ORF9c

ORF9c (anteriormente también llamado ORF14 ) es un marco de lectura abierto (ORF) en los genomas de coronavirus del subgénero Sarbecovirus . ^{[ 1 ]} Tiene 73 codones de longitud en el genoma del SARS-CoV-2 . ^{[ 2 ]} Aunque a menudo se incluye en las listas de genes de proteínas accesorias virales de Sarbecovirus , la evidencia experimental y bioinformática sugiere que ORF9c podría no ser un gen funcional que codifique proteínas . ^{[ 3 ]}

Ha habido inconsistencia en la nomenclatura utilizada para este gen en la literatura científica. En algunos trabajos sobre el SARS-CoV , se le ha denominado ORF14. ^{[ 4 ]} En ocasiones se le ha llamado ORF9b, mientras que a su vecino más extenso, ORF9b, se le dio el nombre de ORF9a. La nomenclatura recomendada actualmente se refiere a este gen como ORF9c, y al gen anterior como ORF9b. ^{[ 2 ]}

ORF9c es uno de dos genes superpuestos que se encuentran completamente dentro del marco de lectura abierto del gen N que codifica la proteína de la nucleocápside del coronavirus ; el otro es ORF9b . No está claro si ORF9c se expresa funcionalmente durante las infecciones por SARS-CoV-2; según se informa, no se traduce en condiciones experimentales. ^{[ 5 ]} Cuando se sobreexpresa experimentalmente , la proteína interactúa con los receptores sigma y con la vía NF-kB . ^{[ 1 ] [ 6 ]} La proteína del SARS-CoV forma autointeracciones que sugieren la formación de dímeros proteicos u oligómeros de orden superior . ^{[ 7 ]}

ORF9c tiene aproximadamente un 74% de identidad de secuencia entre el SARS-CoV y el SARS-CoV-2. ^{[ 1 ]}

Se han identificado variantes del SARS-CoV-2 en las que se introducen codones de parada prematuros o donde se pierde el codón de inicio , y la secuencia de aminoácidos está poco conservada , lo que apoya la hipótesis de que no codifica una proteína funcional. ^{[ 3 ] [ 6 ]}