Articulo de referencia

complejo del poro nuclear

El complejo del poro nuclear ( NPC ) es un gran complejo proteico que da origen al poro nuclear . Un gran número de poros nucleares se encuentran distribuidos por toda la envolt...

El complejo del poro nuclear ( NPC ) es un gran complejo proteico que da origen al poro nuclear . Un gran número de poros nucleares se encuentran distribuidos por toda la envoltura nuclear que rodea el núcleo de la célula eucariota . Los poros permiten el transporte nuclear de macromoléculas entre el nucleoplasma del núcleo y el citoplasma de la célula . Las moléculas pequeñas pueden difundirse fácilmente a través de los poros. [ 1 ] El transporte nuclear incluye el transporte de ARN y proteínas ribosómicas desde el núcleo al citoplasma, y ​​el transporte de proteínas (como la ADN polimerasa y las laminas ), carbohidratos , moléculas de señalización y lípidos hacia el núcleo. Cada complejo del poro nuclear puede mediar activamente hasta 1000 translocaciones por segundo.

El complejo del poro nuclear está compuesto predominantemente por una familia de proteínas conocidas como nucleoporinas (Nups). Cada complejo de poro en el núcleo de la célula humana está compuesto por aproximadamente 1000 moléculas de proteína individuales, de un conjunto evolutivamente conservado de 35 nucleoporinas distintas. [ 2 ] Las secuencias conservadas que codifican las nucleoporinas regulan el transporte molecular a través del poro nuclear. [ 3 ] [ 4 ] El transporte mediado por nucleoporinas no implica un gasto energético directo, sino que depende de gradientes de concentración asociados con el ciclo RAN (ciclo de proteínas nucleares relacionado con Ras). En 2022, se dilucidó alrededor del 90 % de la estructura del NPC humano en una conformación abierta y cerrada, y se publicó en un número especial de Science , que apareció en la portada. [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] En 2024 se resolvió la estructura de la cesta nuclear , finalizando así la estructura del complejo del poro nuclear. [ 8 ]

Aproximadamente la mitad de las nucleoporinas comprenden dominios de proteínas solenoides , como solenoides alfa o pliegues de hélice beta , y ocasionalmente ambos como dominios estructurales separados . Por el contrario, las nucleoporinas restantes exhiben características de proteínas "nativamente desplegadas" o intrínsecamente desordenadas , caracterizadas por una alta flexibilidad y una falta de estructura terciaria ordenada . Estas proteínas desordenadas, denominadas nucleoporinas FG (FG-Nups), contienen múltiples repeticiones de fenilalanina - glicina ( repeticiones FG ) en sus secuencias de aminoácidos. [ 9 ] Las FG-Nups son uno de los tres tipos principales de nucleoporinas que se encuentran en el NPC. Los otros dos son las Nups transmembrana y las Nups de andamiaje. Las Nups transmembrana están formadas por hélices alfa transmembrana y desempeñan un papel vital en el anclaje del NPC a la envoltura nuclear. Los Nups de andamiaje están formados por pliegues de solenoide alfa y hélice beta, y crean el marco estructural de los NPC. [ 10 ]

El número de complejos de poro nuclear varía según el tipo de célula y las diferentes etapas del ciclo de vida celular, encontrándose aproximadamente 2000 complejos de poro nuclear (CPN) en el núcleo de una célula de vertebrado. [ 11 ] El complejo de poro nuclear humano es una estructura sustancial, con un peso molecular de 120 megadaltons (MDa). [ 12 ] Cada CPN comprende ocho subunidades proteicas que rodean el poro propiamente dicho, formando el anillo exterior. Además, estas subunidades proyectan una proteína en forma de radio sobre el canal del poro. La región central del poro puede presentar una estructura similar a un tapón; sin embargo, su naturaleza precisa sigue siendo desconocida, y aún no se ha determinado si representa un tapón real o simplemente una carga atrapada transitoriamente en tránsito.

