Hispanopedia WikiSciCrunch es una base de conocimiento editada de forma colaborativa sobre recursos científicos. Es un portal comunitario para investigadores y un sistema de gestión de contenido para datos y bases de datos. Su objetivo es proporcionar una fuente común de datos a la comunidad investigadora y datos sobre Identificadores de Recursos de Investigación ( RRID ), que pueden utilizarse en publicaciones científicas . Tras comenzar como un proyecto piloto con dos revistas en 2014, para 2022 más de 1000 revistas lo utilizaban y se habían citado más de medio millón de RRID en la literatura científica. [ 1 ] En cierto modo, es para la ciencia y la publicación académica, similar a lo que Wikidata es para los proyectos de la Fundación Wikimedia . Alojado por la Universidad de California, San Diego , SciCrunch también se diseñó para ayudar a las comunidades de investigadores a crear sus propios portales para proporcionar acceso a recursos, bases de datos y herramientas relevantes para sus áreas de investigación. [ 2 ]
Identificadores de recursos de investigación
Los identificadores de recursos de investigación (RRID) son únicos y persistentes a nivel mundial. [ 3 ]Fueron introducidos y son promovidos por la Iniciativa de Identificación de Recursos . [ 3 ] Los recursos en este contexto son recursos de investigación como reactivos, herramientas o materiales. [ 3 ] [ 4 ] Un ejemplo de tal recurso sería una línea celular utilizada en un experimento o una herramienta de software utilizada en un análisis computacional. El Portal de Identificación de Recursos ( https://scicrunch.org/resources ) se creó para apoyar esta iniciativa y es un servicio central donde se pueden buscar y crear estos identificadores. [ 3 ] [ 5 ] Estos identificadores deberían ser totalmente consultables mediante minería de datos , a diferencia de los archivos complementarios, y se pueden actualizar a nuevas versiones a medida que la metodología básica cambia con el tiempo.
Formato para citas RRID
A continuación se muestra la recomendación para citar fuentes de investigación clave en el ámbito de los recursos biológicos:
- Anticuerpo: Millipore Cat# MAB377 (lote) RRID:AB_2298772
- Organismo modelo: NXR Cat# 1049, RRID:NXR_1049
- Línea celular: Coriell Cat# GM03745, RRID:CVCL_1H60
- Plásmidos: plásmido pMD2.G, RRID:Addgene_12259
- BioSamples: mujer sin diabetes, HPAP, Cat# HPAP-066, RRID:SAMN19842595
- Herramientas: Software de análisis de imágenes CellProfiler, (versión o fecha) RRID:SCR_007358
El portal de identificación de recursos muestra los RRID existentes e instrucciones para crear uno nuevo si no existe un RRID que coincida con el recurso.
Características de los RRID
Descripción: Cada RRID contiene un ID, un tipo, una URL y un nombre. Existen cientos de otros atributos, pero la mayoría son específicos del tipo; por ejemplo, los RRID de tipo anticuerpo incluyen un atributo llamado clonalidad, que indica si el reactivo es monoclonal o policlonal, mientras que las líneas celulares tienen un atributo de "línea celular parental" que indica el origen de la línea celular descrita.
Citas RRID: Los RRID denotan aquellos recursos de investigación que se han utilizado en la realización de un estudio. No están pensados para ser citas casuales. Los RRID que se han utilizado en artículos científicos se han extraído de la literatura utilizando herramientas automatizadas [ 6 ] y herramientas semiautomatizadas gracias a una asociación con Hypothes.is . Los datos que definen qué artículo cita un RRID en particular generalmente están disponibles en la página de resolución para ese RRID, por ejemplo: https://scicrunch.org/resolver/CVCL_0038 muestra la lista de 44 artículos (a fecha de 11 de abril de 2023) que han utilizado esta línea celular en investigación. Cada referencia mostrará cómo los autores han utilizado el RRID incluyendo un breve fragmento de la oración en la que los autores definen el recurso.
