Articulo de referencia

MBD4

La proteína 4 del dominio de unión a metil-CpG es una proteína que en humanos está codificada por el gen MBD4 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Estructura La proteína MBD4 humana tiene 580 am...

La proteína 4 del dominio de unión a metil-CpG es una proteína que en humanos está codificada por el gen MBD4 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

Estructura

La proteína MBD4 humana tiene 580 aminoácidos con un dominio de unión a metil-CpG en los aminoácidos 82–147 y un dominio de ADN glicosilasa C-terminal en los aminoácidos 426–580. [ 8 ] Estos dominios están separados por una región intermedia que interactúa con UHRF1 , una ubiquitina ligasa E3 , y USP7 , una enzima desubiquitinante. [ 9 ]

Función

La metilación del ADN es la principal modificación de los genomas eucariotas y desempeña un papel esencial en el desarrollo de los mamíferos. Las proteínas humanas MECP2 , MBD1 , MBD2 , MBD3 y MBD4 (este gen) constituyen una familia de proteínas nucleares relacionadas por la presencia en cada una de ellas de un dominio de unión a metil-CpG (MBD). Cada una de estas proteínas, con la excepción de MBD3, es capaz de unirse específicamente al ADN metilado. MBD4 podría funcionar mediando las consecuencias biológicas de la señal de metilación. Además, MBD4 presenta similitud en la secuencia proteica con enzimas de reparación del ADN bacteriano y, por lo tanto, podría tener alguna función en la reparación del ADN . Asimismo, se han detectado mutaciones en el gen MBD4 en tumores con inestabilidad de microsatélites primaria (MSI), una forma de inestabilidad genómica asociada con una reparación defectuosa de errores de apareamiento del ADN , y el gen MBD4 cumple 4 de los 5 criterios de un gen diana MIS genuino. [ 7 ]

Bases desaminadas como objetivos

Las bases del ADN se degradan espontáneamente, y esta degradación incluye la desaminación hidrolítica de purinas y pirimidinas que contienen un grupo amino exocíclico (véase la imagen). La hipoxantina y la xantina se generan a una velocidad relativamente lenta por desaminación de adenina y guanina , respectivamente. Sin embargo, la desaminación de pirimidinas ocurre a una velocidad 50 veces mayor, aproximadamente 200-300 eventos por célula por día, [ 8 ] y es potencialmente altamente mutagénica. La desaminación de citosina (C) a uracilo (U) y de 5-metilcitosina (5mC) a timina (T) genera apareamientos erróneos G:U y G:T, respectivamente. Durante la replicación del ADN, estos apareamientos erróneos causan mutaciones de transición de C a T. Cabe destacar que, para la desaminación de 5mC, estas mutaciones surgen predominantemente en el contexto de sitios CpG. La tasa de desaminación de 5mC es aproximadamente tres veces mayor que la de C. La proteína MBD4 se une preferentemente a los sitios CpG completamente metilados y a sus derivados de desaminación, los pares de bases G:U y G:T. [ 8 ] MBD4, que se emplea en un paso inicial de la reparación por escisión de bases , cataliza específicamente la eliminación de T y U emparejadas con guanina (G) dentro de los sitios CpG. [ 10 ]

Importancia mutacional de los objetivos

Los desajustes G:U y G:T, durante la replicación del ADN, dan lugar a mutaciones de transición de C a T. [ 10 ] La U o T desajuste suele ser eliminada por MBD4 antes de la replicación, evitando así la mutación. Alternativamente, para los desajustes G:T, la T puede ser eliminada por la timina-ADN glicosilasa . Las mutaciones en el gen MBD4 (especialmente las expansiones/deleciones en las regiones de poliadenina del gen MBD4) aumentan el fenotipo de inestabilidad genómica de un subconjunto de tumores con defectos en la reparación de errores de apareamiento (MMR) en ratones, contribuyendo específicamente a un aumento de las transiciones de G:C a A:T. [ 11 ]

Aproximadamente un tercio de todas las mutaciones intragénicas de un solo par de bases en cánceres humanos ocurren en dinucleótidos CpG y son el resultado de transiciones de C a T o de G a A. [ 10 ] [ 12 ] Estas transiciones comprenden las mutaciones más frecuentes en el cáncer humano. Por ejemplo, casi el 50 % de las mutaciones somáticas del gen supresor de tumores p53 en el cáncer colorrectal son transiciones de G:C a A:T dentro de sitios CpG. [ 10 ]

