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mutación de cambio de marco

Diferentes tipos de mutaciones indel. El panel C es simplemente una deleción y no una mutación de cambio de marco de lectura. Una mutación de cambio de marco de lectura (también...

Diferentes tipos de mutaciones indel. El panel C es simplemente una deleción y no una mutación de cambio de marco de lectura.

Una mutación de cambio de marco de lectura (también llamada error de marco o cambio de marco de lectura ) es una mutación genética causada por indels ( inserciones o deleciones ) de varios nucleótidos en una secuencia de ADN que no es divisible por tres. Debido a la naturaleza de triplete de la expresión génica por codones , la inserción o deleción puede cambiar el marco de lectura (la agrupación de los codones), lo que resulta en una traducción completamente diferente a la original. Cuanto antes en la secuencia ocurra la deleción o inserción, más alterada estará la proteína. [ 1 ] Una mutación de cambio de marco de lectura no es lo mismo que un polimorfismo de un solo nucleótido en el que se reemplaza un nucleótido, en lugar de insertarse o eliminarse. Una mutación de cambio de marco de lectura generalmente hará que la lectura de los codones posteriores a la mutación codifique diferentes aminoácidos. La mutación de cambio de marco de lectura también alterará el primer codón de parada ("UAA", "UGA" o "UAG") encontrado en la secuencia. El polipéptido resultante podría ser anormalmente corto o anormalmente largo, y lo más probable es que no sea funcional. [ 2 ]

Las mutaciones de cambio de marco son evidentes en enfermedades genéticas graves como la enfermedad de Tay-Sachs ; aumentan la susceptibilidad a ciertos cánceres y clases de hipercolesterolemia familiar ; en 1997, [ 3 ] una mutación de cambio de marco se relacionó con la resistencia a la infección por el retrovirus VIH. Se ha propuesto que las mutaciones de cambio de marco sean una fuente de novedad biológica, como con la supuesta creación de la nylonasa ; sin embargo, esta interpretación es controvertida. Un estudio de Negoro et al. (2006) [ 4 ] encontró que era improbable que una mutación de cambio de marco hubiera sido la causa y que, más bien, una sustitución de dos aminoácidos en el sitio activo de una esterasa ancestral dio como resultado la nylonasa.

Fondo

La información contenida en el ADN determina la función de las proteínas en las células de todos los organismos. La transcripción y la traducción permiten que esta información se transmita para la síntesis de proteínas. Sin embargo, un error en la interpretación de esta información puede provocar una función proteica incorrecta y, eventualmente, enfermedades, incluso cuando la célula incorpora diversos mecanismos de corrección. El ADN transmite la información genética para la síntesis de proteínas dentro de las células. Una interpretación errónea puede conducir a una función defectuosa y a enfermedades, a pesar de los mecanismos de corrección celular.

El modelo del dogma central

Dogma central

En 1956, Francis Crick describió el flujo de información genética desde el ADN hasta una disposición específica de aminoácidos para la formación de una proteína como el dogma central. [ 1 ] Para que una célula funcione correctamente, se requiere que las proteínas se produzcan con precisión para las actividades estructurales y catalíticas . Una proteína producida incorrectamente puede tener efectos perjudiciales sobre la viabilidad celular y, en la mayoría de los casos, provocar que el organismo superior enferme debido a funciones celulares anormales. Para asegurar que el genoma transmita correctamente la información, se incorporan mecanismos de corrección de errores , como las exonucleasas y los sistemas de reparación de errores de apareamiento, en la replicación del ADN . [ 1 ]

Transcripción y traducción

El proceso de traducción

Después de la replicación del ADN, la lectura de una sección seleccionada de información genética se realiza mediante transcripción . [ 1 ] Los nucleótidos que contienen la información genética se encuentran ahora en una plantilla de cadena simple de ARN mensajero llamada ARNm . El ARNm se incorpora a una subunidad del ribosoma e interactúa con un ARNr . La información genética contenida en los codones del ARNm es leída (decodificada) por los anticodones del ARNt. A medida que se lee cada codón (triplete), se unen aminoácidos hasta que se alcanza un codón de parada (UAG, UGA o UAA). En este punto, el polipéptido (proteína) se ha sintetizado y se libera. [ 1 ] Por cada 1000 aminoácidos incorporados a la proteína, no hay más de uno incorrecto. Esta fidelidad en el reconocimiento de codones, que mantiene la importancia del marco de lectura correcto, se logra mediante el apareamiento adecuado de bases en el sitio A del ribosoma, la actividad de hidrólisis de GTP de EF-Tu (una forma de estabilidad cinética) y un mecanismo de corrección de errores cuando se libera EF-Tu. [ 1 ]