Servicios de resolución externos para RRID: El resolvedor de nombre a objeto de la Biblioteca Digital de California puede resolver cualquier RRID utilizando el siguiente patrón : https://n2t.net/ [RRID] Ejemplo: https://n2t.net/RRID:NXR_1049
El resolvedor de Identifiers.org también puede resolver cualquier RRID utilizando el siguiente patrón: https://identifiers.org/RRID/ [RRID] Ejemplo: https://identifiers.org/RRID/RRID:NXR_1049
Instituciones y editoriales que recomiendan el uso de RRID
Varias editoriales, iniciativas e instituciones de investigación fomentan el uso de los RRID de SciCrunch: Common Citation Format Article in Nature, [ 7 ] Cell Press , eLife , FORCE11 , Frontiers Media , [ 8 ] GigaScience , [ 9 ] MIRIAM Registry , [ 10 ] NIH , [ 11 ] PLOS Biology y PLOS Genetics . [ 12 ]
Véase también
Referencias
- ↑ Bandrowski, Anita (2022). "Una década de Gigaciencia : ¿Qué se puede aprender de medio millón de RRID en la literatura científica?" . GigaScience . 11 . doi : 10.1093/gigascience/giac058 . ISSN 2047-217X . PMC 9197678 . PMID 35701373 .
- ↑ Jeffrey, Grethe; Anita, Bandrowski; Davis, Banks; Christopher, Condit; Amarnath, Gupta; Stephen, Larson; Yueling, Li; Ibrahim, Ozyurt; Andrea, Stagg; Patricia, Whetzel; Luis, Marenco; Perry, Miller; Rixin, Wang; Gordon, Shepherd; Maryann, Martone (2014). "SciCrunch: Una plataforma cooperativa y colaborativa de descubrimiento de datos y recursos para comunidades científicas" . Frontiers in Neuroinformatics . 8. doi : 10.3389/conf.fninf.2014.18.00069 .
- 1 2 3 4 Bandrowski, Anita; Brush, Matthew; Grethe, Jeffery S.; Haendel, Melissa A.; Kennedy, David N.; Hill, Sean; Hof, Patrick R.; Martone, Maryann E.; Pols, Maaike; Tan, Serena; Washington, Nicole; Zudilova-Seinstra, Elena; Vasilevsky, Nicole (19 de noviembre de 2015). "La iniciativa de identificación de recursos: un cambio cultural en la publicación" . F1000Research . 2. 4 (134): 134. doi : 10.12688/f1000research.6555.2 . PMC 4648211. PMID 26594330 .
- ↑ "¿Qué es un recurso?" . scicrunch.org . SciCrunch . Consultado el 11 de abril de 2023 .
- ↑ "Portal de identificación de recursos" . scicrunch.org . SciCrunch . Consultado el 11 de abril de 2023 .
- ↑ Ozyurt (2016). "Resource Disambiguator for the Web: Extracting Biomedical Resources and Their Citations from the Scientific Literature" . PLoS One . 11 (1) e0146300. Bibcode : 2016PLoSO..1146300O . doi : 10.1371/journal.pone.0146300 . PMC 5156472. PMID 26730820 .
- ↑ Singh Chawla, Dalmeet (29 de mayo de 2015). "Los investigadores abogan por un formato estándar para citar recursos de laboratorio". Nature . doi : 10.1038/nature.2015.17652 . S2CID 211730637 .
- ↑ "Directrices para autores de Frontiers" . Frontiers . Consultado el 19 de abril de 2016 .
- ↑ "Nota técnica | GigaScience | Oxford Academic" . academic.oup.com . Consultado el 15 de julio de 2019 .
- ↑ «identificadores.org» . Recogida de datos: RRID . Consultado el 18 de abril de 2016 .
- ↑ "NIDA apoya a SciCrunch y a los RRID para visibilizar los recursos de investigación en la ciencia" . FORCE11 . 7 de marzo de 2016. Consultado el 30 de mayo de 2025 .
- ↑ "Presentación de la Iniciativa de Identificación de Recursos para la Investigación en PLOS Biology y PLOS Genetics" . PLOS Biologue . 29 de enero de 2015.
Enlaces externos
- Sitio web oficial
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- Resolutor RRID
- Conozca más sobre SciCrunch y las RRID: Entrevista con la Dra. Anita Bandrowski
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