Articulo de referencia

Outron

Un outrón es una secuencia de nucleótidos en el extremo 5' del transcrito primario de un gen que se elimina mediante una forma especial de empalme de ARN durante la maduración d...

Un outrón es una secuencia de nucleótidos en el extremo 5' del transcrito primario de un gen que se elimina mediante una forma especial de empalme de ARN durante la maduración del producto de ARN final. [ 1 ] Mientras que las secuencias de intrones se encuentran dentro del gen, las secuencias de outrones se encuentran fuera del gen. [ 2 ]

Características

El outrón es una secuencia similar a un intrón que posee características similares, como el contenido de G+C [ 3 ] y un sitio aceptor de empalme que es la señal para el trans -empalme . [ 4 ] [ 5 ] Dicho sitio de trans -empalme se define esencialmente como un sitio de empalme aceptor (3') sin un sitio de empalme donador (5') aguas arriba.

En eucariotas como euglenozoos , dinoflagelados , esponjas , nematodos , cnidarios , ctenóforos , platelmintos , crustáceos , quetognatos , rotíferos y tunicados , la longitud de los outrones líderes empalmados (SL) varía de 30 a 102 nucleótidos (nt) , con la longitud del exón SL que varía de 16 a 51 nt, y la longitud total del ARN SL que varía de 46 a 141 nt. [ 3 ]

Tratamiento

En el empalme cis estándar , se requiere el sitio de empalme donador en posición corriente arriba junto con un sitio aceptor ubicado en posición corriente abajo en la misma molécula de pre-ARNm. Por el contrario, el trans -empalme SL depende de un sitio de empalme aceptor 3' en el outrón y un sitio de empalme donador 5' (dinucleótido GU) ubicado en una molécula de ARN separada, el ARN SL. [ 3 ] Además, el outrón del ARNm inmaduro contiene una adenosina de punto de ramificación —seguida de un tracto de polipirimidina corriente abajo— que interactúa con la porción similar a un intrón del ARN SL para formar un subproducto ramificado en 'Y', que recuerda la estructura de lazo formada durante el empalme de intrones. La maquinaria nuclear luego resuelve esta estructura de ramificación en 'Y' mediante el trans -empalme de la secuencia de ARN SL al sitio aceptor de trans -empalme 3' (dinucleótido AG) del pre-ARNm. [ 2 ]

Cuando se procesan los outrones, el exón SL se trans -empalma a sitios aceptores distintos, no apareados y corriente abajo, adyacentes a cada marco de lectura abierto del pre-ARNm policistrónico, lo que da lugar a transcritos maduros con caperuza distintos. [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]

Véase también

  • Exón : Región de un gen transcrito presente en la molécula de ARNm funcional final. 
  • ARN mensajero : ARN que es leído por el ribosoma para producir una proteína. 

Referencias

  1. Conrad, Richard; Fen Liou, Ruey; Blumenthal, Thomas (1993-02-25). "Análisis funcional de un aceptor de trans-splice de C. elegans" . Nucleic Acids Research . 21 (4): 913– 919. doi : 10.1093/nar/21.4.913 . ISSN 0305-1048 . PMC 309224. PMID 8451190 .   
  2. 1 2 Stover, Nicholas A.; Kaye, Michelle S.; Cavalcanti, Andre RO (2006-01-10). "Trans-empalme del líder empalmado" . Current Biology . 16 (1): R8– R9. Bibcode : 2006CBio...16...R8S . doi : 10.1016/j.cub.2005.12.019 . ISSN 0960-9822 . PMID 16401417 .  
  3. 1 2 3 Lasda, Erika L.; Blumenthal, Thomas (2011-05-01). " Trans -splicing". Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA . 2 (3): 417– 434. doi : 10.1002/wrna.71 . PMID 21957027 . S2CID 209567118 .  
  4. "Referencia de Oxford — Outron" . Consultado el 26 de septiembre de 2019 .
  5. "El navegador de ontologías de secuencias MISO — Outron (SO:0001475)" . Consultado el 26 de septiembre de 2019 .
  6. Clayton, Christine E. (15 de abril de 2002). "¿Vida sin control transcripcional? De la mosca al hombre y viceversa" . The EMBO Journal . 21 (8): 1881–1888 . doi : 10.1093/emboj/21.8.1881 . ISSN 1460-2075 . PMC 125970. PMID 11953307 .   
  7. Blumenthal, Thomas; Gleason, Kathy Seggerson (febrero de 2003). " Operones de Caenorhabditis elegans : forma y función". Nature Reviews Genetics . 4 (2): 110– 118. doi : 10.1038/nrg995 . ISSN 1471-0056 . PMID 12560808. S2CID 9864778 .   
  8. Lei Q, Li C, Zuo Z, Huang C, Cheng H, Zhou R (marzo de 2016). "Perspectivas evolutivas sobre el trans-empalme de ARN en vertebrados" . Genome Biology and Evolution . 8 (3): 562– 77. doi : 10.1093 / gbe/evw025 . PMC 4824033. PMID 26966239 .