El cambio de marco de lectura también puede ocurrir durante la traducción en profase , produciendo diferentes proteínas a partir de marcos de lectura abiertos superpuestos, como las proteínas retrovirales gag-pol-env . Esto es bastante común en virus y también ocurre en bacterias y levaduras (Farabaugh, 1996). Se cree que la transcriptasa inversa , a diferencia de la ARN polimerasa II , es una causa más importante de la aparición de mutaciones por cambio de marco de lectura. En experimentos, solo entre el 3 % y el 13 % de todas las mutaciones por cambio de marco de lectura ocurrieron debido a la ARN polimerasa II. En procariotas , la tasa de error que induce mutaciones por cambio de marco de lectura se encuentra solo en algún punto del rango de 0,0001 a 0,00001. [ 5 ]

Existen varios procesos biológicos que ayudan a prevenir las mutaciones por desplazamiento del marco de lectura. Se producen mutaciones inversas que transforman la secuencia mutada en la secuencia original de tipo silvestre . Otra posibilidad para la corrección de mutaciones es el uso de una mutación supresora . Esta contrarresta el efecto de la mutación original mediante la creación de una mutación secundaria, desplazando la secuencia para permitir la lectura de los aminoácidos correctos. También se puede utilizar ARN guía para insertar o eliminar uridina en el ARNm después de la transcripción, lo que permite el correcto marco de lectura. [ 1 ]

Importancia del triplete de codones

El código de tres letras, el codón

Un codón es un conjunto de tres nucleótidos , un triplete que codifica un aminoácido específico. El primer codón establece el marco de lectura, donde comienza un nuevo codón. La secuencia de aminoácidos de una proteína se define mediante tripletes contiguos. [ 6 ] Los codones son clave para la traducción de la información genética para la síntesis de proteínas. El marco de lectura se establece cuando comienza la traducción del ARNm y se mantiene a medida que se lee un triplete tras otro. La lectura del código genético está sujeta a tres reglas que rigen los codones en el ARNm. Primero, los codones se leen en dirección 5' a 3'. Segundo, los codones no se solapan y el mensaje no tiene huecos. La última regla, como se mencionó anteriormente, es que el mensaje se traduce en un marco de lectura fijo. [ 1 ]

Ejemplo de diferentes tipos de mutaciones puntuales

Mecanismo

Las mutaciones por desplazamiento del marco de lectura pueden ocurrir de forma aleatoria o ser causadas por un estímulo externo. Su detección puede realizarse mediante diversos métodos. Si bien son un tipo de mutación que puede dar lugar a proteínas incompletas o incorrectas, representan un porcentaje significativo de errores en el ADN. En un gen no alterado, los codones (tripletes de nucleótidos) se interpretan secuencialmente, y cada codón codifica un aminoácido específico. Esto se conoce como marco de lectura estándar. Sin embargo, en el caso de las mutaciones por desplazamiento del marco de lectura, se inserta uno o más nucleótidos adicionales en la secuencia de ADN, alterando el marco de lectura típico y provocando un cambio en la secuencia.

Esta inserción provoca un cambio en el marco de lectura debido a la naturaleza de triplete del código genético. Por ejemplo, la adición de una "A" extra produce un cambio en la secuencia, lo que desencadena la lectura de un conjunto de codones completamente diferente. Esta desviación en la información genética hace que el ribosoma, que lee el ARNm para la síntesis de proteínas, interprete erróneamente los datos genéticos. En consecuencia, se genera una serie de aminoácidos completamente diferente, lo que resulta en la generación de una secuencia proteica alterada. En la mayoría de los casos, el nuevo marco de lectura produce un encuentro prematuro con un codón de parada, lo que lleva a la formación de una proteína acortada y generalmente inactiva. Este tipo de mutación se denomina codón de parada prematuro o mutación sin sentido.

Genéticas o ambientales

Se trata de una mutación genética a nivel de bases nucleotídicas. Se investigan continuamente las causas y los mecanismos de las mutaciones por desplazamiento del marco de lectura. Se realizó un estudio ambiental, específicamente sobre la producción de mutaciones por desplazamiento del marco de lectura inducidas por radiación UV mediante ADN polimerasas deficientes en la actividad exonucleasa 3′ → 5′. La secuencia normal 5′ GTC GTT TTA CAA 3′ se modificó a GTC GTT T TTA CAA (MIDT) o GTC GTT C TTA CAA (MIDC) para estudiar los desplazamientos del marco de lectura. Las enzimas mutantes de la ADN polimerasa pol I Kf y T7 de E. coli, desprovistas de la actividad exonucleasa 3′ → 5′, producen revertantes inducidos por radiación UV con mayor frecuencia que sus contrapartes con actividad exonucleasa . Los datos indican que la pérdida de la actividad correctora aumenta la frecuencia de los desplazamientos del marco de lectura inducidos por radiación UV. [ 7 ]

Detección

Fluorescencia

Se han investigado en profundidad los efectos de las bases vecinas y la estructura secundaria para detectar la frecuencia de mutaciones de cambio de marco de lectura mediante fluorescencia . El ADN marcado con fluorescencia, mediante análogos de bases, permite estudiar los cambios locales de una secuencia de ADN. [ 8 ] Los estudios sobre los efectos de la longitud de la hebra cebadora revelan que se observó una mezcla de equilibrio de cuatro conformaciones de hibridación cuando las bases del molde se extendían formando un bucle, es decir, una estructura flanqueada a ambos lados por ADN bicatenario. Por el contrario, se observó una estructura de doble bucle con una conformación de ADN inusualmente desapilada en su borde distal cuando las bases extruidas se posicionaban en la unión cebador-molde, lo que demuestra que las desalineaciones pueden ser modificadas por la estructura secundaria del ADN vecino. [ 9 ]

Secuenciación

Una mutación por deleción altera todos los codones que la siguen y puede provocar que la síntesis de proteínas se detenga prematuramente al formar un codón de parada .

La secuenciación de Sanger y la pirosecuenciación son dos métodos que se han utilizado para detectar mutaciones de cambio de marco de lectura; sin embargo, es probable que los datos generados no sean de la más alta calidad. Aun así, se han identificado 1,96 millones de inserciones/deleciones mediante la secuenciación de Sanger que no se superponen con otras bases de datos. Cuando se observa una mutación de cambio de marco de lectura, se compara con la Base de Datos de Mutaciones del Genoma Humano (HGMD) para determinar si la mutación tiene un efecto dañino. Esto se hace analizando cuatro características: primero, la proporción entre el ADN afectado y el conservado; segundo, la ubicación de la mutación con respecto al transcrito; tercero, la proporción de aminoácidos conservados y afectados; y finalmente, la distancia de la inserción/deleción al final del exón . [ 10 ]

La secuenciación masivamente paralela es un método más reciente que se puede utilizar para detectar mutaciones. Mediante este método, se pueden secuenciar hasta 17 gigabases a la vez, en comparación con los rangos limitados de la secuenciación de Sanger, que es de solo alrededor de 1 kilobase. Existen varias tecnologías disponibles para realizar esta prueba y se está considerando su uso en aplicaciones clínicas. [ 11 ] Al analizar diferentes carcinomas, los métodos actuales solo permiten examinar un gen a la vez. La secuenciación masivamente paralela puede analizar una variedad de mutaciones causantes de cáncer a la vez, en lugar de realizar varias pruebas específicas. [ 12 ] Un experimento para determinar la precisión de este nuevo método de secuenciación analizó 21 genes y no presentó falsos positivos para mutaciones de cambio de marco de lectura. [ 13 ]

Diagnóstico

Una patente estadounidense (5,958,684) de 1999 por Leeuwen, detalla los métodos y reactivos para el diagnóstico de enfermedades causadas por o asociadas con un gen que tiene una mutación somática que da lugar a una mutación de cambio de marco. Los métodos incluyen proporcionar una muestra de tejido o fluido y realizar un análisis genético para la mutación de cambio de marco o una proteína de este tipo de mutación. La secuencia de nucleótidos del gen sospechoso se proporciona a partir de secuencias genéticas publicadas o de la clonación y secuenciación del gen sospechoso. Luego se predice la secuencia de aminoácidos codificada por el gen. [ 14 ] Secuenciación de NA: la secuenciación de Sanger o la secuenciación de próxima generación (NGS) se pueden utilizar para secuenciar directamente el ADN e identificar inserciones o deleciones. Reacción en cadena de la polimerasa (PCR): la PCR se puede utilizar para amplificar la región específica que contiene la mutación para el análisis posterior. Amplificación de sonda dependiente de ligación múltiple (MLPA): MLPA es una técnica utilizada para detectar variaciones en el número de copias y pequeñas inserciones o deleciones. Hibridación genómica comparativa (CGH): La CGH se utiliza para detectar desequilibrios cromosómicos, que pueden incluir grandes inserciones o deleciones.

