de todas las distribuciones circulares, lo que permite un análisis estadístico más sencillo, y constituye una aproximación cercana a la distribución normal envuelta , la cual, de forma análoga a la distribución normal lineal, es importante porque representa el caso límite para la suma de un gran número de pequeñas desviaciones angulares. De hecho, la distribución de von Mises se conoce a menudo como la distribución "normal circular" debido a su facilidad de uso y su estrecha relación con la distribución normal envuelta. [ 3 ]

La función de densidad de probabilidad de la distribución de von Mises es:F(θ;μ,κ)=miκporque(θμ)2πI0(κ){\displaystyle f(\theta ;\mu ,\kappa )={\frac {e^{\kappa \cos(\theta -\mu )}}{2\pi I_{0}(\kappa )}}} dondeI0{\displaystyle I_{0}}es la función de Bessel modificada de orden 0.

Distribución uniforme circular

La función de densidad de probabilidad (pdf) de la distribución uniforme circular viene dada por U(θ)=12π.{\displaystyle U(\theta )={\frac {1}{2\pi }}.}

También puede considerarse comoκ=0{\displaystyle \kappa =0}del von Mises mencionado anteriormente.

Distribución normal envuelta

La función de densidad de probabilidad (pdf) de la distribución normal envuelta (WN) es: Wnorte(θ;μ,σ)=1σ2πk=exp[(θμ2πk)22σ2]=12πϑ(θμ2π,iσ22π){\displaystyle WN(\theta ;\mu ,\sigma )={\frac {1}{\sigma {\sqrt {2\pi }}}}\sum _{k=-\infty }^{\infty }\exp \left[{\frac {-(\theta -\mu -2\pi k)^{2}}{2\sigma ^{2}}}\right]={\frac {1}{2\pi }}\vartheta \left({\frac {\theta -\mu }{2\pi }},{\frac {i\sigma ^{2}}{2\pi }}\right)} donde μ y σ son la media y la desviación estándar de la distribución desenrollada, respectivamente y ϑ(θ,τ){\displaystyle \vartheta (\theta,\tau)}es la función theta de Jacobi : ϑ(θ,τ)=norte=(w2)norteqnorte2{\displaystyle \vartheta (\theta ,\tau )=\sum _{n=-\infty }^{\infty }(w^{2})^{n}q^{n^{2}}}dóndewmiiπθ{\displaystyle w\equiv e^{i\pi \theta }}yqmiiπτ.{\displaystyle q\equiv e^{i\pi \tau }.}

Distribución de Cauchy envuelta

El PDF de la distribución de Cauchy envuelta (WC) es: Wdo(θ;θ0,γ)=norte=γπ(γ2+(θ+2πnorteθ0)2)=12πsinhγaporrearγporque(θθ0){\displaystyle WC(\theta ;\theta _{0},\gamma )=\sum _{n=-\infty }^{\infty }{\frac {\gamma }{\pi (\gamma ^{2}+(\theta +2\pi n-\theta _{0})^{2})}}={\frac {1}{2\pi }}\,\,{\frac {\sinh \gamma }{\cosh \gamma -\cos(\theta -\theta _{0})}}} dondeγ{\displaystyle \gamma }es el factor de escala yθ0{\displaystyle \theta _{0}}es la posición máxima.

Distribución Lévy envuelta

El PDF de la distribución de Lévy encapsulada (WL) es: FWL(θ;μ,do)=norte=do2πmido/2(θ+2πnorteμ)(θ+2πnorteμ)3/2{\displaystyle f_{WL}(\theta ;\mu ,c)=\sum _{n=-\infty }^{\infty }{\sqrt {\frac {c}{2\pi }}}\,{\frac {e^{-c/2(\theta +2\pi n-\mu )}}{(\theta +2\pi n-\mu )^{3/2}}}} donde el valor del sumando se toma como cero cuandoθ+2πnorteμ0{\displaystyle \theta +2\pi n-\mu \leq 0},do{\displaystyle c}es el factor de escala yμ{\displaystyle \mu }es el parámetro de ubicación.

