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TAF7

El factor de iniciación de la transcripción TFIID subunidad 7, también conocido como TAFII55, es una proteína que en humanos está codificada por el gen TAF7 . [ 5 ] Función El g...

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El factor de iniciación de la transcripción TFIID subunidad 7, también conocido como TAFII55, es una proteína que en humanos está codificada por el gen TAF7 . [ 5 ]

Función

El gen sin intrones de este coactivador de la transcripción se localiza entre los grupos de genes de protocadherina beta y gamma en el cromosoma 5. La proteína codificada por este gen es un componente del complejo proteico TFIID, un complejo que se une a la caja TATA en los promotores de clase II y recluta la ARN polimerasa II y otros factores. Esta subunidad en particular interactúa con la subunidad TFIID más grande, así como con múltiples activadores de la transcripción. La proteína es necesaria para la transcripción de los promotores a los que se dirige la ARN polimerasa II. [ 6 ]

El factor de transcripción general , TFIID, consta de la proteína de unión a TATA (TBP) asociada a una serie de factores asociados a TBP (TAF) que participan conjuntamente en el ensamblaje del complejo de preiniciación de la transcripción . TAFII55 se une a TAFII250 e inhibe su actividad acetiltransferasa. Actualmente se desconoce la función exacta de TAFII55, pero los estudios han demostrado que interactúa con la vía C-jun . [ 7 ] La región conservada se sitúa hacia el extremo N-terminal de la proteína. [ 8 ] Esta entrada trata sobre el dominio N-terminal .

Los estudios cristalográficos han revelado una cavidad hidrofóbica muy significativa entre TAF7 y TAF1, su principal proteína de unión. Debido a la increíble hidrofobicidad de esta interacción, es improbable que TAF1 pueda plegarse correctamente sin la presencia de TAF7. Por lo tanto, es posible que TAF7 sea necesario para la correcta producción de TAF1 [ 9 ].

Interacciones

Se ha demostrado que TAF7 interactúa con:

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000178913 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000051316 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Chiang CM, Roeder RG (enero de 1995). "Clonación de una subunidad TFIID humana intrínseca que interactúa con múltiples activadores transcripcionales". Science . 267 ( 5197): 531– 6. Bibcode : 1995Sci...267..531C . doi : 10.1126/science.7824954 . PMID 7824954. S2CID 21236901 .  
  6. ↑ "Entrez Gene: TAF7 TAF7 ARN polimerasa II, factor asociado a la proteína de unión a la caja TATA (TBP), 55 kDa" .
  7. ^ Munz C, Psichari E, Mandilis D, Lavigne AC, Spiliotaki M, Oehler T, Davidson I, Tora L, Angel P, Pintzas A (junio de 2003). "TAF7 (TAFII55) juega un papel en la activación de la transcripción por c-Jun" . La Revista de Química Biológica . 278 (24): 21510– 6. doi : 10.1074/jbc.M212764200 . PMID 12676957 . 
  8. 1 2 Gegonne A, Weissman JD, Singer DS (octubre de 2001). "La unión de TAFII55 a TAFII250 inhibe su actividad acetiltransferasa" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 98 (22): 12432– 7. Bibcode : 2001PNAS...9812432G . doi : 10.1073/pnas.211444798 . PMC 60071. PMID 11592977 .  
  9. ↑ Bhattacharya S, Lou X, Hwang P, Rajashankar KR, Wang X, Gustafsson JÅ , Fletterick RJ, Jacobson RH, Webb P (junio de 2014). "Perspectiva estructural y funcional sobre TAF1-TAF7, un subcomplejo del factor de transcripción II D" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 111 (25): 9103– 8. Bibcode : 2014PNAS..111.9103B . doi : 10.1073 / pnas.1408293111 . PMC 4078864. PMID 24927529 .  
  10. ↑ Bertolotti A, Melot T, Acker J, Vigneron M, Delattre O, Tora L (marzo de 1998). "EWS, pero no EWS-FLI-1, está asociado tanto con TFIID como con la ARN polimerasa II: interacciones entre dos miembros de la familia TET, EWS y hTAFII68, y subunidades de los complejos TFIID y ARN polimerasa II" . Biología Molecular y Celular . 18 (3): 1489–97 . doi : 10.1128/mcb.18.3.1489 . PMC 108863. PMID 9488465 .  
  11. ↑ Pointud JC, Mengus G, Brancorsini S, Monaco L, Parvinen M, Sassone-Corsi P, Davidson I (mayo de 2003). "La localización intracelular de TAF7L, un parálogo de la subunidad TAF7 del factor de transcripción TFIID, está regulada durante el desarrollo en la diferenciación de las células germinales masculinas". Journal of Cell Science . 116 (Pt 9): 1847–58 . doi : 10.1242/jcs.00391 . PMID 12665565. S2CID 24519687 .  
  12. ↑ Bellorini M, Lee DK, Dantonel JC, Zemzoumi K, Roeder RG, Tora L, Mantovani R (junio de 1997). "Interacciones de unión de CCAAT NF-Y-TBP: NF-YB y NF-YC requieren dominios cortos adyacentes a sus motivos de plegamiento de histonas para la asociación con residuos básicos de TBP" . Nucleic Acids Research . 25 (11): 2174–81 . doi : 10.1093 / nar/25.11.2174 . PMC 146709. PMID 9153318 .  