Frecuencia

A pesar de las reglas que rigen el código genético y los diversos mecanismos presentes en una célula para asegurar la correcta transferencia de información genética durante el proceso de replicación del ADN, así como durante la traducción, ocurren mutaciones; la mutación por cambio de marco no es el único tipo. Existen al menos otros dos tipos de mutaciones puntuales reconocidas, específicamente la mutación de sentido erróneo y la mutación sin sentido . [ 1 ] Una mutación por cambio de marco puede alterar drásticamente la capacidad de codificación (información genética) del mensaje. [ 1 ] Las inserciones o deleciones pequeñas (de menos de 20 pares de bases) constituyen el 24 % de las mutaciones que se manifiestan en las enfermedades genéticas actualmente reconocidas. [ 10 ]

Se ha observado que las mutaciones por cambio de marco de lectura son más frecuentes en las regiones repetitivas del ADN. Esto se debe, en parte, al deslizamiento de la enzima polimerasa en dichas regiones, lo que permite la entrada de mutaciones en la secuencia . [ 15 ] Se pueden realizar experimentos para determinar la frecuencia de la mutación por cambio de marco de lectura añadiendo o eliminando un número preestablecido de nucleótidos. Se han realizado experimentos añadiendo cuatro pares de bases, denominados experimentos +4, pero un equipo de la Universidad de Emory analizó la diferencia en la frecuencia de la mutación al añadir y eliminar un par de bases. Se demostró que no existía diferencia en la frecuencia entre la adición y la eliminación de un par de bases. Sin embargo, sí existe una diferencia en el resultado de la proteína. [ 15 ]

La enfermedad de Huntington es uno de los nueve trastornos de reiteración de codones causados ​​por mutaciones de expansión de poliglutamina, que incluyen la ataxia espinocerebelosa (SCA) 1, 2, 6, 7 y 3, la atrofia muscular espinobulbar y la atrofia dentatorrubal-palidoluysianatrofia. Podría existir una relación entre las enfermedades causadas por mutaciones de expansión de poliglutamina y polialanina, como el cambio de marco de lectura del producto génico SCA3 original que codifica CAG/poliglutaminas a GCA/polialaninas. Se ha propuesto que el deslizamiento ribosomal durante la traducción de la proteína SCA3 es el mecanismo que produce el cambio del marco de lectura de la poliglutamina al de la polialanina. Una deleción de dinucleótidos o una inserción de un solo nucleótido dentro del tracto de poliglutamina del exón 1 de la huntingtina desplazaría el marco de codificación CAG (poliglutamina) en +1 (+1 cambio de marco) al marco de codificación GCA (polialanina) e introduciría un nuevo epítopo en el extremo C del exón 1 de Htt (APAAAPAATRPGCG). [ 16 ]

Enfermedades

Varias enfermedades tienen como causa, al menos en parte, mutaciones con cambio de marco de lectura. Conocer las mutaciones más frecuentes también puede ayudar en el diagnóstico de la enfermedad. Actualmente se están realizando esfuerzos para utilizar las mutaciones con cambio de marco de lectura de forma beneficiosa en el tratamiento de enfermedades, modificando el marco de lectura de los aminoácidos.

Frecuencia de mutaciones en el gen BRCA1 en el cromosoma 17
Frecuencia de mutaciones en el gen BRCA2 en el cromosoma 13

Cáncer

Se sabe que las mutaciones de cambio de marco son un factor en el cáncer colorrectal , así como en otros cánceres con inestabilidad de microsatélites . Como se indicó anteriormente, las mutaciones de cambio de marco tienen más probabilidades de ocurrir en una región de secuencia repetida. Cuando la reparación de errores de apareamiento del ADN no corrige la adición o eliminación de bases, estas mutaciones tienen más probabilidades de ser patógenas. Esto puede deberse en parte a que el tumor no recibe la señal para detener su crecimiento. Los experimentos en levaduras y bacterias ayudan a mostrar características de los microsatélites que pueden contribuir a la reparación defectuosa de errores de apareamiento del ADN. Estas incluyen la longitud del microsatélite , la composición del material genético y la pureza de las repeticiones. Según los resultados experimentales, los microsatélites más largos tienen una mayor tasa de mutaciones de cambio de marco. El ADN flanqueante también puede contribuir a las mutaciones de cambio de marco. [ 17 ] En el cáncer de próstata, una mutación de cambio de marco altera el marco de lectura abierto (ORF) e impide que ocurra la apoptosis . Esto conduce a un crecimiento descontrolado del tumor . Si bien existen factores ambientales que contribuyen a la progresión del cáncer de próstata , también existe un componente genético. Durante las pruebas de regiones codificantes para identificar mutaciones, se descubrieron 116 variantes genéticas, incluidas 61 mutaciones de cambio de marco de lectura. [ 18 ] Hay más de 500 mutaciones en el cromosoma 17 que parecen desempeñar un papel en el desarrollo del cáncer de mama y de ovario en el gen BRCA1, muchas de las cuales son de cambio de marco de lectura. [ 19 ]

enfermedad de Crohn

La enfermedad de Crohn está asociada al gen NOD2 . La mutación consiste en la inserción de una citosina en la posición 3020. Esto genera un codón de parada prematuro, acortando la proteína que debería transcribirse. Cuando la proteína se forma normalmente, responde a los liposacáridos bacterianos; sin embargo, la mutación 3020insC impide que la proteína responda. [ 20 ]

