Hispanopedia Wiki
Articulo de referencia

Lista de plastomas secuenciados

Mapa genético del plastoma de 156 kb de Nicotiana tabacum Mapa del genoma del plastidio de 154 kb de una planta modelo con flores ( Arabidopsis thaliana : Brassicaceae) El mapa ...

Hispanopedia WikiContenido en espanolLectura gratuita
Mapa genético del plastoma de 156 kb de Nicotiana tabacum
Mapa del genoma del plastidio de 154 kb de una planta modelo con flores ( Arabidopsis thaliana : Brassicaceae)
El mapa del plastoma altamente reducido, de 27 kb, del parásito Hydnora visseri.

Un plastoma es el genoma de un plastidio , un tipo de orgánulo presente en plantas y en diversos protistas . El número de secuencias genómicas de plastidios conocidas creció rápidamente en la primera década del siglo XXI. Por ejemplo, se secuenciaron 25 genomas de cloroplastos para un estudio filogenético molecular . [ 1 ]

Las plantas con flores están especialmente bien representadas en los genomas completos de cloroplastos. A enero de 2017, todos sus órdenes están representados excepto Commelinales , Picramniales , Huerteales , Escalloniales , Bruniales y Paracryphiales .

El NCBI mantiene una compilación de la mayoría de los genomas de plastidios completos en un repositorio público. [ 2 ]

Plantas

Briofitas sl

Helechos y licófitas

gimnospermas

plantas con flores

Se espera que esta tabla ordenable recopile genomas completos de plastidios que representen la mayor variedad de tamaños, número de genes y familias de angiospermas.

Algas verdes

Algas rojas

Glaucofitas

Metaalgas y apicomplejos

Las metaalgas son organismos con orgánulos fotosintéticos de origen endosimbiótico secundario o terciario, y sus parientes cercanos no fotosintéticos que poseen plastidios. Los apicomplejos son un grupo de cromalveoados secundariamente no fotosintéticos que conservan un orgánulo plastídico reducido.

cromalveolados fotosintéticos

Los genomas de los plastidios de los dinoflagelados no están organizados en una sola molécula de ADN circular como otros genomas de plastidios, sino en una serie de minicírculos.

Cloraraquniofitas

Euglenofitas

Apicomplejos

genomas de nucleomorfos

En algunos organismos fotosintéticos, esta capacidad se adquirió mediante simbiosis con un alga verde unicelular ( clorofita ) o un alga roja ( rodofita ). En algunos de estos casos, el cloroplasto de la antigua alga unicelular no solo conserva su propio genoma, sino también un remanente del alga. Cuando este retiene un núcleo y un genoma nuclear, se denomina nucleomorfo .

Genomas de Cyanelle

El eucariota unicelular Paulinella chromatophora posee un orgánulo (la cianela ) que representa un caso independiente de adquisición de la fotosíntesis mediante endosimbiosis cianobacteriana . (Nota: el término "cianela" también se aplica a los plastidios de las glaucofitas).

