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MicroARN derivado del ARN nucleolar pequeño

En biología molecular, los microARN derivados del ARN nucleolar pequeño (snoRNA) son microARN (miRNA) derivados del ARN nucleolar pequeño (snoRNA). Los microARN generalmente se ...

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En biología molecular, los microARN derivados del ARN nucleolar pequeño (snoRNA) son microARN (miRNA) derivados del ARN nucleolar pequeño (snoRNA). Los microARN generalmente se derivan de precursores conocidos como pre-miRNA, los cuales son reconocidos y escindidos de un precursor pri-miRNA por las proteínas Pasha y Drosha . Sin embargo, se sabe que algunos microARN, los mirtrones , se derivan de intrones a través de una vía diferente que evita a Pasha y Drosha. También se sabe que algunos microARN se derivan del ARN nucleolar pequeño.

Descubrimiento

El microARN derivado del ARN nucleolar pequeño se describió por primera vez en 2008. El parásito intestinal protozoario Giardia lamblia carece de la proteína Drosha, implicada en la escisión del pre-miARN a partir del pri-miARN. Sin embargo, la proteína de procesamiento de miARN Dicer se encuentra en Giardia . [ 1 ] Un ARN de 26 nucleótidos , miR2, es procesado a partir del snoARN GlsR17 de Giardia lamblia por Dicer. MiR2 es un microARN que puede regular la expresión de proteínas de superficie variantes. [ 2 ]

También en 2008, se descubrió que un pequeño ARN era escindido de SCARNA15, un ARN pequeño específico del cuerpo de Cajal humano , por la enzima Dicer. Se descubrió que este pequeño ARN funcionaba como un microARN. También se identificaron posibles microARN en varios otros snoARN humanos. [ 3 ]

microARN derivados del snoRNA de Giardia

Giardia lamblia produce al menos 20 snoRNAs. [ 4 ] Los snoRNAs guían la modificación del ARNr y contienen una región de 10 a 21 nucleótidos que es complementaria al ARN diana. [ 5 ] Cinco de los snoRNAs de Giardia lamblia no tienen complementariedad con el ARNr, lo que implica que pueden tener una función diferente. [ 4 ] Los microARN se derivan de cinco de los snoRNAs de caja C/D de Giardia lamblia :

  • El microARN miR2 se deriva del snoRNA GlsR17 y puede regular la expresión de proteínas de superficie variantes [ 2 ].
  • El microARN miR3 se deriva del snoRNA GlsR16 [ 2 ].
  • El microARN miR5 deriva del snoARN GlsR2. MiR5 puede regular la expresión de varios genes diferentes, incluyendo cuatro quinasas y tres proteínas de superficie variantes. Las proteínas de superficie variantes son diferentes de las que potencialmente regula miR2 [ 6 ].
  • El microARN miR6 se deriva del snoRNA GlsR1. Los sitios diana predichos para este miRNA incluyen proteínas de superficie variantes [ 7 ].
  • El microARN miR10 se deriva del snoRNA GlsR8. Los sitios diana predichos para este miRNA incluyen proteínas de superficie variantes [ 7 ].

Véase también

Referencias

  1. ↑ Macrae IJ, Zhou K, Li F, Repic A, Brooks AN, Cande WZ, et  al. (2006). "Base estructural del procesamiento del ARN de doble cadena por Dicer". Science . 311 (5758): 195– 198. Bibcode : 2006Sci...311..195M . doi : 10.1126/science.1121638 . PMID 16410517 . S2CID 23785494 .  
  2. ^ Saraiya AA, Wang CC (2008) . "snoRNA, un nuevo precursor de microRNA en Giardia lamblia" . PLOS Patog . 4 (11) e1000224. doi : 10.1371/journal.ppat.1000224 . PMC 2583053 . PMID 19043559 .  
  3. ^ Ender C, Krek A, Friedländer MR, Beitzinger M, Weinmann L, Chen W, et al. (2008). "Un snoRNA humano con funciones similares a las de un microRNA" . Célula Mol . 32 (4): 519– 528. doi : 10.1016/j.molcel.2008.10.017 . PMID 19026782 .  
  4. 1 2 Yang CY, Zhou H, Luo J, Qu LH (2005). "Identificación de 20 ARN similares a snoRNA del eucariota primitivo Giardia lamblia". Biochem Biophys Res Commun . 328 (4): 1224– 1231. Bibcode : 2005BBRC..328.1224Y . doi : 10.1016/j.bbrc.2005.01.077 . PMID 15708007 . 
  5. ↑ Kiss-László Z, Henry Y, Kiss T (1998). "Elementos estructurales y de secuencia de los snoRNA guía de metilación esenciales para la metilación de ribosa específica del sitio del pre-ARNr" . EMBO J. 17 ( 3): 797–807 . doi : 10.1093/emboj/17.3.797 . PMC 1170428. PMID 9451004 .  
  6. ↑ Li W, Saraiya AA, Wang CC (2011). "La regulación génica en Giardia lambia involucra un microARN putativo derivado de un ARN nucleolar pequeño" . PLOS Negl Trop Dis . 5 (10) e1338. doi : 10.1371/journal.pntd.0001338 . PMC 3196473. PMID 22028939 .  
  7. 1 2 Li W, Saraiya AA, Wang CC (2012). "El perfil de microARN derivados de snoRNA que regulan la expresión de proteínas de superficie variantes en Giardia lamblia" . Cell Microbiol . 14 (9): 1455– 1473. doi : 10.1111/j.1462-5822.2012.01811.x . PMC 3422372. PMID 22568619 .