Proteína ribosómica SA

La proteína ribosómica 40S SA es una proteína ribosómica que en humanos está codificada por el gen RPSA . ^{[ 5 ] [ 6 ]} También actúa como receptor de superficie celular , en particular para la laminina , y está involucrada en varios procesos patogénicos.

Esta proteína ha recibido diversos nombres: proteína ribosómica SA; RPSA; LamR; LamR1; precursor del receptor de laminina de 37 kDa; 37LRP; receptor de laminina de 67 kDa; 67LR; receptor de laminina de 37/67 kDa; LRP/LR; LBP/p40; y proteína asociada al ribosoma p40. Proteína ribosómica SA y RPSA son el nombre y símbolo aprobados.

Existen múltiples copias del gen similar a RPSA; sin embargo, la mayoría son pseudogenes que se cree que surgieron de eventos de retrotransposición . Se han encontrado dos variantes de transcripción con empalme alternativo que codifican la misma proteína para este gen. ^{[ 7 ]}

El ADN complementario (ADNc) del gen RPSA se forma mediante el ensamblaje de siete exones, seis de los cuales corresponden a la secuencia codificante. ^{[ 6 ]}

La secuencia de aminoácidos de RPSA, deducida de la secuencia de su ADNc, incluye 295 residuos. RPSA se puede subdividir en dos dominios principales: un dominio N (residuos 1–209), que corresponde a los exones 2–5 del gen, y un dominio C (residuos 210–295), que corresponde a los exones 6–7. El dominio N de RPSA es homólogo a la proteína ribosómica S2 (RPS2) de los procariotas. Contiene una secuencia palindrómica 173LMWWML178 que se conserva en todos los metazoos. Su dominio C está altamente conservado en vertebrados. La secuencia de aminoácidos de RPSA es idéntica en un 98% en todos los mamíferos. RPSA es una proteína ribosómica que ha adquirido la función de receptor de laminina durante la evolución. ^{[ 8 ] [ 9 ]} La estructura del dominio N de RPSA es similar a la de RPS2 procariota. ^{[ 10 ]} El dominio C es intrínsecamente desordenado en solución. El dominio N es monomérico en solución y se despliega según un equilibrio de tres estados. El intermedio de plegamiento es predominante a 37  °C. ^{[ 11 ]}

Las lamininas , una familia de glicoproteínas de la matriz extracelular , son el principal componente no colagenoso de las membranas basales . Se han relacionado con una amplia variedad de procesos biológicos, incluyendo la adhesión celular , la diferenciación , la migración , la señalización , el crecimiento de neuritas y la metástasis . Muchos de los efectos de la laminina están mediados por interacciones con receptores de la superficie celular . Estos receptores incluyen miembros de la familia de las integrinas , así como proteínas de unión a la laminina no integrínicas. El gen RPSA codifica una proteína multifuncional, que es a la vez una proteína ribosómica y un receptor de laminina no integrínico de alta afinidad.

La secuencia de aminoácidos de RPSA está altamente conservada a lo largo de la evolución , lo que sugiere una función biológica clave .

Se ha observado que el nivel de transcripción de RPSA es mayor en el tejido de carcinoma de colon y en las líneas celulares de cáncer de pulmón que en sus contrapartes normales. Asimismo, existe una correlación entre la sobreexpresión de este polipéptido en las células cancerosas y su fenotipo invasivo y metastásico .

Varias interacciones de RPSA, descubiertas originalmente mediante métodos de biología celular, se han confirmado posteriormente utilizando derivados recombinantes y experimentos in vitro. Estos últimos han demostrado que el dominio N plegado y el dominio C desordenado de RPSA tienen funciones tanto comunes como específicas. ^{[ 12 ]}

• RPSA se une a proteínas que participan en la traducción del código genético. (i) Los ensayos de doble híbrido en levadura han demostrado que RPSA se une a la proteína ribosómica S21 de la subunidad ribosómica pequeña 40S. ^{[ 13 ] [ 14 ]} (ii) Las deleciones en serie de RPSA han demostrado que el segmento de residuos 236–262, incluido en el dominio C, participa en la interacción entre RPSA y la subunidad 40S del ribosoma. ^{[ 15 ]} (iii) Estudios basados ​​en espectroscopia de resonancia magnética nuclear (RMN) han demostrado que el dominio de unión al anticodón de la lisil-ARNt sintetasa se une directamente al dominio C de RPSA. ^{[ 16 ]}
• La RPSA se identificó inicialmente como una proteína de unión a laminina. ^{[ 17 ] [ 18 ]} Tanto el dominio N recombinante como el dominio C de la RPSA se unen a la laminina in vitro, y lo hacen con constantes de disociación similares (300 nM). ^{[ 10 ] [ 12 ]}
• Tanto la RPSA como la laminina pertenecen al interactoma de heparina/sulfato de heparano. ^{[ 19 ]} La heparina se une in vitro al dominio N de la RPSA, pero no a su dominio C. Además, el dominio C de la RPSA y la heparina compiten por la unión a la laminina, lo que demuestra que el dominio C altamente ácido de la RPSA imita a la heparina (y potencialmente a los sulfatos de heparano) en la unión a la laminina. ^{[ 12 ]}
• RPSA es un receptor celular potencial para varios flavivirus patógenos , incluido el virus del dengue (DENV), ^{[ 20 ] [ 21 ]} y alfavirus , incluido el virus Sindbis (SINV). ^{[ 22 ]} El dominio N de RPSA incluye un sitio de unión para SINV in vitro. ^{[ 10 ]} El dominio N también incluye sitios de unión débiles para el dominio 3 recombinante (ED3, residuos 296–400) de las proteínas de envoltura de dos flavivirus , el virus del Nilo Occidental y el serotipo 2 del DENV. El dominio C incluye sitios de unión débiles para el dominio 3 del virus de la fiebre amarilla (YFV) y de los serotipos 1 y 2 del DENV. Por el contrario, el dominio 3 del virus de la encefalitis japonesa no parece unirse a RPSA in vitro. ^{[ 12 ]}
• RPSA también es un receptor de moléculas pequeñas. (i) RPSA se une a la aflatoxina B1 tanto in vivo como in vitro. ^{[ 23 ]} (ii) RPSA es un receptor de epigalocatequina-galato (EGCG), que es un componente principal del té verde y tiene muchos efectos relacionados con la salud. ^{[ 24 ] [ 25 ]} EGCG se une solo al dominio N de RPSA in vitro, con una constante de disociación de 100 nM, pero no a su dominio C. ^{[ 12 ]}