La proteína asociada a Sin3A, de 30 kDa , también conocida como SAP30 , es una proteína que en humanos está codificada por el gen SAP30 . [ 5 ]
Función
La acetilación de histonas desempeña un papel fundamental en la regulación de la expresión génica eucariota. La acetilación y desacetilación de histonas son catalizadas por complejos multisubunitarios. La proteína codificada por este gen es un componente del complejo de histona desacetilasa , que incluye SIN3A , SAP18 , HDAC1 , HDAC2 , RbAp46 , RbAp48 y otros polipéptidos. Este complejo es activo en la desacetilación de octámeros de histonas centrales, pero inactivo en la desacetilación de histonas nucleosomales. Un pseudogén de este gen se localiza en el cromosoma 3. [ 5 ]
Los mamíferos poseen un parálogo de SAP30, denominado SAP30-like ( SAP30L ), que comparte un 70 % de identidad de secuencia con SAP30. [ 6 ] SAP30 y SAP30L constituyen conjuntamente una familia de proteínas SAP30 bien conservada. Además, SAP30L interactúa con varios componentes del complejo correpresor Sin3A e induce la represión transcripcional mediante el reclutamiento de Sin3A y desacetilasas de histonas. [ 7 ]
Las proteínas de la familia SAP30 (proteínas SAP30) poseen una señal de localización nucleolar funcional y son capaces de dirigir Sin3A al nucléolo. [ 7 ] Las proteínas SAP30 tienen un contacto con el ADN independiente de la secuencia a través de su módulo dependiente de zinc N-terminal, y su región central ácida contribuye a las interacciones con histonas y nucleosomas. La unión al ADN de las proteínas SAP30 está regulada por los lípidos de señalización nuclear, los fosfoinosítidos (PI). [ 8 ] Las proteínas SAP30 proporcionan el primer ejemplo en el que el ADN y los PI parecen estar en una interrelación mutuamente antagónica con respecto a su interacción con las proteínas de dedo de zinc y, por lo tanto, ejemplifican el mecanismo molecular mediante el cual estos lípidos pueden contribuir a la regulación génica. [ 8 ] [ 9 ]
Interacciones
Se ha demostrado que SAP30 interactúa con:
Referencias
- 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000164105 – Ensembl , mayo de 2017
- 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000031609 – Ensembl , mayo de 2017
- ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
- 1 2 "Entrez Gene: proteína asociada a SAP30 Sin3A, 30 kDa" .
- ^ Lindfors K, Viiri KM, Niittynen M, Heinonen TY, Mäki M, Kainulainen H (diciembre de 2003). "TGF-beta induce la expresión de SAP30L, una nueva proteína nuclear" . Genómica BMC . 4 (1): 53. doi : 10.1186/1471-2164-4-53 . PMC 319701 . PMID 14680513 .
- ^ Viiri KM, Korkeamäki H, Kukkonen MK, Nieminen LK, Lindfors K, Peterson P, Mäki M, Kainulainen H, Lohi O (2006). "SAP30L interactúa con miembros del complejo correpresor Sin3A y dirige Sin3A al nucléolo" . Investigación de ácidos nucleicos . 34 (11): 3288– 98. doi : 10.1093/nar/gkl401 . PMC 1500868 . PMID 16820529 .
- 1 2 Viiri KM, Jänis J, Siggers T, Heinonen TY, Valjakka J, Bulyk ML, Mäki M, Lohi O (enero de 2009). "Las actividades de unión y flexión del ADN de SAP30L y SAP30 están mediadas por un módulo dependiente de zinc y monofosfoinosítidos" . Biología Molecular y Celular . 29 (2): 342– 56. doi : 10.1128/MCB.01213-08 . PMC 2612513. PMID 19015240 .
- ↑ «Haku Tampereen yliopiston väitöskirjatietokannasta» . Archivado desde el original el 25 de mayo de 2011 . Consultado el 24 de abril de 2009 .
- 1 2 Huang NE, Lin CH, Lin YS, Yu WC (junio de 2003). "Modulación de la actividad de YY1 por SAP30". Biochemical and Biophysical Research Communications . 306 (1): 267– 75. doi : 10.1016/s0006-291x(03)00966-5 . PMID 12788099 .
- 1 2 3 4 5 Zhang Y, Sun ZW, Iratni R, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Hampsey M, Reinberg D (junio de 1998). "SAP30, una nueva proteína conservada entre humanos y levaduras, es un componente de un complejo de histona deacetilasa" . Molecular Cell . 1 (7): 1021–31 . doi : 10.1016/s1097-2765(00)80102-1 . PMID 9651585 .
- 1 2 3 4 5 Zhang Y, Ng HH, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Bird A, Reinberg D (agosto de 1999). " Análisis de las subunidades NuRD revela un complejo central de histona deacetilasa y una conexión con la metilación del ADN" . Genes & Development . 13 (15): 1924–35 . doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . PMC 316920. PMID 10444591 .