Lecturas adicionales

  • Zhou Q, Sharp PA (enero de 1995). " Nuevo mecanismo y factor de regulación por HIV-1 Tat" . The EMBO Journal . 14 (2): 321–8 . doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07006.x . PMC 398086. PMID 7835343 .  
  • Parada CA, Yoon JB, Roeder RG (febrero de 1995). "Una nueva restricción de la transcripción del VIH-1 mediada por LBP-1 a nivel de elongación in vitro" . The Journal of Biological Chemistry . 270 (5): 2274–83 . doi : 10.1074/jbc.270.5.2274 . PMID 7836461 . 
  • Ou SH, García-Martínez LF, Paulssen EJ, Gaynor RB (noviembre de 1994). "Papel de los motivos de la caja E flanqueantes en la función del elemento TATA del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1" . Revista de Virología . 68 (11): 7188– 99. doi : 10.1128/JVI.68.11.7188-7199.1994 . PMC 237158 . PMID 7933101 .  
  • Cross SH, Charlton JA, Nan X, Bird AP (marzo de 1994). "Purificación de islas CpG mediante una columna de unión de ADN metilado". Nature Genetics . 6 (3): 236– 44. doi : 10.1038/ng0394-236 . PMID 8012384. S2CID 12847618 .  
  • Kashanchi F, Piras G, Radonovich MF, Duvall JF, Fattaey A, Chiang CM, Roeder RG, Brady JN (enero de 1994). "Interacción directa del TFIID humano con el transactivador tat del VIH-1". Naturaleza . 367 (6460): 295– 9. Bibcode : 1994Natur.367..295K . doi : 10.1038/367295a0 . PMID 8121496 . S2CID 4362048 .  
  • Wang Z, Morris GF, Rice AP, Xiong W, Morris CB (junio de 1996). "Mutantes de tipo salvaje y con defectos de transactivación de la proteína Tat del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 se unen a la proteína de unión a TATA humana in vitro" . Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes and Human Retrovirology . 12 (2): 128–38 . doi : 10.1097/00042560-199606010-00005 . PMID 8680883 . 
  • Lavigne AC, Mengus G, May M, Dubrovskaya V, Tora L, Chambon P, Davidson I (agosto de 1996). "Múltiples interacciones entre hTAFII55 y otras subunidades TFIID. Requisitos para la formación de complejos ternarios estables entre hTAFII55 y la proteína de unión a TATA" . The Journal of Biological Chemistry . 271 (33): 19774–80 . doi : 10.1074/jbc.271.33.19774 . PMID 8702684 . 
  • Pendergrast PS, Morrison D, Tansey WP, Hernandez N (agosto de 1996). "Las mutaciones en el dominio carboxilo-terminal de TBP afectan la síntesis de los transcritos completos y cortos del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 de manera similar" . Journal of Virology . 70 (8): 5025–34 . doi : 10.1128/JVI.70.8.5025-5034.1996 . PMC 190456. PMID 8764009 .  
  • Kashanchi F, Khleif SN, Duvall JF, Sadaie MR, Radonovich MF, Cho M, Martin MA, Chen SY, Weinmann R, Brady JN (agosto de 1996). "La interacción del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 Tat con un sitio único de TFIID inhibe el cofactor negativo Dr1 y estabiliza el complejo TFIID-TFIIA" . Revista de Virología . 70 (8): 5503– 10. doi : 10.1128/JVI.70.8.5503-5510.1996 . PMC 190508 . PMID 8764062 .  