Distribución normal proyectada

La distribución normal proyectada es una distribución circular que representa la dirección de una variable aleatoria con distribución normal multivariada, obtenida mediante la proyección radial de la variable sobre la esfera unitaria (n-1). Debido a esto, y a diferencia de otras distribuciones circulares de uso común, no es simétrica ni unimodal .

Distribuciones en variedades de dimensiones superiores

Tres conjuntos de puntos muestreados a partir de diferentes distribuciones de Kent en la esfera.

También existen distribuciones en la esfera bidimensional (como la distribución de Kent [ 4 ] ), la esfera N- dimensional (la distribución de von Mises-Fisher [ 5 ] ) o el toro (la distribución bivariada de von Mises [ 6 ] ).

La distribución matricial de von Mises-Fisher es una distribución en la variedad de Stiefel y puede utilizarse para construir distribuciones de probabilidad sobre matrices de rotación . [ 7 ]

La distribución de Bingham es una distribución sobre ejes en N dimensiones, o equivalentemente, sobre puntos en la esfera ( N  1)-dimensional con los antípodas identificados. [ 8 ] Por ejemplo, si N  =  2, los ejes son líneas no dirigidas que pasan por el origen en el plano. En este caso, cada eje corta el círculo unitario en el plano (que es la esfera unidimensional) en dos puntos que son antípodas entre sí. Para N  =  4, la distribución de Bingham es una distribución sobre el espacio de cuaterniones unitarios ( versores ). Dado que un versor corresponde a una matriz de rotación, la distribución de Bingham para N  =  4 puede usarse para construir distribuciones de probabilidad sobre el espacio de rotaciones, al igual que la distribución de Matrix-von Mises-Fisher.

Estas distribuciones se utilizan, por ejemplo, en geología , [ 9 ] cristalografía [ 10 ] y bioinformática . [ 1 ] [ 11 ] [ 12 ]

Momentos

Los momentos vectoriales brutos (o trigonométricos) de una distribución circular se definen como

metronorte=mi(znorte)=ΓPAG(θ)znortedθ{\displaystyle m_{n}=\operatorname {E} (z^{n})=\int _{\Gamma }P(\theta )z^{n}\,d\theta }

dóndeΓ{\displaystyle \Gamma }es cualquier intervalo de longitud2π{\displaystyle 2\pi },PAG(θ){\displaystyle P(\theta )}es el PDF de la distribución circular, yz=miiθ{\displaystyle z=e^{i\theta }}. Dado que la integralPAG(θ){\displaystyle P(\theta )}Si la unidad y el intervalo de integración es finito, se deduce que los momentos de cualquier distribución circular son siempre finitos y están bien definidos.

Los momentos de muestra se definen de forma análoga:

metro¯norte=1nortei=1nortezinorte.{\displaystyle {\overline {m}}_{n}={\frac {1}{N}}\sum _{i=1}^{N}z_{i}^{n}.}

El vector resultante de la población, su longitud y el ángulo medio se definen de forma análoga a los parámetros de muestra correspondientes.

ρ=metro1{\displaystyle \rho =m_{1}}
R=|metro1|{\displaystyle R=|m_{1}|}
θnorte=Arg(metronorte).{\displaystyle \theta _{n}=\operatorname {Arg} (m_{n}).}

Además, las longitudes de los momentos superiores se definen como:

Rnorte=|metronorte|{\displaystyle R_{n}=|m_{n}|}

mientras que las partes angulares de los momentos superiores son simplemente(norteθnorte)mod2π{\displaystyle (n\theta _ {n}){\bmod {2}}\pi }La duración de todos los momentos estará comprendida entre 0 y 1.

Medidas de localización y propagación

Se pueden definir diversas medidas de tendencia central y dispersión estadística tanto para la población como para una muestra extraída de esa población. [ 3 ]

Tendencia central

La medida de posición más común es la media circular. La media circular poblacional es simplemente el primer momento de la distribución, mientras que la media muestral es el primer momento de la muestra. La media muestral sirve como estimador insesgado de la media poblacional.

Cuando los datos están concentrados, la mediana y la moda pueden definirse por analogía con el caso lineal, pero para datos más dispersos o multimodales, estos conceptos no son útiles.

