Articulo de referencia

LRRC7

La proteína que contiene repeticiones ricas en leucina 7, también conocida como LRRC7 , Densin-180 o LAP1, es una proteína que en humanos está codificada por el gen LRRC7 . [ 5 ...

La proteína que contiene repeticiones ricas en leucina 7, también conocida como LRRC7 , Densin-180 o LAP1, es una proteína que en humanos está codificada por el gen LRRC7 . [ 5 ]

Estructura

Se ha descubierto que está densamente asociada a la densidad postsináptica (PSD), y se ha caracterizado como una proteína específica del cerebro de 188 kDa (originalmente se pensaba que era de 180 kDa, de ahí la nomenclatura), de 1495 residuos de longitud, que contiene 16 repeticiones ricas en leucina (LRR) dentro de los 500 residuos N-terminales y un dominio Psd95/Discs large/Zona occludens ( PDZ ) dentro de los 200 residuos C-terminales . Originalmente se postuló que tenía un dominio transmembrana aparente, pero ahora se ha demostrado que la proteína tiene numerosos sitios de fosforilación tanto en el extremo N como en el C de este dominio, y que, por lo tanto, la proteína es citoplasmática ; se cree que la palmitoilación ocurre cerca del extremo N de la proteína, lo que explicaría su localización en la PSD. [ 6 ]

Interacciones

Se ha demostrado que LRRC7 interactúa con CDH2 . [ 7 ]

Las interacciones actualmente expuestas de Densin-180 muestran a la proteína como un actor promiscuo entre los principales actores sinápticos, lo que concuerda con la observación original de la densa presencia de la proteína entre las proteínas centrales de la PSD por parte del Laboratorio de Mary B. Kennedy . Entre los socios de interacción identificados se incluyen: CaMKII-alfa, alfa-actinina y NR2B (a través de CaMKII-alfa), canales Cav1.3 (Ca2+ de tipo L), MAGUIN-1, Shank, PSD-95 (a través de Shank y MAGUIN-1), beta-catenina, delta-cateninas y NCadherina (a través de las cateninas). La naturaleza y función de estas interacciones, detalladas en las tablas 1-1 y 1-2, muestran a Densin-180 como un interactor clave en medio de proteínas receptoras, proteínas de andamiaje y proteínas estructurales. [Número de fuentes - referenciadas en - Localización subcelular de clones recombinantes de Densin-180 expresados ​​en células HEK293 TSA Ranatunga, JM (2011) Localización subcelular de clones recombinantes de Densin-180 expresados ​​en células HEK293 TSA. Tesis de maestría, UCL (University College London). http://discovery.ucl.ac.uk/1322972/ ]

También es muy posible que Densin-180 se dimerice o multimerice mediante interacciones entre su dominio PDZ y sus propios residuos de aminoácidos terminales. [Localización subcelular de clones recombinantes de Densin-180 expresados ​​en células HEK293 TSA Ranatunga, JM (2011) Subcellular localisation of recombinant Densin-180 clones expressed in HEK293 TSA cells. Masters tes, UCL (University College London). http://discovery.ucl.ac.uk/1322972/ ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000033122 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000028176 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. "Gen Entrez: LRRC7 que contiene 7 repeticiones ricas en leucina" .
  6. Thalhammer A, Trinidad JC, Burlingame AL, Schoepfer R (abril de 2009). "Densin-180: topología de membrana revisada, estructura de dominio y estado de fosforilación" . J. Neurochem . 109 (2): 297–302 . doi : 10.1111/j.1471-4159.2009.05951.x . PMC 2846389. PMID 19187442 .  
  7. Izawa, Ichiro; Nishizawa Miwako; Ohtakara Kazuhiro; Inagaki Masaki (febrero de 2002). "La densina-180 interactúa con la proteína de repetición de armadillo relacionada con la delta-catenina/plakofilina neuronal en las sinapsis" . J. Biol. Chem . 277 (7). Estados Unidos: 5345–50 . doi : 10.1074/jbc.M110052200 . ISSN 0021-9258 . PMID 11729199 .  

