Lista de códigos genéticos

Aunque hay muchas similitudes, diferentes partes del árbol de la vida utilizan códigos genéticos ligeramente diferentes . ^{[ 1 ]} Al traducir del genoma a la proteína, el uso del código genético correcto es esencial. Los códigos mitocondriales son ejemplos relativamente conocidos de variación. La tabla de traducción que aparece a continuación sigue la numeración y designación del NCBI. ^{[ 2 ]} Shulgina y Eddy descubrieron cuatro nuevos códigos genéticos alternativos en genomas bacterianos utilizando su software de asignación de codones Codetta, y los validaron mediante el análisis de anticodones de ARNt y elementos de identidad; ^{[ 3 ]} estos códigos no están adoptados actualmente en el NCBI, pero se numeran aquí del 34 al 37 y se especifican en la tabla siguiente.

1. El código estándar
2. El código mitocondrial de los vertebrados
3. El código mitocondrial de la levadura
4. El código mitocondrial de mohos, protozoos y celentéreos y el código de micoplasmas/espiroplasmas
5. El código mitocondrial de los invertebrados
6. El código nuclear de ciliados, dasicladáceos y hexamitas
7. El código del cinetoplasto eliminado ; cf. tabla 4.
8. eliminado, cf. tabla 1.
9. El código mitocondrial de los equinodermos y los platelmintos
10. El código nuclear de los euplotidos
11. El código de plastidios bacterianos, arqueales y vegetales
12. El código nuclear alternativo de la levadura
13. El código mitocondrial de las ascidias
14. El código mitocondrial alternativo del gusano plano
15. El código nuclear Blepharisma ^{[ 4 ]}
16. El código mitocondrial de las clorofíceas
17. (ninguno)
18. (ninguno)
19. (ninguno)
20. (ninguno)
21. El código mitocondrial del trematodo
22. El código mitocondrial de Scenedesmus obliquus
23. El código mitocondrial de Thraustochytrium
24. El código mitocondrial de los Pterobranchia
25. La división candidata SR1 y el código de gracilibacteria
26. El código nuclear de Pachysolen tannophilus
27. El código nuclear cariorelicto
28. El código nuclear de Condylostoma
29. El código nuclear del mesodio
30. El código nuclear del peritrico
31. El código nuclear de Blastocrithidia
32. El código de plastidios de Balanophoraceae ^{[ 4 ] [ 5 ]}
33. El código mitocondrial de los cefalódiscidos
34. El código de Enterosoma ^{[ 3 ]}
35. El código de Peptacetobacter ^{[ 3 ]}
36. El código de Anaerococcus y Onthovivens ^{[ 3 ]}
37. El código genético de Absconditabacterales ^{[ 3 ]}

Las tablas de traducción alternativas (de la 2 a la 37) implican reasignaciones de codones que se recapitulan en las tablas de codones de ADN y ARN .

Comparación de tablas de traducción alternativas para todos los codones (utilizando los códigos de aminoácidos de la IUPAC ):

Tres tablas de traducción tienen un estatus peculiar:

• La tabla 7 ahora se ha fusionado con la tabla de traducción 4.
• La tabla 8 se fusiona con la tabla 1; todas las diferencias en los cloroplastos de las plantas se deben a la edición de ARN.

La lista de códigos genéticos proporcionada por NCBI no tiene en cuenta los dos aminoácidos proteinogénicos "especiales":

• La selenocisteína (Sec o U), cuya inserción requiere una maquinaria de traducción bastante compleja que involucra un factor de elongación especial y el elemento SECIS del ARNm . Véase Producción de selenoproteínas  . ^{[ 6 ]}
• La pirrolisina (Pyl u O) no requiere maquinaria especial para insertarse siempre que haya disponible ^{el ARNt} -Pyl . Como resultado, puede aparecer, y de hecho ha aparecido, en proteínas mediante mutaciones de sentido erróneo neutras . ^{[ 7 ]}

En la biosíntesis de proteínas también intervienen otros mecanismos , como la modificación postranscripcional .

• Códigos genéticos: lista de codones alternativos

• Lista de códigos alternativos del NCBI

• Stefanie Gabriele Sammet; Ugo Bastolla y Markus Porto (14 de junio de 2010). "Comparación de cargas de traducción para códigos genéticos estándar y alternativos" . BMC Evol Biol . 10 (178): 178. Bibcode : 2010BMCEE..10..178S . doi : 10.1186/1471-2148-10-178 . PMC 2909233. PMID 20546599 .  
• Liliana Torcoroma García; Ney Ribeiro Leite; Juan D Alfonso; Otávio Henrique Thiemann (31 de julio de 2007). "Efectos del silenciamiento de las triptofanil-ARNt sintetasas de Trypanosoma brucei por interferencia de ARN" . Memoria. Inst. Oswaldo Cruz . 102 (6). Río de Janeiro.