
NeighborNet [ 1 ] es un algoritmo para construir redes filogenéticas que se basa libremente en el algoritmo de unión de vecinos . Al igual que este último, el método toma como entrada una matriz de distancias y funciona aglomerando clústeres. Sin embargo, el algoritmo NeighborNet puede generar colecciones de clústeres que se superponen y no forman una jerarquía , y se representan mediante un tipo de red filogenética llamada grafo de divisiones . Si la matriz de distancias satisface las condiciones combinatorias de Kalmanson , NeighborNet devolverá el ordenamiento circular correspondiente. [ 2 ] [ 3 ] El método está implementado en los paquetes SplitsTree y R /Phangorn [ 4 ] [ 5 ] .
Ejemplos de la aplicación de Neighbor-net se pueden encontrar en virología, [ 6 ] horticultura, [ 7 ] genética de dinosaurios, [ 8 ] lingüística comparada , [ 9 ] y arqueología. [ 10 ]
Referencias
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