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Articulo de referencia

POLG2

La subunidad gamma-2 de la ADN polimerasa mitocondrial es una proteína que en humanos está codificada por el gen POLG2 . El gen POLG2 codifica una proteína de subunidad accesori...

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La subunidad gamma-2 de la ADN polimerasa mitocondrial es una proteína que en humanos está codificada por el gen POLG2 . El gen POLG2 codifica una proteína de subunidad accesoria de 55 kDa que confiere alta procesividad y tolerancia a la sal a la subunidad catalítica de la ADN polimerasa gamma , codificada por el gen POLG . [ 5 ] [ 6 ] Las mutaciones en este gen dan lugar a una oftalmoplejía externa progresiva autosómica dominante con deleciones del ADN mitocondrial . [ 7 ]

Estructura

POLG2 se localiza en el brazo q del cromosoma 17 en la posición 23.3 y tiene 8 exones . [ 7 ] POLG2, la proteína codificada por este gen, contiene un residuo modificado de fosfoserina en la posición  38 y un péptido de tránsito . Su estructura consta de 25 hebras beta , 21 hélices alfa y 8 vueltas. [ 8 ] [ 9 ]

Función

POLG2 codifica la subunidad de procesividad de la ADN polimerasa gamma mitocondrial . La proteína codificada forma un heterotrímero que contiene una subunidad catalítica y dos subunidades de procesividad. Esta proteína mejora la unión al ADN , estimula la actividad de la polimerasa y la exonucleasa , y promueve la síntesis procesiva del ADN . [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]

Actividad catalítica

Desoxinucleósido trifosfato + ADN(n) = difosfato + ADN(n+1) [ 8 ] [ 9 ]

Importancia clínica

Las mutaciones en POLG2 se han asociado con oftalmoplejía externa progresiva con deleciones del ADN mitocondrial. Esta enfermedad produce debilidad progresiva de los músculos oculares y del músculo elevador del párpado superior, y los pacientes también pueden manifestar miopatía esquelética , fibras rojas irregulares y atrofia observada en la biopsia muscular, cataratas , pérdida de audición , neuropatía axonal sensorial, ataxia , depresión, hipogonadismo y parkinsonismo . Esta enfermedad multisistémica se ha vinculado a una mutación G451E que altera las subunidades gamma de la ADN polimerasa. [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]

En pacientes con hepatitis C crónica , se cree que aquellos portadores del alelo menor DDX5 o de los haplotipos DDX5-POLG2 tienen un mayor riesgo de fibrosis avanzada . Sin embargo, es importante señalar que se cree que aquellos portadores del alelo menor CPT1A tienen un riesgo menor. [ 11 ]

Interacciones

Se ha demostrado que POLG2 tiene 39 interacciones proteína-proteína binarias , incluidas 19 interacciones de co-complejo. POLG2 parece interactuar con POLG . [ 12 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000256525 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000020718 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Wang Y, Farr CL, Kaguni LS (mayo de 1997). "Subunidad accesoria de la ADN polimerasa mitocondrial de embriones de Drosophila. Clonación, análisis molecular y asociación en la enzima nativa" . The Journal of Biological Chemistry . 272 ​​(21): 13640– 6. doi : 10.1074/jbc.272.21.13640 . PMID 9153213 . 
  6. ↑ Lim SE, Longley MJ, Copeland WC (diciembre de 1999). "La subunidad accesoria p55 mitocondrial de la ADN polimerasa gamma humana mejora la unión al ADN, promueve la síntesis procesiva de ADN y confiere resistencia a la N-etilmaleimida" . The Journal of Biological Chemistry . 274 (53): 38197–203 . doi : 10.1074/jbc.274.53.38197 . PMID 10608893 . 
  7. 1 2 3 "Gen Entrez: polimerasa POLG2 (dirigida por ADN), gamma 2, subunidad accesoria" .Dominio públicoEste artículo incorpora texto de esta fuente, que es de dominio público .
  8. 1 2 3 4 "POLG2 - Subunidad gamma-2 de la ADN polimerasa, precursor mitocondrial - Homo sapiens (Humano) - Gen y proteína POLG2" . www.uniprot.org . Consultado el 31 de agosto de 2018 . Este artículo incorpora texto disponible bajo la licencia CC BY 4.0 .
  9. 1 2 3 4 " UniProt: la base de datos universal de conocimiento de proteínas" . Nucleic Acids Research . 45 (D1): D158– D169. Enero de 2017. doi : 10.1093/nar/gkw1099 . PMC 5210571. PMID 27899622 .  
  10. ↑ Longley MJ, Clark S, Yu Wai Man C, Hudson G, Durham SE, Taylor RW, Nightingale S, Turnbull DM, Copeland WC, Chinnery PF (junio de 2006). "La mutación POLG2 altera las subunidades gamma de la ADN polimerasa y causa oftalmoplejía externa progresiva" . American Journal of Human Genetics . 78 (6): 1026–34 . doi : 10.1086/504303 . PMC 1474082. PMID 16685652 .  
  11. ↑ Huang H, Shiffman ML, Cheung RC, Layden TJ, Friedman S, Abar OT, Yee L, Chokkalingam AP, Schrodi SJ, Chan J, Catanese JJ, Leong DU, Ross D, Hu X, Monto A, McAllister LB, Broder S, White T, Sninsky JJ, Wright TL (mayo de 2006). "Identificación de dos variantes genéticas asociadas con el riesgo de fibrosis avanzada en pacientes con hepatitis C crónica" . Gastroenterology . 130 (6): 1679–87 . doi : 10.1053/j.gastro.2006.02.032 . PMID 16697732 . 
  12. ↑ "Se encontraron 39 interacciones binarias para el término de búsqueda POLG2" . IntAct . EMBL-EBI . Consultado el 4 de septiembre de 2019 .

