Hispanopedia WikiEl dominio NACHT es un dominio proteico conservado evolutivamente . Este dominio NTPasa se encuentra en proteínas de apoptosis así como en aquellas involucradas en la transcripción del MHC . [1] Su nombre refleja algunas de las proteínas que lo contienen: NAIP ( proteína inhibidora de la apoptosis de la familia NLP ), CIITA (es decir, C2TA o activador de la transcripción del MHC de clase II ), HET-E (proteína del locus de incompatibilidad de Podospora anserina ) y TEP1 (es decir, TP1 o proteína asociada a la telomerasa).
El dominio NACHT contiene de 300 a 400 aminoácidos . Es un dominio de nucleósido-trifosfatasa (NTPasa) predicho, que se encuentra en proteínas animales , fúngicas y bacterianas . Se encuentra en asociación con otros dominios, como el dominio de reclutamiento de caspasa ( InterPro : IPR001315 ), el dominio de pirina ( InterPro : IPR004020 ), el dominio de repetición HEAT ( InterPro : IPR004155 ), la repetición WD40 ( InterPro : IPR001680 ), la repetición rica en leucina (LRR) o la repetición BIR ( InterPro : IPR001370 ). [1]
El dominio NACHT consta de siete motivos conservados distintos, incluido el bucle P específico de ATP/GTPasa, el sitio de unión de Mg 2+ ( motivos Walker A y B , respectivamente) y cinco motivos más específicos. Las características únicas del dominio NACHT incluyen la prevalencia de residuos "pequeños" (glicina, alanina o serina) directamente en el extremo C del aspartato coordinador de Mg 2+ en el motivo Walker B, en lugar de un segundo residuo ácido predominante en otras NTPasas. Un segundo residuo ácido se encuentra típicamente en las proteínas que contienen NACHT dos posiciones aguas abajo. Además, el motivo distal VII contiene un patrón conservado de residuos polares, aromáticos e hidrófobos que no se observa en ninguna otra familia de NTPasas. [1]
Ejemplos
Las proteínas humanas que contienen este dominio incluyen:
- CIITA
- Programa Nacional de Inspección (NAIP)
- NLRC3 , NLRC4 , NLRC5
- NLRP1 , NLRP2 , NLRP3 , NLRP4 , NLRP5 , NLRP6 , NLRP7 , NLRP8 , NLRP9 , NLRP10 , NLRP11 , NLRP12 , NLRP13 , NLRP14 , NLRX1
- NOD1 , NOD2
- NWD1
- TEP1