Importancia clínica en el cáncer

Mutaciones de la línea germinal de MBD4

Se han identificado mutaciones germinales mono- y bialélicas de MBD4 en leucemias mieloides agudas , melanomas uveales y glioblastomas . [ 13 ] [ 14 ] y se ha demostrado que las mutaciones germinales monoalélicas de MBD4 predisponen a los melanomas uveales. [ 15 ] Estos casos presentaron una inactivación del segundo alelo de MBD4 en el tumor y se asociaron con una carga mutacional posterior muy alta en dinucleótidos CpG. Se encontró una deleción monoalélica de MBD4 entre árabes cristianos israelíes. Esta mutación heterocigota aumentó la tasa de mutación somática en las células sanguíneas entre los portadores. [ 16 ]

Mutaciones somáticas de MBD4

La mutación de MBD4 ocurre en aproximadamente el 4% de los cánceres colorrectales. [ 11 ] Las mutaciones de MBD4 también ocurren en muestras tumorales de melanoma, cáncer de ovario, pulmón, esófago y próstata con frecuencias entre el 0,5% y el 8%. [ 11 ]

MBD4 tiene una relación especial con la reparación de errores de emparejamiento del ADN (MMR). La proteína MBD4 se une fuertemente a la proteína MMR MLH1 . [ 6 ] Una deficiencia mutacional en MBD4 causa una regulación negativa, a nivel proteico, de las proteínas MMR Mlh1 , Msh2 , Pms2 y Msh6 en 5,8, 5,6, 2,6 y 2,7 ​​veces, respectivamente. [ 17 ] En cánceres colorrectales con mutaciones en genes MMR, se encontró la coexistencia de mutaciones de MBD4 en el 27% de los cánceres. [ 11 ]

Silenciamiento epigenético

La expresión del ARNm de MBD4 se reduce en las neoplasias colorrectales debido a la metilación de la región promotora de MBD4 . [ 18 ] La mayoría de los campos histológicamente normales que rodean los crecimientos neoplásicos también muestran una expresión reducida del ARNm de MBD4 (un defecto de campo ) en comparación con el tejido histológicamente normal de individuos que nunca han tenido una neoplasia de colon. Esto indica que una deficiencia epigenética en la expresión de MBD4 es un evento temprano frecuente en la tumorigénesis colorrectal.

Si bien otros genes de reparación del ADN, como MGMT y MLH1 , se evalúan con frecuencia para detectar la represión epigenética en muchos tipos de cáncer, la deficiencia epigenética de MBD4 no suele evaluarse, pero podría ser importante también en dichos cánceres.

Respuesta a los inhibidores de puntos de control

Se demostró que el perfil hipermutado asociado a MBD4 estaba relacionado con la regresión tumoral cuando un paciente con melanoma uveal fue tratado con un inhibidor de puntos de control, lo que convierte a estas mutaciones en posibles biomarcadores para el tratamiento del cáncer. [ 14 ]