Lecturas adicionales

  • Michiels S, Danoy P, Dessen P, Bera A, Boulet T, Bouchardy C, Lathrop M, Sarasin A, Benhamou S (agosto de 2007). "Descubrimiento de polimorfismos en 62 genes de reparación del ADN y asociaciones de haplotipos con riesgos de cáncer de pulmón y de cabeza y cuello" . Carcinogenesis . 28 (8): 1731–9 . doi : 10.1093/carcin/bgm111 . PMID 17494052 . 
  • Huang H, Shiffman ML, Cheung RC, Layden TJ, Friedman S, Abar OT, Yee L, Chokkalingam AP, Schrodi SJ, Chan J, Catanese JJ, Leong DU, Ross D, Hu X, Monto A, McAllister LB, Broder S, White T, Sninsky JJ, Wright TL (mayo de 2006). "Identificación de dos variantes genéticas asociadas con el riesgo de fibrosis avanzada en pacientes con hepatitis C crónica" . Gastroenterology . 130 (6): 1679–87 . doi : 10.1053/j.gastro.2006.02.032 . PMID 16697732 . 
  • Longley MJ, Clark S, Yu Wai Man C, Hudson G, Durham SE, Taylor RW, Nightingale S, Turnbull DM, Copeland WC, Chinnery PF (junio de 2006). "La mutación de POLG2 altera las subunidades gamma de la ADN polimerasa y causa oftalmoplejía externa progresiva" . American Journal of Human Genetics . 78 (6): 1026–34 . doi : 10.1086/504303 . PMC 1474082. PMID 16685652 .  
  • Yakubovskaya E, Chen Z, Carrodeguas JA, Kisker C, Bogenhagen DF (enero de 2006). "La ADN polimerasa gamma mitocondrial humana funcional forma un heterotrímero" . The Journal of Biological Chemistry . 281 (1): 374–82 . doi : 10.1074/jbc.M509730200 . PMID 16263719 . 
  • Carrodeguas JA, Pinz KG, Bogenhagen DF (diciembre de 2002). "Propiedades de unión al ADN del pol gammaB humano" . La Revista de Química Biológica . 277 (51): 50008– 14. doi : 10.1074/jbc.M207030200 . PMID 12379656 . 
  • Johnson AA, Tsai Y, Graves SW, Johnson KA (febrero de 2000). "Holoenzima de la ADN polimerasa mitocondrial humana: reconstitución y caracterización". Biochemistry . 39 (7): 1702–8 . doi : 10.1021/bi992104w . PMID 10677218 . 
  • Carrodeguas JA, Bogenhagen DF (marzo de 2000). "Las secuencias de proteínas conservadas en las aminoacil-ARNt sintetasas procariotas son importantes para la actividad del factor de procesividad de la ADN polimerasa mitocondrial humana" . Nucleic Acids Research . 28 (5): 1237–44 . doi : 10.1093 / nar/28.5.1237 . PMC 102604. PMID 10666468 .  
  • Lim SE, Longley MJ, Copeland WC (diciembre de 1999). "La subunidad accesoria p55 mitocondrial de la ADN polimerasa gamma humana mejora la unión al ADN, promueve la síntesis procesiva de ADN y confiere resistencia a la N-etilmaleimida" . The Journal of Biological Chemistry . 274 (53): 38197–203 . doi : 10.1074/jbc.274.53.38197 . PMID 10608893 . 
  • Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q9UHN1 (subunidad gamma-2 de la ADN polimerasa humana, mitocondrial) en el PDBe-KB .
  • Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q9QZM2 (subunidad gamma-2 de la ADN polimerasa de ratón, mitocondrial) en el PDBe-KB .

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .