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Articulo de referencia

UPF3B

El regulador de transcripciones sin sentido 3B es una proteína que en humanos está codificada por el gen UPF3B . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Este gen codifica una proteína que forma parte...

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El regulador de transcripciones sin sentido 3B es una proteína que en humanos está codificada por el gen UPF3B . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

Este gen codifica una proteína que forma parte de un complejo multiproteico post-empalme involucrado tanto en la exportación nuclear del ARNm como en su vigilancia. La proteína codificada es uno de los dos homólogos funcionales de Upf3p de levadura. La vigilancia del ARNm detecta los ARNm exportados con marcos de lectura abiertos truncados e inicia la degradación del ARNm mediada por codones de parada prematuros (NMD). Cuando la traducción termina antes de la última unión exón-exón, esto desencadena la NMD para degradar los ARNm que contienen codones de parada prematuros. Esta proteína se une al ARNm y permanece unida después de la exportación nuclear, actuando como una proteína de transporte nucleocitoplasmático. Forma con Y14 un complejo que se une específicamente 20 nt antes de las uniones exón-exón. Este gen se encuentra en el brazo largo del cromosoma X. Se han encontrado dos variantes de empalme que codifican diferentes isoformas para este gen. [ 7 ]

Interacciones

Se ha demostrado que UPF3B interactúa con UPF2 [ 6 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] y UPF1 . [ 6 ] [ 9 ] [ 11 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000125351 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000036572 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
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  7. 1 2 "Entrez Gene: UPF3B Homólogo B del regulador de transcritos sin sentido UPF3 (levadura)" .
  8. ↑ Lehner, Ben; Sanderson Christopher M (julio de 2004). " Un marco de interacción de proteínas para la degradación del ARNm humano" . Genome Res . 14 (7): 1315–23 . doi : 10.1101/gr.2122004 . ISSN 1088-9051 . PMC 442147. PMID 15231747 .   
  9. 1 2 Lejeune, Fabrice; Li Xiaojie; Maquat Lynne E (septiembre de 2003). "La degradación de ARNm mediada por codones de terminación prematura en células de mamíferos implica actividades de descapuchamiento, desadenilación y exonucleolíticas" . Mol. Cell . 12 (3): 675–87 . doi : 10.1016/S1097-2765(03)00349-6 . ISSN 1097-2765 . PMID 14527413 .  
  10. ↑ Lykke-Andersen, Jens (dic. 2002). "Identificación de un complejo de descapuchamiento humano asociado con proteínas hUpf en la degradación mediada por mutaciones sin sentido" . Mol . Cell. Biol . 22 (23): 8114–21 . doi : 10.1128/MCB.22.23.8114-8121.2002 . ISSN 0270-7306 . PMC 134073. PMID 12417715 .   
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Lecturas adicionales

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  • Wilson KF, Fortes P, Singh US, et  al. (1999). "El complejo de unión a la tapa nuclear es un nuevo objetivo de la transducción de señales acoplada al receptor del factor de crecimiento" . J. Biol. Chem . 274 (7): 4166–73 . doi : 10.1074/jbc.274.7.4166 . PMID 9933612 . 
  • Kim VN, Kataoka N, Dreyfuss G (2001). "Función del factor de degradación mediado por codones de terminación hUpf3 en el complejo de unión exón-exón dependiente del empalme". Science . 293 (5536): 1832– 6. Bibcode : 2001Sci...293.1832K . doi : 10.1126/science.1062829 . PMID 11546873 . S2CID 12018200 .  
  • Lykke-Andersen J, Shu MD, Steitz JA (2001). "Comunicación de la posición de las uniones exón-exón a la maquinaria de vigilancia del ARNm por la proteína RNPS1". Science . 293 (5536): 1836– 9. Bibcode : 2001Sci...293.1836L . doi : 10.1126/science.1062786 . PMID 11546874 . S2CID 389385 .  
  • Lejeune F, Ishigaki Y, Li X, Maquat LE (2002). "El complejo de unión de exones se detecta en el ARNm unido a CBP80 pero no en el unido a eIF4E en células de mamíferos: dinámica de la remodelación de mRNP" . EMBO J. 21 ( 13): 3536–45 . doi : 10.1093/emboj/cdf345 . PMC 126094. PMID 12093754 .  
  • Lykke-Andersen J (2003). "Identificación de un complejo de descapuchamiento humano asociado con proteínas hUpf en la degradación mediada por mutaciones sin sentido" . Mol . Cell. Biol . 22 (23): 8114– 21. doi : 10.1128/MCB.22.23.8114-8121.2002 . PMC 134073. PMID 12417715 .  
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  • Schell T, Köcher T, Wilm M, et  al. (2003). "Complejos entre el factor de la vía de degradación de ARNm mediada por mutaciones sin sentido humano upf1 (proteína de cambio de marco ascendente 1) y factores esenciales de degradación de ARNm mediada por mutaciones sin sentido en células HeLa" . Biochem . J. 373 ( Pt 3): 775–83 . doi : 10.1042/BJ20021920 . PMC 1223536. PMID 12723973 .  
  • Lejeune F, Li X, Maquat LE (2003). "La degradación de ARNm mediada por codones de terminación prematura en células de mamíferos implica actividades de descapuchamiento, desadenilación y exonucleolíticas" . Mol. Cell . 12 (3): 675–87 . doi : 10.1016/S1097-2765(03)00349-6 . PMID 14527413 . 
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et  al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 cDNA humanos de longitud completa" . Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 . 
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  • Kim YK, Furic L, Desgroseillers L, Maquat LE (2005). "Mammalian Staufen1 recruits Upf1 to mRNA 3'UTRs specific so to eliciting mRNA degrade" . Cell . 120 (2): 195– 208. doi : 10.1016/j.cell.2004.11.050 . PMID 15680326 . 
  • Gehring NH, Kunz JB, Neu-Yilik G, et  al. (2005). "Los componentes del complejo de unión de exones especifican rutas distintas de degradación de ARNm mediada por codones de terminación con requerimientos de cofactores diferenciales" . Mol. Cell . 20 (1): 65–75 . doi : 10.1016/j.molcel.2005.08.012 . PMID 16209946 . 
  • Kunz JB, Neu-Yilik G, Hentze MW, et  al. (2006). "Funciones de hUpf3a y hUpf3b en la traducción y desintegración del ARNm mediada por tonterías" . ARN . 12 (6): 1015– 22. doi : 10.1261/rna.12506 . PMC 1464862 . PMID 16601204 .