Fibrosis quística

La fibrosis quística (FQ) es una enfermedad causada por mutaciones en el gen regulador de la conductancia transmembrana de la fibrosis quística . Se han identificado más de 1500 mutaciones, pero no todas provocan la enfermedad. [ 21 ] La mayoría de los casos de fibrosis quística se deben a la mutación ∆F508, que elimina el aminoácido completo. Dos mutaciones con cambio del marco de lectura son de interés para el diagnóstico de la FQ: CF1213delT y CF1154-insTC. Ambas mutaciones suelen presentarse junto con al menos otra mutación. Ambas provocan una ligera disminución de la función pulmonar y se presentan en aproximadamente el 1 % de los pacientes analizados. Estas mutaciones se identificaron mediante secuenciación de Sanger . [ 22 ]

VIH

CCR5 es uno de los cofactores de entrada celular asociados al VIH, que participa con mayor frecuencia en cepas no inductoras de sincitios y es más evidente en pacientes con VIH que en pacientes con SIDA. Se ha identificado una deleción de 32 pares de bases en CCR5 como una mutación que anula la probabilidad de una infección por VIH. Esta región en el marco de lectura abierto (ORF) contiene una mutación de cambio de marco que conduce a un codón de parada prematuro. Esto provoca la pérdida de la función del correceptor del VIH in vitro. CCR5-1 se considera el tipo silvestre y CCR5-2 se considera el alelo mutante. Aquellos con una mutación heterocigota para CCR5 fueron menos susceptibles al desarrollo del VIH. En un estudio, a pesar de la alta exposición al virus del VIH, no hubo ningún individuo homocigoto para la mutación CCR5 que diera positivo para el VIH. [ 3 ]

Enfermedad de Tay-Sachs

La enfermedad de Tay-Sachs es una enfermedad mortal que afecta al sistema nervioso central. Se encuentra con mayor frecuencia en bebés y niños pequeños. La progresión de la enfermedad comienza en el útero , pero los síntomas no aparecen hasta aproximadamente los 6 meses de edad. No hay cura para la enfermedad. [ 23 ] Se sabe que las mutaciones en el gen β-hexosaminidasa A ( HEXA ) afectan el inicio de Tay-Sachs, con 78 mutaciones de diferentes tipos descritas, 67 de las cuales se sabe que causan la enfermedad. La mayoría de las mutaciones observadas (65/78) son sustituciones de una sola base o SNP, 11 deleciones, 1 grande y 10 pequeñas, y 2 inserciones. 8 de las mutaciones observadas son de cambio de marco, 6 deleciones y 2 inserciones. Una inserción de 4 pares de bases en el exón 11 se observa en el 80% de la presencia de la enfermedad de Tay-Sachs en la población judía asquenazí . Las mutaciones con cambio de marco de lectura dan lugar a un codón de parada prematuro, que se sabe que desempeña un papel en la enfermedad en lactantes. La enfermedad de aparición tardía parece estar causada por 4 mutaciones diferentes, una de las cuales es una deleción de 3 pares de bases. [ 24 ]

Síndrome de Smith-Magenis

El síndrome de Smith-Magenis (SMS) es un síndrome complejo que incluye discapacidad intelectual , trastornos del sueño, problemas de comportamiento y diversas anomalías craneofaciales, esqueléticas y viscerales. La mayoría de los casos de SMS presentan una deleción común de aproximadamente 3,5 Mb que abarca el gen retinoic acid induced-1 ( RAI1 ). Otros casos ilustran una variabilidad en el fenotipo del SMS no observada previamente para la mutación de RAI1, incluyendo pérdida auditiva, comportamientos autolesivos y retrasos globales leves. La secuenciación de RAI1 reveló una mutación en un tracto C heptamérico (CCCCCCCC) en el exón 3 que produce mutaciones con cambio de marco de lectura. De las siete mutaciones con cambio de marco de lectura notificadas que ocurren en tractos de poli C en RAI1, cuatro casos (aproximadamente el 57%) ocurren en este tracto C heptamérico. Los resultados indican que este tracto C heptamérico es un punto caliente de recombinación preferencial para inserciones/deleciones (SNindels) y, por lo tanto, un objetivo principal para el análisis en pacientes con sospecha de mutaciones en RAI1. [ 25 ]

miocardiopatía hipertrófica

La miocardiopatía hipertrófica es la causa más común de muerte súbita en jóvenes, incluidos atletas entrenados, y se debe a mutaciones en genes que codifican proteínas del sarcómero cardíaco. Las mutaciones en el gen de la troponina C ( TNNC1 ) son una causa genética poco frecuente de miocardiopatía hipertrófica. Un estudio reciente indicó que una mutación con cambio del marco de lectura (c.363dupG o p.Gln122AlafsX30) en la troponina C fue la causa de miocardiopatía hipertrófica (y muerte súbita cardíaca) en un varón de 19 años. [ 26 ]

