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Aquí se han encontrado tumbas excavadas en la roca, probablemente de origen cristiano . ^{[ 7 ]}

Nein es mencionado en los escritos de Eusebio (c. 263–339) y Jerónimo (c. 347–420) como situado cerca de Endor ( Indur ). ^{[ 8 ]} Su identidad como sitio bíblico fue reconocida por los cruzados , quienes construyeron una iglesia allí para conmemorar el lugar del milagro, iglesia reconstruida por los franciscanos. ^{[ 4 ] [ 8 ] [ 9 ]}

En 1101, durante la época de las Cruzadas , Tancredo, príncipe de Galilea, cedió Nein junto con varias otras aldeas a la abadía del Monte Tabor . ^{[ 10 ]} En 1153, pertenecía a los Hospitalarios . ^{[ 11 ]} Hacia 1263, la zona estaba gobernada por Baybars . ^{[ 9 ]}

Nein, al igual que el resto de Israel, se incorporó al Imperio Otomano en 1517, y en el censo de 1596, la aldea se ubicaba en la nahiya de Safa, en la liwa de Lajjun . Tenía una población de 119 hogares, todos musulmanes . Pagaban un impuesto fijo del 25% sobre los productos agrícolas, incluyendo trigo, cebada, cultivos de verano, olivos, cabras y colmenas, además de pastos de invierno e ingresos ocasionales; los impuestos ascendían a 80.000 akçe . ^{[ 12 ]}

En 1838, Robinson y Smith observaron que Nein había disminuido de tamaño con el paso del tiempo y que en aquel entonces era una pequeña aldea habitada por unas pocas familias. ^{[ 6 ] [ 8 ] [ 13 ]} En 1875, Victor Guérin vio aquí un edificio en ruinas, que medía 18 por 12 pasos. ^{[ 14 ]}

En el Estudio de Palestina Occidental (1882) del Fondo de Exploración de Palestina , Nein fue descrito como una pequeña aldea hecha de piedra y adobe , con una pequeña mezquita, llamada Mukam Sidna Aisa, al norte. ^{[ 15 ]}

En el censo de Palestina de 1922 realizado por las autoridades británicas , Nain tenía una población de 157 habitantes, todos musulmanes, ^{[ 16 ]} aumentando en el censo de 1931 a 189, todavía todos musulmanes, en un total de 34 casas. ^{[ 17 ]}

En las estadísticas de 1945, la población era de 270 habitantes, todos musulmanes, ^{[ 18 ]} mientras que la superficie total era de 4687 dunams (1158 acres) , según un censo oficial de tierras y población. ^{[ 19 ]} De esta superficie, 87 dunams (21 acres) correspondían a plantaciones y tierras de regadío, 3602 a cereales, ^{[ 20 ]} mientras que 31 dunams se clasificaban como zonas urbanizadas. ^{[ 21 ]}