El factor de iniciación de la transcripción TFIID subunidad 11, también conocido como TAFII28, es una proteína que en humanos está codificada por el gen TAF11 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
Función
La iniciación de la transcripción por la ARN polimerasa II requiere la actividad de más de 70 polipéptidos. La proteína que coordina estas actividades es el factor de transcripción IID (TFIID), que se une al promotor central para posicionar correctamente la polimerasa, sirve como andamiaje para el ensamblaje del resto del complejo de transcripción y actúa como canal para las señales reguladoras. El TFIID está compuesto por la proteína de unión a TATA (TBP) y un grupo de proteínas conservadas evolutivamente conocidas como factores asociados a TBP o TAF. Los TAF pueden participar en la transcripción basal, actuar como coactivadores, participar en el reconocimiento del promotor o modificar los factores de transcripción generales (GTF) para facilitar el ensamblaje del complejo y la iniciación de la transcripción. Este gen codifica una subunidad pequeña del TFIID que está presente en todos los complejos TFIID e interactúa con TBP. Esta subunidad también interactúa con otra subunidad pequeña, TAF13, para formar un heterodímero con una estructura similar a la del núcleo de las histonas. [ 7 ]
En biología molecular, TAFII28 se refiere al factor asociado a la proteína de unión a la caja TATA . Junto con la proteína de unión a TATA y otros TAF, forma el factor de transcripción general TFIID. Ambos participan en el ensamblaje del complejo de preiniciación de la transcripción . La región conservada se encuentra en el extremo C-terminal de la mayoría de las proteínas que lo componen .
Estructura
La estructura cristalina de hTAFII28 con hTAFII18 muestra que esta región está involucrada en la unión de estas dos subunidades . La región conservada contiene cuatro hélices alfa y tres bucles dispuestos como en la histona H3. [ 5 ] [ 8 ]
Interacciones
Se ha demostrado que TAF11 interactúa con:
Referencias
- 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000064995 – Ensembl , mayo de 2017
- 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000024218 – Ensembl , mayo de 2017
- ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
- 1 2 3 4 Mengus G, May M, Jacq X, Staub A, Tora L, Chambon P, Davidson I (mayo de 1995). " Clonación y caracterización de hTAFII18, hTAFII20 y hTAFII28: tres subunidades del factor de transcripción humano TFIID" . EMBO J. 14 ( 7): 1520–31 . doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07138.x . PMC 398239. PMID 7729427 .
- ↑ Kuzuhara T, Horikoshi M (noviembre de 1996). "Aislamiento y caracterización de un ADNc que codifica una subunidad TFIID humana que contiene una variedad de supuestos motivos estructurales, incluyendo repeticiones directas" . Biol. Pharm. Bull . 19 (1): 122–6 . doi : 10.1248/bpb.19.122 . PMID 8820923 .
- 1 2 "Entrez Gene: TAF11 TAF11 ARN polimerasa II, factor asociado a la proteína de unión a la caja TATA (TBP), 28 kDa" .
- 1 2 Birck C, Poch O, Romier C, Ruff M, Mengus G, Lavigne AC, Davidson I, Moras D (julio de 1998). "Las proteínas humanas TAF(II)28 y TAF(II)18 interactúan a través de un pliegue de histona codificado por motivos conservados evolutivamente atípicos que también se encuentran en la familia SPT3" . Cell . 94 ( 2): 239– 49. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81423-3 . PMID 9695952. S2CID 6274415 .
- 1 2 3 Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (mayo de 1997). "BRCA1 es un componente de la holoenzima de la ARN polimerasa II" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (11): 5605– 10. Bibcode : 1997PNAS...94.5605S . doi : 10.1073 / pnas.94.11.5605 . PMC 20825. PMID 9159119 .
- ↑ Bertolotti A, Melot T, Acker J, Vigneron M, Delattre O, Tora L (marzo de 1998). "EWS, pero no EWS-FLI-1, está asociado tanto con TFIID como con la ARN polimerasa II: interacciones entre dos miembros de la familia TET, EWS y hTAFII68, y subunidades de los complejos TFIID y ARN polimerasa II" . Mol . Cell. Biol . 18 (3): 1489–97 . doi : 10.1128/mcb.18.3.1489 . PMC 108863. PMID 9488465 .
- ↑ Bellorini M, Lee DK, Dantonel JC, Zemzoumi K, Roeder RG, Tora L, Mantovani R (junio de 1997). "Interacciones de unión de CCAAT NF-Y-TBP: NF-YB y NF-YC requieren dominios cortos adyacentes a sus motivos de plegamiento de histonas para la asociación con residuos básicos de TBP" . Nucleic Acids Res . 25 (11): 2174–81 . doi : 10.1093 / nar/25.11.2174 . PMC 146709. PMID 9153318 .
- ↑ May M, Mengus G, Lavigne AC, Chambon P, Davidson I (junio de 1996). "El TAF(II28) humano promueve la estimulación transcripcional mediante la función de activación 2 de los receptores de retinoides X" . EMBO J. 15 ( 12): 3093–104 . doi : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00672.x . PMC 450252. PMID 8670810 .
Lecturas adicionales
- Zhou Q, Sharp PA (1995). " Nuevo mecanismo y factor de regulación por HIV-1 Tat" . EMBO J. 14 ( 2): 321–8 . doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07006.x . PMC 398086. PMID 7835343 .
- Parada CA, Yoon JB, Roeder RG (1995). "Una nueva restricción de la transcripción del VIH-1 mediada por LBP-1 a nivel de elongación in vitro" . J. Biol. Chem . 270 (5): 2274–83 . doi : 10.1074/jbc.270.5.2274 . PMID 7836461 .