  • Rowlands JC, McEwan IJ, Gustafsson JA (septiembre de 1996). "Transactivación por el receptor de hidrocarburos arílicos humano y las proteínas translocadoras nucleares del receptor de hidrocarburos arílicos: interacciones directas con factores de transcripción basales". Farmacología molecular . 50 (3): 538– 48. PMID 8794892 . 
  • Zhou Q, Sharp PA (octubre de 1996). "Tat-SF1: cofactor para la estimulación de la elongación transcripcional por Tat del VIH-1". Science . 274 ( 5287): 605– 10. Bibcode : 1996Sci...274..605Z . doi : 10.1126/science.274.5287.605 . PMID 8849451. S2CID 13266489 .  
  • García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (marzo de 1997). "Asociación de Tat con complejos de preiniciación de la transcripción purificados de VIH-1 y VIH-2" . The Journal of Biological Chemistry . 272 ​​(11): 6951–8 . doi : 10.1074/jbc.272.11.6951 . PMID 9054383 . 
  • Dantonel JC, Murthy KG, Manley JL, Tora L (septiembre de 1997). "El factor de transcripción TFIID recluta al factor CPSF para la formación del extremo 3' del ARNm". Nature . 389 ( 6649): 399– 402. Bibcode : 1997Natur.389..399D . doi : 10.1038/38763 . PMID 9311784. S2CID 4413324 .  
  • Bertolotti A, Melot T, Acker J, Vigneron M, Delattre O, Tora L (marzo de 1998). "EWS, pero no EWS-FLI-1, está asociado tanto con TFIID como con la ARN polimerasa II: interacciones entre dos miembros de la familia TET, EWS y hTAFII68, y subunidades de los complejos TFIID y ARN polimerasa II" . Biología Molecular y Celular . 18 (3): 1489–97 . doi : 10.1128/mcb.18.3.1489 . PMC 108863. PMID 9488465 .  
  • Fraser RA, Heard DJ, Adam S, Lavigne AC, Le Douarin B, Tora L, Losson R, Rochette-Egly C, Chambon P (junio de 1998). "El supuesto cofactor TIF1alfa es una proteína quinasa que se hiperfosforila al interactuar con receptores nucleares ligados" . The Journal of Biological Chemistry . 273 (26): 16199–204 . doi : 10.1074/jbc.273.26.16199 . PMID 9632676 . 
  • Furukawa T, Tanese N (septiembre de 2000). "El ensamblaje de complejos parciales de TFIID en células de mamíferos revela actividades distintas asociadas con factores individuales asociados a la proteína de unión a la caja TATA" . The Journal of Biological Chemistry . 275 (38): 29847–56 . doi : 10.1074/jbc.M002989200 . PMID 10896937 . 
  • Yuan CX, Gurley WB (julio de 2000). "Posibles objetivos para HSF1 dentro del complejo de preiniciación" . Cell Stress & Chaperones . 5 (3): 229– 42. PMC 312889. PMID 11005381 .  
  • Wu Q, Zhang T, Cheng JF, Kim Y, Grimwood J, Schmutz J, Dickson M, Noonan JP, Zhang MQ, Myers RM, Maniatis T (marzo de 2001). "Análisis comparativo de secuencias de ADN de grupos de genes de protocadherina de ratón y humanos" . Genome Research . 11 (3): 389– 404. doi : 10.1101/gr.167301 . PMC 311048. PMID 11230163 .  
  • Zhou T, Chiang CM (julio de 2001). "El gen humano TAF(II)55, sin intrones ni TATA, contiene un iniciador funcional y un elemento promotor corriente abajo" . The Journal of Biological Chemistry . 276 (27): 25503–11 . doi : 10.1074/jbc.M102875200 . PMID 11340078 . 
  • FactorBook TAF7
  • Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q15545 (factor de iniciación de la transcripción TFIID subunidad 7) en el PDBe-KB .
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