Estructura

El complejo del poro nuclear (NPC) es una estructura celular crucial con un diámetro de aproximadamente 120 nanómetros en vertebrados. Su canal fusiona las membranas interna y externa de la envoltura nuclear y varía de 5,2 nanómetros en humanos a 10,7  nm en la rana Xenopus laevis , con una profundidad de aproximadamente 45  nm. [ 13 ] [ 14 ] Además, el ARNm , al ser monocatenario, tiene un grosor que oscila entre 0,5 y 1  nm. El NPC de los mamíferos tiene una masa molecular de aproximadamente124 MDa  , que comprende aproximadamente 30 componentes proteicos distintos, cada uno en múltiples copias, y alrededor de 800 nucleoporinas organizadas en subcomplejos NPC distintos. [ 15 ] Por el contrario, la levadura Saccharomyces cerevisiae posee una masa menor, estimada en solo 66 MDa. [ 16 ]

Transporte nuclear

El ciclo Ran-GTP, que impulsa la importación y exportación de ARN y proteínas a través del complejo proteico nuclear.
Microscopía de barrido e iluminación de poros nucleares, lámina nuclear y cromatina .

El complejo del poro nuclear (NPC) actúa como una puerta de entrada altamente regulada para el transporte de moléculas entre el núcleo y el citoplasma. [ 13 ] Este intrincado sistema permite el paso selectivo de moléculas, incluyendo proteínas, ARN y moléculas de señalización, asegurando así la función celular adecuada y la homeostasis. Las moléculas pequeñas, como proteínas, agua e iones, pueden difundirse a través de los NPC, pero las cargas (>40 kDa ), como el ARN y las proteínas más grandes, requieren la participación de receptores de transporte solubles. [ 17 ]

La familia más grande de receptores de transporte nuclear son las carioferinas, que incluyen importinas y exportinas . Estas constituyen una superfamilia que facilita la translocación de proteínas, ARN y partículas ribonucleares a través del complejo del poro nuclear (NPC) mediante un proceso dependiente de la hidrolasa Ran GTP. [ 18 ] Esta familia se subdivide a su vez en las subfamilias carioferina -α y carioferina -β. Otros receptores de transporte nuclear incluyen NTF2 y algunas proteínas similares a NTF2.

Se han propuesto tres modelos para explicar el mecanismo de translocación:

  • Gradientes de afinidad a lo largo del tapón central
  • Compuerta de afinidad browniana
  • Fase selectiva

Importación de proteínas

Las proteínas nucleares se sintetizan en el citoplasma y deben ser importadas al núcleo a través de los complejos de poro nuclear (NPC). La importación puede ser dirigida por diversas señales, de las cuales la señal de localización nuclear (NLS) es la mejor caracterizada. [ 19 ] Se conocen varias secuencias NLS, que generalmente contienen una secuencia conservada con residuos básicos como PKKKRKV. Cualquier material con una NLS será captado por las importinas hacia el núcleo.

La importación comienza con la unión de Importina-α a la secuencia NLS de las proteínas de carga, formando un complejo. Posteriormente, Importina-β se une a Importina-α, facilitando el transporte hacia el NPC. [ 20 ]

Cuando el complejo llega al NPC, se difunde a través del poro sin necesidad de energía adicional. Al entrar en el núcleo, RanGTP se une a Importina-β y la desplaza del complejo. Luego, la proteína de susceptibilidad a la apoptosis celular (CAS), una exportina que en el núcleo está unida a RanGTP, desplaza a Importina-α de la carga. La proteína NLS queda así libre en el nucleoplasma. El complejo Importina-β-RanGTP e Importina-α-CAS-RanGTP se difunde de vuelta al citoplasma, donde los GTP se hidrolizan a GDP, lo que provoca la liberación de Importina-β e Importina-α, que quedan disponibles para una nueva ronda de importación de proteínas NLS. [ 21 ]

Si bien la translocación a través del complejo del poro nuclear (NPC) no depende de energía, el ciclo de importación completo requiere la hidrólisis de dos moléculas de GTP, lo que lo convierte en un proceso de transporte activo. Este ciclo se impulsa mediante el gradiente nucleocitoplasmático de RanGTP. Dicho gradiente se origina por la localización nuclear exclusiva de las RanGEF, proteínas que intercambian GDP por GTP en las moléculas de Ran. Por lo tanto, existe una mayor concentración de RanGTP en el núcleo que en el citoplasma.

