DE AIRE CALIENTE

HOTAIR (por HOX transcript antisense RNA ) ^{[ 3 ]} es un gen humano ubicado entre HOXC11 y HOXC12 en el cromosoma 12. Es el primer ejemplo de un ARN expresado en un cromosoma que se ha encontrado que influye en la transcripción de los genes posteriores del clúster HOXD ubicados en el cromosoma 2. La secuencia y la función de HOTAIR son diferentes en humanos y ratones. ^{[ 4 ]} El análisis de secuencia de HOTAIR reveló que existe en mamíferos, tiene secuencias poco conservadas y estructuras considerablemente conservadas, y ha evolucionado más rápido que los genes HoxC cercanos. ^{[ 5 ]} Un estudio posterior identificó que HOTAIR tiene un elemento no codificante conservado ( CNE ) de 32 nucleótidos de longitud que tiene una copia paráloga en la región del clúster HOXD (ubicada entre HOXD11 y HOXD12), ^{[ 6 ]} lo que sugiere que las secuencias conservadas de HOTAIR son anteriores a los eventos de duplicación del genoma completo en la raíz de los vertebrados. Mientras que la secuencia conservada paráloga con el clúster HOXD tiene 32 nucleótidos de longitud, la secuencia HOTAIR conservada desde humanos hasta peces tiene aproximadamente 200 nucleótidos de longitud y está marcada por características de potenciador activo (transcripción bidireccional, picos de H3K4me1 y H3K27ac ). ^{[ 6 ]}

El gen HOTAIR contiene 6232 pb y codifica una molécula de ARN no codificante de 2,2 kb de longitud , que controla la expresión génica. Su ADN de origen se encuentra dentro de un grupo de genes HOXC . Es transportado del cromosoma 12 al cromosoma 2 por la proteína Suz-Twelve . ^{[ 7 ]}

El extremo 5′ de HOTAIR interactúa con una proteína del grupo Polycomb, el Complejo Represor de Polycomb 2 ( PRC2 ), y como resultado regula el estado de la cromatina . Es necesario para el silenciamiento génico del locus HOXD por PRC2. ^{[ 8 ] [ 9 ]} PRC2 es prescindible para el silenciamiento transcripcional mediado por HOTAIR. ^{[ 10 ]} El extremo 3′ de HOTAIR interactúa con la histona desmetilasa LSD1 . ^{[ 9 ]}

Es un factor importante en la diferenciación epigenética de la piel en la superficie del cuerpo. La piel de diversas posiciones anatómicas es distinta; por ejemplo, la piel del párpado difiere notablemente de la de la planta del pie. ^{[ 8 ] [ 11 ]}

HOTAIR se expresa en altos niveles en cánceres de mama metastásicos . Los altos niveles de expresión en tumores mamarios primarios son un predictor significativo de metástasis y muerte posteriores. Esto se debe en parte a la sobreexpresión del oncogén HER2 mediada por HOTAIR a través del secuestro de miR-331-3p, que es un regulador negativo de la expresión de HER2. ^{[ 12 ]} En las células, especialmente aquellas que sobreexpresan PRC2 , la prevención de la expresión de HOTAIR conduce a una reducción en el potencial invasivo de esa célula. ^{[ 13 ]} También está involucrado en el carcinoma de células escamosas de esófago . ^{[ 14 ]}

• Página para la región 1 conservada de HOTAIR en Rfam
• Página para la región 2 conservada de HOTAIR en Rfam
• Página para la región 3 conservada de HOTAIR en Rfam
• Página para la región 4 conservada del intrón HOTAIR en Rfam
• Página para la región 5 conservada del intrón HOTAIR en Rfam