Curas

Encontrar una cura para las enfermedades causadas por mutaciones con cambio de marco de lectura es poco común. La investigación al respecto continúa. Un ejemplo es la inmunodeficiencia primaria (IDP), una afección hereditaria que puede aumentar el riesgo de infecciones. Existen 120 genes y 150 mutaciones implicadas en las inmunodeficiencias primarias. El tratamiento estándar actual es la terapia génica , pero este tratamiento conlleva un alto riesgo y a menudo puede provocar otras enfermedades, como la leucemia. Los procedimientos de terapia génica incluyen la modificación de la proteína de fusión nucleasa fringer de zinc, que corta ambos extremos de la mutación, eliminándola así de la secuencia. El salto de exones mediado por oligonucleótidos antisentido es otra posibilidad para la distrofia muscular de Duchenne . Este proceso permite omitir la mutación, de modo que el resto de la secuencia permanece en el marco de lectura correcto y la función de la proteína se mantiene intacta. Sin embargo, esto no cura la enfermedad, solo trata los síntomas, y solo es práctico en proteínas estructurales u otros genes repetitivos. Una tercera forma de reparación es el mosaicismo revertante , que ocurre de forma natural mediante la creación de una mutación inversa o una mutación en un segundo sitio que corrige el marco de lectura. Esta reversión puede ocurrir por recombinación intragénica , conversión génica mitótica , deslizamiento del ADN en un segundo sitio o reversión específica del sitio. Esto es posible en varias enfermedades, como la inmunodeficiencia combinada grave ligada al cromosoma X (SCID), el síndrome de Wiskott-Aldrich y el síndrome de Bloom . No existen fármacos ni otros métodos farmacogenómicos que ayuden con las inmunodeficiencias primarias (IDP). [ 27 ]

Una patente europea (EP1369126A1) de Bork, de 2003, describe un método para la prevención del cáncer y el tratamiento curativo de tumores y lesiones precancerosas, como tumores esporádicos con deficiencia en la reparación de errores de emparejamiento del ADN (MMR) y tumores asociados al síndrome de Lynch (HNPCC). La idea consiste en utilizar inmunoterapia con mezclas combinatorias de péptidos derivados de mutaciones de cambio de marco específicas del tumor para inducir una respuesta de linfocitos T citotóxicos dirigida específicamente contra las células tumorales. [ 28 ]

