Base de datos de frecuencias de alelos STR de la Tierra humana

La base de datos de frecuencias alélicas de STR de la Tierra ^[1] es un proyecto científico basado en una interfaz web dinámica y un sistema de gestión de bases de datos relacionales. Su principal objetivo es la gestión de datos poblacionales de STR notificados en todo el mundo, proporcionando herramientas de genética de poblaciones altamente especializadas y también una visión general de la estructura genética de la población mundial a escala global.

En la base del enfoque EHSTRAFD se encuentra la tendencia de estandarización de las revistas revisadas por pares en la publicación de datos poblacionales ^[2] y, lo más importante, la distribución del gradiente de frecuencias de alelos en vastas áreas geográficas. ^[3]^[4]^[5]

Herramientas de base de datos (módulos)

Seguimiento global de frecuencias alélicas (AFGT): permite buscar la distribución de frecuencias alélicas a nivel global y regional. Los loci STR están disponibles en AFGT si se informan en al menos diez poblaciones de EHSTRAFD. La lista de locus AFGT se actualiza permanentemente con cada lanzamiento de EHSTRAFD.

Frecuencia de perfil regional (RPF): permite calcular la frecuencia de un perfil genético a nivel global y regional, basándose en los registros actuales de EHSTRAFD. RPF está disponible solo para loci ISSOL ( Interpol Standard Set Of Loci), ESS (European Standard Set - recomendado por ENFSI) y CODIS (Combined DNA Index System).

Origen geográfico más probable (MPGO): permite buscar el origen geográfico más probable de un perfil genético STR determinado. El origen geográfico se estima mediante la frecuencia del perfil en diferentes poblaciones. MPGO está disponible solo para loci ISSOL ( Interpol Standard Set Of Loci), ESS (European Standard Set - recomendado por ENFSI) y CODIS (Combined DNA Index System).

Véase también

Referencias

^ EHSTRAFD - Base de datos de frecuencias de alelos STR humanos de la Tierra. c2009 [citado el 14 de junio de 2009 - R1]. Disponible en http://www.ehstrafd.org Archivado el 13 de julio de 2009 en Wayback Machine.
^ Patrick Lincoln, Angel Carracedo. Publicación de datos poblacionales de polimorfismos humanos. Forensic Sci Int. 2000;110(1):3-5.
^ Yates GB. Teoría de la correlación de gradientes. c1996 [citado el 16 de mayo de 2009] . Disponible de la http://www.autismtheory.org/GradientCorrelation.htm Archivado el 25 de junio de 2009 en Wayback Machine.
^ Serre D, Pääbo S. Evidencia de gradientes de diversidad genética humana dentro y entre continentes. Genome Res. 2004;14(9):1679-85.
^ Roewer L, Croucher PJ, Willuweit S, Lu TT, Kayser M, Lessig R, de Knijff P, Jobling MA, Tyler-Smith C, Krawczak M. Firma de eventos históricos recientes en la distribución del haplotipo STR del cromosoma Y europeo. Hum Genet. 2005;116(4):279-91

Enlaces externos

EHSTRAFD.org

[1] EHSTRAFD - Base de datos de frecuencias de alelos STR humanos de la Tierra. c2009 [citado el 14 de junio de 2009 - R1]. Disponible en http://www.ehstrafd.org Archivado el 13 de julio de 2009 en Wayback Machine.

[2] Patrick Lincoln, Angel Carracedo. Publicación de datos poblacionales de polimorfismos humanos. Forensic Sci Int. 2000;110(1):3-5.

[3] Yates GB. Teoría de la correlación de gradientes. c1996 [citado el 16 de mayo de 2009] . Disponible de la http://www.autismtheory.org/GradientCorrelation.htm Archivado el 25 de junio de 2009 en Wayback Machine.

[4] Serre D, Pääbo S. Evidencia de gradientes de diversidad genética humana dentro y entre continentes. Genome Res. 2004;14(9):1679-85.

[5] Roewer L, Croucher PJ, Willuweit S, Lu TT, Kayser M, Lessig R, de Knijff P, Jobling MA, Tyler-Smith C, Krawczak M. Firma de eventos históricos recientes en la distribución del haplotipo STR del cromosoma Y europeo. Hum Genet. 2005;116(4):279-91