Hispanopedia WikiEn biología , el elemento SECIS (SECIS: se leno c ysteine insertion sequence ) es un elemento de ARN de alrededor de 60 nucleótidos de longitud que adopta una estructura de tallo-bucle . [1] Este motivo estructural (patrón de nucleótidos) dirige a la célula para traducir los codones UGA como selenocisteínas (UGA es normalmente un codón de terminación ). Los elementos SECIS son, por tanto, un aspecto fundamental de los ARN mensajeros que codifican selenoproteínas , proteínas que incluyen uno o más residuos de selenocisteína .
En las bacterias, el elemento SECIS aparece poco después del codón UGA al que afecta. En las arqueas y los eucariotas , se encuentra en el UTR 3' de un ARNm y puede provocar que varios codones UGA dentro del ARNm codifiquen selenocisteína. Un elemento SECIS de las arqueas, en Methanococcus , se encuentra en el UTR 5' . [2] [3]
El elemento SECIS aparece definido por características de secuencia, es decir, nucleótidos particulares tienden a estar en posiciones particulares en ella, y una estructura secundaria característica . La estructura secundaria es el resultado del apareamiento de bases de nucleótidos de ARN complementarios , y causa una estructura similar a una horquilla. El elemento SECIS eucariota incluye pares de bases AG no canónicos , que son poco comunes en la naturaleza, pero son de importancia crítica para la función correcta del elemento SECIS. Aunque los elementos SECIS eucariotas, arqueales y bacterianos comparten cada uno una estructura de horquilla general, no son alineables, por ejemplo, un esquema basado en la alineación para reconocer elementos SECIS eucariotas no podrá reconocer elementos SECIS arqueales. Sin embargo, en Lokiarcheota , los elementos SECIS son más similares a los elementos eucariotas. [4]
En bioinformática se han creado varios programas informáticos que buscan elementos SECIS dentro de una secuencia genómica , basándose en las características de secuencia y estructura secundaria de los elementos SECIS. Estos programas se han utilizado en búsquedas de nuevas selenoproteínas. [5]
Distribución de especies
El elemento SECIS se encuentra en una amplia variedad de organismos de los tres dominios de la vida (incluidos sus virus). [5] [6] [7] [8] [9] [10] [11]
Referencias
- ^ Walczak R, Westhof E, Carbon P, Krol A (abril de 1996). "Un nuevo motivo estructural de ARN en el elemento de inserción de selenocisteína de los ARNm de selenoproteínas eucariotas". ARN . 2 (4): 367– 379. PMC 1369379 . PMID 8634917.
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