Articulo de referencia

Mirtron

Los mirtrones son un tipo de microARN que se localizan en los intrones del ARNm que codifica los genes del huésped. [ 1 ] [ 2 ] Estos intrones cortos en horquilla se forman a tr...

Los mirtrones son un tipo de microARN que se localizan en los intrones del ARNm que codifica los genes del huésped. [ 1 ] [ 2 ] Estos intrones cortos en horquilla se forman a través de vías atípicas de biogénesis de miRNA. [ 3 ] [ 4 ] Los mirtrones surgen de los intrones empalmados y se sabe que funcionan en la expresión génica.

Los mirtrones se identificaron por primera vez en Drosophila melanogaster y Caenorhabditis elegans . [ 5 ] [ 6 ] El número de mirtrones identificados hasta la fecha es de 14, 9 y 19 en D. melanogaster, C. elegans y mamíferos , respectivamente. [ 7 ] Los mirtrones son precursores alternativos para la biogénesis de microARN. Los intrones cortos en horquilla utilizan el empalme para evitar la escisión de DROSHA, que de otro modo es esencial para la generación de microARN animales canónicos. Los mirtrones surgen de los intrones empalmados y se sabe que funcionan como los microARN (miR) clásicos y regulan la expresión génica, ya sea por desestabilización del ARNm, inhibición de la traducción o escisión del ARNm diana. [ 8 ]

Ahora están surgiendo más pruebas que respaldan la existencia de mirtrones en plantas. Todos los miRNAs en plantas se derivan de las escisiones secuenciales de DCL1 a partir de pri-miRNA para dar lugar a pre-miRNA (o precursor de miRNA), pero los mirtrones evitan la escisión de DCL1 y entran como pre-miRNA en la vía de maduración de miRNA. [ 7 ]

Los mirtrones son distintos de las secuencias de miRNA canónicas y pueden distinguirse con métodos de aprendizaje automático en el análisis de datos. [ 9 ]

Referencias

  1. Ruby, JG; Jan, CH; Bartel, DP (5 de julio de 2007). "Precursores de microARN intrónicos que evitan el procesamiento de Drosha" . Nature . 448 ( 7149): 83–6 . Bibcode : 2007Natur.448...83R . doi : 10.1038/nature05983 . PMC 2475599. PMID 17589500 .  
  2. Wen, Jiayu; Ladewig, Erik; Shenker, Sol; Mohammed, Jaaved; Lai, Eric C. (2015). " Análisis de casi mil mirtrones de mamíferos revela características novedosas de los sustratos de Dicer" . PLOS Computational Biology . 11 (9) e1004441. Bibcode : 2015PLSCB..11E4441W . doi : 10.1371/journal.pcbi.1004441 . PMC 4556696. PMID 26325366 .  
  3. Ruby, JG; Jan, CH; Bartel, DP (5 de julio de 2007). "Precursores de microARN intrónicos que evitan el procesamiento de Drosha" . Nature . 448 ( 7149): 83–6 . Bibcode : 2007Natur.448...83R . doi : 10.1038/nature05983 . PMC 2475599. PMID 17589500 .  
  4. Da Fonseca, Bruno Henrique Ribeiro; Domingues, Douglas Silva; Paschoal, Alexandre Rossi (1 de octubre de 2019). "mirtronDB: una base de conocimientos de mirtron" . Bioinformática . 35 (19): 3873– 3874. doi : 10.1093/bioinformatics/btz153 . ISSN 1367-4803 . PMC 6761972 . PMID 30874795 .   
  5. Ruby, JG; Jan, CH; Bartel, DP (5 de julio de 2007). "Precursores de microARN intrónicos que evitan el procesamiento de Drosha" . Nature . 448 ( 7149): 83–6 . Bibcode : 2007Natur.448...83R . doi : 10.1038/nature05983 . PMC 2475599. PMID 17589500 .  
  6. Jan, CH; Ruby, JG; Friedman, R; Bartel, DP (6 de enero de 2011). "Formación, regulación y evolución de las 3′UTR de Caenorhabditis elegans" ( PDF) . Nature . 469 (7328): 97–101 . Bibcode : 2011Natur.469...97J . doi : 10.1038/nature09616 . PMC 3057491. PMID 21085120 .  
  7. 1 2 Zhu, Q.-H.; Spriggs, A.; Matthew, L.; Fan, L.; Kennedy, G.; Gubler, F.; Helliwell, C. (30 de julio de 2008). "Un conjunto diverso de microARN y ARN pequeños similares a microARN en granos de arroz en desarrollo" . Genome Research . 18 (9): 1456– 1465. doi : 10.1101/gr.075572.107 . PMC 2527712. PMID 18687877 .  
  8. "mirtron" . mirtron.gene-quantification.info . Consultado el 10 de diciembre de 2022 .
  9. Rorbach, Grzegorz; Viejo, Olgierd; Konopka, Bogumil M. (2018). "Distinguir los mirtrones de los miARN canónicos con métodos de exploración de datos y aprendizaje automático" . Informes científicos . 8 (1): 7560. Código Bib : 2018NatSR...8.7560R . doi : 10.1038/s41598-018-25578-3 . PMC 5953923 . PMID 29765080 .