Véase también

Referencias

  1. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 Moore MJ, Soltis PS, Bell CD, Burleigh JG, Soltis DE (marzo de 2010). "Análisis filogenético de 83 genes de plastidios resuelve aún más la diversificación temprana de las eudicotiledóneas" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 107 (10): 4623– 8. Bibcode : 2010PNAS..107.4623M . doi : 10.1073/pnas.0907801107 . PMC 2842043. PMID 20176954 .  
  2. ↑ "Índice de /refseq/release/plastid" . ftp.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 8 de enero de 2017 .
  3. ↑ Wickett NJ, Zhang Y, Hansen SK, Roper JM, Kuehl JV, Plock SA, Wolf PG, DePamphilis CW, Boore JL, Goffinet B (febrero de 2008). "Las pérdidas de genes funcionales ocurren con una reducción mínima del tamaño en el genoma del plastidio de la hepática parásita Aneura mirabilis" . Biología Molecular y Evolución . 25 (2): 393–401 . doi : 10.1093/molbev/msm267 . PMID 18056074 . 
  4. ^ Evolución del genoma de plástidos de la hepática no fotosintética Aneura mirabilis (Malmb.) Wickett & Goffinet (Aneuraceae)
  5. ^ Kugita M, Kaneko A, Yamamoto Y, Takeya Y, Matsumoto T, Yoshinaga K (enero de 2003). "La secuencia completa de nucleótidos del genoma del cloroplasto del hornwort (Anthoceros formosae): información sobre las primeras plantas terrestres" . Investigación de ácidos nucleicos . 31 (2): 716– 21. doi : 10.1093/nar/gkg155 . PMC 140519 . PMID 12527781 .  
  6. ↑ K Ohyama, Fukuzawa, H., Kohchi, T., Shirai, H., Sano, T., Chang Z, Aota SI, Inokuchi H, Ozeki H (2003). "Organización del gen del cloroplasto deducida de la secuencia completa del ADN del cloroplasto de la hepática Marchantia polymorpha ". Nature . 322 (6079): 716– 721. Bibcode : 1986Natur.322..572O . doi : 10.1038/322572a0 . S2CID 4311952 . 
  7. ↑ Villarreal JC, Forrest LL, Wickett N, Goffinet B (marzo de 2013). "El genoma del plastidio del antoceronte Nothoceros aenigmaticus (Dendrocerotaceae): señal filogenética en la expansión de repeticiones invertidas, pseudogenización y ganancia de intrones". American Journal of Botany . 100 (3): 467–77 . doi : 10.3732/ajb.1200429 . PMID 23416362 . 
  8. ↑ Grosche C, Funk HT, Maier UG, Zauner S (2012). "El genoma del cloroplasto de Pellia endiviifolia: contenido genético, patrón de edición de ARN y origen de la edición del cloroplasto" . Genome Biology and Evolution . 4 (12): 1349– 57. doi : 10.1093 / gbe/evs114 . PMC 3542565. PMID 23221608 .  
  9. ↑ Sugiura C, Kobayashi Y, Aoki S, Sugita C, Sugita M (septiembre de 2003). "Secuencia completa del ADN del cloroplasto del musgo Physcomitrella patens: evidencia de la pérdida y reubicación de rpoA del cloroplasto al núcleo" . Nucleic Acids Research . 31 (18): 5324–31 . doi : 10.1093/nar/gkg726 . PMC 203311. PMID 12954768 .  
  10. ↑ Laura L. Forrest; Norman J. Wickett, Cymon J. Cox y Bernard Goffinet (2011). "La secuenciación profunda de Ptilidium (Ptilidiaceae) sugiere una estasis evolutiva en la estructura del genoma del plastidio de las hepáticas" (PDF) . Plant Ecology and Evolution . 144 (1): 29– 43. doi : 10.5091/plecevo.2011.535 . hdl : 10400.1/5518 .
  11. ↑ Oliver MJ, Murdock AG, Mishler BD, Kuehl JV, Boore JL, Mandoli DF, Everett KD, Wolf PG, Duffy AM, Karol KG (febrero de 2010). "Secuencia del genoma del cloroplasto del musgo Tortula ruralis: contenido genético, polimorfismo y disposición estructural en relación con otros genomas de cloroplastos de plantas verdes" . BMC Genomics . 11 : 143. doi : 10.1186/1471-2164-11-143 . PMC 2841679. PMID 20187961 .  
  12. ↑ Wolf PG, Rowe CA, Sinclair RB, Hasebe M (abril de 2003). "Secuencia completa de nucleótidos del genoma del cloroplasto de un helecho leptosporangiado, Adiantum capillus-veneris L" . DNA Research . 10 (2): 59– 65. doi : 10.1093/dnares/10.2.59 . PMID 12755170 . 
  13. ↑ Gao L, Yi X, Yang YX, Su YJ, Wang T (junio de 2009). "Secuencia completa del genoma del cloroplasto de un helecho arborescente Alsophila spinulosa: perspectivas sobre los cambios evolutivos en los genomas de cloroplastos de helechos" . BMC Evolutionary Biology . 9 (1): 130. Bibcode : 2009BMCEE...9..130G . doi : 10.1186/1471-2148-9-130 . PMC 2706227. PMID 19519899 .  
  14. ^ Roper JM, Hansen SK, Wolf PG, Karol KG, Mandoli DF, Everett KD, Kuehl J, Boore JL (2007). "La secuencia completa del genoma del plastidio de Angiopteris evecta (G. Forst.) Hoffm. (Marattiaceae)" . Revista americana de helechos . 97 (2): 95– 106. doi : 10.1640/0002-8444(2007)97 [ 95:TCPGSO ] 2.0.CO ; 2 .
  15. ^ Wolf PG, Karol KG, Mandoli DF, Kuehl J, Arumuganathan K, Ellis MW, Mishler BD, Kelch DG, Olmstead RG, Boore JL (mayo de 2005). "La primera secuencia completa del genoma del cloroplasto de un licófito, Huperzia lucidula (Lycopodiaceae)" . Gen.​ 350 (2): 117– 28. doi : 10.1016/j.gene.2005.01.018 . PMID 15788152 . 
  16. ↑ Wakasugi, T (1998). "Secuencia completa de nucleótidos del genoma del plastidio de un helecho, Psilotum nudum " . Endocytobiology and Cell Research . 13 (Suplemento): 147.Consulte los enlaces externos a continuación.
  17. ↑ Tsuji S, Ueda K, Nishiyama T, Hasebe M, Yoshikawa S, Konagaya A, Nishiuchi T, Yamaguchi K (marzo de 2007). "El genoma del cloroplasto de una licófita (microfilófita), Selaginella uncinata, tiene una inversión única, transposiciones y muchas pérdidas de genes". Journal of Plant Research . 120 (2): 281– 90. Bibcode : 2007JPlR..120..281T . doi : 10.1007/s10265-006-0055-y . PMID 17297557 . S2CID 7691300 .  
  18. ↑ Hirao T, Watanabe A, Kurita M, Kondo T, Takata K (junio de 2008). "Secuencia completa de nucleótidos del genoma del cloroplasto de Cryptomeria japonica D. Don. y genómica comparativa del cloroplasto: estructura genómica diversificada de especies coníferas" . BMC Plant Biology . 8 : 70. doi : 10.1186/1471-2229-8-70 . PMC 2443145. PMID 18570682 .  
  19. 1 2 3 4 5 6 Jansen RK, Cai Z, Raubeson LA, Daniell H, Depamphilis CW, Leebens-Mack J, Müller KF, Guisinger-Bellian M, Haberle RC, Hansen AK, Chumley TW, Lee SB, Peery R, ​​McNeal JR, Kuehl JV, Boore JL (diciembre de 2007). "Análisis de 81 genes de 64 genomas de plastidios resuelve relaciones en angiospermas e identifica patrones evolutivos a escala genómica" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 104 (49): 19369– 74. Bibcode : 2007PNAS..10419369J . doi : 10.1073/pnas.0709121104 . PMC 2148296 . PMID 18048330 .  
  20. ↑ Wu CS, Wang YN, Liu SM, Chaw SM (junio de 2007). "Genoma del cloroplasto (ADNcp) de Cycas taitungensis y 56 genes codificadores de proteínas cp de Gnetum parvifolium: perspectivas sobre la evolución del ADNcp y la filogenia de las plantas con semillas existentes" . Biología molecular y evolución . 24 (6): 1366–79 . doi : 10.1093/molbev/msm059 . PMID 17383970 . 
  21. 1 2 Leebens-Mack J, Raubeson LA, Cui L, Kuehl JV, Fourcade MH, Chumley TW, Boore JL, Jansen RK, depamphilis CW (octubre de 2005). "Identificación del nodo basal de las angiospermas en las filogenias del genoma del cloroplasto: muestreo para salir de la zona de Felsenstein" . Biología molecular y evolución . 22 (10): 1948–63 . doi : 10.1093/molbev/msi191 . PMID 15944438 . 
  22. ↑ Lin, Diana; Coombe, Lauren; Jackman, Shaun D.; Gagalova, Kristina K.; Warren, René L.; Hammond, S. Austin; McDonald, Helen; Kirk, Heather; Pandoh, Pawan; Zhao, Yongjun; Moore, Richard A. (2019-06-13). Stajich, Jason E. (ed.). "Secuencia completa del genoma del cloroplasto de un abeto de Engelmann (Picea engelmannii, genotipo Se404-851) del oeste de Canadá" . Microbiology Resource Announcements . 8 (24): e00382–19, /mra/8/24/MRA.00382–19.atom. doi : 10.1128/MRA.00382-19 . ISSN 2576-098X . PMC 6588038 . PMID 31196920 .   
  23. ↑ Jackman, Shaun D.; Warren, René L.; Gibb, Ewan A.; Vandervalk, Benjamin P.; Mohamadi, Hamid; Chu, Justin; Raymond, Anthony; Pleasance, Stephen; Coope, Robin; Wildung, Mark R.; Ritland, Carol E. (enero de 2016). "Genomas de orgánulos del abeto blanco (Picea glauca): ensamblaje y anotación" . Genome Biology and Evolution . 8 (1): 29– 41. doi : 10.1093/gbe / evv244 . ISSN 1759-6653 . PMC 4758241. PMID 26645680 .   