- ↑ Swanson KA, Knoepfler PS, Huang K, Kang RS, Cowley SM, Laherty CD, Eisenman RN, Radhakrishnan I (agosto de 2004). "Los represores HBP1 y Mad1 se unen al dominio PAH2 del correpresor Sin3 con orientaciones helicoidales opuestas". Nature Structural & Molecular Biology . 11 (8): 738–46 . doi : 10.1038/nsmb798 . PMID 15235594. S2CID 44324333 .
- 1 2 Yochum GS, Ayer DE (julio de 2001). "Pf1, una nueva proteína de dedo de zinc PHD que une el correpresor TLE al complejo desacetilasa de histonas mSin3A" . Biología molecular y celular . 21 (13): 4110–8 . doi : 10.1128/MCB.21.13.4110-4118.2001 . PMC 87072. PMID 11390640 .
- 1 2 3 4 5 6 Kuzmichev A, Zhang Y, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (febrero de 2002). "Función del complejo Sin3-histona desacetilasa en la regulación del crecimiento por el supresor tumoral candidato p33(ING1)" . Biología molecular y celular . 22 (3): 835– 48. doi : 10.1128/mcb.22.3.835-848.2002 . PMC 133546. PMID 11784859 .
- 1 2 Laherty CD, Billin AN, Lavinsky RM, Yochum GS, Bush AC, Sun JM, Mullen TM, Davie JR, Rose DW, Glass CK, Rosenfeld MG, Ayer DE, Eisenman RN (julio de 1998). "SAP30, un componente del complejo correpresor mSin3 involucrado en la represión mediada por N-CoR por factores de transcripción específicos" . Molecular Cell . 2 (1): 33– 42. doi : 10.1016/s1097-2765(00)80111-2 . PMID 9702189 .
- ↑ Underhill C, Qutob MS, Yee SP, Torchia J (diciembre de 2000). "Un nuevo complejo correpresor de receptores nucleares, N-CoR, contiene componentes del complejo SWI/SNF de mamíferos y el correpresor KAP-1" . The Journal of Biological Chemistry . 275 (51): 40463–70 . doi : 10.1074/jbc.M007864200 . PMID 11013263 .
- ↑ Fleischer TC, Yun UJ, Ayer DE (mayo de 2003). "Identificación y caracterización de tres nuevos componentes del complejo correpresor mSin3A" . Biología molecular y celular . 23 (10): 3456–67 . doi : 10.1128/mcb.23.10.3456-3467.2003 . PMC 164750. PMID 12724404 .
Lecturas adicionales
- Ayer DE, Lawrence QA, Eisenman RN (marzo de 1995). "La represión transcripcional de Mad-Max está mediada por la formación de un complejo ternario con homólogos de mamíferos del represor de levadura Sin3" . Cell . 80 ( 5): 767–76 . doi : 10.1016/0092-8674(95)90355-0 . PMID 7889570. S2CID 8749951 .
- Zhang Y, Iratni R, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (mayo de 1997). "Las histonas deacetilasas y SAP18, un nuevo polipéptido, son componentes de un complejo Sin3 humano" . Cell . 89 (3): 357–64 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)80216-0 . PMID 9150135 .
- Zhang Y, Sun ZW, Iratni R, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Hampsey M, Reinberg D (junio de 1998). "SAP30, una nueva proteína conservada entre humanos y levaduras, es un componente de un complejo de histona deacetilasa" . Molecular Cell . 1 (7): 1021–31 . doi : 10.1016/S1097-2765(00)80102-1 . PMID 9651585 .
- Laherty CD, Billin AN, Lavinsky RM, Yochum GS, Bush AC, Sun JM, Mullen TM, Davie JR, Rose DW, Glass CK, Rosenfeld MG, Ayer DE, Eisenman RN (julio de 1998). "SAP30, un componente del complejo correpresor mSin3 involucrado en la represión mediada por N-CoR por factores de transcripción específicos" . Molecular Cell . 2 (1): 33– 42. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80111-2 . PMID 9702189 .
- Zhang Y, LeRoy G, Seelig HP, Lane WS, Reinberg D (octubre de 1998). "El autoantígeno Mi2 específico de la dermatomiositis es un componente de un complejo que contiene actividades de histona deacetilasa y remodelación de nucleosomas" . Cell . 95 ( 2): 279–89 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)81758-4 . PMID 9790534. S2CID 18786866 .
- Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL (octubre de 1998). "Desacetilación de la cromatina por un complejo de remodelación de nucleosomas dependiente de ATP". Nature . 395 ( 6705): 917–21 . Bibcode : 1998Natur.395..917T . doi : 10.1038/27699 . PMID 9804427. S2CID 4355885 .
- Hsieh JJ, Zhou S, Chen L, Young DB, Hayward SD (enero de 1999). "CIR, un correpresor que vincula el factor de unión al ADN CBF1 con el complejo de histona deacetilasa" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 96 (1): 23– 8. Bibcode : 1999PNAS ...96...23H . doi : 10.1073/pnas.96.1.23 . PMC 15086. PMID 9874765 .