Lecturas adicionales

  • Apperson ML, Moon IS, Kennedy MB (1996). "Caracterización de la densina-180, una nueva proteína sináptica específica del cerebro de la familia de las O-sialoglicoproteínas" . J. Neurosci . 16 (21): 6839– 52. doi : 10.1523/JNEUROSCI.16-21-06839.1996 . PMC 6579252. PMID 8824323 .  
  • Nagase T, Kikuno R, Ishikawa KI, et  al. (2000). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. XVI. Las secuencias completas de 150 nuevos clones de ADNc del cerebro que codifican proteínas grandes in vitro" . DNA Res . 7 (1): 65–73 . doi : 10.1093/dnares/7.1.65 . PMID 10718198 . 
  • Walikonis RS, Oguni A, Khorosheva EM, et  al. (2001). "Densin-180 forma un complejo ternario con la subunidad (alfa) de Ca2 + / proteína quinasa II dependiente de calmodulina y (alfa) -actinina" . J. Neurociencias . 21 (2): 423– 33. doi : 10.1523/JNEUROSCI.21-02-00423.2001 . PMC 6763799 . PMID 11160423 .  
  • Izawa I, Nishizawa M, Ohtakara K, Inagaki M (2002). "La densina-180 interactúa con la proteína de repetición de armadillo relacionada con la delta-catenina/plakofilina neuronal en las sinapsis" . J. Biol. Chem . 277 (7): 5345–50 . doi : 10.1074/jbc.M110052200 . PMID 11729199 . 
  • Ohtakara K, Nishizawa M, Izawa I, et  al. (2003). "Densin-180, una proteína sináptica, se une a PSD-95 a través de su interacción directa con MAGUIN-1" . Genes Cells . 7 (11): 1149– 60. doi : 10.1046/j.1365-2443.2002.00589.x . PMID 12390249 . 
  • Wang L, Xu J, Wu Q, et  al. (2003). "Clonación y caracterización de una nueva variante de empalme de la proteína específica del cerebro densina-180". Int. J. Mol. Med . 11 (2): 257– 60. doi : 10.3892/ijmm.11.2.257 . PMID 12525888 . 
  • Ahola H, Heikkilä E, Aström E, et  al. (2003). "Una nueva proteína, la densina, expresada por los podocitos glomerulares" . J. Am. Soc. Nephrol . 14 (7): 1731– 7. doi : 10.1097/01.ASN.0000075553.33781.9F . PMID 12819232 . 
  • Goodchild RE, Dauer WT (2005). "La proteína AAA+ torsinaA interactúa con un dominio conservado presente en LAP1 y una nueva proteína del RE" . J. Cell Biol . 168 (6): 855– 62. doi : 10.1083/jcb.200411026 . PMC 2171781. PMID 15767459 .  
  • Robison AJ, Bass MA, Jiao Y, et  al. (2005). "Interacciones multivalentes de la proteína quinasa II dependiente de calcio/calmodulina con las proteínas de la densidad postsináptica NR2B, densina-180 y alfa-actinina-2" . J. Biol. Chem . 280 (42): 35329–36 . doi : 10.1074/jbc.M502191200 . PMID 16120608 . 
  • Gregory SG, Barlow KF, McLay KE, et  al. (2006). "La secuencia de ADN y la anotación biológica del cromosoma 1 humano" . Nature . 441 (7091): 315–21 . Bibcode : 2006Natur.441..315G . doi : 10.1038/nature04727 . PMID 16710414 . 
  • Rinta-Valkama J, Aaltonen P, Lassila M, et  al. (2007). "Densina y filtrina en el páncreas y en el riñón, objetivos de la autoinmunidad humoral en pacientes con diabetes tipo 1". Diabetes Metab. Res. Rev. 23 ( 2): 119– 26. doi : 10.1002/dmrr.655 . PMID 16741999 . S2CID 30494486 .  
  • Lassila M, Juhila J, Heikkilä E, Holthöfer H (2007). "La densina es una nueva proteína de la membrana celular de las células de Sertoli en el testículo". Mol . Reprod. Dev . 74 (5): 641– 5. doi : 10.1002/mrd.20659 . PMID 17039495. S2CID 43409823 .  
  • Ewing RM, Chu P, Elisma F, et  al. (2007). "Mapeo a gran escala de interacciones proteína-proteína humanas mediante espectrometría de masas" . Mol . Syst. Biol . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948. PMID 17353931 .  
  • Heikkilä E, Ristola M, Endlich K, et  al. (2007). "La densina y la beta-catenina forman un complejo y se localizan conjuntamente en las uniones celulares de los podocitos cultivados". Mol. Cell. Biochem . 305 ( 1–2 ) : 9–18 . doi : 10.1007/s11010-007-9522-6 . PMID 17581699. S2CID 31301047 .  

Añadir: una tesis muy detallada con experimentos preliminares y teorías sobre la función de Densin-180 titulada Localización subcelular de clones recombinantes de Densin-180 expresados ​​en células HEK293 TSA http://discovery.ucl.ac.uk/1322972/

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