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Articulo de referencia

TAF13

La subunidad 13 del factor de iniciación de la transcripción TFIID es una proteína que en humanos está codificada por el gen TAF13 . [ 5 ] [ 6 ] Función La iniciación de la tran...

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La subunidad 13 del factor de iniciación de la transcripción TFIID es una proteína que en humanos está codificada por el gen TAF13 . [ 5 ] [ 6 ]

Función

La iniciación de la transcripción por la ARN polimerasa II requiere la actividad de más de 70 polipéptidos. La proteína que coordina estas actividades es el factor de transcripción IID (TFIID), que se une al promotor central para posicionar correctamente la polimerasa, sirve como andamiaje para el ensamblaje del resto del complejo de transcripción y actúa como canal para las señales reguladoras. El TFIID está compuesto por la proteína de unión a TATA (TBP) y un grupo de proteínas conservadas evolutivamente conocidas como factores asociados a TBP o TAF. Los TAF pueden participar en la transcripción basal, actuar como coactivadores, participar en el reconocimiento del promotor o modificar los factores de transcripción generales (GTF) para facilitar el ensamblaje del complejo y la iniciación de la transcripción. Este gen codifica una subunidad pequeña asociada a un subconjunto de complejos TFIID. Esta subunidad interactúa con TBP y con otras dos subunidades pequeñas de TFIID, TAF10 y TAF11. Existe un pseudogén ubicado en el cromosoma 6. [ 6 ]

Interacciones

Se ha demostrado que TAF13 interactúa con TAF15 , [ 7 ] TAF11 , [ 5 ] [ 8 ] TAF10 [ 5 ] y la proteína de unión a TATA . [ 5 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000197780 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000048100 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. 1 2 3 4 Mengus G, May M, Jacq X, Staub A, Tora L, Chambon P, Davidson I (mayo de 1995). " Clonación y caracterización de hTAFII18, hTAFII20 y hTAFII28: tres subunidades del factor de transcripción humano TFIID" . EMBO J. 14 ( 7): 1520–31 . doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07138.x . PMC 398239. PMID 7729427 .  
  6. 1 2 "Gen Entrez: TAF13 ARN polimerasa II TAF13, factor asociado a la proteína de unión a la caja TATA (TBP), 18 kDa" .
  7. ↑ Bertolotti A, Melot T, Acker J, Vigneron M, Delattre O, Tora L (marzo de 1998). "EWS, pero no EWS-FLI-1, está asociado tanto con TFIID como con la ARN polimerasa II: interacciones entre dos miembros de la familia TET, EWS y hTAFII68, y subunidades de los complejos TFIID y ARN polimerasa II" . Mol . Cell. Biol . 18 (3): 1489–97 . doi : 10.1128/mcb.18.3.1489 . PMC 108863. PMID 9488465 .  
  8. ↑ Birck C, Poch O, Romier C, Ruff M, Mengus G, Lavigne AC, Davidson I, Moras D (julio de 1998). "Las proteínas humanas TAF(II)28 y TAF(II)18 interactúan a través de un pliegue de histona codificado por motivos conservados evolutivamente atípicos que también se encuentran en la familia SPT3" . Cell . 94 ( 2): 239–49 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)81423-3 . PMID 9695952. S2CID 6274415 .  

Lecturas adicionales

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  • Parada CA, Yoon JB, Roeder RG (1995). "Una nueva restricción de la transcripción del VIH-1 mediada por LBP-1 a nivel de elongación in vitro" . J. Biol. Chem . 270 (5): 2274–83 . doi : 10.1074/jbc.270.5.2274 . PMID 7836461 . 
  • Ou SH, Garcia-Martínez LF, Paulssen EJ, Gaynor RB (1994). "Función de los motivos de la caja E flanqueantes en la función del elemento TATA del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1" . J. Virol . 68 (11): 7188–99 . doi : 10.1128/JVI.68.11.7188-7199.1994 . PMC 237158. PMID 7933101 .  
  • Kashanchi F, Piras G, Radonovich MF, Duvall JF, Fattaey A, Chiang CM, Roeder RG, Brady JN (1994). "Interacción directa del TFIID humano con el transactivador tat del VIH-1". Nature . 367 ( 6460): 295– 9. Bibcode : 1994Natur.367..295K . doi : 10.1038/367295a0 . PMID 8121496. S2CID 4362048 .  
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  • Pendergrast PS, Morrison D, Tansey WP, Hernandez N (1996). "Las mutaciones en el dominio carboxilo-terminal de TBP afectan la síntesis de los transcritos completos y cortos del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 de manera similar" . J. Virol . 70 (8): 5025–34 . doi : 10.1128/JVI.70.8.5025-5034.1996 . PMC 190456. PMID 8764009 .  
  • Kashanchi F, Khleif SN, Duvall JF, Sadaie MR, Radonovich MF, Cho M, Martin MA, Chen SY, Weinmann R, Brady JN (1996). "La interacción del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 Tat con un sitio único de TFIID inhibe el cofactor negativo Dr1 y estabiliza el complejo TFIID-TFIIA" . J. Virol . 70 (8): 5503– 10. doi : 10.1128/JVI.70.8.5503-5510.1996 . PMC 190508 . PMID 8764062 .  
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  • García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). "Asociación de Tat con complejos de preiniciación de la transcripción purificados de VIH-1 y VIH-2" . J. Biol. Chem . 272 ​​(11): 6951–8 . doi : 10.1074/jbc.272.11.6951 . PMID 9054383 . 
  • Dantonel JC, Murthy KG, Manley JL, Tora L (1997). "El factor de transcripción TFIID recluta al factor CPSF para la formación del extremo 3' del ARNm". Nature . 389 (6649): 399– 402. Bibcode : 1997Natur.389..399D . doi : 10.1038 /38763 . PMID 9311784. S2CID 4413324 .  
  • Bertolotti A, Melot T, Acker J, Vigneron M, Delattre O, Tora L (1998). "EWS, pero no EWS-FLI-1, está asociado tanto con TFIID como con la ARN polimerasa II: interacciones entre dos miembros de la familia TET, EWS y hTAFII68, y subunidades de los complejos TFIID y ARN polimerasa II" . Mol . Cell. Biol . 18 (3): 1489–97 . doi : 10.1128/mcb.18.3.1489 . PMC 108863. PMID 9488465 .  
  • Birck C, Poch O, Romier C, Ruff M, Mengus G, Lavigne AC, Davidson I, Moras D (1998). "Las proteínas humanas TAF(II)28 y TAF(II)18 interactúan a través de un pliegue de histona codificado por motivos conservados evolutivamente atípicos que también se encuentran en la familia SPT3" . Cell . 94 ( 2): 239– 49. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81423-3 . PMID 9695952. S2CID 6274415 .  
  • Imabayashi H, Mori T, Gojo S, Kiyono T, Sugiyama T, Irie R, Isogai T, Hata J, Toyama Y, Umezawa A (2003). "Rediferenciación de condrocitos desdiferenciados y condrogénesis de células estromales de médula ósea humana mediante la formación de condrosferas con perfil de expresión mediante análisis de ADNc a gran escala". Exp. Cell Res . 288 (1): 35–50 . doi : 10.1016/S0014-4827(03)00130-7 . PMID 12878157 . 
  • Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q15543 (factor de iniciación de la transcripción TFIID subunidad 13) en el PDBe-KB .