  24. ↑ Lin, Diana; Coombe, Lauren; Jackman, Shaun D.; Gagalova, Kristina K.; Warren, René L.; Hammond, S. Austin; Kirk, Heather; Pandoh, Pawan; Zhao, Yongjun; Moore, Richard A.; Mungall, Andrew J. (2019-06-06). Rokas, Antonis (ed.). "Secuencia completa del genoma del cloroplasto de un abeto blanco (Picea glauca, genotipo WS77111) del este de Canadá" . Microbiology Resource Announcements . 8 (23): e00381–19, /mra/8/23/MRA.00381–19.atom. doi : 10.1128/MRA.00381-19 . ISSN 2576-098X . PMC 6554609 . PMID 31171622 .   
  25. ↑ Coombe, Lauren; Warren, René L.; Jackman, Shaun D.; Yang, Chen; Vandervalk, Benjamin P.; Moore, Richard A.; Pleasance, Stephen; Coope, Robin J.; Bohlmann, Joerg; Holt, Robert A.; Jones, Steven JM (2016-09-15). Budak, Hikmet (ed.). "Ensamblaje del genoma completo del cloroplasto del abeto de Sitka utilizando datos de secuenciación GemCode de 10X Genomics" . PLOS ONE . 11 (9) e0163059. Bibcode : 2016PLoSO..1163059C . doi : 10.1371/journal.pone.0163059 . ISSN 1932-6203 . PMC 5025161 . PMID 27632164 .   
  26. ↑ Wakasugi T, Tsudzuki J, Ito S, Nakashima K, Tsudzuki T, Sugiura M (octubre de 1994). "Pérdida de todos los genes ndh determinada mediante la secuenciación del genoma completo del cloroplasto del pino negro Pinus thunbergii" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 91 (21): 9794–8 . Bibcode : 1994PNAS...91.9794W . doi : 10.1073/pnas.91.21.9794 . PMC 44903. PMID 7937893 .  
  27. ↑ McCoy SR, Kuehl JV, Boore JL, Raubeson LA (mayo de 2008). "La secuencia completa del genoma del plastidio de Welwitschia mirabilis: un plastoma inusualmente compacto con tasas de divergencia aceleradas" . BMC Evolutionary Biology . 8 (1): 130. Bibcode : 2008BMCEE...8..130M . doi : 10.1186/1471-2148-8-130 . PMC 2386820. PMID 18452621 .  
  28. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Guisinger et al, Implicaciones de la secuencia del genoma del plastidio de Typha (Typhaceae, Poales) para la comprensión de la evolución del genoma en Poaceae, J Mol Evol 70: 149–166 (2010)
  29. ↑ Yan M, Moore MJ, Meng A, Yao X, Wang H (2016-09-21). "La primera secuencia completa del plastoma de la familia basal de astéridas Styracaceae (Ericales) revela una gran inversión". Plant Systematics and Evolution . 303 (1): 61– 70. doi : 10.1007/s00606-016-1352-0 . ISSN 0378-2697 . S2CID 25942874 .  
  30. 1 2 Kim JS, Kim JH (2013-06-18). "Análisis comparativo del genoma y relación filogenética del orden Liliales: perspectivas a partir de las secuencias completas del genoma del plastidio de dos lirios (Lilium longiflorum y Alstroemeria aurea)" . PLOS ONE . 8 (6) e68180. Bibcode : 2013PLoSO...868180K . doi : 10.1371/journal.pone.0068180 . PMC 3688979. PMID 23950788 .  
  31. ↑ Goremykin VV, Hirsch-Ernst KI, Wolfl S, Hellwig FH (septiembre de 2003). "El análisis de la secuencia del genoma del cloroplasto de Amborella trichopoda sugiere que Amborella no es una angiosperma basal" . Biología Molecular y Evolución . 20 (9): 1499– 505. doi : 10.1093/molbev/msg159 . PMID 12832641 . 
  32. ↑ Sato S, Nakamura Y, Kaneko T, Asamizu E, Tabata S (octubre de 1999). "Estructura completa del genoma del cloroplasto de Arabidopsis thaliana" . DNA Research . 6 (5): 283– 90. doi : 10.1093/dnares/6.5.283 . PMID 10574454 . 
  33. ↑ Schmitz-Linneweber C, Regel R, Du TG, Hupfer H, Herrmann RG, Maier RM (septiembre de 2002). "El cromosoma plastídico de Atropa belladonna y su comparación con el de Nicotiana tabacum: el papel de la edición de ARN en la generación de divergencia en el proceso de especiación vegetal". Biología molecular y evolución . 19 (9): 1602–12 . doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a004222 . PMID 12200487. S2CID 1111063 .  
  34. ^ Hansen DR, Dastidar SG, Cai Z , Peñaflor C, Kuehl JV, Boore JL, Jansen RK (noviembre de 2007 ) . "Implicaciones filogenéticas y evolutivas de las secuencias completas del genoma del cloroplasto de cuatro angiospermas de divergencia temprana: Buxus (Buxaceae), Chloranthus (Chloranthaceae), Dioscorea (Dioscoreaceae) e Illicium (Schisandraceae)". Filogenética molecular y evolución . 45 (2): 547– 63. Código Bib : 2007MolPE..45..547H . doi : 10.1016/j.ympev.2007.06.004 . PMID 17644003 . 
  35. ↑ Goremykin V, Hirsch-Ernst KI, Wölfl S, Hellwig FH (2003). "El genoma del cloroplasto de la angiosperma basal Calycanthus fertilis : análisis estructurales y filogenéticos". Plant Systematics and Evolution . 242 ( 1–4 ): 119–135 . Bibcode : 2003PSyEv.242..119G . doi : 10.1007/s00606-003-0056-4 . S2CID 44377635 . 
  36. ↑ Yang Y, Wang M, Lu Z, Xie X, Feng S (2017-01-04). "Caracterización del genoma completo del cloroplasto de Carpinus tientaiensis ". Conservation Genetics Resources . 9 (2): 339– 341. Bibcode : 2017ConGR...9..339Y . doi : 10.1007/s12686-016-0668-y . ISSN 1877-7252 . S2CID 5184815 .  
  37. ↑ Bausher MG, Singh ND, Lee SB, Jansen RK, Daniell H (septiembre de 2006). "La secuencia completa del genoma del cloroplasto de Citrus sinensis (L.) Osbeck var 'Ridge Pineapple': organización y relaciones filogenéticas con otras angiospermas" . BMC Plant Biology . 6 : 21. doi : 10.1186/1471-2229-6-21 . PMC 1599732. PMID 17010212 .  
  38. ↑ Huang YY, Matzke AJ, Matzke M (2013-08-30). "Secuencia completa y análisis comparativo del genoma del cloroplasto de la palma de coco (Cocos nucifera)" . PLOS ONE . 8 (8) e74736. Bibcode : 2013PLoSO...874736H . doi : 10.1371/journal.pone.0074736 . PMC 3758300. PMID 24023703 .  
  39. ↑ Samson N, Bausher MG, Lee SB, Jansen RK, Daniell H (marzo de 2007). "La secuencia completa de nucleótidos del genoma del cloroplasto del café (Coffea arabica L.): organización e implicaciones para la biotecnología y las relaciones filogenéticas entre las angiospermas" . Plant Biotechnology Journal . 5 (2): 339– 53. doi : 10.1111/j.1467-7652.2007.00245.x . PMC 3473179. PMID 17309688 .  
  40. ↑ Leseberg CH, Duvall MR (octubre de 2009). "El genoma completo del cloroplasto de Coix lacryma-jobi y un análisis evolutivo molecular comparativo de los plastomas en cereales". Journal of Molecular Evolution . 69 (4): 311– 8. Bibcode : 2009JMolE..69..311L . doi : 10.1007/ s00239-009-9275-9 . PMID 19777151. S2CID 24418374 .  
  41. ↑ Wicke S, Müller KF, de Pamphilis CW, Quandt D, Wickett NJ, Zhang Y, Renner SS, Schneeweiss GM (octubre de 2013). " Mecanismos de reducción funcional y física del genoma en plantas parásitas fotosintéticas y no fotosintéticas de la familia de las orobancas" . The Plant Cell . 25 (10): 3711–25 . doi : 10.1105/tpc.113.113373 . PMC 3877813. PMID 24143802 .  
  42. ↑ Plader W, Yukawa Y, Sugiura M, Malepszy S (2007). "La estructura completa del genoma del cloroplasto del pepino (Cucumis sativus L.): su composición y análisis comparativo" . Cellular & Molecular Biology Letters . 12 (4): 584– 94. doi : 10.2478/s11658-007-0029-7 . PMC 6275786. PMID 17607527 .  
  43. 1 2 McNeal JR, Kuehl JV, Boore JL, de Pamphilis CW (octubre de 2007). "Las secuencias completas del genoma del plastidio sugieren una fuerte selección para la retención de genes fotosintéticos en el género de plantas parásitas Cuscuta" . BMC Plant Biology . 7 : 57. doi : 10.1186/1471-2229-7-57 . PMC 2216012. PMID 17956636 .  
  44. 1 2 Funk HT, Berg S, Krupinska K, Maier UG, Krause K (agosto de 2007). "Secuencias completas de ADN de los genomas de plastidios de dos especies de plantas con flores parásitas, Cuscuta reflexa y Cuscuta gronovii" . BMC Plant Biology . 7 : 45. doi : 10.1186/1471-2229-7-45 . PMC 2089061. PMID 17714582 .  
  45. ↑ Lin CS, Chen JJ, Huang YT, Chan MT, Daniell H, Chang WJ, Hsu CT, Liao DC, Wu FH, Lin SY, Liao CF, Deyholos MK, Wong GK, Albert VA, Chou ML, Chen CY, Shih MC (marzo de 2015). " La ubicación y translocación de los genes ndh de origen cloroplástico en la familia Orchidaceae" . Scientific Reports . 5 : 9040. Bibcode : 2015NatSR...5E9040L . doi : 10.1038/srep09040 . PMC 4356964. PMID 25761566 .  
  46. ^ Roquet C, Coissac É, Cruaud C, Boleda M, Boyer F, Alberti A, Gielly L, Taberlet P, Thuiller W, Van Es J, Lavergne S (julio de 2016). "Comprensión de la evolución de las plantas holoparásitas: el genoma plastidio completo del holoparásito Cytinus hipocistis (Cytinaceae)" . Anales de botánica . 118 (5): 885–896 . doi : 10.1093/aob/mcw135 . PMC 5055816 . PMID 27443299 .  
  47. ↑ Ruhlman T, Lee SB, Jansen RK, Hostetler JB, Tallon LJ, Town CD, Daniell H (agosto de 2006). " Secuencia completa del genoma del plastidio de Daucus carota: implicaciones para la biotecnología y la filogenia de las angiospermas" . BMC Genomics . 7 : 222. doi : 10.1186/1471-2164-7-222 . PMC 1579219. PMID 16945140 .  
  48. 1 2 3 Cai Z, Penaflor C, Kuehl JV, Leebens-Mack J, Carlson JE, dePamphilis CW, Boore JL, Jansen RK (octubre de 2006). "Secuencias completas del genoma del plastidio de Drimys, Liriodendron y Piper: implicaciones para las relaciones filogenéticas de los magnólidos" . BMC Evolutionary Biology . 6 (1): 77. Bibcode : 2006BMCEE...6...77C . doi : 10.1186/1471-2148-6-77 . PMC 1626487. PMID 17020608 .  
  49. ↑ Wolfe KH, Morden CW, Palmer JD (noviembre de 1992). "Función y evolución de un genoma plastidial mínimo de una planta parásita no fotosintética" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 89 (22): 10648– 52. Bibcode : 1992PNAS...8910648W . doi : 10.1073/pnas.89.22.10648 . PMC 50398. PMID 1332054 .  
  50. 1 2 Schelkunov MI, Shtratnikova VY, Nuraliev MS, Selosse MA, Penin AA, Logacheva MD (enero de 2015). "Explorando los límites para la reducción de genomas de plastidios: un estudio de caso de las orquídeas micoheterótrofas Epipogium aphyllum y Epipogium roseum" . Genome Biology and Evolution . 7 (4): 1179– 91. doi : 10.1093/gbe/evv019 . PMC 4419786. PMID 25635040 .  
  51. 1 2 Blazier JC, Jansen RK, Mower JP, Govindu M, Zhang J, Weng ML, Ruhlman TA (junio de 2016). " Presencia variable de la repetición invertida y estabilidad del plastoma en Erodium" . Annals of Botany . 117 (7): 1209–20 . doi : 10.1093/aob/mcw065 . PMC 4904181. PMID 27192713 .  
  52. 1 2 3 Guisinger MM, Kuehl JV, Boore JL, Jansen RK (enero de 2011). "Reconfiguración extrema de los genomas de plastidios en la familia de angiospermas Geraniaceae: reordenamientos, repeticiones y uso de codones" . Biología molecular y evolución . 28 (1): 583– 600. doi : 10.1093/molbev/msq229 . PMID 20805190 . 
  53. ↑ Steane DA (2005). "Secuencia completa de nucleótidos del genoma del cloroplasto del eucalipto azul de Tasmania, Eucalyptus globulus (Myrtaceae)" . DNA Research . 12 (3): 215–20 . doi : 10.1093/dnares/dsi006 . PMID 16303753 . 
  54. ↑ Logacheva MD, Samigullin TH, Dhingra A, Penin AA (mayo de 2008). "Genómica comparativa de cloroplastos y filogenética de Fagopyrum esculentum ssp. ancestrale: un ancestro silvestre del trigo sarraceno cultivado" . BMC Plant Biology . 8 : 59. doi : 10.1186/1471-2229-8-59 . PMC 2430205. PMID 18492277 .  
  55. ↑ Saski C, Lee SB, Daniell H, Wood TC, Tomkins J, Kim HG, Jansen RK (septiembre de 2005). "Secuencia completa del genoma del cloroplasto de Glycine max y análisis comparativos con otros genomas de leguminosas". Plant Molecular Biology . 59 (2): 309–22 . doi : 10.1007/s11103-005-8882-0 . PMID 16247559. S2CID 3332004 .  
  56. ↑ Ibrahim RI, Azuma J, Sakamoto M (octubre de 2006). "Secuencia completa de nucleótidos del genoma del cloroplasto del algodón (Gossypium barbadense L.) con un análisis comparativo de secuencias entre 9 plantas dicotiledóneas" . Genes & Genetic Systems . 81 (5): 311–21 . doi : 10.1266/ggs.81.311 . PMID 17159292 . 
  57. ↑ Lee SB, Kaittanis C, Jansen RK, Hostetler JB, Tallon LJ, Town CD, Daniell H (marzo de 2006). " La secuencia completa del genoma del cloroplasto de Gossypium hirsutum: organización y relaciones filogenéticas con otras angiospermas" . BMC Genomics . 7 : 61. doi : 10.1186/1471-2164-7-61 . PMC 1513215. PMID 16553962 .  
  58. 1 2 Timme RE, Kuehl JV, Boore JL, Jansen RK (marzo de 2007). "Análisis comparativo de los genomas de plastidios de Lactuca y Helianthus (Asteraceae): identificación de regiones divergentes y categorización de repeticiones compartidas" . American Journal of Botany . 94 (3): 302– 12. doi : 10.3732/ajb.94.3.302 . PMID 21636403 . 
  59. ↑ Naumann J, Der JP, Wafula EK, Jones SS, Wagner ST, Honaas LA, Ralph PE, Bolin JF, Maass E, Neinhuis C, Wanke S, dePamphilis CW (enero de 2016). "Detección y caracterización del genoma de plastidios altamente divergente de la planta parásita no fotosintética Hydnora visseri (Hydnoraceae)" . Genome Biology and Evolution . 8 (2): 345– 63. doi : 10.1093/gbe/evv256 . PMC 4779604. PMID 26739167 .  
  60. ↑ Lee HL, Jansen RK, Chumley TW, Kim KJ (mayo de 2007). "Las reubicaciones de genes dentro de los genomas de cloroplastos de Jasminum y Menodora (Oleaceae) se deben a múltiples inversiones superpuestas" . Biología Molecular y Evolución . 24 (5): 1161–80 . doi : 10.1093/molbev/msm036 . PMID 17329229 . 
  61. ↑ Hu Y, Woeste KE, Zhao P (2017-01-01). "Juglans y su contribución a la filogenia de los cloroplastos" . Frontiers in Plant Science . 7 : 1955. doi : 10.3389/fpls.2016.01955 . PMC 5216037. PMID 28111577 .  
  62. ↑ Mardanov AV, Ravin NV, Kuznetsov BB, Samigullin TH, Antonov AS, Kolganova TV, Skyabin KG (junio de 2008). "Secuencia completa del genoma del cloroplasto de la lenteja de agua (Lemna minor): organización estructural y relaciones filogenéticas con otras angiospermas". Journal of Molecular Evolution . 66 (6): 555– 64. Bibcode : 2008JMolE..66..555M . doi : 10.1007/s00239-008-9091-7 . PMID 18463914. S2CID 10044367 .  
  63. ↑ Malé PJ, Bardon L, Besnard G, Coissac E, Delsuc F, Engel J, Lhuillier E, Scotti-Saintagne C, Tinaut A, Chave J (septiembre de 2014). "La secuenciación genómica rápida mediante secuenciación de escopeta ayuda a resolver la filogenia de una familia de árboles pantropicales". Molecular Ecology Resources . 14 (5): 966– 75. doi : 10.1111/1755-0998.12246 . PMID 24606032. S2CID 26777683 .  
  64. ↑ Liang H, Carlson JE, Leebens-Mack JH, Wall PK, Mueller LA, Buzgo M, Landherr LL, Hu Y, DiLoreto DS, Ilut DC, Field D, Tanksley SD, Ma H, Claude (2008). "Una base de datos EST para los botones florales de Liriodendron tulipifera L.: el primer recurso EST para genómica funcional y comparativa en Liriodendron". Tree Genetics & Genomes . 4 (3): 419– 433. doi : 10.1007/s11295-007-0120-2 . S2CID 44266336 . 
  65. ↑ Kato T, Kaneko T, Sato S, Nakamura Y, Tabata S (diciembre de 2000). "Estructura completa del genoma del cloroplasto de una leguminosa, Lotus japonicus" . DNA Research . 7 (6): 323–30 . doi : 10.1093/dnares/7.6.323 . PMID 11214967 . 
  66. ↑ Daniell H, Wurdack KJ, Kanagaraj A, Lee SB, Saski C, Jansen RK (marzo de 2008). "La secuencia completa de nucleótidos del genoma del cloroplasto de la yuca (Manihot esculenta) y la evolución de atpF en Malpighiales: edición de ARN y pérdidas múltiples de un intrón del grupo II" . Theoretical and Applied Genetics . 116 (5): 723–37 . doi : 10.1007/s00122-007-0706-y . PMC 2587239. PMID 18214421 .  
  67. ↑ Ravin NV, Gruzdev EV, Beletsky AV, Mazur AM, Prokhortchouk EB, Filyushin MA, Kochieva EZ, Kadnikov VV, Mardanov AV, Skryabin KG (noviembre de 2016). "La pérdida de vías fotosintéticas en los genomas plastidiales y nucleares de la eudicotiledónea micoheterótrofa no fotosintética Monotropa hypopitys" . BMC Plant Biology . 16 (Supl. 3): 238. doi : 10.1186/s12870-016-0929-7 . PMC 5123295. PMID 28105941 .  
  68. ↑ Ravi V, Khurana JP, Tyagi AK, Khurana P (2006). "El genoma del cloroplasto de la morera: secuencia completa de nucleótidos, organización genética y análisis comparativo". Tree Genetics & Genomes . 3 (1): 49– 59. doi : 10.1007/s11295-006-0051-3 . S2CID 22104273 . 