Interacciones

Se ha demostrado que MBD4 interactúa con MLH1 [ 6 ] y FADD . [ 19 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000129071 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000030322 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. Hendrich B, Bird A (noviembre de 1998). "Identificación y caracterización de una familia de proteínas de unión a metil-CpG de mamíferos" . Biología molecular y celular . 18 (11): 6538– 6547. doi : 10.1128/mcb.18.11.6538 . PMC 109239. PMID 9774669 .  
  6. 1 2 3 Bellacosa A, Cicchillitti L, Schepis F, Riccio A, Yeung AT, Matsumoto Y, et al. (mayo de 1999). "MED1, una nueva endonucleasa humana de unión a metil-CpG, interactúa con la proteína de reparación de errores de emparejamiento del ADN MLH1" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 96 (7): 3969– 3974. Bibcode : 1999PNAS...96.3969B . doi : 10.1073/pnas.96.7.3969 . PMC 22404. PMID 10097147 .   
  7. 1 2 "Entrez Gene: MBD4 proteína 4 del dominio de unión a metil-CpG" .
  8. 1 2 3 Bellacosa A, Drohat AC (agosto de 2015). "Función de la reparación por escisión de bases en el mantenimiento de la integridad genética y epigenética de los sitios CpG" . Reparación del ADN . 32. Amst: 33–42 . doi : 10.1016/j.dnarep.2015.04.011 . PMC 4903958. PMID 26021671 .  
  9. Meng H, Harrison DJ, Meehan RR (marzo de 2015). "MBD4 interactúa con USP7 y la recluta a focos heterocromáticos" . Journal of Cellular Biochemistry . 116 (3): 476– 485. doi : 10.1002/jcb.25001 . PMC 4964934. PMID 25358258 .  
  10. 1 2 3 4 Sjolund AB, Senejani AG, Sweasy JB (2013). "MBD4 y TDG: glicosilasas de ADN multifacéticas con funciones biológicas cada vez más amplias" . Mutation Research . 743–744 : 12–25 . doi : 10.1016/j.mrfmmm.2012.11.001 . PMC 3661743. PMID 23195996 .  
  11. 1 2 3 4 Tricarico R, Cortellino S, Riccio A, Jagmohan-Changur S, Van der Klift H, Wijnen J, et al. (octubre de 2015). "Participación de la inactivación de MBD4 en la tumorigénesis deficiente en reparación de desajustes" . Oncoobjetivo . 6 (40): 42892– 42904. doi : 10.18632/oncotarget.5740 . PMC 4767479 . PMID 26503472 .   
  12. Cooper DN, Youssoufian H (febrero de 1988). "El dinucleótido CpG y la enfermedad genética humana". Human Genetics . 78 (2): 151– 155. doi : 10.1007/bf00278187 . PMID 3338800. S2CID 41948691 .  
  13. Sanders MA, Chew E, Flensburg C, Zeilemaker A, Miller SE, Al Hinai AS, et al. (febrero de 2020). "Análisis pancáncer de genomas completos" . Nature . 578 (7793): 82–93 . bioRxiv 10.1101/208330 . doi : 10.1038/ s41586-020-1969-6 . PMC 7025898. PMID 32025007 .    
  14. 1 2 Rodrigues M, Mobuchon L, Houy A, Fiévet A, Gardrat S, Barnhill RL, et al. (mayo de 2018). "Respuesta atípica al anti-PD1 en el melanoma uveal revela mutaciones germinales de MBD4 en tumores hipermutados" . Nature Communications . 9 (1) 1866. Bibcode : 2018NatCo...9.1866R . doi : 10.1038/s41467-018-04322-5 . PMC 5951831. PMID 29760383 .   
  15. ^ Derrien AC, Rodrigues M, Eeckhoutte A, Dayot S, Houy A, Mobuchon L, et al. (abril de 2020). "Mutaciones de la línea germinal MBD4 y predisposición al melanoma uveal" . Revista del Instituto Nacional del Cáncer . 112 (1): 80– 87. doi : 10.1093/jnci/djaa047 . PMC 7781447 . PMID 32239153 .   
  16. Dadi G, Rosen S, Naor H, Hellou E, Chapal-Ilani N, Bacharach T, et al. (marzo de 2026). "Una mutación heterocigota fundadora en la proteína 4 del dominio de unión a metil-CpG (MBD4) prevalente entre los árabes cristianos israelíes predispone a una mayor mutagénesis" . Haematologica . 111 ( 3): 1034– 1038. doi : 10.3324/haematol.2025.287690 . PMC 12951175. PMID 40905073 .   
  17. Cortellino S, Turner D, Masciullo V, Schepis F, Albino D, Daniel R, et al. (diciembre de 2003). "La enzima de reparación por escisión de bases MED1 media la respuesta al daño del ADN a los fármacos antitumorales y está asociada con la integridad del sistema de reparación de errores de emparejamiento" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 100 (25): 15071– 15076. doi : 10.1073/pnas.2334585100 . PMC 299910. PMID 14614141 .   
  18. Howard JH, Frolov A, Tzeng CW, Stewart A, Midzak A, Majmundar A, et al. (enero de 2009). " Regulación epigenética negativa del gen de reparación del ADN MED1/MBD4 en el cáncer colorrectal y de ovario" . Cancer Biology & Therapy . 8 (1): 94– 100. doi : 10.4161/cbt.8.1.7469 . PMC 2683899. PMID 19127118 .   
  19. Screaton RA, Kiessling S, Sansom OJ, Millar CB, Maddison K, Bird A, et al. (abril de 2003). "La proteína del dominio de muerte asociada a Fas interactúa con la proteína 4 del dominio de unión a metil-CpG: un vínculo potencial entre la vigilancia del genoma y la apoptosis" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 100 (9): 5211– 5216. Bibcode : 2003PNAS..100.5211S . doi : 10.1073/pnas.0431215100 . PMC 154324. PMID 12702765 .   