Dispersión

Las medidas más comunes de propagación circular son:

  • ElVarianza circular . Para la muestra, la varianza circular se define como:Var(z)¯=1R¯{\displaystyle {\overline {\operatorname {Var} (z)}}=1-{\overline {R}}}y para la poblaciónVar(z)=1R{\displaystyle \operatorname {Var} (z)=1-R}Ambos tendrán valores entre 0 y 1.
  • Eldesviación estándar circularS(z)=ln(1/R2)=2ln(R){\displaystyle S(z)={\sqrt {\ln(1/R^{2})}}={\sqrt {-2\ln(R)}}}S¯(z)=ln(1/R¯2)=2ln(R¯){\displaystyle {\overline {S}}(z)={\sqrt {\ln(1/{\overline {R}}^{2})}}={\sqrt {-2\ln({\overline {R}})}}}con valores entre 0 e infinito. Esta definición de la desviación estándar (en lugar de la raíz cuadrada de la varianza) es útil porque, para una distribución normal envuelta, es un estimador de la desviación estándar de la distribución normal subyacente. Por lo tanto, permitirá estandarizar la distribución circular como en el caso lineal, para valores pequeños de la desviación estándar. Esto también se aplica a la distribución de von Mises, que se aproxima mucho a la distribución normal envuelta. Nótese que para valores pequeñosS(z){\displaystyle S(z)}, tenemosS(z)2=2Var(z){\displaystyle S(z)^{2}=2\operatorname {Var} (z)}.
  • Eldispersión circularδ=1R22R2{\displaystyle \delta ={\frac {1-R_{2}}{2R^{2}}}}δ¯=1R¯22R¯2{\displaystyle {\overline {\delta }}={\frac {1-{{\overline {R}}_{2}}}{2{\overline {R}}^{2}}}}con valores entre 0 e infinito. Esta medida de dispersión resulta útil en el análisis estadístico de la varianza.

Distribución de la media

Dado un conjunto de N medicionesznorte=miiθnorte{\displaystyle z_{n}=e^{i\theta _{n}}}El valor medio de z se define como:

z¯=1nortenorte=1norteznorte{\displaystyle {\overline {z}}={\frac {1}{N}}\sum _{n=1}^{N}z_{n}}

que puede expresarse como

z¯=do¯+iS¯{\displaystyle {\overline {z}}={\overline {C}}+i{\overline {S}}}

dónde

do¯=1nortenorte=1norteporque(θnorte) y S¯=1nortenorte=1nortepecado(θnorte){\displaystyle {\overline {C}}={\frac {1}{N}}\sum _{n=1}^{N}\cos(\theta _{n}){\text{ and }}{\overline {S}}={\frac {1}{N}}\sum _{n=1}^{N}\sin(\theta _{n})}

o, alternativamente, como:

z¯=R¯miiθ¯{\displaystyle {\overline {z}}={\overline {R}}e^{i{\overline {\theta }}}}

dónde

R¯=do¯2+S¯2 y θ¯=arctan(S¯/do¯).{\displaystyle {\overline {R}}={\sqrt {{\overline {C}}^{2}+{\overline {S}}^{2}}}{\text{ and }}{\overline {\theta }}=\arctan({\overline {S}}/{\overline {C}}).}

La distribución del ángulo medio (θ¯{\displaystyle {\overline {\theta }}}) para una función de densidad de probabilidad circular P ( θ ) vendrá dada por:

PAG(do¯,S¯)ddo¯dS¯=PAG(R¯,θ¯)dR¯dθ¯=ΓΓnorte=1norte[PAG(θnorte)dθnorte]{\displaystyle P({\overline {C}},{\overline {S}})\,d{\overline {C}}\,d{\overline {S}}=P({\overline {R}},{\overline {\theta }})\,d{\overline {R}}\,d{\overline {\theta }}=\int _{\Gamma }\cdots \int _{\Gamma }\prod _{n=1}^{N}\left[P(\theta _{n})\,d\theta _{n}\right]}

dóndeΓ{\displaystyle \Gamma }es sobre cualquier intervalo de longitud2π{\displaystyle 2\pi }y la integral está sujeta a la restricción de queS¯{\displaystyle {\overline {S}}}ydo¯{\displaystyle {\overline {C}}}son constantes, o, alternativamente, queR¯{\displaystyle {\overline {R}}}yθ¯{\displaystyle {\overline {\theta }}}son constantes.