  69. ↑ Shetty SM, Md Shah MU, Makale K, Mohd-Yusuf Y, Khalid N, Othman RY (julio de 2016). "Secuencia completa del genoma del cloroplasto que corrobora la heterogeneidad estructural de las repeticiones invertidas en progenitores silvestres de bananos y plátanos cultivados" . The Plant Genome . 9 (2). doi : 10.3835/plantgenome2015.09.0089 . PMID 27898825 . 
  70. 1 2 Moore MJ, Dhingra A, Soltis PS, Shaw R, Farmerie WG, Folta KM, Soltis DE (agosto de 2006). " Secuenciación rápida y precisa de genomas de plastidios de angiospermas mediante pirosecuenciación" . BMC Plant Biology . 6 : 17. doi : 10.1186/1471-2229-6-17 . PMC 1564139. PMID 16934154 .  
  71. ^ Logacheva MD, Schelkunov MI, Penin AA (1 de enero de 2011). "Secuenciación y análisis del genoma de plástidos en la orquídea micoheterotrófica Neottia nidus-avis" . Biología y evolución del genoma . 3 : 1296–303 . doi : 10.1093/gbe/evr102 . PMC 3228488 . PMID 21971517 .  
  72. ^ Shinozaki K, Ohme M, Tanaka M, Wakasugi T, Hayashida N, Matsubayashi T, Zaita N, Chunwongse J, Obokata J, Yamaguchi-Shinozaki K, Ohto C, Torazawa K, Meng BY, Sugita M, Deno H, Kamogashira T, Yamada K, Kusuda J, Takaiwa F, Kato A, Tohdoh N, Shimada H, Sugiura M (Septiembre de 1986). "La secuencia completa de nucleótidos del genoma del cloroplasto del tabaco: su organización y expresión genética" . La Revista EMBO . 5 (9): 2043–2049.doi : 10.1002 / j.1460-2075.1986.tb04464.x . PMC 1167080 . PMID 16453699 .  
  73. 1 2 Raubeson LA, Peery R, ​​Chumley TW, Dziubek C, Fourcade HM, Boore JL, Jansen RK (junio de 2007). " Genómica comparativa de cloroplastos: análisis que incluyen nuevas secuencias de las angiospermas Nuphar advena y Ranunculus macranthus" . BMC Genomics . 8 : 174. doi : 10.1186/1471-2164-8-174 . PMC 1925096. PMID 17573971 .  
  74. ↑ Goremykin VV, Hirsch-Ernst KI, Wölfl S, Hellwig FH (julio de 2004). "El genoma del cloroplasto de Nymphaea alba: análisis del genoma completo y el problema de identificar la angiosperma más basal" . Biología molecular y evolución . 21 (7): 1445–54 . doi : 10.1093/molbev/msh147 . PMID 15084683 . 
  75. 1 2 3 4 5 Greiner S, Wang X, Rauwolf U, Silber MV, Mayer K, Meurer J, Haberer G, Herrmann RG (abril de 2008). "Las secuencias completas de nucleótidos de los cinco genomas de plastidios genéticamente distintos de Oenothera, subsección Oenothera: I. evaluación de secuencias y evolución del plastoma" . Nucleic Acids Research . 36 (7): 2366–78 . doi : 10.1093/nar/gkn081 . PMC 2367718. PMID 18299283 .  
  76. 1 2 Yu J, Wang J, Lin W, Li S, Li H, Zhou J, et al. (febrero de 2005). " Los genomas de Oryza sativa: una historia de duplicaciones" . PLOS Biology . 3 (2) e38. doi : 10.1371/journal.pbio.0030038 . PMC 546038. PMID 15685292 .   
  77. ↑ Hiratsuka J, Shimada H, Whittier R, Ishibashi T, Sakamoto M, Mori M, Kondo C, Honji Y, Sun CR, Meng BY (junio de 1989). "La secuencia completa del genoma del cloroplasto del arroz (Oryza sativa): la recombinación intermolecular entre distintos genes de ARNt explica una importante inversión del ADN del plastidio durante la evolución de los cereales". Molecular & General Genetics . 217 ( 2–3 ): 185–94 . doi : 10.1007/BF02464880 . PMID 2770692. S2CID 36458326 .  
  78. 1 2 3 Petersen G, Cuenca A, Seberg O (agosto de 2015). "Evolución del plastoma en muérdagos hemiparásitos" . Genome Biology and Evolution . 7 (9): 2520– 32. doi : 10.1093/gbe/evv165 . PMC 4607522. PMID 26319577 .  
  79. ↑ Kim KJ, Lee HL (agosto de 2004). "Secuencias completas del genoma del cloroplasto del ginseng coreano (Panax schinseng Nees) y análisis comparativo de la evolución de la secuencia entre 17 plantas vasculares" . DNA Research . 11 (4): 247– 61. doi : 10.1093/dnares/11.4.247 . PMID 15500250 . 
  80. ↑ Chumley TW, Palmer JD, Mower JP, Fourcade HM, Calie PJ, Boore JL, Jansen RK (noviembre de 2006). "La secuencia completa del genoma del cloroplasto de Pelargonium x hortorum: organización y evolución del genoma del cloroplasto más grande y más altamente reordenado de las plantas terrestres" . Biología Molecular y Evolución . 23 (11): 2175–90 . doi : 10.1093/molbev/msl089 . PMID 16916942 . 
  81. ↑ Logacheva MD, Schelkunov MI, Nuraliev MS, Samigullin TH, Penin AA (enero de 2014). "El genoma del plastidio de la monocotiledónea micoheterótrofa Petrosavia stellaris presenta tanto pérdidas de genes como múltiples reordenamientos" . Genome Biology and Evolution . 6 (1): 238– 46. doi : 10.1093/gbe/evu001 . PMC 3914687. PMID 24398375 .  
  82. ↑ Chang CC, Lin HC, Lin IP, Chow TY, Chen HH, Chen WH, Cheng CH, Lin CY, Liu SM, Chang CC, Chaw SM (febrero de 2006). "El genoma del cloroplasto de Phalaenopsis aphrodite (Orchidaceae): análisis comparativo de la tasa evolutiva con la de las gramíneas y sus implicaciones filogenéticas" . Biología molecular y evolución . 23 (2): 279–91 . doi : 10.1093/molbev/msj029 . PMID 16207935 . 
  83. ↑ Guo X, Castillo-Ramírez S, González V, Bustos P, Fernández-Vázquez JL, Santamaría RI, Arellano J, Cevallos MA, Dávila G (julio de 2007). "Rápido cambio evolutivo del plastoma del frijol común (Phaseolus vulgaris L) y diversificación genómica de los cloroplastos de leguminosas" . Genómica BMC . 8 : 228. doi : 10.1186/1471-2164-8-228 . PMC 1940014 . PMID 17623083 .  
  84. 1 2 Bellot S, Renner SS (diciembre de 2015). "Los plastomas de dos especies del género endoparásito Pilostyles (Apodanthaceae) conservan cada uno solo cinco o seis genes posiblemente funcionales" . Genome Biology and Evolution . 8 (1): 189–201 . doi : 10.1093/gbe/evv251 . PMC 4758247. PMID 26660355 .  
  85. ↑ Okumura S, Sawada M, Park YW, Hayashi T, Shimamura M, Takase H, Tomizawa K (octubre de 2006). "Transformación de plastidios de álamo (Populus alba) y expresión de proteínas extrañas en cloroplastos de árboles". Transgenic Research . 15 (5): 637– 46. doi : 10.1007/s11248-006-9009-3 . PMID 16952016. S2CID 39294451 .  
  86. ↑ Delannoy E, Fujii S, Colas des Francs-Small C, Brundrett M, Small I (julio de 2011). "La pérdida genética desenfrenada en la orquídea subterránea Rhizanthella gardneri pone de manifiesto las limitaciones evolutivas de los genomas de los plastidios" . Biología Molecular y Evolución . 28 (7): 2077–86 . doi : 10.1093/molbev/msr028 . PMC 3112369. PMID 21289370 .  
  87. ↑ Lam VK, Soto Gomez M, Graham SW (julio de 2015). "El plastoma altamente reducido de Sciaphila micoheterótrofa (Triuridaceae) es colineal con sus parientes verdes y está bajo una fuerte selección purificadora" . Genome Biology and Evolution . 7 (8): 2220–36 . doi : 10.1093 / gbe/evv134 . PMC 4558852. PMID 26170229 .  
  88. ↑ Chung HJ, Jung JD, Park HW, Kim JH, Cha HW, Min SR, Jeong WJ, Liu JR (diciembre de 2006). "Las secuencias completas del genoma del cloroplasto de Solanum tuberosum y el análisis comparativo con especies de Solanáceas identificaron la presencia de una deleción de 241 pb en la secuencia de ADN del cloroplasto de la patata cultivada". Plant Cell Reports . 25 (12): 1369–79 . doi : 10.1007/s00299-006-0196-4 . PMID 16835751. S2CID 24055793 .  
  89. ↑ Schmitz-Linneweber C, Maier RM, Alcaraz JP, Cottet A, Herrmann RG, Mache R (febrero de 2001). "El cromosoma plastídico de la espinaca (Spinacia oleracea): secuencia completa de nucleótidos y organización genética". Plant Molecular Biology . 45 (3): 307– 15. doi : 10.1023/A:1006478403810 . PMID 11292076. S2CID 28271437 .  
  90. ↑ Haberle RC, Fourcade HM, Boore JL, Jansen RK (abril de 2008). "Reordenamientos extensos en el genoma del cloroplasto de Trachelium caeruleum están asociados con repeticiones y genes de ARNt". Journal of Molecular Evolution . 66 (4): 350– 61. Bibcode : 2008JMolE..66..350H . CiteSeerX 10.1.1.174.5498 . doi : 10.1007 / s00239-008-9086-4 . PMID 18330485. S2CID 18228097 .   
  91. ↑ Cai Z, et al. (2008). "Reorganización extensa del genoma del plastidio de Trifolium subterraneum (Fabaceae) asociada con numerosas secuencias repetidas e inserciones de ADN novedosas". J Mol Evol . 67 (6): 696– 704. Bibcode : 2008JMolE..67..696C . doi : 10.1007/s00239-008-9180-7 . PMID 19018585. S2CID 36486188 .   