Exportación de proteínas

Además de la importación nuclear, ciertas moléculas y complejos macromoleculares, como las subunidades ribosómicas y los ARN mensajeros , requieren ser exportados del núcleo al citoplasma. Este proceso de exportación refleja el mecanismo de importación en complejidad e importancia.

En un escenario de exportación clásico, las proteínas con una secuencia de exportación nuclear (NES) forman un complejo heterotrimérico con una exportina y RanGTP dentro del núcleo. Un ejemplo de dicha exportina es CRM1. Este complejo posteriormente se transloca al citoplasma , donde ocurre la hidrólisis de GTP, liberando la proteína que contiene la NES. El complejo CRM1-RanGDP resultante regresa al núcleo, donde las RanGEF catalizan el intercambio de GDP por GTP en Ran, reponiendo la fuente de energía del sistema. Todo este proceso depende de la energía y consume una molécula de GTP. Cabe destacar que la actividad de exportación mediada por CRM1 puede ser inhibida por compuestos como la leptomicina B.

Exportación de ARN

Diferentes vías de exportación a través del complejo del poro nuclear (NPC) para diversas clases de ARN. La exportación de ARN está mediada por señales, con señales de exportación nuclear (NES) presentes en las proteínas de unión a ARN, excepto para el ARNt, que carece de un adaptador. Cabe destacar que todos los ARN virales y celulares ( ARNt , ARNr , ARNsn U , microARN ), excepto el ARNm, dependen de RanGTP. Los factores de exportación de ARNm conservados son necesarios para la exportación nuclear del ARNm. Estos factores son Mex67/Tap (subunidad grande) y Mtr2/p15 (subunidad pequeña).

En los eucariotas superiores, se cree que la exportación de ARNm depende del empalme. El empalme recluta el complejo proteico TREX a los mensajes empalmados, que actúa como adaptador para TAP, una proteína de unión a ARN de baja afinidad. Sin embargo, existen vías alternativas de exportación de ARNm que no dependen del empalme para mensajes especializados como las histonas. Trabajos recientes también sugieren una interacción entre la exportación dependiente del empalme y una de estas vías alternativas de exportación de ARNm para los transcritos secretores y mitocondriales. [ 22 ]

Asamblea de la PNJ

Núcleo celular que contiene poros nucleares.

Dado que el complejo del poro nuclear (NPC) regula el acceso al genoma, su presencia en cantidades significativas durante las etapas del ciclo celular caracterizadas por altas tasas de transcripción es crucial. Por ejemplo, las células de mamíferos y levaduras en división duplican la cantidad de NPC en el núcleo entre las fases G1 y G2. De manera similar, los ovocitos acumulan abundantes NPC en previsión de la rápida actividad mitótica durante el desarrollo temprano. Además, las células en interfase deben mantener la generación de NPC para sostener niveles consistentes, ya que algunas pueden sufrir daños. Asimismo, ciertas células pueden incluso aumentar el número de NPC debido a una mayor demanda transcripcional. [ 23 ]

Teorías del ensamblaje

Existen varias teorías sobre cómo se ensamblan los complejos de poro nuclear (NPC). Dado que la inmunodepleción de ciertos complejos proteicos, como el complejo Nup 107-160, da lugar a la formación de núcleos sin poro, parece probable que los complejos Nup participen en la fusión de la membrana externa de la envoltura nuclear con la interna, y no que la fusión de la membrana inicie la formación del poro. Existen varias maneras en que esto podría conducir a la formación completa del NPC.

