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Retroposón

Árbol filogenético de marsupiales derivado de datos de retrotransposones [ 1 ] Los retrotransposones son fragmentos de ADN repetitivos que se insertan en los cromosomas después ...

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Árbol filogenético de marsupiales derivado de datos de retrotransposones [ 1 ]

Los retrotransposones son fragmentos de ADN repetitivos que se insertan en los cromosomas después de haber sido transcritos inversamente a partir de cualquier molécula de ARN .

Diferencia entre retroposones y retrotransposones

A diferencia de los retrotransposones , los retroposones nunca codifican transcriptasa inversa (RT) (pero véase más abajo). Por lo tanto, son elementos no autónomos con respecto a la actividad de transposición (a diferencia de los transposones ). Los retrotransposones sin repeticiones terminales largas (LTR), como los elementos LINE1 humanos , a veces se denominan erróneamente retroposones. Sin embargo, esto depende del autor. Por ejemplo, Howard Temin publicó la siguiente definición: Los retroposones codifican RT pero carecen de repeticiones terminales largas (LTR), por ejemplo, elementos intercalados largos (LINE). Los retrotransposones también presentan LTR y los retrovirus , además, se empaquetan como partículas virales (viriones). Las retrosecuencias son elementos no autónomos que carecen de RT. Se retroponen con la ayuda de la maquinaria de elementos autónomos, como los LINE; ejemplos son los elementos nucleares intercalados cortos (SINE) o los retro(pseudo)genes derivados del ARNm . [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]

duplicaciones genéticas

La retroposición representa aproximadamente 10 000 eventos de duplicación genética en el genoma humano, de los cuales entre el 2 % y el 10 % probablemente sean funcionales. [ 5 ] Estos genes se denominan retrogenes y representan un tipo específico de retrotransposón.

transferencia horizontal de genes

Un evento clásico es la retroinserción de una molécula de pre-ARNm empalmada del gen c-Src en el ancestro proviral del virus del sarcoma de Rous (VSR). El pre-ARNm c-src retroinsertado aún contenía un único intrón y, dentro del VSR, ahora se le denomina gen v-Src . [ 6 ]

Referencias

  1. ↑ Nilsson, MA; Churakov, G.; Sommer, M.; et  al. (2010). "Seguimiento de la evolución de los marsupiales mediante inserciones de retrotransposones genómicos arcaicos" . PLOS Biology . 8 (7) e1000436. doi : 10.1371/journal.pbio.1000436 . PMC 2910653. PMID 20668664 .  
  2. ↑ Temin HM (1989). " Retrones en bacterias" . Nature . 339 (6222): 254– 5. Bibcode : 1989Natur.339..254T . doi : 10.1038/339254a0 . PMID 2471077. S2CID 29368479 .  
  3. ↑ Makałowski W, Toda Y (2007). "Modulación de genes del huésped por elementos transponibles de mamíferos". En Volff JN, Schmid M (eds.). Evolución de genes y proteínas . Dinámica del genoma. Vol. 3 (3.ª ed.). Basilea: S. Karger. pág. 166. doi : 10.1159/000107610 . ISBN    978-3-8055-8341-1. OCLC 729848415 . PMID 18753791 .  
  4. ↑ Makałowski W, Gotea V, Pande A, Makałowska I (2019). "Elementos transponibles: clasificación, identificación y su uso como herramienta para la genómica comparativa". En Anisimova M (ed.). Genómica evolutiva . Métodos en biología molecular. Vol. 1910. Clifton, NJ. pp. 185–86 . doi : 10.1007/978-1-4939-9074-0_6 . ISBN   978-3-8055-8341-1. OCLC 145014779 . PMID 31278665 .  {{cite book}}: CS1 mantenimiento: falta el editor de ubicación ( enlace )
  5. ↑ Emerson JJ, Kaessmann H, Betrán E, Long M (enero de 2004). "Tráfico genético extenso en el cromosoma X de los mamíferos". Science . 303 ( 5657): 537– 40. Bibcode : 2004Sci...303..537E . doi : 10.1126/science.1090042 . PMID 14739461. S2CID 41158232 .  
  6. ↑ Swanstrom, R; Parker, RC; Varmus, HE; ​​Bishop, JM (mayo de 1983). "Transducción de un oncogén celular: la génesis del virus del sarcoma de Rous" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 80 (9): 2519– 2523. Bibcode : 1983PNAS...80.2519S . doi : 10.1073/pnas.80.9.2519 . PMC 393857. PMID 6302692 .