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Articulo de referencia

U2AF2

La subunidad de 65 kDa del factor de empalme U2AF es una proteína que en humanos está codificada por el gen U2AF2 . [ 5 ] Función En eucariotas , los intrones en el pre-ARNm tra...

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La subunidad de 65 kDa del factor de empalme U2AF es una proteína que en humanos está codificada por el gen U2AF2 . [ 5 ]

Función

En eucariotas , los intrones en el pre-ARNm transcrito deben ser eliminados primero por el espliceosoma para formar un ARNm maduro. Un espliceosoma se ensambla a partir de ribonucleoproteínas nucleares pequeñas (snRNP) y ARN nucleares pequeños (ARNsn). El factor de empalme se puede dividir en proteínas snRNP y no snRNP. El factor auxiliar U2 ( U2AF ), compuesto por una subunidad grande y una pequeña , es una proteína no snRNP necesaria para la unión de la snRNP U2 al sitio de ramificación del pre-ARNm. Este gen codifica la subunidad grande de U2AF, que contiene una región de unión a ARN específica de secuencia con 3 motivos de reconocimiento de ARN y un dominio rico en arginina/ser necesario para el empalme. La subunidad grande se une al tracto de polipirimidinas de los intrones al inicio del ensamblaje del espliceosoma . Se han detectado múltiples variantes de transcripción con empalme alternativo para este gen, pero hasta la fecha solo se ha determinado la naturaleza de longitud completa de dos de ellas. [ 6 ]

En humanos y otros tetrápodos, se ha demostrado que sin U2AF2, el proceso de empalme se inhibe. Sin embargo, en el pez cebra y otros teleósteos, el proceso de empalme de ARN aún puede ocurrir en ciertos genes en ausencia de U2AF2. Esto puede deberse a que el 10 % de los genes tienen pares de bases TG y AC alternados en el sitio de empalme 3' (3'ss) y el sitio de empalme 5' (5'ss) respectivamente en cada intrón, lo que altera la estructura secundaria del ARN e influye en el empalme. [ 7 ]

El factor de empalme U2AF65 puede reconocer específicamente el tracto de polipirimidina (tracto Py), ya que U2AF65 consta de 3 dominios de unión a ARN (RRM), todos ellos con alta afinidad de unión al tracto Py en su sitio de empalme 3' adyacente. [ 6 ] Los dominios RRM1 y RRM2 son suficientes para la unión específica de ARN/proteína, mientras que el dominio RRM3 es responsable de las interacciones proteína-proteína. Por ejemplo, el dominio RRM3 C-terminal contribuye a establecer contactos proteína-proteína con factores de empalme como UAP56, SAP155 y mBBP/SF1. [ 8 ]

Interacciones

Se ha demostrado que U2AF2 interactúa con:

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000063244 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000030435 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Zamore PD, Patton JG, Green MR (febrero de 1992). "Clonación y estructura de dominios del factor de empalme de mamíferos U2AF". Nature . 355 ( 6361): 609– 614. Bibcode : 1992Natur.355..609Z . doi : 10.1038/355609a0 . PMID 1538748. S2CID 4332390 .  
  6. 1 2 "Gen Entrez: U2AF2 Factor auxiliar 2 del ARN nuclear pequeño U2" .
  7. ↑ Lin CL, Taggart AJ, Lim KH, Cygan KJ, Ferraris L, Creton R, et al. (enero de 2016). " La estructura del ARN reemplaza la necesidad de U2AF2 en el empalme" . Genome Research . 26 (1): 12– 23. doi : 10.1101/gr.181008.114 . PMC 4691745. PMID 26566657 .   
  8. ↑ Selenko P, Gregorovic G, Sprangers R, Stier G, Rhani Z, Krämer A, Sattler M (abril de 2003). "Base estructural para el reconocimiento molecular entre los factores de empalme humanos U2AF65 y SF1/mBBP" . Molecular Cell . 11 (4): 965–976 . doi : 10.1016/s1097-2765(03)00115-1 . PMID 12718882 . 
  9. 1 2 3 4 Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, et al. (octubre de 2005). " Hacia un mapa a escala del proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Nature . 437 (7062): 1173– 1178. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514. S2CID 4427026 .   
  10. ↑ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, et al. (2007). "Mapeo a gran escala de interacciones proteína-proteína humanas mediante espectrometría de masas" . Molecular Systems Biology . 3 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948. PMID 17353931 .   
  11. ↑ Berglund JA, Abovich N, Rosbash M (marzo de 1998). "Una interacción cooperativa entre U2AF65 y mBBP/SF1 facilita el reconocimiento de la región del punto de ramificación" . Genes & Development . 12 (6): 858– 867. doi : 10.1101/gad.12.6.858 . PMC 316625. PMID 9512519 .  
  12. ↑ Abovich N, Rosbash M (mayo de 1997). "Las interacciones de puenteo entre intrones en el complejo de compromiso de la levadura se conservan en mamíferos" . Cell . 89 ( 3): 403– 412. doi : 10.1016/s0092-8674(00)80221-4 . PMID 9150140. S2CID 18466775 .  
  13. ↑ Zhang WJ, Wu JY (octubre de 1996). "Propiedades funcionales de p54, una nueva proteína SR activa en el empalme constitutivo y alternativo" . Biología Molecular y Celular . 16 (10): 5400– 5408. doi : 10.1128/MCB.16.10.5400 . PMC 231539. PMID 8816452 .  
  14. ↑ Zhang WJ, Wu JY (febrero de 1998). "Sip1, una nueva proteína que contiene un dominio RS esencial para el empalme del pre-ARNm" . Biología Molecular y Celular . 18 (2): 676– 684. doi : 10.1128/MCB.18.2.676 . PMC 108778. PMID 9447963 .  
  15. ↑ Wang HY, Lin W, Dyck JA, Yeakley JM, Songyang Z, Cantley LC, Fu XD (febrero de 1998). "SRPK2: una quinasa específica de proteína SR expresada diferencialmente involucrada en la mediación de la interacción y localización de factores de empalme de pre-ARNm en células de mamíferos" . The Journal of Cell Biology . 140 (4): 737– 750. doi : 10.1083/jcb.140.4.737 . PMC 2141757. PMID 9472028 .  
  16. ↑ Zhang M, Zamore PD, Carmo-Fonseca M, Lamond AI, Green MR (septiembre de 1992). "Clonación y localización intracelular de la subunidad pequeña del factor auxiliar de la ribonucleoproteína nuclear pequeña U2" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 89 (18): 8769– 8773. Bibcode : 1992PNAS...89.8769Z . doi : 10.1073 / pnas.89.18.8769 . PMC 50002. PMID 1388271 .  
  17. ↑ Davies RC, Calvio C, Bratt E, Larsson SH, Lamond AI, Hastie ND (octubre de 1998). "WT1 interactúa con el factor de empalme U2AF65 de manera dependiente de la isoforma y puede incorporarse a los espliceosomas" . Genes & Development . 12 (20): 3217–3225 . doi : 10.1101/gad.12.20.3217 . PMC 317218. PMID 9784496 .  

