La proteína POTEB, miembro B de la familia de dominios de anquirina, es una proteína humana codificada por el gen POTEB . [ 3 ] ( Prostate , Ovary , Testes Expressed ankyrin domain family member B). Probablemente participa en la mediación de la interacción proteína-proteína a través de sus 5 dominios de anquirina. [ 4 ] Es muy probable que POTEB ayude en la señalización intracelular , pero no es probable que sea una proteína secretada o nuclear. [ 4 ] Es probable que la función de POTEB esté regulada a través de 17 posibles sitios de fosforilación . [ 5 ] Actualmente no hay evidencia que sugiera que POTEB tenga señales de localización nuclear . [ 6 ]
Gene
El gen POTEB se localiza en 15q11.2 del cromosoma 15 en humanos y se transcribe a partir de la cadena inversa del ADN. También se le conoce como POTEB3 y POTE15. [ 7 ] El gen POTEB tiene una longitud de 47.547 pares de bases y está compuesto por 11 exones . [ 7 ]
ARNm
El gen POTEB puede transcribirse para crear cuatro ARNm potenciales . Sin embargo, solo uno de estos ARNm, que posee los 11 exones , es capaz de traducirse a la proteína POTEB. [ 8 ] Los otros tres transcritos no codifican proteínas.

Proteína
La proteína POTEB está compuesta por 544 aminoácidos y, según análisis bioinformáticos , tiene un peso molecular de 61,7 kDa. Su punto isoeléctrico es de 5,68. [ 9 ] Sus aminoácidos más comunes son la leucina y el ácido glutámico , que representan el 11 % y el 10,3 % de la proteína, respectivamente. [ 9 ] Sin embargo, esto es normal en las proteínas humanas. Es muy probable que POTEB sea una proteína citoplasmática [ 10 ] fosforilada en 17 serinas , treoninas y tirosinas distribuidas a lo largo de la proteína, [ 5 ] pero concentrada en el extremo C-terminal. Su estructura secundaria consiste principalmente en cinco dominios de repetición de anquirina helicoidales, que contienen el motivo TALHL. También hay un sitio de miristoilación en la proteína, cerca del extremo N-terminal. [ 11 ]

Expresión
POTEB se expresa en niveles elevados en la próstata, el ovario y los testículos humanos. Sin embargo, también hay evidencia que muestra que se expresa en niveles bajos en células madre embrionarias , la región nasofaríngea y el tejido mamario. [ 12 ] [ 13 ] En las células madre embrionarias, es probable que la diferenciación desactive la expresión de POTEB, mientras que en el cáncer de mama, se ha observado que las células triple negativas no presentan expresión de POTEB, lo que sugiere un papel en las vías activadas por el cáncer. [ 13 ]

Algunos estudios han utilizado sondas POTEB para estudiar la expresión de POTEB en el cerebro humano. Sin embargo, la única región con una expresión notable de POTEB es la corteza cerebelosa , responsable de la función motora y algunas funciones cognitivas. [ 14 ]

Regulación de la expresión
Es probable que la expresión de POTEB esté regulada por factores de unión a la caja E y factores de transcripción tipo Krueppel , junto con factores de transcripción del factor nuclear kappa B ( NF-κB ). [ 15 ]
La expresión de POTEB podría estar regulada por la unión de factores de transcripción al intrón 1 del pre-ARNm, lo que daría lugar a la producción de un ARNm truncado que no se traduce. Alternativamente, la expresión de POTEB podría estar regulada negativamente por la formación de bucles de tallo cerca del codón de inicio. [ 16 ] No se conocen sitios de ubiquitinación en POTEB que puedan contribuir a regular su función y estabilidad.

Función
Es muy probable que POTEB participe en la mediación de la interacción proteína-proteína a través de sus 5 dominios de anquirina. [ 4 ] Es muy probable que POTEB ayude en la señalización intracelular , pero es improbable que sea una proteína secretada o nuclear [ 4 ] ya que es improbable que contenga señales de localización nuclear. [ 6 ] Es probable que la función de POTEB esté regulada a través de 17 posibles sitios de fosforilación [ 5 ] que determinan cómo los dominios de anquirina interactúan con otras proteínas. [ 17 ]
Interacciones proteína-proteína
No se han publicado estudios que confirmen la interacción de POTEB con otras proteínas humanas. Sin embargo, existen datos no publicados que sugieren una interacción entre POTEB y las glicoproteínas alfa-1-B , los factores de complementación APOBEC1 y la alfa-2-macroglobulina . [ 18 ] Estos datos se basan en espectrometría de masas con captura de afinidad .
Importancia clínica
La expresión de POTEB es baja o está completamente reducida en las células de cáncer de mama triple negativo en comparación con otros tipos de células de cáncer de mama. [ 13 ] Esto sugiere la participación de POTEB en vías de señalización intracelular que suprimen el cáncer, o en vías que regulan el crecimiento y la división normales de las células.
Homología
Parálogos
POTEB tiene 8 parálogos predichos (según la secuencia de proteínas) en humanos, y la mayoría de ellos se encuentran en diferentes cromosomas humanos. [ 19 ] [ 20 ] Se especula que este gran número de parálogos surgió de múltiples eventos de duplicación . [ 10 ]
Ortólogos
Se han encontrado ortólogos de POTEB en mamíferos , aves , reptiles , anfibios , peces e incluso en invertebrados como anémonas de mar y gusanos poliquetos marinos . [ 19 ] Estos ortólogos comparten una similitud con POTEB debido principalmente a la presencia de repeticiones de anquirina, lo que sugiere que las proteínas que contienen dominios de anquirina se han conservado durante millones de años. No se han encontrado ortólogos de POTEB en plantas, eucariotas unicelulares, bacterias ni arqueas. [ 19 ]

Referencias
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Lecturas adicionales
- Genes en el cromosoma 15 humano
- Proteínas humanas