Jalview

Jalview es un software bioinformático que se utiliza para visualizar y editar alineamientos de secuencias múltiples . El programa fue escrito originalmente por Michele Clamp mientras trabajaba en el grupo de Geoff Barton en la Universidad de Oxford y el Instituto Europeo de Bioinformática (EBI). ^{[ 2 ]} Jalview 2, una versión rediseñada producida por Andrew Waterhouse y Jim Procter mientras trabajaban en el grupo de Geoff Barton en la Facultad de Ciencias de la Vida de la Universidad de Dundee , se lanzó en 2005, ^{[ 3 ]} y su desarrollo cuenta con el apoyo del Consejo de Investigación de Biotecnología y Ciencias Biológicas (BBSRC) y Wellcome Trust .

Es ampliamente utilizado por diversos servidores web (por ejemplo, el servidor EBI ClustalW y la base de datos de dominios de proteínas Pfam ), pero también está disponible como editor de alineación de propósito general.

Jalview ofrece una amplia gama de funciones, además de la generación, visualización y edición de alineamientos de secuencias múltiples, incluyendo el cálculo de árboles filogenéticos y la visualización de estructuras moleculares. Las versiones recientes de Jalview incorporan funciones para el análisis de la variación genética a partir de bases de datos públicas o archivos locales en formato VCF ( Variant Call Format ). Jalview se conecta a numerosos servicios web externos para importar datos y realizar cálculos.

• Jpred