BioPlex

La red de interacción de MED1 , una de las subunidades del complejo Mediador.

BioPlex ( interacciones biofísicas de complejos basados en ORFeoma ) es un recurso de acceso abierto para el estudio de interacciones proteína -proteína. ^[¹^]^[²^]^[³^] Es el resultado de colaboraciones entre la Facultad de Medicina de Harvard y Biogen . BioPlex 1.0 reportó 23.744 interacciones entre 7.668 proteínas. ^[⁴^] BioPlex 2.0 amplió esas observaciones para detectar más de 29.000 nuevas interacciones. ^[⁵^]

La tecnología básica consiste en expresar una proteína "cebo" en células humanas. Estas proteínas cebo interactúan con otras proteínas, y luego los complejos formados por la proteína cebo y la proteína "presa" se aíslan mediante purificación por afinidad . Las proteínas presa que interactúan se identifican mediante espectrometría de masas .

Uso en la investigación

Determinar los socios de interacción de proteínas poco caracterizadas puede proporcionar pistas sobre la función de esas proteínas, y saber en qué "comunidad de proteínas" reside un gen causante de una enfermedad puede dar un mejor contexto para su acción. ^{[ 5 ]}

Véase también

Referencias

↑ anónimo. "BioPlex" . harvard.edu . harvard.edu . Consultado el 24 de mayo de 2017 .
↑ anon (18 de julio de 2015). "Facebook para el proteoma" . technology.org . technology.org . Consultado el 24 de mayo de 2017 .
↑ anónimo. "Nuevo estudio mapea las interacciones de proteínas para una cuarta parte del genoma humano" . phys.org/ . phys.org . Consultado el 24 de mayo de 2017 .
^ Huttlin EL, Ting L, Bruckner RJ, Gebreab F, Gygi MP, Szpyt J, Tam S, Zarraga G, Colby G, Baltier K, Dong R, Guarani V, Vaites LP, Ordureau A, Rad R, Erickson BK, Wühr M, Chick J, Zhai B, Kolippakkam D, Mintseris J, Obar RA, Harris T, Artavanis-Tsakonas S, Sowa ME, De Camilli P, Paulo JA, Harper JW, Gygi SP (2015). "La red BioPlex: una exploración sistemática del interactoma humano" . Celúla . 162 (2): 425– 40. doi : 10.1016/j.cell.2015.06.043 . PMC 4617211 . PMID 26186194 .
1 2 Huttlin EL, Bruckner RJ, Paulo JA, Cannon JR, Ting L, Baltier K, Colby G, Gebreab F, Gygi MP, Parzen H, Szpyt J, Tam S, Zarraga G, Pontano-Vaites L, Swarup S, White AE, Schweppe DK, Rad R, Erickson BK, Obar RA, Guruharsha KG, Li K, Artavanis-Tsakonas S, Gygi SP, Harper JW (2017). "La arquitectura del interactoma humano define las comunidades de proteínas y las redes de enfermedades" . Nature . 545 ( 7655): 505– 509. Bibcode : 2017Natur.545..505H . doi : 10.1038/nature22366 . PMC 5531611. PMID 28514442 .

[1] ónimo. "BioPlex" . harvard.edu . harvard.edu . Consultado el 24 de mayo de 2017 .

[2] (18 de julio de 2015). "Facebook para el proteoma" . technology.org . technology.org . Consultado el 24 de mayo de 2017 .

[3] ónimo. "Nuevo estudio mapea las interacciones de proteínas para una cuarta parte del genoma humano" . phys.org/ . phys.org . Consultado el 24 de mayo de 2017 .

[pmid26186194-4] Huttlin EL, Ting L, Bruckner RJ, Gebreab F, Gygi MP, Szpyt J, Tam S, Zarraga G, Colby G, Baltier K, Dong R, Guarani V, Vaites LP, Ordureau A, Rad R, Erickson BK, Wühr M, Chick J, Zhai B, Kolippakkam D, Mintseris J, Obar RA, Harris T, Artavanis-Tsakonas S, Sowa ME, De Camilli P, Paulo JA, Harper JW, Gygi SP (2015). "La red BioPlex: una exploración sistemática del interactoma humano" . Celúla . 162 (2): 425– 40. doi : 10.1016/j.cell.2015.06.043 . PMC 4617211 . PMID 26186194 .

[pmid28514442-5] 1 2 Huttlin EL, Bruckner RJ, Paulo JA, Cannon JR, Ting L, Baltier K, Colby G, Gebreab F, Gygi MP, Parzen H, Szpyt J, Tam S, Zarraga G, Pontano-Vaites L, Swarup S, White AE, Schweppe DK, Rad R, Erickson BK, Obar RA, Guruharsha KG, Li K, Artavanis-Tsakonas S, Gygi SP, Harper JW (2017). "La arquitectura del interactoma humano define las comunidades de proteínas y las redes de enfermedades" . Nature . 545 ( 7655): 505– 509. Bibcode : 2017Natur.545..505H . doi : 10.1038/nature22366 . PMC 5531611. PMID 28514442 .

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