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Articulo de referencia

Programa del Atlas Biomolecular Humano

3 ramas de HuBMAP: desarrollo de tecnología transformadora, el centro de mapeo de tejidos y la integración, visualización y participación de HuBMAP. [ 1 ] El Programa Atlas Biom...

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3 ramas de HuBMAP: desarrollo de tecnología transformadora, el centro de mapeo de tejidos y la integración, visualización y participación de HuBMAP. [ 1 ]

El Programa Atlas Biomolecular Humano ( HuBMAP ) es un programa financiado por los Institutos Nacionales de Salud de EE. UU . para caracterizar el cuerpo humano a nivel de célula individual, integrado a otros esfuerzos como el Atlas Celular Humano . [ 1 ] Entre los productos del programa se encuentran los conjuntos de datos de referencia Azimuth para datos de secuenciación de ARN de célula única [ 2 ] [ 3 ] y el ASCT+B Reporter, una herramienta de visualización para estructuras anatómicas, tipos de células y biomarcadores . [ 4 ] [ 5 ]

Los millitomes se utilizan para crear bloques de tejido de tamaño uniforme que coinciden con la forma y el tamaño de los órganos de la biblioteca de objetos de referencia 3D de HuBMAP. [ 6 ]

El HuBMAP recibió 27 millones de dólares estadounidenses de financiación de los NIH en 2020 y alrededor de 28,5 millones en 2021. [ 7 ]

Tecnologías y enfoques utilizados por el consorcio HuBMAP, incluyendo secuenciación de ARN de célula única y transcriptómica espacial . [ 1 ]

Referencias

  1. 1 2 3 Snyder MP, Lin S, Posgai A, Atkinson M, Regev A, Rood J, et  al. (Consorcio HuBMAP) (octubre de 2019). "El cuerpo humano a resolución celular: el Programa Atlas Biomolecular Humano de los NIH" . Nature . 574 (7777): 187– 192. Bibcode : 2019Natur.574..187H . doi : 10.1038/S41586-019-1629- X . PMC 6800388. PMID 31597973 .  
  2. ↑ Hao Y, Hao S, Andersen-Nissen E, Mauck WM, Zheng S, Butler A, et al. (junio de 2021). "Análisis integrado de datos multimodales de células individuales" . Cell . 184 (13): 3573–3587.e29. doi : 10.1016/j.cell.2021.04.048 . PMC 8238499. PMID 34062119 .   
  3. ↑ "Azimuth" . azimuth.hubmapconsortium.org . Archivado del original el 6 de julio de 2022. Consultado el 11 de julio de 2022 .
  4. ↑ "ASCT+B Reporter" . ccf-asctb-reporter-v2.netlify.app . Archivado del original el 22 de octubre de 2021. Consultado el 11 de julio de 2022 .
  5. ↑ Boppana A, Lee S, Malhotra R, Halushka M, Quardokus EM, Herr BW, Börner K, Weber GM (2023). "Estructuras anatómicas, tipos celulares y biomarcadores de la vasculatura sanguínea humana sana" . Scientific Data . 10 452. bioRxiv 10.1101/2022.02.28.482302 . doi : 10.1038/s41597-023-02018-0 . PMID 37468503 .  
  6. ↑ Equipo HIVE MC-IU. "HuBMAP: Portal CCF" . hubmapconsortium.github.io . Consultado el 27 de agosto de 2022 .
  7. ↑ "Justificación del Congreso para el Fondo Común de los NIH, año fiscal 2022" (PDF) . Archivado (PDF) del original el 5 de noviembre de 2021. Consultado el 11 de julio de 2022 .
  • Sitio web oficial
  • "Programa Atlas Biomolecular Humano" . Nature . 19 de julio de 2023.