El cálculo de la distribución de la media para la mayoría de las distribuciones circulares no es analíticamente posible, y para realizar un análisis de varianza se necesitan aproximaciones numéricas o matemáticas. [ 13 ]

El teorema del límite central puede aplicarse a la distribución de las medias muestrales. (Artículo principal: Teorema del límite central para estadísticas direccionales ). Se puede demostrar [ 13 ] que la distribución de[do¯,S¯]{\displaystyle [{\overline {C}},{\overline {S}}]}Se aproxima a una distribución normal bivariada en el límite de un tamaño de muestra grande.

Pruebas de bondad de ajuste y significancia

Para datos cíclicos (por ejemplo, si están distribuidos uniformemente)  :

Véase también

Referencias

  1. 1 2 Hamelryck, Thomas; Kent, John T.; Krogh, Anders (2006). "Hamelryck, T., Kent, J., Krogh, A. (2006) Muestreo de conformaciones proteicas realistas utilizando sesgo estructural local. PLoS Comput. Biol., 2(9): e131" . PLOS Computational Biology . 2 (9): e131. Bibcode : 2006PLSCB...2..131H . doi : 10.1371/journal.pcbi.0020131 . PMC 1570370. PMID 17002495 .  
  2. Bahlmann, C., (2006), Características direccionales en el reconocimiento de escritura a mano en línea , Pattern Recognition, 39
  3. 1 2 Fisher 1993 .
  4. Kent, J (1982) La distribución de Fisher-Bingham en la esfera . J Royal Stat Soc, 44, 71–80.
  5. Fisher, RA (1953) Dispersión en una esfera. Proc. Roy. Soc. London Ser. A., 217, 295–305
  6. Mardia, KM. Taylor; CC; Subramaniam, GK. (2007). "Protein Bioinformatics and Mixtures of Bivariate von Mises Distributions for Angular Data". Biometrics . 63 (2): 505– 512. doi : 10.1111/j.1541-0420.2006.00682.x . PMID 17688502 . S2CID 14293602 .  
  7. Downs (1972). "Estadísticas de orientación". Biometrika . 59 (3): 665– 676. doi : 10.1093/biomet/59.3.665 .
  8. Bingham, C. (1974). "Una distribución simétrica antipodal en la esfera" . Ann. Stat . 2 (6): 1201– 1225. doi : 10.1214/aos/1176342874 .
  9. Peel, D.; Whiten, WJ.; McLachlan, GJ. (2001). "Ajuste de mezclas de distribuciones de Kent para ayudar en la identificación de conjuntos conjuntos" (PDF) . J. Am. Stat. Assoc . 96 (453): 56– 63. doi : 10.1198/016214501750332974 . S2CID 11667311 . 
  10. Krieger Lassen, NC; Juul Jensen, D.; Conradsen, K. (1994). "Sobre el análisis estadístico de datos de orientación". Acta Crystallogr . A50 (6): 741– 748. Bibcode : 1994AcCrA..50..741K . doi : 10.1107/S010876739400437X .
  11. Kent, JT, Hamelryck, T. (2005). Uso de la distribución de Fisher-Bingham en modelos estocásticos para la estructura de proteínas. Archivado el 20 de enero de 2024 en Wayback Machine . En S. Barber, PD Baxter, KVMardia y RE Walls (Eds.), Biología cuantitativa, análisis de formas y ondículas, págs. 57-60. Leeds, Leeds University Press.
  12. Boomsma, Wouter; Mardia, Kanti V.; Taylor, Charles C.; Ferkinghoff-Borg, Jesper; Krogh, Anders; Hamelryck, Thomas (2008). "Un modelo generativo y probabilístico de la estructura local de las proteínas" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 105 (26): 8932– 8937. Bibcode : 2008PNAS..105.8932B . doi : 10.1073 / pnas.0801715105 . PMC 2440424. PMID 18579771 .  
  13. ^ Jammalamadaka y Sengupta 2001 .

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