GigaDB

GigaDB (GigaScience DataBase) es un repositorio disciplinario lanzado en 2011 ^{[ 1 ]} con el objetivo de garantizar el acceso a largo plazo a conjuntos de datos multidimensionales masivos de estudios de ciencias de la vida y ciencias biomédicas. Los conjuntos de datos son diversos e incluyen datos genómicos , transcriptómicos y de imágenes. Los conjuntos de datos son curados por biocuradores de GigaDB que trabajan para BGI y el Banco Nacional de Genes de China .

En sus inicios, GigaDB fue diseñado como el archivo de apoyo para datos de investigación a gran escala enviados a las revistas de datos de GigaScience Press, GigaScience y GigaByte , cuyo enfoque es garantizar la reproducibilidad y la reutilización de la investigación biológica y biomédica. El alcance de GigaDB se ha ampliado para incluir objetos de investigación computacional, como datos sintéticos, software y flujos de trabajo. ^{[ 2 ]} La base de datos utiliza atributos y estándares de muestras aprobados por el Genomics Standard Consortium (GSC) , y también colabora con el GSC para garantizar que los datos sean completos y localizables. ^{[ 3 ]} Los conjuntos de datos alojados en GigaDB se definen como un grupo de archivos y metadatos que respaldan un artículo o estudio específico. Para cada conjunto de datos publicado en GigaDB, se asigna un identificador de objeto digital DataCite y los datos se indexan y localizan en NCBI Datamed y el Clarivate Analytics Data Citation Index. GigaDB también ha colaborado con Repositive para mejorar la visibilidad de sus conjuntos de datos humanos. ^{[ 4 ]}

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