Articulo de referencia

fermentación de ácidos mixtos

La vía de fermentación de ácidos mixtos en E. coli . [ 1 ] [ 2 ] Los productos finales están resaltados en azul. En bioquímica , la fermentación ácida mixta es el proceso metabó...

La vía de fermentación de ácidos mixtos en E. coli . [ 1 ] [ 2 ] Los productos finales están resaltados en azul.

En bioquímica , la fermentación ácida mixta es el proceso metabólico mediante el cual un azúcar de seis carbonos (por ejemplo , glucosa , C₆H₁₂O₆ ) se convierte en una mezcla compleja y variable de ácidos . Es una reacción de fermentación común en bacterias . Es característica de los miembros de las Enterobacteriaceae , una gran familia de bacterias Gram negativas que incluye a E. coli . [ 3 ]

La mezcla de productos finales producidos por la fermentación de ácidos mixtos incluye lactato , acetato , succinato , formiato , etanol y los gases H₂ y CO₂ . La formación de estos productos finales depende de la presencia de ciertas enzimas clave en la bacteria. La proporción en la que se forman varía entre diferentes especies bacterianas. [ 4 ] La vía de fermentación de ácidos mixtos difiere de otras vías de fermentación, que producen menos productos finales en cantidades fijas. Los productos finales de la fermentación de ácidos mixtos pueden tener muchas aplicaciones útiles en biotecnología e industria . Por ejemplo, el etanol se utiliza ampliamente como biocombustible . [ 5 ] Por lo tanto, se han modificado metabólicamente múltiples cepas bacterianas en el laboratorio para aumentar los rendimientos individuales de ciertos productos finales. [ 2 ] Esta investigación se ha llevado a cabo principalmente en E. coli y continúa en curso. Se producen variaciones de la fermentación de ácidos mixtos en varias especies bacterianas, incluidos patógenos bacterianos como Haemophilus influenzae, donde se producen principalmente acetato y succinato y el lactato puede servir como sustrato de crecimiento. [ 6 ]

Fermentación de ácidos mixtos en E. coli

E. coli utiliza las vías de fermentación como opción final para el metabolismo energético, ya que producen muy poca energía en comparación con la respiración. [ 7 ] La fermentación de ácidos mixtos en E. coli ocurre en dos etapas. Estas etapas están descritas en la base de datos biológica para E. coli , EcoCyc . [ 1 ]

La primera de estas dos etapas es una reacción de glucólisis . En condiciones anaeróbicas, tiene lugar una reacción de glucólisis en la que la glucosa se convierte en piruvato :

glucosa → 2 piruvato

Se produce una cantidad neta de 2 moléculas de ATP y 2 de NADH por cada molécula de glucosa convertida. El ATP se genera mediante fosforilación a nivel de sustrato . El NADH se forma a partir de la reducción de NAD.

En la segunda etapa, el piruvato producido por la glucólisis se convierte en uno o más productos finales mediante las siguientes reacciones. En cada caso, ambas moléculas de NADH generadas por la glucólisis se reoxidan a NAD + . Cada vía alternativa requiere una enzima clave diferente en E. coli . Después de que se forman cantidades variables de los diferentes productos finales mediante estas vías, estos se secretan de la célula. [ 1 ]

La conversión de piruvato en lactato está catalizada por la enzima lactato deshidrogenasa .

Formación de lactato

El piruvato producido por la glucólisis se convierte en lactato . Esta reacción es catalizada por la enzima lactato deshidrogenasa (LDHA). [ 1 ]

piruvato + NADH + H +lactato + NAD +

Formación de acetato

El piruvato se convierte en acetil-coenzima A (acetil-CoA) por acción de la enzima piruvato deshidrogenasa . Este acetil-CoA se transforma posteriormente en acetato en E. coli , produciendo ATP mediante fosforilación a nivel de sustrato . La formación de acetato requiere dos enzimas: la fosfato acetiltransferasa y la acetato quinasa. [ 1 ]

La vía de fermentación de ácidos mixtos es característica de la familia Enterobacteriaceae , que incluye a E. coli.
acetil-CoA + fosfato → acetil-fosfato + CoA
acetilfosfato + ADP → acetato + ATP

Formación de etanol

El etanol se forma en E. coli mediante la reducción de la acetil coenzima A utilizando NADH. Esta reacción de dos pasos requiere la enzima alcohol deshidrogenasa (ADHE). [ 1 ]

acetil-CoA + NADH + H + → acetaldehído + NAD + + CoA
acetaldehído + NADH + H +etanol + NAD +

Formación de formato

El formato se produce por la escisión del piruvato. Esta reacción es catalizada por la enzima piruvato-formato liasa (PFL), que desempeña un papel importante en la regulación de la fermentación anaeróbica en E. coli . [ 8 ]

piruvato + CoA → acetil-CoA + formiato

Formación de succinato

Estructura esquelética del succinato

El succinato se forma en E. coli en varias etapas.