Lecturas adicionales

  • Zhang M, Zamore PD, Carmo-Fonseca M, Lamond AI, Green MR (septiembre de 1992). "Clonación y localización intracelular de la subunidad pequeña del factor auxiliar de la ribonucleoproteína nuclear pequeña U2" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 89 (18): 8769– 8773. Bibcode : 1992PNAS ...89.8769Z . doi : 10.1073/pnas.89.18.8769 . PMC 50002. PMID 1388271 .  
  • Zamore PD, Green MR (enero de 1991). "Caracterización bioquímica del factor auxiliar U2 snRNP: un factor esencial de empalme de pre-ARNm con una distribución intranuclear novedosa" . The EMBO Journal . 10 (1): 207–214 . doi : 10.1002/j.1460-2075.1991.tb07937.x . PMC 452631. PMID 1824937 .  
  • Zuo P, Maniatis T (junio de 1996). "El factor de empalme U2AF35 media interacciones proteína-proteína críticas en el empalme constitutivo y dependiente de potenciadores" . Genes & Development . 10 (11): 1356– 1368. doi : 10.1101/gad.10.11.1356 . PMID 8647433 . 
  • Zhang WJ, Wu JY (octubre de 1996). "Propiedades funcionales de p54, una nueva proteína SR activa en el empalme constitutivo y alternativo" . Biología Molecular y Celular . 16 (10): 5400– 5408. doi : 10.1128/MCB.16.10.5400 . PMC 231539. PMID 8816452 .  
  • Hong W, Bennett M, Xiao Y, Feld Kramer R, Wang C, Reed R (enero de 1997). "Asociación de U2 snRNP con el complejo espliceosómico E" . Nucleic Acids Research . 25 (2): 354– 361. doi : 10.1093 / nar/25.2.354 . PMC 146436. PMID 9016565 .  
  • Abovich N, Rosbash M (mayo de 1997). "Las interacciones de puenteo entre intrones en el complejo de compromiso de la levadura se conservan en mamíferos" . Cell . 89 ( 3): 403– 412. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80221-4 . PMID 9150140. S2CID 18466775 .  
  • Tronchère H, Wang J, Fu XD (julio de 1997). "Una proteína relacionada con el factor de empalme U2AF35 que interactúa con U2AF65 y las proteínas SR en el empalme del pre-ARNm" . Nature . 388 (6640): 397–400 . Bibcode : 1997Natur.388..397T . doi : 10.1038 / 41137 . PMID 9237760. S2CID 4386808 .  
  • Fleckner J, Zhang M, Valcárcel J, Green MR (julio de 1997). "U2AF65 recluta una nueva proteína humana de la familia DEAD box necesaria para la interacción entre el snRNP U2 y el punto de ramificación" . Genes & Development . 11 (14): 1864–1872 . doi : 10.1101/gad.11.14.1864 . PMID 9242493 . 
  • Zhang WJ, Wu JY (febrero de 1998). "Sip1, una nueva proteína que contiene un dominio RS esencial para el empalme del pre-ARNm" . Biología Molecular y Celular . 18 (2): 676– 684. doi : 10.1128/MCB.18.2.676 . PMC 108778. PMID 9447963 .  
  • Wang HY, Lin W, Dyck JA, Yeakley JM, Songyang Z, Cantley LC, Fu XD (febrero de 1998). "SRPK2: una quinasa específica de proteína SR expresada diferencialmente involucrada en la mediación de la interacción y localización de factores de empalme de pre-ARNm en células de mamíferos" . The Journal of Cell Biology . 140 (4): 737– 750. doi : 10.1083/jcb.140.4.737 . PMC 2141757. PMID 9472028 .  
  • Berglund JA, Abovich N, Rosbash M (marzo de 1998). "Una interacción cooperativa entre U2AF65 y mBBP/SF1 facilita el reconocimiento de la región del punto de ramificación" . Genes & Development . 12 (6): 858– 867. doi : 10.1101/gad.12.6.858 . PMC 316625. PMID 9512519 .  
  • Rudner DZ, Kanaar R, Breger KS, Rio DC (abril de 1998). "La interacción entre las subunidades del factor de empalme heterodimérico U2AF es esencial in vivo" . Biología Molecular y Celular . 18 (4): 1765– 1773. doi : 10.1128/MCB.18.4.1765 . PMC 121406. PMID 9528748 .  
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  • Neubauer G, King A, Rappsilber J, Calvio C, Watson M, Ajuh P, et al. (septiembre de 1998). "  La espectrometría de masas y la búsqueda en bases de datos EST permiten la caracterización del complejo espliceosoma multiproteico". Nature Genetics . 20 (1): 46– 50. doi : 10.1038/1700 . PMID 9731529. S2CID 585778 .  
  • Davies RC, Calvio C, Bratt E, Larsson SH, Lamond AI, Hastie ND (octubre de 1998). "WT1 interactúa con el factor de empalme U2AF65 de manera dependiente de la isoforma y puede incorporarse a los espliceosomas" . Genes & Development . 12 (20): 3217–3225 . doi : 10.1101/gad.12.20.3217 . PMC 317218. PMID 9784496 .  
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  • Wang X, Bruderer S, Rafi Z, Xue J, Milburn PJ, Krämer A, Robinson PJ (agosto de 1999). "La fosforilación del factor de empalme SF1 en Ser20 por la proteína quinasa dependiente de cGMP regula el ensamblaje del espliceosoma" . The EMBO Journal . 18 (16): 4549– 4559. doi : 10.1093/emboj/18.16.4549 . PMC 1171529. PMID 10449420 .  
  • Ladomery MR, Slight J, Mc Ghee S, Hastie ND (diciembre de 1999). "Presencia de WT1, el producto del gen supresor del tumor de Wilms, en la ribonucleoproteína nuclear poli(A)(+)" . The Journal of Biological Chemistry . 274 (51): 36520– 36526. doi : 10.1074/jbc.274.51.36520 . PMID 10593950 .