  • Una posibilidad es que, como complejo proteico, se una a la cromatina . Posteriormente, se inserta en la doble membrana cerca de la cromatina. Esto, a su vez, provoca la fusión de dicha membrana. Alrededor de este complejo proteico, otros se unen finalmente formando el complejo del poro nuclear (NPC). Este método es posible durante todas las fases de la mitosis, ya que la doble membrana está presente alrededor de la cromatina antes de que el complejo de proteínas de fusión de membrana pueda insertarse. Las células posmitóticas podrían formar primero una membrana, en la que posteriormente se insertarían poros.
  • Otro modelo para la formación del NPC es la producción de un preporo como punto de partida en lugar de un único complejo proteico. Este preporo se formaría cuando varios complejos Nup se unen a la cromatina. Esto daría lugar a la formación de una doble membrana a su alrededor durante el reensamblaje mitótico. Se han observado posibles estructuras de preporo en la cromatina antes de la formación de la envoltura nuclear (EN) mediante microscopía electrónica. [ 24 ] Durante la interfase del ciclo celular, la formación del preporo ocurriría dentro del núcleo, siendo cada componente transportado a través de los NPC existentes. Estas Nups se unirían a una importina, una vez formadas, impidiendo el ensamblaje de un preporo en el citoplasma. Una vez transportadas al núcleo, Ran GTP se uniría a la importina y provocaría la liberación de la carga. Esta Nup quedaría libre para formar un preporo. Se ha demostrado que la unión de las importinas transporta al núcleo las nucleoporinas Nup 107 y Nup 153. [ 23 ] El ensamblaje del NPC es un proceso muy rápido, pero ocurren estados intermedios definidos, lo que lleva a la idea de que este ensamblaje ocurre de manera gradual. [ 25 ]

Desmontaje

Durante la mitosis, el NPC parece desensamblarse por etapas, excepto en eucariotas inferiores como la levadura, donde el desensamblaje del NPC no ocurre durante la mitosis. [ 26 ] Las nucleoporinas periféricas , como Nup153, Nup98 y Nup214, se disocian del NPC. El resto, que puede considerarse una proteína andamiaje , permanece estable como complejos de anillos cilíndricos dentro de la envoltura nuclear. Se cree que este desensamblaje de los grupos periféricos del NPC está impulsado principalmente por fosfato, ya que varias de estas nucleoporinas se fosforilan durante las etapas de la mitosis. Sin embargo, se desconoce la enzima involucrada en la fosforilación in vivo. En los metazoos (que experimentan mitosis abierta), la NE se degrada rápidamente después de la pérdida de las Nups periféricas. La razón de esto puede deberse al cambio en la arquitectura del NPC. Este cambio puede hacer que el NPC sea más permeable a las enzimas involucradas en la degradación de la NE, como la tubulina citoplasmática, además de permitir la entrada de proteínas reguladoras mitóticas clave. En organismos que experimentan una mitosis semiabierta, como el hongo filamentoso Aspergillus nidulans , 14 de las 30 nucleoporinas se desensamblan de la estructura central del andamiaje, impulsadas por la activación de las quinasas NIMA y Cdk1 que fosforilan las nucleoporinas y abren los poros nucleares [ 27 ] [ 28 ] , ensanchando así el poro nuclear y permitiendo la entrada de reguladores mitóticos. [ 29 ]

Preservación de la integridad

En los hongos que experimentan mitosis cerrada , donde el núcleo permanece intacto, los cambios en la barrera de permeabilidad de la envoltura nuclear se atribuyen a alteraciones dentro del complejo del poro nuclear (CPN). Estos cambios facilitan la entrada de reguladores mitóticos al núcleo. Estudios en Aspergillys nidulans sugieren que la composición del CPN parece estar afectada por la quinasa mitótica NIMA. NIMA potencialmente fosforila las nucleoporinas Nup98 y Gle2/Rae1, lo que conduce a la remodelación del CPN. [ 30 ] Esta remodelación permite la entrada nuclear del complejo proteico cdc2/ciclina B y varias otras proteínas, incluida la tubulina soluble. El andamiaje del CPN permanece intacto durante toda la mitosis cerrada. Esto parece preservar la integridad de la envoltura nuclear. [ 31 ]

Referencias

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