Véase también

Referencias

  1. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Losick, Richard; Watson, James D.; Baker, Tania A.; Bell, Stephen; Gann, Alexander; Levine, Michael W. (2008). Biología molecular del gen (6.ª  ed.). San Francisco: Pearson/Benjamin Cummings. ISBN 978-0-8053-9592-1.
  2. "El ADN cambia constantemente a través del proceso de mutación" . Nature . Consultado el 17 de mayo de 2019 .
  3. 1 2 Zimmerman PA, Buckler-White A, Alkhatib G, Spalding T, Kubofcik J, Combadiere C, Weissman D, Cohen O, Rubbert A, Lam G, Vaccarezza M, Kennedy PE, Kumaraswami V, Giorgi JV, Detels R, Hunter J, Chopek M, Berger EA, Fauci AS, Nutman TB, Murphy PM (enero de 1997). "Resistencia hereditaria al VIH-1 conferida por una mutación inactivadora en el receptor de quimiocina CC 5: estudios en poblaciones con fenotipos clínicos contrastantes, antecedentes raciales definidos y riesgo cuantificado" . Molecular Medicine . 3 (1): 23– 36. PMC 2230106. PMID 9132277 .  
  4. ^ Negoro S, Ohki T, Shibata N, Mizuno N, Wakitani Y, Tsurukame J, Matsumoto K, Kawamoto I, Takeo M, Higuchi Y (noviembre de 2005). "Análisis cristalográfico de rayos X de 6-aminohexanoato-dímero hidrolasa: base molecular para el nacimiento de una enzima que degrada el oligómero de nailon" . J Biol Chem . 280 (47): 39644– 52. doi : 10.1074/jbc.m505946200 . PMID 16162506 . 
  5. Zhang, J (agosto de 2004). "La ARN polimerasa II del huésped contribuye mínimamente a las mutaciones de cambio de marco retrovirales" . The Journal of General Virology . 85 (Pt 8): 2389–95 . doi : 10.1099/vir.0.80081-0 . PMID 15269381 . 
  6. Cox, Michael; Nelson, David R.; Lehninger, Albert L. (2008). Principios de bioquímica de Lehninger . San Francisco: WH Freeman. ISBN 978-0-7167-7108-1.
  7. Sagher, Daphna; Turkington, Edith; Acharya, Sonia; Strauss, Bernard (julio de 1994). "Producción de mutaciones de cambio de marco inducidas por UV in vitro por ADN polimerasas deficientes en actividad exonucleasa 3′ → 5′". Journal of Molecular Biology . 240 (3): 226– 242. doi : 10.1006/jmbi.1994.1437 . PMID 8028006 . 
  8. Johnson, Neil P.; Walter A. Baase; Peter H. von Hippel (marzo de 2004). "Dicroísmo circular de baja energía del dinucleótido de 2-aminopurina como sonda de la conformación local del ADN y el ARN" . Proc Natl Acad Sci USA . 101 (10): 3426–31 . Bibcode : 2004PNAS..101.3426J . doi : 10.1073/pnas.0400591101 . PMC 373478. PMID 14993592 .  
  9. Baase, Walter A.; Davis Jose; Benjamin C. Ponedel; Peter H. von Hippel; Neil P. Johnson (2009). " Modelos de ADN de deleciones de cambio de marco de lectura de trinucleótidos: la formación de bucles y protuberancias en la unión del cebador-plantilla" . Nucleic Acids Research . 37 (5): 1682–9 . doi : 10.1093/nar/gkn1042 . PMC 2655659. PMID 19155277 .  
  10. 1 2 Hu, J; Ng, PC (9 de febrero de 2012). "Predicción de los efectos de las inserciones/deleciones que provocan cambios de marco de lectura" . Genome Biology . 13 (2): R9. doi : 10.1186/gb-2012-13-2-r9 . PMC 3334572. PMID 22322200 .  
  11. Tucker, Tracy; Marra, Marco; Friedman, Jan M. (2009). "Secuenciación masivamente paralela: la próxima gran novedad en medicina genética" . The American Journal of Human Genetics . 85 (2): 142– 154. doi : 10.1016/j.ajhg.2009.06.022 . PMC 2725244. PMID 19679224 .  
  12. Walsh, T.; Casadei, S.; Lee, MK; Pennil, CC; Nord, AS; Thornton, AM; Roeb, W.; Agnew, KJ; Stray, SM; Wickramanayake, A.; Norquist, B.; Pennington, KP; Garcia, RL; King, M.-C.; Swisher, EM (2011). "De la portada: Mutaciones en 12 genes para carcinoma ovárico, de trompas de Falopio y peritoneal hereditario identificados mediante secuenciación masiva en paralelo" . Proc Natl Acad Sci USA . 108 (44): 18032– 7. Bibcode : 2011PNAS..10818032W . doi : 10.1073/pnas.1115052108 . PMC 3207658 . PMID 22006311 .  
  13. Walsh, T.; Lee, MK; Casadei, S.; Thornton, AM; Stray, SM; Pennil, C.; Nord, AS; Mandell, JB; Swisher, EM; King, M.-C. (2010). "Detección de mutaciones hereditarias para el cáncer de mama y ovario mediante captura genómica y secuenciación masivamente paralela" . Proc Natl Acad Sci USA . 107 (28): 12629– 33. Bibcode : 2010PNAS..10712629W . doi : 10.1073/pnas.1007983107 . PMC 2906584. PMID 20616022 .  
  14. Patente estadounidense 5,958,684 (28 de septiembre de 1999) "Diagnóstico de enfermedades neurodegenerativas" por Leeuwen et al.