  92. ↑ Ogihara Y, Isono K, Kojima T, Endo A, Hanaoka M, Shiina T, et al. (2000). "Genoma del cloroplasto del trigo de primavera chino ( Triticum aestivum L.): secuencia completa y clones de contigs". Plant Molecular Biology Reporter . 18 (3): 243– 253. doi : 10.1007/BF02823995 . S2CID 41773993 .  
  93. ^ Ogihara Y, Isono K, Kojima T, Endo A, Hanaoka M, Shiina T, Terachi T, Utsugi S, Murata M, Mori N, Takumi S, Ikeo K, Gojobori T, Murai R, Murai K, Matsuoka Y, Ohnishi Y, Tajiri H, Tsunewaki K (enero de 2002). "Características estructurales de un plastoma de trigo reveladas por la secuenciación completa del ADN del cloroplasto". Genética y Genómica Molecular . 266 (5): 740– 6. doi : 10.1007/s00438-001-0606-9 . PMID 11810247 . S2CID 22434780 .  
  94. ^ Fajardo D, Senalik D, Ames M, Zhu H, Steffan SA, Harbut R, Polashock J, Vorsa N, Gillespie E, Kron K, Zalapa JE (2013). "Secuencia completa del genoma del plástido de Vaccinium macrocarpon: estructura, contenido genético y reordenamientos revelados por la secuenciación de próxima generación". Genética y genomas de árboles . 9 (2): 489– 498. doi : 10.1007/s11295-012-0573-9 . S2CID 17130517 . 
  95. ↑ Jansen RK, Kaittanis C, Saski C, Lee SB, Tomkins J, Alverson AJ, Daniell H (abril de 2006). "Análisis filogenéticos de Vitis (Vitaceae) basados ​​en secuencias completas del genoma del cloroplasto: efectos del muestreo de taxones y métodos filogenéticos en la resolución de relaciones entre rosáceas" . BMC Evolutionary Biology . 6 (1): 32. Bibcode : 2006BMCEE...6...32J . doi : 10.1186/1471-2148-6-32 . PMC 1479384. PMID 16603088 .  
  96. ↑ Maier RM, Neckermann K, Igloi GL, Kössel H (septiembre de 1995). "Secuencia completa del genoma del cloroplasto del maíz: contenido genético, puntos críticos de divergencia y ajuste fino de la información genética mediante edición de transcripción". Journal of Molecular Biology . 251 (5): 614– 28. doi : 10.1006/jmbi.1995.0460 . PMID 7666415 . 
  97. ↑ Moore MJ, Bell CD, Soltis PS, Soltis DE (diciembre de 2007). "Uso de datos a escala del genoma de plastidios para resolver relaciones enigmáticas entre angiospermas basales" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 104 (49): 19363–8 . Bibcode : 2007PNAS..10419363M . doi : 10.1073/pnas.0708072104 . PMC 2148295. PMID 18048334 .  
  98. ^ Gerald A. Tuskan y otros (110 autores). 2006. "El genoma del álamo negro, Populus trichocarpa (Torr. & Gray)". Ciencia 313 (5793): 1596-1604.
  99. ↑ Nickrent DL, Malécot V, Vidal-Russell R, Der JP (2010). "Una clasificación revisada de Santalales". Taxon . 59 (2): 538– 558. doi : 10.1002/tax.592019 . S2CID 85950875 . 
  100. 1 2 Leliaert F, Lopez-Bautista JM (marzo de 2015). "Los genomas de cloroplastos de Bryopsis plumosa y Tydemania expeditiones (Bryopsidales, Chlorophyta): genomas compactos y genes de origen bacteriano" . BMC Genomics . 16 (1): 204. doi : 10.1186/ s12864-015-1418-3 . PMC 4487195. PMID 25879186 .  
  101. ↑ Turmel M, Otis C, Lemieux C (agosto de 2002). "Las secuencias del genoma del cloroplasto y la mitocondria de la carófita Chaetosphaeridium globosum: perspectivas sobre la cronología de los eventos que reestructuraron los ADN de los orgánulos dentro del linaje de algas verdes que condujo a las plantas terrestres" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 99 (17): 11275–80 . Bibcode : 2002PNAS...9911275T . doi : 10.1073/pnas.162203299 . PMC 123247. PMID 12161560 .  
  102. ^ Wakasugi T, Nagai T, Kapoor M, Sugita M, Ito M, Ito S, Tsudzuki J, Nakashima K, Tsudzuki T, Suzuki Y, Hamada A, Ohta T, Inamura A, Yoshinaga K, Sugiura M (mayo de 1997). "Secuencia completa de nucleótidos del genoma del cloroplasto del alga verde Chlorella vulgaris: existencia de genes posiblemente implicados en la división del cloroplasto" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 94 (11): 5967– 72. Código bibliográfico : 1997PNAS...94.5967W . doi : 10.1073/pnas.94.11.5967 . PMC 20890 . PMID 9159184 .  
  103. ↑ Turmel M, Otis C, Lemieux C (mayo de 2007). " Un genoma mitocondrial inesperadamente grande y poco compacto en el alga verde carofícea Chlorokybus atmophyticus" . BMC Genomics . 8 : 137. doi : 10.1186/1471-2164-8-137 . PMC 1894977. PMID 17537252 .  
  104. ↑ Smith DR, et al. (mayo de 2010). "Los genomas de los orgánulos de Dunaliella salina: secuencias grandes, infladas con ADN intrónico e intergénico" . BMC Plant Biology . 10 : 83. doi : 10.1186/1471-2229-10-83 . PMC 3017802. PMID 20459666 .   
  105. ↑ de Koning AP, Keeling PJ (abril de 2006). "La secuencia completa del genoma del plastidio del alga verde parásita Helicosporidium sp. está altamente reducida y estructurada" . BMC Biology . 4 : 12. doi : 10.1186/1741-7007-4-12 . PMC 1463013. PMID 16630350 .  
  106. ↑ de Cambiaire JC, Otis C, Turmel M, Lemieux C (julio de 2007). "La secuencia del genoma del cloroplasto del alga verde Leptosira terrestris: múltiples pérdidas de la repetición invertida y extensos reordenamientos del genoma dentro de las Trebouxiophyceae" . BMC Genomics . 8 : 213. doi : 10.1186/1471-2164-8-213 . PMC 1931444. PMID 17610731 .  
  107. 1 2 3 Turmel M, Gagnon MC, O'Kelly CJ, Otis C, Lemieux C (marzo de 2009). "Los genomas de cloroplastos de las algas verdes Pyramimonas, Monomastix y Pycnococcus arrojan nueva luz sobre la historia evolutiva de las prasinofitas y el origen de los cloroplastos secundarios de los euglenoides" . Biología molecular y evolución . 26 (3): 631– 48. doi : 10.1093/molbev/msn285 . PMID 19074760 . 
  108. ↑ Turmel M, Otis C, Lemieux C (agosto de 1999). "La secuencia completa del ADN del cloroplasto del alga verde Nephroselmis olivacea: perspectivas sobre la arquitectura de los genomas ancestrales del cloroplasto" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 96 (18): 10248– 53. Bibcode : 1999PNAS...9610248T . doi : 10.1073 / pnas.96.18.10248 . PMC 17874. PMID 10468594 .  
  109. ↑ Brouard JS, Otis C, Lemieux C, Turmel M (junio de 2008). "Secuencia de ADN del cloroplasto del alga verde Oedogonium cardiacum (Chlorophyceae): arquitectura genómica única, caracteres derivados compartidos con las Chaetophorales y genes nuevos adquiridos mediante transferencia horizontal" . BMC Genomics . 9 : 290. doi : 10.1186/1471-2164-9-290 . PMC 2442088. PMID 18558012 .  
  110. ↑ Pombert JF, Lemieux C, Turmel M (febrero de 2006). "La secuencia completa del ADN del cloroplasto del alga verde Oltmannsiellopsis viridis revela una arquitectura cuatripartita distintiva en el genoma del cloroplasto de las ulvofitas de divergencia temprana" . BMC Biology . 4 :3. doi : 10.1186 /1741-7007-4-3 . PMC 1402334. PMID 16472375 .  
  111. ↑ Robbens S, Derelle E, Ferraz C, Wuyts J, Moreau H, Van de Peer Y (abril de 2007). "La secuencia completa del ADN del cloroplasto y la mitocondria de Ostreococcus tauri: los genomas de los orgánulos del eucariota más pequeño son ejemplos de compactación" . Biología Molecular y Evolución . 24 (4): 956–68 . doi : 10.1093/molbev/msm012 . PMID 17251180 . 
  112. ↑ Pombert JF, Otis C, Lemieux C, Turmel M (septiembre de 2005). "La secuencia del genoma del cloroplasto del alga verde Pseudendoclonium akinetum (Ulvophyceae) revela características estructurales inusuales y nuevas perspectivas sobre el orden de ramificación de los linajes de clorofitas" . Biología Molecular y Evolución . 22 (9): 1903–18 . doi : 10.1093/molbev/msi182 . PMID 15930151 . 
  113. ↑ de Cambiaire JC, Otis C, Lemieux C, Turmel M (abril de 2006). "La secuencia completa del genoma del cloroplasto del alga verde clorofícea Scenedesmus obliquus revela una organización genética compacta y una distribución sesgada de genes en las dos hebras de ADN" . BMC Evolutionary Biology . 6 (1): 37. Bibcode : 2006BMCEE...6...37D . doi : 10.1186/1471-2148-6-37 . PMC 1513399. PMID 16638149 .  
  114. ↑ Turmel M, Otis C, Lemieux C (octubre de 2005). "Las secuencias completas del ADN del cloroplasto de las algas verdes carofíceas Staurastrum y Zygnema revelan que el genoma del cloroplasto sufrió cambios extensos durante la evolución de las Zygnematales" . BMC Biology . 3 : 22. doi : 10.1186/1741-7007-3-22 . PMC 1277820. PMID 16236178 .  