Lecturas adicionales

  • Boland CR, Thibodeau SN, Hamilton SR, Sidransky D, Eshleman JR, Burt RW, et  al. (1998). "Taller del Instituto Nacional del Cáncer sobre inestabilidad de microsatélites para la detección del cáncer y la predisposición familiar: desarrollo de criterios internacionales para la determinación de la inestabilidad de microsatélites en el cáncer colorrectal". Cancer Research . 58 (22): 5248– 5257. PMID 9823339 . 
  • Hendrich B, Abbott C, McQueen H, Chambers D, Cross S, Bird A (1999). "Estructura genómica y mapeo cromosómico de los genes Mbd1, Mbd2, Mbd3 y Mbd4 murinos y humanos". Genoma de mamíferos . 10 (9): 906– 912. doi : 10.1007/s003359901112 . PMID 10441743. S2CID 819148 .  
  • Hendrich B, Hardeland U, Ng HH, Jiricny J, Bird A (1999). "La timina glicosilasa MBD4 puede unirse al producto de la desaminación en sitios CpG metilados". Nature . 401 (6750): 301– 304. Bibcode : 1999Natur.401..301H . doi : 10.1038/45843 . PMID 10499592 . S2CID 4413207 .  
  • Riccio A, Aaltonen LA, Godwin AK, Loukola A, Percesepe A, Salovaara R, et  al. (1999). "El gen de reparación del ADN MBD4 (MED1) está mutado en carcinomas humanos con inestabilidad de microsatélites". Genética de la Naturaleza . 23 (3): 266– 268. doi : 10.1038/15443 . PMID 10545939 . S2CID 38109803 .  
  • Petronzelli F, Riccio A, Markham GD, Seeholzer SH, Stoerker J, Genuardi M, et  al. (2000). "Cinética bifásica de la proteína de reparación del ADN humano MED1 (MBD4), una N-glicosilasa de ADN específica para desajustes" . The Journal of Biological Chemistry . 275 (42): 32422– 32429. doi : 10.1074/jbc.M004535200 . PMID 10930409 . 
  • Petronzelli F, Riccio A, Markham GD, Seeholzer SH, Genuardi M, Karbowski M, et  al. (2000). "Investigación del espectro de sustratos de la N-glicosilasa de ADN específica de desajustes humanos MED1 (MBD4): papel fundamental del dominio catalítico". Journal of Cellular Physiology . 185 (3): 473– 480. doi : 10.1002/1097-4652(200012)185:3 < 473::AID-JCP19 > 3.0.CO ; 2-# . PMID 11056019 . S2CID 196587071 .  
  • Schlegel J, Güneysu S, Mennel HD (2002). "Expresión de los genes de las proteínas del dominio de unión a metilo en gliomas humanos". Oncology Reports . 9 (2): 393– 395. doi : 10.3892/or.9.2.393 . PMID 11836615 . 
  • Jost JP, Thiry S, Siegmann M (2002). "El receptor de estradiol potencia, in vitro, la actividad de la 5-metilcitosina ADN glicosilasa" . FEBS Letters . 527 ( 1–3 ): 63–66 . doi : 10.1016/S0014-5793(02)03166-6 . PMID 12220634. S2CID 40374373 .  
  • Yamada T, Koyama T, Ohwada S, Tago K, Sakamoto I, Yoshimura S, et  al. (2002). "Mutaciones con cambio de marco de lectura en el gen MBD4/MED1 en cáncer gástrico primario con inestabilidad de microsatélites de alta frecuencia". Cancer Letters . 181 (1): 115– 120. doi : 10.1016/S0304-3835(02)00043-5 . PMID 12430186 . 
  • Evertson S, Wallin A, Arbman G, Rütten S, Emterling A, Zhang H, et  al. (2003). "Inestabilidad de microsatélites y mutación de MBD4 en cáncer colorrectal no seleccionado". Anticancer Research . 23 (4): 3569– 3574. PMID 12926109 . 
  • Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (2004). "Análisis de un sistema de doble híbrido de levadura de alto rendimiento y su uso para predecir la función de las proteínas intracelulares codificadas dentro de la región MHC clase III humana". Genomics . 83 (1): 153– 167. doi : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . PMID 14667819 . 
  • Kondo E, Gu Z, Horii A, Fukushige S (2005). "La timidina ADN glicosilasa MBD4 reprime la transcripción y está asociada con los genes p16INK4a y hMLH1 metilados" . Biología molecular y celular . 25 (11): 4388– 4396. doi : 10.1128/MCB.25.11.4388-4396.2005 . PMC 1140624. PMID 15899845 .  
  • Zhang X, Krutchinsky A, Fukuda A, Chen W, Yamamura S, Chait BT, et  al. (2005). "MED1/TRAP220 existe predominantemente en una subpoblación TRAP/Mediador enriquecida en ARN polimerasa II y es necesaria para la transcripción mediada por ER" . Molecular Cell . 19 (1): 89– 100. doi : 10.1016/j.molcel.2005.05.015 . PMID 15989967 . 
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