PubRef.org

PubRef.org fue un proyecto efímero que ahora está descontinuado. El sitio web ya no está disponible. Se puede acceder a una versión antigua desde Internet Archive . ^{[ 1 ]}

Utilizaron el mismo nombre PubRef , que era un servicio proporcionado por PubMed para enlazar bibliografías, superado por el servicio independiente Crossref . ^{[ 2 ]}

PubRef era una aplicación de composición y gestión de proyectos utilizada por investigadores y estudiantes para la redacción y comunicación académica . PubRef utiliza una forma extendida de Markdown como formato de autoría principal y lo convierte a JATS , el formato de archivo utilizado por la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos .

Los investigadores gestionan proyectos de redacción académica dentro de repositorios de archivos con control de versiones llamados contenedores , que funcionan de manera similar a los repositorios git y los contenedores docker para proporcionar una mayor reproducibilidad , transparencia y reutilización en la publicación científica digital.

Un manuscrito de PubRef es un archivo Markdown dentro de un contenedor que contiene información adicional integrada que describe los elementos esenciales de la introducción de un manuscrito académico, como el título, el título abreviado , la lista de autores, las afiliaciones de los autores y las palabras clave. Esta información se captura en bloques YAML integrados dentro del manuscrito principal, denominados Meta . Las figuras, tablas, ecuaciones y otros contenidos especiales pueden integrarse de forma similar dentro del contexto del documento mediante descriptores Meta .

Este ejemplo de formato mínimo reutiliza un artículo clásico de Stephen Hawking y Roger Penrose Las singularidades del colapso gravitacional y la cosmología : ^{[ 3 ]}

# El meta descriptor de la revista declara a qué revista debe enviarse el # manuscrito. ! título de la revista : Proceedings of the Royal Society of London

# El meta descriptor del artículo define el título, las palabras clave y la categorización . Tipo de artículo : Investigación original. Título : Las singularidades del colapso gravitacional y la cosmología.

# Un bloque meta que describe al autor correspondiente. !author correspondiente : sí nombre : Stephen apellido : Hawking títulos : Doctorado afiliación : Cambridge --- !author nombre : Roger apellido : Penrose títulos : Doctorado afiliación : Birbeck

# Un bloque meta que describe una afiliación organizacional. # El 'id' permite referenciarlo dentro del documento. !affiliation id : cambridge university : Cambridge University institute : Institute of Theoretical Astronomy --- !affiliation id : birbeck college : Birbeck College dept : Department of Mathematics

# Introducción Una característica importante de la gravitación, para concentraciones de masa muy grandes, es que es esencialmente *inestable*. Esto se debe a... 

# Esto inserta una bibliografía dentro del documento. Las referencias de las citas se # resuelven a elementos en una carpeta llamada 'references', en el mismo directorio que el # archivo del manuscrito. !bibliography src : references

Una vez declarados los metaelementos esenciales de la información inicial, los manuscritos pueden enviarse automáticamente a las editoriales académicas. ^{[ 4 ]} Los artículos, los datos de apoyo y el código dependiente pueden publicarse directamente en PubRef en forma de comunicaciones personales bajo el prefijo DOI 10.17920/P9.pubref . ^{[ 5 ]}