  115. ↑ Bélanger AS, Brouard JS, Charlebois P, Otis C, Lemieux C, Turmel M (noviembre de 2006). "Arquitectura distintiva del genoma del cloroplasto en el alga verde clorofícea Stigeoclonium helveticum". Molecular Genetics and Genomics . 276 (5): 464– 77. doi : 10.1007/s00438-006-0156-2 . PMID 16944205. S2CID 19489840 .  
  116. ↑ Melton JT, Leliaert F, Tronholm A, Lopez-Bautista JM (2015). "Los genomas completos del cloroplasto y la mitocondria de la macroalga verde Ulva sp. UNA00071828 (Ulvophyceae, Chlorophyta)" . PLOS ONE . 10 (4) e0121020. Bibcode : 2015PLoSO..1021020M . doi : 10.1371/journal.pone.0121020 . PMC 4388391. PMID 25849557 .  
  117. ↑ Smith DR, Lee RW (marzo de 2009). " Los genomas mitocondriales y plastidiales de Volvox carteri: moléculas hinchadas ricas en ADN repetitivo" . BMC Genomics . 10 (132): 132. doi : 10.1186/1471-2164-10-132 . PMC 2670323. PMID 19323823 .  
  118. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 Lee J, Cho CH, Park SI, Choi JW, Song HS, West JA, Bhattacharya D, Yoon HS (septiembre de 2016). "Evolución paralela de la arquitectura del genoma del plastidio altamente conservada en algas rojas y plantas con semillas" . BMC Biology . 14 (1): 75. doi : 10.1186/s12915-016-0299-5 . PMC 5010701. PMID 27589960 .  
  119. 1 2 Janouškovec J, Liu SL, Martone PT, Carré W, Leblanc C, Collén J, Keeling PJ (2013-03-25). Bhattacharya D (ed.). "Evolución de los genomas de plastidios de algas rojas: arquitecturas antiguas, intrones, transferencia horizontal de genes y utilidad taxonómica de los marcadores de plastidios" . PLOS ONE . 8 (3) e59001. Bibcode : 2013PLoSO...859001J . doi : 10.1371/journal.pone.0059001 . PMC 3607583. PMID 23536846 .  
  120. ^ Ohta N, Matsuzaki M, Misumi O, Miyagishima SY, Nozaki H, Tanaka K, Shin-I T, Kohara Y, Kuroiwa T (abril de 2003). "Secuencia completa y análisis del genoma del plástido del alga roja unicelular Cyanidioschyzon merolae" . Investigación del ADN . 10 (2): 67– 77. doi : 10.1093/dnares/10.2.67 . PMID 12755171 . 
  121. ↑ Glöckner G, Rosenthal A, Valentin K (octubre de 2000). "La estructura y el repertorio genético de un genoma de plastidio de alga roja antigua". Journal of Molecular Evolution . 51 (4): 382– 90. Bibcode : 2000JMolE..51..382G . CiteSeerX 10.1.1.566.2529 . doi : 10.1007/s002390010101 . PMID 11040290. S2CID 23064129 .   
  122. ↑ Jain K, Krause K, Grewe F, Nelson GF, Weber AP, Christensen AC, Mower JP (diciembre de 2014). "Características extremas de los genomas organelares de Galdieria sulphuraria: ¿una consecuencia de la poliextremofilia?" . Genome Biology and Evolution . 7 (1): 367– 80. doi : 10.1093/gbe/evu290 . PMC 4316638 . PMID 25552531 .  
  123. 1 2 3 4 Lee J, Kim KM, Yang EC, Miller KA, Boo SM, Bhattacharya D, Yoon HS (marzo de 2016). " Reconstrucción de la compleja historia evolutiva de los plásmidos móviles en los genomas de algas rojas" . Scientific Reports . 6 (1) 23744. Bibcode : 2016NatSR...623744L . doi : 10.1038/srep23744 . PMC 4814812. PMID 27030297 .  
  124. ↑ Boo GH, Hughey JR (febrero de 2019). "Filogenómica y filogenias multigénicas descifran dos nuevas algas marinas crípticas de California, Gelidium gabrielsonii y G. kathyanniae (Gelidiales, Rhodophyta)" . Journal of Phycology . 55 (1): 160–172 . Bibcode : 2019JPcgy..55..160B . doi : 10.1111/jpy.12802 . PMID 30341779 . 
  125. ↑ Ho CL, Lee WK, Lim EL (marzo de 2018). "Desentrañando los genomas nuclear y cloroplástico de una macroalga roja productora de agar, Gracilaria changii (Rhodophyta, Gracilariales)" . Genomics . 110 (2): 124–133 . doi : 10.1016/j.ygeno.2017.09.003 . PMID 28890206 . 
  126. ↑ Campbell, Matthew A.; Presting, Gernot; Bennett, Matthew S.; Sherwood, Alison R. (2014-02-21). "Genomas de orgánulos altamente conservados en las Gracilariales inferidos a partir de nuevos datos del alga invasora hawaiana Gracilaria salicornia (Rhodophyta)". Phycologia . 53 (2): 109– 116. Bibcode : 2014Phyco..53..109C . doi : 10.2216/13-222.1 . S2CID 85867132 . 
  127. ↑ Hagopian JC, Reis M, Kitajima JP, Bhattacharya D, de Oliveira MC (octubre de 2004). "Análisis comparativo de la secuencia completa del genoma del plastidio del alga roja Gracilaria tenuistipitata var. liui proporciona información sobre la evolución de los rodoplastos y su relación con otros plastidios". Journal of Molecular Evolution . 59 (4): 464– 77. Bibcode : 2004JMolE..59..464H . CiteSeerX 10.1.1.614.9150 . doi : 10.1007/s00239-004-2638-3 . PMID 15638458. S2CID 19135480 .   
  128. ↑ DePriest MS, Bhattacharya D, López-Bautista JM (2013-07-19). "El genoma del plastidio de la macroalga roja Grateloupia taiwanensis (Halymeniaceae)" . PLOS ONE . 8 (7) e68246. Bibcode : 2013PLoSO...868246D . doi : 10.1371/journal.pone.0068246 . PMC 3716797. PMID 23894297 .  
  129. 1 2 3 Cho CH, Choi JW, Lam DW, Kim KM, Yoon HS (2018-05-08). "Análisis del genoma de plastidios de tres especies de algas rojas Nemaliophycidae sugiere adaptación ambiental para hábitats limitados por hierro" . PLOS ONE . 13 (5) e0196995. Bibcode : 2018PLoSO..1396995C . doi : 10.1371/journal.pone.0196995 . PMC 5940233. PMID 29738547 .  
  130. ↑ Reith M, Munholland J (abril de 1993). "Mapa genético de alta resolución del genoma del cloroplasto del alga roja Porphyra purpurea" . The Plant Cell . 5 (4): 465– 475. doi : 10.1105/tpc.5.4.465 . PMC 160285. PMID 12271072 .  
  131. ↑ Brawley SH, Blouin NA, Ficko-Blean E, Wheeler GL, Lohr M, Goodson HV, et al. (agosto de 2017). "Porphyra umbilicalis (Bangiophyceae, Rhodophyta)" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 114 (31): E6361– E6370. doi : 10.1073/pnas.1703088114 . PMC 5547612. PMID 28716924 .   
  132. ↑ Tajima N, Sato S, Maruyama F, Kurokawa K, Ohta H, Tabata S, Sekine K, Moriyama T, Sato N (mayo de 2014). "Análisis del genoma completo del plastidio del alga roja unicelular Porphyridium purpureum". Journal of Plant Research . 127 (3): 389– 97. Bibcode : 2014JPlR..127..389T . doi : 10.1007 / s10265-014-0627-1 . PMID 24595640. S2CID 1420996 .  
  133. 1 2 3 Hughey JR, Gabrielson PW, Rohmer L, Tortolani J, Silva M, Miller KA, Young JD, Martell C, Ruediger E (junio de 2014). "El muestreo mínimamente destructivo de especímenes tipo de Pyropia (Bangiales, Rhodophyta) recupera genomas completos de plastidios y mitocondrias" . Scientific Reports . 4 (1): 5113. Bibcode : 2014NatSR...4E5113H . doi : 10.1038/srep05113 . PMC 4044621. PMID 24894641 .  
  134. 1 2 Wang L, Mao Y, Kong F, Li G, Ma F, Zhang B, Sun P, Bi G, Zhang F, Xue H, Cao M (2013-05-29). "Secuencia completa y análisis de genomas de plastidios de dos algas rojas de importancia económica: Pyropia haitanensis y Pyropia yezoensis" . PLOS ONE . 8 (5) e65902. Bibcode : 2013PLoSO...865902W . doi : 10.1371/ journal.pone.0065902 . PMC 3667073. PMID 23734264 .  
  135. ↑ Salomaki ED, Nickles KR, Lane CE (abril de 2015). "El plastidio fantasma de Choreocolax polysiphoniae". Journal of Phycology . 51 (2): 217–21 . Bibcode : 2015JPcgy..51..217S . doi : 10.1111 / jpy.12283 . PMID 26986516. S2CID 30670447 .  
  136. ↑ Löffelhardt W, Bohnert HJ, Bryant DA (1997). "La secuencia completa del genoma de la cianela Cyanophora paradoxa (Glaucocystophyceae)". Sistemática y evolución de las plantas . Vol. 11. Springer Vienna. pp. 149–162 . doi : 10.1007/978-3-7091-6542-3_8 . ISBN   978-3-211-83035-2.
  137. 1 2 3 4 Kim JI, Moore CE, Archibald JM, Bhattacharya D, Yi G, Yoon HS, Shin W (julio de 2017). " Dinámica evolutiva de los genomas de plastidios de criptofitas" . Genome Biology and Evolution . 9 (7): 1859– 1872. doi : 10.1093/gbe/evx123 . PMC 5534331. PMID 28854597 .  
  138. ↑ Donaher N, Tanifuji G, Onodera NT, Malfatti SA, Chain PS, Hara Y, Archibald JM (noviembre de 2009). " La secuencia completa del genoma del plastidio del alga secundariamente no fotosintética Cryptomonas paramecium: reducción, compactación y tasa evolutiva acelerada" . Genome Biology and Evolution . 1 : 439–48 . doi : 10.1093/gbe/evp047 . PMC 2839278. PMID 20333213 .  