- Ou SH, Garcia-Martínez LF, Paulssen EJ, Gaynor RB (1994). "Función de los motivos de la caja E flanqueantes en la función del elemento TATA del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1" . J. Virol . 68 (11): 7188–99 . doi : 10.1128/JVI.68.11.7188-7199.1994 . PMC 237158. PMID 7933101 .
- Kashanchi F, Piras G, Radonovich MF, Duvall JF, Fattaey A, Chiang CM, Roeder RG, Brady JN (1994). "Interacción directa del TFIID humano con el transactivador tat del VIH-1". Nature . 367 ( 6460): 295– 9. Bibcode : 1994Natur.367..295K . doi : 10.1038/367295a0 . PMID 8121496. S2CID 4362048 .
- May M, Mengus G, Lavigne AC, Chambon P, Davidson I (1996). "El TAF(II28) humano promueve la estimulación transcripcional mediante la función de activación 2 de los receptores de retinoides X" . EMBO J. 15 ( 12): 3093–104 . doi : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00672.x . PMC 450252. PMID 8670810 .
- Wang Z, Morris GF, Rice AP, Xiong W, Morris CB (1996). "Mutantes de tipo salvaje y con deficiencia de transactivación de la proteína Tat del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 se unen a la proteína de unión a TATA humana in vitro" . J. Acquir. Immune Defic. Syndr. Hum. Retrovirol . 12 (2): 128– 38. doi : 10.1097/00042560-199606010-00005 . PMID 8680883 .
- Pendergrast PS, Morrison D, Tansey WP, Hernandez N (1996). "Las mutaciones en el dominio carboxilo-terminal de TBP afectan la síntesis de los transcritos completos y cortos del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 de manera similar" . J. Virol . 70 (8): 5025–34 . doi : 10.1128/JVI.70.8.5025-5034.1996 . PMC 190456. PMID 8764009 .
- Kashanchi F, Khleif SN, Duvall JF, Sadaie MR, Radonovich MF, Cho M, Martin MA, Chen SY, Weinmann R, Brady JN (1996). "La interacción del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 Tat con un sitio único de TFIID inhibe el cofactor negativo Dr1 y estabiliza el complejo TFIID-TFIIA" . J. Virol . 70 (8): 5503– 10. doi : 10.1128/JVI.70.8.5503-5510.1996 . PMC 190508 . PMID 8764062 .
- Zhou Q, Sharp PA (1996). "Tat-SF1: cofactor para la estimulación de la elongación transcripcional por HIV-1 Tat". Science . 274 (5287): 605– 10. Bibcode : 1996Sci...274..605Z . doi : 10.1126/science.274.5287.605 . PMID 8849451 . S2CID 13266489 .
- Tao Y, Guermah M, Martinez E, Oelgeschläger T, Hasegawa S, Takada R, Yamamoto T, Horikoshi M, Roeder RG (1997). "Interacciones específicas y funciones potenciales del TAFII100 humano" . J. Biol. química . 272 (10): 6714– 21. doi : 10.1074/jbc.272.10.6714 . PMID 9045704 .
- García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). "Asociación de Tat con complejos de preiniciación de la transcripción purificados de VIH-1 y VIH-2" . J. Biol. Chem . 272 (11): 6951–8 . doi : 10.1074/jbc.272.11.6951 . PMID 9054383 .
- Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (1997). " BRCA1 es un componente de la holoenzima de la ARN polimerasa II" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (11): 5605– 10. Bibcode : 1997PNAS...94.5605S . doi : 10.1073/pnas.94.11.5605 . PMC 20825. PMID 9159119 .
- Dantonel JC, Murthy KG, Manley JL, Tora L (1997). "El factor de transcripción TFIID recluta al factor CPSF para la formación del extremo 3' del ARNm". Nature . 389 (6649): 399– 402. Bibcode : 1997Natur.389..399D . doi : 10.1038 /38763 . PMID 9311784. S2CID 4413324 .
- Bertolotti A, Melot T, Acker J, Vigneron M, Delattre O, Tora L (1998). "EWS, pero no EWS-FLI-1, está asociado tanto con TFIID como con la ARN polimerasa II: interacciones entre dos miembros de la familia TET, EWS y hTAFII68, y subunidades de los complejos TFIID y ARN polimerasa II" . Mol . Cell. Biol . 18 (3): 1489–97 . doi : 10.1128/mcb.18.3.1489 . PMC 108863. PMID 9488465 .
- Guermah M, Malik S, Roeder RG (1998). "Participación de los componentes TFIID y USA en la activación transcripcional del promotor del virus de la inmunodeficiencia humana por NF-kappaB y Sp1" . Mol . Cell. Biol . 18 (6): 3234–44 . doi : 10.1128/mcb.18.6.3234 . PMC 108905. PMID 9584164 .
- Fraser RA, Heard DJ, Adam S, Lavigne AC, Le Douarin B, Tora L, Losson R, Rochette-Egly C, Chambon P (1998). "El supuesto cofactor TIF1alfa es una proteína quinasa que se hiperfosforila al interactuar con receptores nucleares ligados" . J. Biol. Chem . 273 (26): 16199–204 . doi : 10.1074/jbc.273.26.16199 . PMID 9632676 .
- Birck C, Poch O, Romier C, Ruff M, Mengus G, Lavigne AC, Davidson I, Moras D (1998). "Las proteínas humanas TAF(II)28 y TAF(II)18 interactúan a través de un pliegue de histona codificado por motivos conservados evolutivamente atípicos que también se encuentran en la familia SPT3" . Cell . 94 ( 2): 239– 49. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81423-3 . PMID 9695952. S2CID 6274415 .
- Genes en el cromosoma 6 humano