Un SNPSTR es un marcador genético compuesto formado por uno o más SNP y un microsatélite (STR). Los SNPSTR autosómicos , que contienen un SNP y un microsatélite con una separación de 500 pares de bases entre sí, se descubrieron en 2002. [1] Más recientemente, se ha creado una base de datos que contiene todos los SNPSTR en cinco genomas modelo, incluido el humano. [2]
Uso e importancia
Ha habido un interés creciente y generalizado en los marcadores genéticos adecuados para extraer inferencias genéticas de poblaciones sobre eventos demográficos pasados y detectar los efectos de la selección. Los polimorfismos de un solo nucleótido ( SNP ) y los microsatélites (o repeticiones cortas en tándem, STR) han recibido gran atención en el análisis de la historia de la población humana, a pesar de que ambos tienen desventajas. Por lo tanto, se sugirió que la combinación de estos dos marcadores podría dar lugar a mejores conclusiones.
Véase también
- Genética de poblaciones
- Base de datos biológica
- Base de datos de frecuencias de alelos STR de la Tierra humana
- Análisis STR
- Sistema multiplex STR
- Y-STR
Referencias
- ^ Mountain JL, Knight A., Jobin M., Gignoux C., Miller A., Lin AA, Underhill PA SNPSTRs: haplotipos autosómicos de tipificación rápida y derivados empíricamente para la inferencia de la historia de la población y los procesos mutacionales. Genome Res. 2002;12:1766-1772.
- ^ AGRAFIOTI I Y STUMPF MPH (2007) "SNPSTR: una base de datos de marcadores microsatélites-SNP compuestos" Nucleic Acids Research 35 (número de la base de datos): 71–75.