  15. 1 2 Harfe, BD; Jinks-Robertson, S (julio de 1999). "Eliminación de intermediarios de cambio de marco por proteínas de reparación de errores de apareamiento en Saccharomyces cerevisiae" . Biología molecular y celular . 19 (7): 4766– 73. doi : 10.1128/MCB.19.7.4766 . PMC 84275. PMID 10373526 .  
  16. Davies, JE; Rubinsztein, DC (2006). "Productos de cambio de marco de lectura de polialanina y poliserina en la enfermedad de Huntington" . Journal of Medical Genetics . 43 (11): 893– 896. doi : 10.1136/jmg.2006.044222 . PMC 2563184. PMID 16801344 .  
  17. Schmoldt, A; Benthe, HF; Haberland, G (1 de septiembre de 1975). "Metabolismo de la digitoxina por microsomas de hígado de rata" . Farmacología bioquímica . 24 (17): 1639– 41. doi : 10.1016/0006-2952(75)90094-5 . hdl : 10033/333424 . PMID 10 . 
  18. ^ Xu, XiaoLin; Zhu, KaiChang; Liu, Feng; Wang, Yue; Shen, Jianguo; Jin, Jizhong; Wang, Zhong; Chen, Lin; Li, Jia Dong; Xu, Min (mayo de 2013). "Identificación de mutaciones somáticas en cáncer de próstata humano mediante RNA-Seq". Gen.519 (2): 343– 7. doi : 10.1016/j.gene.2013.01.046 . PMID 23434521 . 
  19. "Genómica del cáncer" . Instituto Nacional del Cáncer de los Institutos Nacionales de Salud. Archivado del original el 18 de marzo de 2013. Consultado el 24 de marzo de 2013 .
  20. ^ Ogura Y, Bonen DK, Inohara N, Nicolae DL, Chen FF, Ramos R, Britton H, Moran T, Karaliuskas R, Duerr RH, Achkar JP, Brant SR, Bayless TM, Kirschner BS, Hanauer SB, Nuñez G, Cho JH (31 de mayo de 2001). "Una mutación de cambio de marco en NOD2 asociada con la susceptibilidad a la enfermedad de Crohn" (PDF) . Naturaleza . 411 (6837): 603– 6. Bibcode : 2001Natur.411..603O . doi : 10.1038/35079114 . hdl : 2027.42/62856 . PMID 11385577 . S2CID 205017657 .  
  21. Farrell PM, Rosenstein BJ, White TB, Accurso FJ, Castellani C, Cutting GR, Durie PR, Legrys VA, Massie J, Parad RB, Rock MJ, Campbell PW (2008). "Guías para el diagnóstico de fibrosis quística en recién nacidos hasta adultos mayores: Informe de consenso de la Fundación de Fibrosis Quística" . The Journal of Pediatrics . 153 (2): S4– S14. doi : 10.1016/j.jpeds.2008.05.005 . PMC 2810958. PMID 18639722 .  
  22. Iannuzzi, MC; Stern, RC; Collins, FS; Hon, CT; Hidaka, N; Strong, T; Becker, L; Drumm, ML; White, MB; Gerrard, B (febrero de 1991). "Dos mutaciones de cambio de marco en el gen de la fibrosis quística" . American Journal of Human Genetics . 48 (2): 227– 31. PMC 1683026. PMID 1990834 .  
  23. "Aprendiendo sobre la enfermedad de Tay-Sachs" . Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano . Consultado el 24 de marzo de 2013 .
  24. Myerowitz, R (1997). "Mutaciones causantes de la enfermedad de Tay-Sachs y polimorfismos neutros en el gen Hex A" . Human Mutation . 9 (3): 195– 208. doi : 10.1002/(SICI)1098-1004(1997)9:3 < 195::AID-HUMU1 > 3.0.CO ; 2-7 . PMID 9090523 . 
  25. Truong, Hoa T; Dudding, Tracy; Blanchard, Christopher L.; Elsea, Sarah H (2010). "Identificación de un punto crítico de mutación por cambio de marco de lectura en el síndrome de Smith-Magenis: informe de caso y revisión de la literatura" . BMC Medical Genetics . 11 (1): 142. doi : 10.1186/1471-2350-11-142 . PMC 2964533. PMID 20932317 .  
  26. Chung WK, Kitner C, Maron BJ (junio de 2011). "Nueva mutación de cambio de marco en la troponina C (TNNC1) asociada con miocardiopatía hipertrófica y muerte súbita". Cardiol Young . 21 (3): 345–8 . doi : 10.1017/S1047951110001927 . PMID 21262074. S2CID 46682245 .  
  27. Hu, Hailiang; Gatti, Richard A (2008). "Nuevos enfoques para el tratamiento de las inmunodeficiencias primarias: corrección de mutaciones con sustancias químicas" . Current Opinion in Allergy and Clinical Immunology . 8 (6): 540– 6. doi : 10.1097/ACI.0b013e328314b63b . PMC 2686128. PMID 18978469 .  
  28. Patente europea(10 de diciembre de 2003) "Uso de péptidos derivados de mutaciones de cambio de marco de lectura en regiones de microsatélites codificantes para el tratamiento del cáncer" por Bork et al.

Lecturas adicionales

  • Farabaugh PJ (1996). "Cambio de marco traslacional programado" . Annu. Rev. Genet . 30 (1): 507– 28. doi : 10.1146/annurev.genet.30.1.507 . PMC 239420. PMID 8982463 .  
  • Lewis, Ricki (2005). Genética humana: conceptos y aplicaciones (6.ª  ed.). Boston, MA: McGraw Hill. págs. 227-228 . ISBN  978-0-07-111156-0.
  • "Enzimas Nylonasa" . 20 de abril de 2004. Consultado el 2 de junio de 2009 .