miExperimento

myExperiment es un sitio web social para investigadores que comparten objetos de investigación, como flujos de trabajo científicos . ^{[ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]}

El sitio web myExperiment se lanzó en noviembre de 2007 y contiene una importante colección de flujos de trabajo científicos para diversos sistemas, principalmente Taverna , pero también otras herramientas como Bioclipse . myExperiment cuenta con una API REST y se basa en un código fuente abierto Ruby on Rails . Admite datos enlazados y dispone de un punto final SPARQL , con un tutorial interactivo. ^{[ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]}

El proyecto myExperiment fue dirigido inicialmente por David De Roure en la Universidad de Southampton (posteriormente Universidad de Oxford ) y formó parte de las actividades del consorcio myGrid, liderado por Carole Goble de la Universidad de Manchester (Reino Unido), y del consorcio regional e-Research South UK, liderado por el Centro de Investigación Electrónica de Oxford . Fue financiado originalmente por Jisc en el marco del programa Entorno Virtual de Investigación y por la Iniciativa de Computación Técnica de Microsoft .

Si bien la idea inicial de myExperiment pudo haber sido capturar experimentos computacionales como ejecuciones de flujos de trabajo registrados (enviados a una API de ejecución de flujos de trabajo configurada), en realidad la mayoría de los usuarios de myExperiment solo compartieron definiciones de flujos de trabajo, posiblemente con archivos de ejemplo.

La ontología myExperiment ^{[ 10 ]} incluía detalles sobre redes sociales, atribuciones, experimentos y estructuras de flujo de trabajo. Este trabajo fue fundamental para la creación del concepto de Objetos de Investigación [ ^{11 ] ,} un método de Datos Enlazados para la identificación, agregación e intercambio de información académica. En la ontología myExperiment, el Objeto de Investigación se representaba de forma general como un "paquete" de recursos relacionados y tipificados, incluidos los flujos de trabajo.

myExperiment fue mejorado posteriormente por el proyecto Workflows Forever (Wf4Ever) ^{[ 12 ]} que en 2011 tenía como objetivo proporcionar nuevas características para apoyar la preservación de objetos de investigación en conjunto con el marco de la biblioteca digital dLibra . ^{[ 13 ] [ 14 ]}

El desarrollo conjunto de Wf4Ever con el sistema de flujo de trabajo Taverna (mantenido en ese momento por myGrid ) condujo a la creación de las ontologías del Modelo de Objeto de Investigación. ^{[ 15 ]} El modelo RO utiliza muchas de las ideas conceptuales de la ontología myExperiment, pero con una base de una agregación OAI-ORE como objeto digital central, y con un objetivo principal de reproducibilidad e integración con el modelo de procedencia PROV del W3C , el modelo RO de reemplazo era independiente de la red social en un registro de flujo de trabajo.

En 2019, el desarrollo posterior de Research Object Crate (RO-Crate) reemplazó el modelo RO con un perfil de schema.org serializado en JSON-LD , de propósito general para resultados académicos. Este enfoque sin ontología era más adecuado para el empaquetado en un archivo ZIP y tenía como objetivo ser más accesible para desarrolladores sin experiencia en Linked Data. ^{[ 16 ]}

Desde 2024, myexperiment.org está alojado en la Universidad de Manchester , en el Laboratorio de eCiencia de la profesora Carole Goble , como un servicio heredado. ^{[ 17 ]}

El grupo de investigación lanzó posteriormente ^{[ 18 ] [ 19 ]} el reemplazo de myExperiment, el registro de flujos de trabajo workflowhub.eu , ^{[ 20 ]} que utiliza un perfil de RO-Crate para publicar flujos de trabajo junto con su contexto y dependencias. Sin embargo, a diferencia de myExperiment, WorkflowHub no se centra en los aspectos de la red social (más allá de la organización institucional/de proyectos de las entradas) y no intenta capturar ningún experimento .