- Boutell JM, Thomas P, Neal JW, Weston VJ, Duce J, Harper PS, Jones AL (septiembre de 1999). "Interacciones aberrantes de proteínas represoras transcripcionales con el producto génico de la enfermedad de Huntington, huntingtina" . Human Molecular Genetics . 8 (9): 1647– 55. doi : 10.1093/hmg/8.9.1647 . PMID 10441327 .
- Zhang Y, Ng HH, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Bird A, Reinberg D (agosto de 1999). "Análisis de las subunidades NuRD revela un complejo central de histona deacetilasa y una conexión con la metilación del ADN" . Genes & Development . 13 (15): 1924–35 . doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . PMC 316920. PMID 10444591 .
- Krithivas A, Young DB, Liao G, Greene D, Hayward SD (octubre de 2000). "El virus del herpes humano 8 LANA interactúa con proteínas del complejo correpresor mSin3 y regula negativamente la expresión génica del virus de Epstein-Barr en células PEL doblemente infectadas" . Journal of Virology . 74 (20): 9637–45 . doi : 10.1128/JVI.74.20.9637-9645.2000 . PMC 112396. PMID 11000236 .
- Underhill C, Qutob MS, Yee SP, Torchia J (diciembre de 2000). "Un nuevo complejo correpresor de receptores nucleares, N-CoR, contiene componentes del complejo SWI/SNF de mamíferos y el correpresor KAP-1" . The Journal of Biological Chemistry . 275 (51): 40463–70 . doi : 10.1074/jbc.M007864200 . PMID 11013263 .
- Humphrey GW, Wang Y, Russanova VR, Hirai T, Qin J, Nakatani Y, Howard BH (marzo de 2001). "Complejos estables de histona deacetilasa distinguidos por la presencia de las proteínas del dominio SANT CoREST/kiaa0071 y Mta-L1" . The Journal of Biological Chemistry . 276 (9): 6817–24 . doi : 10.1074/jbc.M007372200 . PMID 11102443 .
- Skowyra D, Zeremski M, Neznanov N, Li M, Choi Y, Uesugi M, Hauser CA, Gu W, Gudkov AV, Qin J (marzo de 2001). "Asociación diferencial de productos de transcripciones alternativas del supresor tumoral candidato ING1 con el complejo correpresor transcripcional mSin3/HDAC1" . The Journal of Biological Chemistry . 276 (12): 8734–9 . doi : 10.1074/jbc.M007664200 . PMID 11118440 .
- Yochum GS, Ayer DE (julio de 2001). "Pf1, una nueva proteína con dedo de zinc PHD que une el correpresor TLE al complejo desacetilasa de histonas mSin3A" . Biología Molecular y Celular . 21 (13): 4110–8 . doi : 10.1128/MCB.21.13.4110-4118.2001 . PMC 87072. PMID 11390640 .
- Kuzmichev A, Zhang Y, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (febrero de 2002). "Función del complejo Sin3-histona deacetilasa en la regulación del crecimiento por el supresor tumoral candidato p33(ING1)" . Biología Molecular y Celular . 22 (3): 835–48 . doi : 10.1128/MCB.22.3.835-848.2002 . PMC 133546. PMID 11784859 .
- Saito M, Ishikawa F (septiembre de 2002). "El dominio de unión a mCpG de la MBD3 humana no se une a mCpG, sino que interactúa con los componentes HDAC1 y MTA2 de NuRD/Mi2" . The Journal of Biological Chemistry . 277 (38): 35434–9 . doi : 10.1074/jbc.M203455200 . PMID 12124384 .
- Wysocka J, Myers MP, Laherty CD, Eisenman RN, Herr W (abril de 2003). "La desacetilasa Sin3 humana y la metiltransferasa de histona H3-K4 Set1/Ash2 relacionada con trithorax están unidas selectivamente por el factor de proliferación celular HCF-1" . Genes & Development . 17 (7): 896–911 . doi : 10.1101/gad.252103 . PMC 196026. PMID 12670868 .
- Huang NE, Lin CH, Lin YS, Yu WC (junio de 2003). "Modulación de la actividad de YY1 por SAP30". Biochemical and Biophysical Research Communications . 306 (1): 267–75 . doi : 10.1016/S0006-291X(03)00966-5 . PMID 12788099 .
- Sironi E, Cerri A, Tomasini D, Sirchia SM, Porta G, Rossella F, Grati FR, Simoni G (abril de 2004). "Pérdida de heterocigosidad en el cromosoma 4q32-35 en carcinomas basocelulares esporádicos: evidencia de la implicación de los genes p33ING2/ING1L y SAP30". Journal of Cutaneous Pathology . 31 (4): 318– 22. doi : 10.1111/j.0303-6987.2004.0187.x . PMID 15005689. S2CID 2520678 .
- Genes en el cromosoma 4 humano