El fosfoenolpiruvato (PEP), un intermediario de la vía glucolítica , es carboxilado por la enzima PEP carboxilasa para formar oxalacetato . [ 9 ] Posteriormente, la enzima malato deshidrogenasa convierte el oxalacetato en malato . La fumarato hidratasa cataliza la deshidratación del malato para producir fumarato . [ 10 ]

fosfoenolpiruvato + HCO 3 → oxalacetato + fosfato
oxaloacetato + NADH + H + → malato + NAD +
malato → fumarato + H₂O

La reacción final en la formación de succinato es la reducción del fumarato. Esta reacción es catalizada por la enzima fumarato reductasa .

fumarato + NADH + H +succinato + NAD +

Esta reducción es una reacción de respiración anaeróbica en E. coli , ya que utiliza electrones asociados con la NADH deshidrogenasa y la cadena de transporte de electrones . El ATP se genera mediante un gradiente electroquímico y la ATP sintasa . Este es el único caso en la vía de fermentación de ácidos mixtos donde el ATP no se produce mediante fosforilación a nivel de sustrato. [ 1 ] [ 2 ]

La vitamina K2 , también conocida como menaquinona, es muy importante para el transporte de electrones al fumarato en E. coli . [ 11 ]

Formación de hidrógeno y dióxido de carbono

El formato puede convertirse en hidrógeno gaseoso y dióxido de carbono en E. coli . Esta reacción requiere la enzima formato-hidrógeno liasa . Puede utilizarse para evitar que las condiciones dentro de la célula se vuelvan demasiado ácidas. [ 1 ]

formatoH₂ y CO₂

Prueba de rojo de metilo

Prueba del rojo de metilo : El tubo de ensayo de la izquierda muestra un resultado positivo, ya que se forman productos finales ácidos por fermentación ácida mixta en E. coli . El tubo de ensayo de la derecha muestra un resultado negativo, ya que no se forman productos ácidos por fermentación.

La prueba del rojo de metilo (RM) permite detectar si se produce la fermentación de ácidos mixtos en microorganismos al añadir glucosa. Se utiliza un indicador de pH que tiñe la solución de rojo si el pH desciende por debajo de 4,4. [ 12 ] Si se ha producido la fermentación, la mezcla de ácidos resultante acidificará considerablemente la solución y provocará un cambio de color a rojo.

La prueba del rojo de metilo pertenece a un grupo conocido como pruebas IMViC .

Ingeniería metabólica

Se han modificado genéticamente diversas cepas bacterianas para aumentar el rendimiento individual de los productos finales formados por la fermentación de ácidos mixtos. Por ejemplo, se han desarrollado cepas para la mayor producción de etanol, lactato, succinato y acetato debido a la utilidad de estos productos en biotecnología . [ 2 ] El principal factor limitante para esta ingeniería es la necesidad de mantener un equilibrio redox en la mezcla de ácidos producida por la vía de fermentación. [ 13 ]

Para la producción de etanol

El etanol es el biocombustible más utilizado y puede producirse a gran escala mediante fermentación. El rendimiento teórico máximo para la producción de etanol se alcanzó hace aproximadamente 20 años. [ 14 ] [ 15 ] Los científicos utilizaron un plásmido que contenía los genes de la piruvato descarboxilasa y la alcohol deshidrogenasa de la bacteria Z. mobilis . Este plásmido se insertó en E. coli , lo que resultó en un mayor rendimiento de etanol. El genoma de esta cepa de E. coli , KO11, se ha secuenciado y mapeado más recientemente. [ 16 ]

La fórmula esquelética del ácido poliláctico
Bolsitas de té fabricadas con ácido poliláctico (PLA)

Para la producción de acetato

La cepa de E. coli W3110 fue modificada genéticamente para generar 2 moles de acetato por cada mol de glucosa que se somete a fermentación. Esto se conoce como vía del homoacetato. [ 17 ]