  139. ↑ Sánchez Puerta MV, Bachvaroff TR, Delwiche CF (2005-01-01). "La secuencia completa del genoma del plastidio de la haptófita Emiliania huxleyi: una comparación con otros genomas de plastidios" . DNA Research . 12 (2): 151– 6. doi : 10.1093/dnares/12.2.151 . PMID 16303746 . 
  140. ↑ Douglas SE, Penny SL (febrero de 1999). "El genoma del plastidio del alga criptofita Guillardia theta: la secuencia completa y los grupos de sintenia conservados confirman su ancestro común con las algas rojas". Journal of Molecular Evolution . 48 (2): 236– 44. Bibcode : 1999JMolE..48..236D . doi : 10.1007/PL00006462 . PMID 9929392. S2CID 2005223 .  
  141. ↑ Cattolico RA, Jacobs MA, Zhou Y, Chang J, Duplessis M, Lybrand T, McKay J, Ong HC, Sims E, Rocap G (mayo de 2008). "Análisis de secuenciación del genoma del cloroplasto de las cepas Heterosigma akashiwo CCMP452 (Atlántico occidental) y NIES293 (Pacífico occidental)" . BMC Genomics . 9 (1): 211. doi : 10.1186/1471-2164-9-211 . PMC 2410131. PMID 18462506 .  
  142. ↑ Kowallik KV, Stoebe B, Schaffran I, Kroth-Pancic P, Freier U (diciembre de 1995). "El genoma del cloroplasto de un alga que contiene clorofila a+c, Odontella sinensis". Plant Molecular Biology Reporter . 13 (4): 336– 342. doi : 10.1007/BF02669188 . ISSN 0735-9640 . S2CID 1515475 .  
  143. 1 2 Oudot-Le Secq MP, Grimwood J, Shapiro H, Armbrust EV, Bowler C, Green BR (abril de 2007). "Genomas de cloroplastos de las diatomeas Phaeodactylum tricornutum y Thalassiosira pseudonana: comparación con otros genomas de plastidios del linaje rojo". Molecular Genetics and Genomics . 277 (4): 427– 39. doi : 10.1007/s00438-006-0199-4 . PMID 17252281. S2CID 23192934 .  
  144. ↑ Khan H, Parks N, Kozera C, Curtis BA, Parsons BJ, Bowman S, Archibald JM (agosto de 2007). "Secuencia del genoma del plastidio del alga criptofita Rhodomonas salina CCMP1319: transferencia lateral de la supuesta maquinaria de replicación del ADN y una prueba de la filogenia del plastidio cromista" . Biología molecular y evolución . 24 (8): 1832–42 . doi : 10.1093/molbev/msm101 . PMID 17522086 . 
  145. ^ Kim JI, Yoon HS, Yi G, Kim HS, Yih W, Shin W (5 de junio de 2015). Przyborski JM (ed.). "El genoma plastidio de la criptomona Teleaulax amphioxeia" . MÁS UNO . 10 (6) e0129284. Código Bib : 2015PLoSO..1029284K . doi : 10.1371/journal.pone.0129284 . PMC 4457928 . PMID 26047475 .  
  146. ↑ Rogers MB, Gilson PR, Su V, McFadden GI, Keeling PJ (enero de 2007). "El genoma completo del cloroplasto de la cloraracniófita Bigelowiella natans: evidencia de orígenes independientes de los endosimbiontes secundarios de cloraracniófitas y euglenoides" . Biología molecular y evolución . 24 (1): 54– 62. doi : 10.1093/molbev/msl129 . PMID 16990439 . 
  147. 1 2 3 Suzuki S, Hirakawa Y, Kofuji R, Sugita M, Ishida KI (julio de 2016). "Las secuencias del genoma de plastidios de Gymnochlora stellata, Lotharella vacuolata y Partenskyella glossopodia revelan una notable conservación estructural entre las especies de cloraraquniofitas". Journal of Plant Research . 129 (4): 581– 590. Bibcode : 2016JPlR..129..581S . doi : 10.1007/s10265-016-0804-5 . PMID 26920842 . S2CID 3463713 .  
  148. ↑ Tanifuji G, Onodera NT, Brown MW, Curtis BA, Roger AJ, Ka-Shu Wong G, Melkonian M, Archibald JM (mayo de 2014). "Secuencias del genoma del nucleomorfo y del plastidio de la cloraraquniófita Lotharella oceanica: evolución reductiva convergente y recombinación frecuente en algas portadoras de nucleomorfos" . BMC Genomics . 15 (1): 374. doi : 10.1186/1471-2164-15-374 . PMC 4035089. PMID 24885563 .  
  149. ↑ Hallick RB, Hong L, Drager RG, Favreau MR, Monfort A, Orsat B, Spielmann A, Stutz E (julio de 1993). "Secuencia completa del ADN del cloroplasto de Euglena gracilis" . Nucleic Acids Research . 21 (15): 3537–44 . doi : 10.1093 / nar/21.15.3537 . PMC 331456. PMID 8346031 .  
  150. ^ Cai X, Fuller AL, McDougald LR, Zhu G (diciembre de 2003). "Genoma apicoplasto del coccidio Eimeria tenella". Gen.​ 321 : 39– 46. doi : 10.1016/j.gene.2003.08.008 . PMID 14636990 . 
  151. ^ Suzuki S, Shirato S, Hirakawa Y, Ishida KI (2015). "Secuencias del genoma nucleomorfo de dos cloraracniofitos, Amorphochlora amoebiformis y Lotharella vacuolata" . Biología y evolución del genoma . 7 (6): 1533–1545 . doi : 10.1093/gbe/evv096 . PMC 4494063 . PMID 26002880 .  
  152. ↑ Gilson PR, Su V, Slamovits CH, Reith ME, Keeling PJ, McFadden GI (junio de 2006). "Secuencia completa de nucleótidos del nucleomorfo de la cloraraquniofita: el núcleo más pequeño de la naturaleza" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 103 ( 25): 9566–71 . Bibcode : 2006PNAS..103.9566G . doi : 10.1073/pnas.0600707103 . PMC 1480447. PMID 16760254 .  
  153. ↑ Curtis BA, Tanifuji G, Burki F, Gruber A, Irimia M, Maruyama S, et al. (diciembre de 2012). "Los genomas de las algas revelan el mosaicismo evolutivo y el destino de los nucleomorfos" (PDF) . Nature . 492 (7427): 59– 65. Bibcode : 2012Natur.492...59C . doi : 10.1038/nature11681 . PMID 23201678 .  
  154. ↑ Moore CE, Curtis B, Mills T, Tanifuji G, Archibald JM (2012). "La secuencia del genoma del nucleomorfo del alga criptofita Chroomonas mesostigmatica CCMP1168 revela la pérdida de genes específica del linaje y la complejidad del genoma" . Genome Biology and Evolution . 4 (11): 1162– 75. doi : 10.1093/gbe/evs090 . PMC 3514955. PMID 23042551 .  
  155. ↑ Tanifuji G, Onodera NT, Wheeler TJ, Dlutek M, Donaher N, Archibald JM (2011). "La secuencia completa del genoma del nucleomorfo del alga no fotosintética Cryptomonas paramecium revela un conjunto central de genes del nucleomorfo" . Genome Biology and Evolution . 3 : 44–54 . doi : 10.1093/gbe/evq082 . PMC 3017389. PMID 21147880 .  
  156. ↑ Douglas S, Zauner S, Fraunholz M, Beaton M, Penny S, Deng LT, Wu X, Reith M, Cavalier-Smith T, Maier UG (abril de 2001). "El genoma altamente reducido de un núcleo de alga esclavizado" . Nature . 410 (6832): 1091–6 . Bibcode : 2001Natur.410.1091D . doi : 10.1038/35074092 . PMID 11323671 . 
  157. ↑ Lane CE, van den Heuvel K, Kozera C, Curtis BA, Parsons BJ, Bowman S, Archibald JM (diciembre de 2007). "El genoma del nucleomorfo de Hemiselmis andersenii revela la pérdida completa de intrones y la compactación como impulsor de la estructura y función de las proteínas" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 104 (50): 19908– 13. Bibcode : 2007PNAS..10419908L . doi : 10.1073/pnas.0707419104 . PMC 2148396. PMID 18077423 .  
  158. ↑ Tanifuji G, Onodera NT, Brown MW, Curtis BA, Roger AJ, Ka-Shu Wong G, Melkonian M, Archibald JM (mayo de 2014). "Secuencias del genoma del nucleomorfo y del plastidio de la cloraraquniófita Lotharella oceanica: evolución reductiva convergente y recombinación frecuente en algas portadoras de nucleomorfos" . BMC Genomics . 15 (1): 374. doi : 10.1186/1471-2164-15-374 . PMC 4035089. PMID 24885563 .  
  159. ↑ Nowack EC, Melkonian M , Glöckner G (marzo de 2008). "La secuencia del genoma del cromatóforo de Paulinella arroja luz sobre la adquisición de la fotosíntesis por eucariotas" . Current Biology . 18 (6): 410–8 . Bibcode : 2008CBio...18..410N . doi : 10.1016/j.cub.2008.02.051 . PMID 18356055 . 
  • Proteomas HAMAP: Plástidos
  • Genomas completos de plastidios
  • Base de datos del genoma del cloroplasto
  • Genomas de plastidios eucariotas del NCBI
  • Lista del genoma del cloroplasto Archivado el 20/04/2012 en Wayback Machine En: Genómica de Montreal Archivado el 20/04/2012 en Wayback Machine
  • Psilotum nud [ 1 ] um
  1. ↑ Dennis, RD (enero de 1976). "Hormonas morfogenéticas de insectos y mecanismos de desarrollo en el nematodo Nematospiroides dubius". Comparative Biochemistry and Physiology. A, Comparative Physiology . 53 (1): 53– 56. doi : 10.1016/s0300-9629(76)80009-6 . ISSN 0300-9629 . PMID 184 .