Sistema Unificado de Lenguaje Médico

El Metatesauro constituye la base del UMLS y comprende más de 1 millón de conceptos biomédicos y 5 millones de nombres de conceptos, todos ellos derivados de los más de 100 vocabularios controlados y sistemas de clasificación incorporados. Algunos ejemplos de los vocabularios controlados incorporados son CPT , ICD-10 , MeSH , SNOMED CT , DSM-IV , LOINC , la Terminología de Reacciones Adversas a Medicamentos de la OMS , los Términos Clínicos del Reino Unido , RxNorm , Gene Ontology y OMIM (véase la lista completa ).

El Metatesauro está organizado por conceptos, y cada concepto tiene atributos específicos que definen su significado y está vinculado a los nombres de conceptos correspondientes en los diversos vocabularios de origen. Se representan numerosas relaciones entre los conceptos, por ejemplo, jerárquicas como " es un " para subclases y "es parte de" para subunidades, y asociativas como "es causado por" o "en la literatura suele aparecer cerca de" (esta última derivada de Medline ).

El alcance del Metatesauro viene determinado por el alcance de los vocabularios de origen. Si distintos vocabularios utilizan nombres diferentes para el mismo concepto, o si utilizan el mismo nombre para conceptos distintos, esto se representará fielmente en el Metatesauro. Toda la información jerárquica de los vocabularios de origen se conserva en el Metatesauro. Los conceptos del Metatesauro también pueden enlazar con recursos externos a la base de datos, como por ejemplo, bases de datos de secuencias genéticas.

A cada concepto del Metatesauro se le asigna uno o más tipos semánticos (categorías), que se vinculan entre sí mediante relaciones semánticas . ^{[ 4 ]} La red semántica es un catálogo de estos tipos y relaciones semánticas. Se trata de una clasificación bastante amplia; existen 127 tipos semánticos y 54 relaciones en total.

Los principales tipos semánticos son organismos, estructuras anatómicas, función biológica, sustancias químicas, eventos, objetos físicos y conceptos o ideas. Los vínculos entre los tipos semánticos definen la estructura de la red y muestran relaciones importantes entre las agrupaciones y los conceptos. El vínculo principal entre los tipos semánticos es el vínculo " es un ", que establece una jerarquía de tipos. La red también tiene 5 categorías principales de relaciones no jerárquicas (o asociativas), que constituyen los 53 tipos de relación restantes. Estas son "relacionado físicamente con", "relacionado espacialmente con", "relacionado temporalmente con", "relacionado funcionalmente con" y "relacionado conceptualmente con". ^{[ 4 ]}

La información sobre un tipo semántico incluye un identificador, una definición, ejemplos, información jerárquica sobre los tipos semánticos que lo engloban y relaciones asociativas . Las relaciones asociativas dentro de la red semántica son muy débiles. Capturan, como máximo, relaciones entre algunos elementos; es decir, capturan el hecho de que alguna instancia del primer tipo puede estar conectada mediante la relación destacada a alguna instancia del segundo tipo. Dicho de otro modo, capturan el hecho de que una aserción relacional correspondiente tiene sentido (aunque no necesariamente sea cierta en todos los casos).

Un ejemplo de relación asociativa es " puede causar ", que, aplicado a los términos (fumar, cáncer de pulmón), daría como resultado: fumar " puede causar " cáncer de pulmón.

El léxico SPECIALIST contiene información sobre vocabulario común en inglés, términos biomédicos, términos de MEDLINE y términos del Metatesauro UMLS. Cada entrada incluye información sintáctica (cómo se combinan las palabras para crear significado), morfológica (forma y estructura) y ortográfica (ortografía). Un conjunto de programas Java utiliza el léxico para analizar las variaciones en textos biomédicos relacionando las palabras según su categoría gramatical, lo que puede ser útil en búsquedas web o en registros médicos electrónicos .

Las entradas pueden ser términos de una o varias palabras. Los registros contienen cuatro partes: la forma base (por ejemplo, "run" para "running"); las partes de la oración (de las cuales Specialist reconoce once); un identificador único; y cualquier variante ortográfica disponible. Por ejemplo, una consulta para "anesthetic" devolvería lo siguiente: ^{[ 5 ]}

{ base=anestésico variante_ortográfica=anestésico entrada=E0008769 gato = sustantivo variantes=reg } { base=anestésico variante_ortográfica=anestésico entrada=E0008770 gato=adjetivo variantes=inv posición=attributo(3) }

El léxico SPECIALIST está disponible en dos formatos. El formato de "registro de unidad" se muestra arriba y consta de ranuras y rellenos . Una ranura es el elemento (es decir, "base=" o "variante ortográfica=") y los rellenos son los valores atribuibles a esa ranura para esa entrada. El formato de " tabla relacional " aún no está normalizado y contiene una gran cantidad de datos redundantes en los archivos.