Para la producción de lactato

El lactato se puede utilizar para producir un bioplástico llamado ácido poliláctico (PLA). Las propiedades del PLA dependen de la proporción de los dos isómeros ópticos del lactato (D-lactato y L-lactato). El D-lactato se produce mediante fermentación ácida mixta en E. coli . [ 18 ] En experimentos iniciales, se modificó genéticamente la cepa de E. coli RR1 para que produjera uno u otro de los dos isómeros ópticos del lactato. [ 19 ]

Experimentos posteriores modificaron la cepa de E. coli KO11, desarrollada originalmente para mejorar la producción de etanol. Los científicos lograron aumentar el rendimiento de D-lactato a partir de la fermentación mediante la realización de varias deleciones . [ 20 ]

Para la producción de succinato

El aumento del rendimiento de succinato en la fermentación de ácidos mixtos se logró inicialmente mediante la sobreexpresión de la enzima PEP carboxilasa . [ 21 ] Esto produjo un rendimiento de succinato aproximadamente tres veces mayor de lo normal. Posteriormente se realizaron varios experimentos utilizando un enfoque similar.

Se han adoptado enfoques alternativos para alterar el equilibrio redox y de ATP y optimizar el rendimiento de succinato. [ 22 ]

Existen otras vías de fermentación que ocurren en los microorganismos. [ 4 ] Todas estas vías comienzan con la conversión de piruvato, pero sus productos finales y las enzimas clave que requieren son diferentes. Estas vías incluyen:

  • fermentación de ácidos mixtos
  • Resumen de EcoCyc sobre la fermentación

Referencias

  1. 1 2 3 4 5 6 7 8 Keseler, Ingrid M.; et  al. (2011). "EcoCyc: una base de datos integral de la biología de Escherichia coli " . Nucleic Acids Research . 39 (número especial de bases de datos): D583– D590. doi : 10.1093/nar/gkq1143 . PMC 3013716. PMID 21097882 .  
  2. 1 2 3 4 Förster, Andreas H. y Johannes Gescher (2014). "Ingeniería metabólica de Escherichia coli para la producción de productos finales de fermentación de ácidos mixtos" . Frontiers in Bioengineering and Biotechnology . 2 : 506–508 . doi : 10.3389/fbioe.2014.00016 . PMC 4126452. PMID 25152889 .  
  3. M. Magidan y J. Martinko (2006). "Biología de los microorganismos de Brock, NJ, Pearson Prentice Hall". 11 : 352.{{cite journal}}: Para citar una revista se requiere |journal=( ayuda )
  4. 1 2 Sharma, PD (2007). "Microbiología": 104.{{cite journal}}: Para citar una revista se requiere |journal=( ayuda )
  5. Farrell, Alexander E.; et al. (2006). "El etanol puede contribuir a los objetivos energéticos y ambientales". Science . 311 (5760): 506– 508. Bibcode : 2006Sci...311..506F . doi : 10.1126/science.1121416 . PMID 16439656 . S2CID 16061891 .   
  6. Hosmer, Jennifer; Nasreen, Marufa; Dhouib, Rabeb; Essilfie, Ama-Tawiah; Schirra, Horst Joachim; Henningham, Anna; Fantino, Emmanuelle; Sly, Peter; McEwan, Alastair G.; Kappler, Ulrike (27 de enero de 2022). "El acceso a sustratos de crecimiento altamente especializados y la producción de metabolitos inmunomoduladores epiteliales determinan la supervivencia de Haemophilus influenzae en células epiteliales de las vías respiratorias humanas" . PLOS Pathogens . 18 (1) e1010209. doi : 10.1371/journal.ppat.1010209 . ISSN 1553-7374 . PMC 8794153. PMID 35085362 .   
  7. Sawers, R. Gary; Blokesch, Melanie ; Böck, August (2004). "Metabolismo anaeróbico de formato e hidrógeno" . EcoSal Plus . 1 (1). doi : 10.1128/ecosalplus.3.5.4 . PMC 11575713. PMID 26443350 .  
  8. Knappe, Joachim y Gary Sawers (1990). "Una ruta química radical hacia el acetil-CoA: el sistema de piruvato formiato-liasa inducido anaeróbicamente de Escherichia coli " . FEMS Microbiology Reviews . 6 (4): 383–398 . doi : 10.1111/j.1574-6968.1990.tb04108.x . PMID 2248795 . 
  9. Kai, Yasushi, Hiroyoshi Matsumura y Katsura Izui (2003). "Fosfoenolpiruvato carboxilasa: estructura tridimensional y mecanismos moleculares". Archives of Biochemistry and Biophysics . 414 (2): 170– 179. doi : 10.1016/S0003-9861(03)00170-X . PMID 12781768 . {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  10. Thakker, Chandresh; et al . (2012). "Producción de succinato en Escherichia coli " . Biotechnology Journal . 7 (2): 213– 224. doi : 10.1002/biot.201100061 . PMC 3517001. PMID 21932253 .   
  11. Guest, JOHN R (1977). "Biosíntesis de menaquinona: mutantes de Escherichia coli K-12 que requieren 2-succinilbenzoato" . Journal of Bacteriology . 130 (3): 1038– 1046. doi : 10.1128/jb.130.3.1038-1046.1977 . PMC 235325. PMID 324971 .  
  12. ^ HT Clarke; WR Kirner (1922). "Rojo de metilo". Org. Sintetizador. 2 : 47. doi : 10.15227/orgsyn.002.0047 .
  13. van Hoek; Milan JA y Roeland MH Merks (2012). "El equilibrio redox es clave para explicar el cambio total frente al parcial hacia un metabolismo de bajo rendimiento" . BMC Systems Biology . 6 (1): 22. doi : 10.1186/1752-0509-6-22 . PMC 3384451. PMID 22443685 .  
  14. Ingram, LO; et al. (1987). "Ingeniería genética de la producción de etanol en Escherichia coli " . Microbiología Aplicada y Ambiental . 53 (10): 2420– 2425. Bibcode : 1987ApEnM..53.2420I . doi : 10.1128 / aem.53.10.2420-2425.1987 . PMC 204123. PMID 3322191 .   
  15. Ohta, Kazuyoshi; et al. (1991). "Mejora genética de Escherichia coli para la producción de etanol: integración cromosómica de genes de Zymomonas mobilis que codifican la piruvato descarboxilasa y la alcohol deshidrogenasa II" . Applied and Environmental Microbiology . 57 (4): 893– 900. Bibcode : 1991ApEnM..57..893O . doi : 10.1128/aem.57.4.893-900.1991 . PMC 182819. PMID 2059047 .   
  16. Turner, Peter C.; et al. (2012). "Mapeo óptico y secuenciación del genoma de Escherichia coli KO11 revelan extensos reordenamientos cromosómicos y múltiples copias en tándem de los genes pdc y adhB de Zymomonas mobilis" . Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology . 39 (4): 629– 639. doi : 10.1007/s10295-011-1052-2 . PMID 22075923. S2CID 15100287 .   
  17. Causey, TB; et al. (2003). "Ingeniería del metabolismo de Escherichia coli W3110 para la conversión de azúcar en productos oxidados y redox-neutros: producción de homoacetato" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 100 (3): 825– 832. Bibcode : 2003PNAS..100..825C . doi : 10.1073/pnas.0337684100 . PMC 298686. PMID 12556564 .   
  18. Clark, David P (1989). "Las vías de fermentación de Escherichia coli " . FEMS Microbiology Reviews . 5 (3): 223– 234. doi : 10.1111/j.1574-6968.1989.tb03398.x . PMID 2698228 . 
  19. Chang, Dong-Eun; et al. (1999). "Producción homofermentativa de d-orl-lactato en Escherichia coli RR1 modificada metabólicamente" . Microbiología Aplicada y Ambiental . 65 (4): 1384– 1389. Bibcode : 1999ApEnM..65.1384C . doi : 10.1128/AEM.65.4.1384-1389.1999 . PMC 91196. PMID 10103226 .   
  20. Zhou, S.; et al. (2005). "Fermentación de azúcar al 10% (p/v) a D (−)-lactato por Escherichia coli B modificada genéticamente". Biotechnology Letters . 27 ( 23– 24): 1891– 1896. doi : 10.1007/s10529-005-3899-7 . PMID 16328986 . S2CID 43204090 .   
  21. Millard, Cynthia Sanville; et al. (1996). "Producción mejorada de ácido succínico por sobreexpresión de fosfoenolpiruvato carboxilasa en Escherichia coli " . Applied and Environmental Microbiology . 62 (5): 1808– 1810. Bibcode : 1996ApEnM..62.1808M . doi : 10.1128/aem.62.5.1808-1810.1996 . PMC 167956. PMID 8633880 .   
  22. Singh, Amarjeet; et al. (2011). "Manipulación del equilibrio redox y ATP para una mejor producción de succinato en E. coli ". Metabolic Engineering . 13 (1): 76– 81. doi : 10.1016/j.ymben.2010.10.006 . PMID 21040799 .  
Obtenido de " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Mixed_acid_fermentation&oldid=1357686475 "