Hispanopedia WikiEn genética , el mapeo HAPPY , propuesto por primera vez por Paul H. Dear y Peter R. Cook en 1989, es un método utilizado para estudiar el vínculo entre dos o más secuencias de ADN . [ 1 ] Según el Grupo de Genómica de Molécula Única , se trata de un "mapeo basado en el análisis de muestras de ADN aproximadamente HAPloid mediante la reacción en cadena de la polimerasa" . En genómica , el mapeo HAPPY se puede aplicar para evaluar la sintenia y la orientación de diversas secuencias de ADN en un genoma determinado, generando así un mapa genómico.
Al igual que en el mapeo de ligamiento , el mapeo HAPPY se basa en la probabilidad diferencial de que dos o más secuencias de ADN se separen. En el mapeo genético, la probabilidad de un evento de recombinación entre dos loci genéticos en el mismo cromosoma es directamente proporcional a la distancia entre ellos. El mapeo HAPPY reemplaza la recombinación con la fragmentación: en lugar de depender de la recombinación para separar los loci genéticos, se fragmenta todo el genoma, por ejemplo, mediante radiación o cizallamiento mecánico. Si el ADN se rompe de forma aleatoria, cuanto mayor sea la distancia entre dos secuencias de ADN, mayor será la probabilidad de que se produzca la ruptura entre ellas, y viceversa.
El mapeo HAPPY conserva las ventajas del mapeo genético, eliminando algunos de los problemas asociados a la recombinación, como la necesidad de polimorfismo y de reproducción. Además, la recombinación puede ser específica de una región, mientras que la rotura del ADN genómico por radiación o cizallamiento mecánico parece ser más aleatoria. Se ha utilizado para mapear genéticamente varios organismos. [ 2 ] [ 3 ]
El mapeo HAPPY también se ha adaptado para permitir el análisis preciso de la variación del número de copias , y en particular el análisis de los cambios en el número de copias en el cáncer. [ 4 ]
Referencias
- ↑ Estimado PH, Cook PR (septiembre de 1989). "Mapeo feliz: una propuesta para el mapeo de ligamiento del genoma humano" . Nucleic Acids Res . 17 (17): 6795–807 . doi : 10.1093/nar/17.17.6795 . PMC 318413. PMID 2780310 .
- ↑ Piper MB, Bankier AT, Dear PH (diciembre de 1998). " Un mapa FELIZ de Cryptosporidium parvum" . Genome Res . 8 (12): 1299–307 . doi : 10.1101/gr.8.12.1299 . PMC 310802. PMID 9872984 .
- ↑ Hamilton EP, Dear PH, Rowland T, Saks K, Eisen JA, Orias E (octubre de 2006). "Uso del mapeo HAPPY para el ensamblaje de orden superior del genoma de Tetrahymena" . Genomics . 88 (4): 443– 51. doi : 10.1016/j.ygeno.2006.05.002 . PMC 3169840. PMID 16782302 .
- ↑ McCaughan F, Darai-Ramqvist E, Bankier AT, Konfortov BA, Foster N, George PJ, Rabbitts TH, Kost-Alimova M, Rabbitts PH, Dear PH (noviembre de 2008). "Recuento molecular de copias por microdisección (microMCC): desbloqueo de archivos de cáncer con PCR digital" . J. Pathol . 216 (3): 307–16 . doi : 10.1002/path.2413 . PMID 18773450 .
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