Laboratorio PSF

PSF Lab es un programa informático que permite calcular la función de dispersión puntual (PSF) de la iluminación de un microscopio confocal bajo diversas condiciones de imagen. El cálculo de los vectores del campo eléctrico se basa en un modelo vectorial riguroso que tiene en cuenta los efectos de polarización en la región cercana al foco y los objetivos de microscopio de alta apertura numérica . ^{[ 1 ]}

La polarización del haz de entrada (que se supone colimado y monocromático ) puede elegirse libremente (lineal, circular o elíptica). Además, se puede asumir un perfil de intensidad del haz de entrada constante o con forma gaussiana . En su recorrido desde el objetivo hasta el foco , la luz de iluminación atraviesa hasta tres capas ópticas estratificadas, lo que permite simular un objetivo de inmersión en aceite /aire (capa 1) que enfoca la luz a través de un cubreobjetos de vidrio (capa 2) hacia el medio de la muestra (capa 3). Cada capa se caracteriza por su índice de refracción (constante) y espesor. PSF Lab también puede simular objetivos de microscopio corregidos para ciertos índices de refracción y espesores de cubreobjetos (parámetros de diseño). De este modo, se tienen en cuenta adecuadamente las desviaciones de las condiciones de imagen ideales para las que se diseñó el objetivo.

Se pueden seleccionar los siguientes parámetros ópticos: ^{[ 2 ]}

• haz de entrada
  • Longitud de onda
  • Parámetro de llenado del perfil gaussiano (0 = perfil constante)
  • Polarización (lineal, circular, elíptica)
• Salidas
  • Componentes de campo individuales
  • Componentes de campo al cuadrado
  • Intensidad
• objetivo del microscopio
  • Apertura numérica
• Medios ópticos
  • Índice de refracción (de diseño y real)
  • Grosor (de diseño y real)
  • Profundidad (posición de enfoque dentro del medio 3)

El programa calcula únicamente la sección 2D de la PSF, pero se pueden combinar varios cálculos (con un programa de terceros) para obtener la PSF 3D completa. Los cálculos se organizan en "conjuntos", cada uno con su propio conjunto de parámetros. Se pueden configurar bucles para que PSF Lab calcule uno o varios conjuntos, aumentando la resolución de las imágenes calculadas en cada nueva iteración. La imagen resultante se muestra en PSF Lab en una escala de color lineal o logarítmica con un mapa de color seleccionable por el usuario, y la intensidad, los componentes individuales del campo o las distribuciones de los componentes del campo al cuadrado se pueden exportar a varios formatos (formatos de datos: .mat, .h5 (HDF5), .txt (ASCII); formatos de imagen: .fig, .ai, .bmp, .emf, .eps, .jpg, .pcx, .pdf, .png, .tif).

• Función de dispersión de puntos
• Microscopio óptico
• Microscopía confocal
• Microscopía confocal de barrido láser

• Sitio web oficial
• Expresiones moleculares , introducción a la deconvolución mediante PSF.