Articulo de referencia

Flavoproteína

Las flavoproteínas son proteínas que contienen un derivado de ácido nucleico de la riboflavina . Estas proteínas participan en una amplia gama de procesos biológicos, incluyendo...

Las flavoproteínas son proteínas que contienen un derivado de ácido nucleico de la riboflavina . Estas proteínas participan en una amplia gama de procesos biológicos, incluyendo la eliminación de radicales que contribuyen al estrés oxidativo , la fotosíntesis y la reparación del ADN . Las flavoproteínas constituyen una de las familias de enzimas más estudiadas.

Las flavoproteínas tienen FMN ( flavina mononucleótido ) o FAD ( flavina adenina dinucleótido ) como grupo prostético o como cofactor . La flavina generalmente se une fuertemente (como en la adrenodoxina reductasa , donde el FAD está profundamente enterrado). [ 1 ] Alrededor del 5-10% de las flavoproteínas tienen un FAD unido covalentemente. [ 2 ] Con base en los datos estructurales disponibles, los sitios de unión de FAD se pueden dividir en más de 200 tipos diferentes. [ 3 ]

En el genoma humano se codifican 90 flavoproteínas; aproximadamente el 84% requiere FAD y alrededor del 16% requiere FMN, mientras que 5 proteínas requieren ambas. [ 4 ] Las flavoproteínas se localizan principalmente en las mitocondrias . [ 4 ] Del total de flavoproteínas, el 90% realiza reacciones redox y el 10% restante son transferasas , liasas , isomerasas y ligasas . [ 5 ]

Descubrimiento

Las flavoproteínas se mencionaron por primera vez en 1879, cuando se aislaron como un pigmento amarillo brillante de la leche de vaca. Inicialmente se las denominó lactocromo . A principios de la década de 1930, este mismo pigmento se había aislado de diversas fuentes y se reconoció como un componente del complejo de vitamina B. Su estructura se determinó y se publicó en 1935, recibiendo el nombre de riboflavina , derivado de la cadena lateral ribitilo y del color amarillo del sistema de anillos conjugados. [ 6 ]

La primera evidencia de la necesidad de flavina como cofactor enzimático surgió en 1935. Hugo Theorell y colaboradores demostraron que una proteína de levadura de color amarillo brillante , identificada previamente como esencial para la respiración celular , podía separarse en apoproteína y un pigmento amarillo brillante. Ni la apoproteína ni el pigmento por sí solos podían catalizar la oxidación del NADH , pero la mezcla de ambos restauraba la actividad enzimática. Sin embargo, reemplazar el pigmento aislado con riboflavina no restauraba la actividad enzimática, a pesar de ser indistinguibles mediante espectroscopia . Esto condujo al descubrimiento de que la proteína estudiada requería no riboflavina, sino flavina mononucleótido para ser catalíticamente activa. [ 6 ] [ 7 ]

Experimentos similares con la D -aminoácido oxidasa [ 8 ] llevaron a la identificación del flavín adenín dinucleótido (FAD) como una segunda forma de flavina utilizada por las enzimas. [ 9 ]

Ejemplos

La familia de las flavoproteínas contiene una amplia gama de enzimas, entre las que se incluyen:

Referencias

  1. 1 2 Hanukoglu I (2017). "Conservación de las interfaces enzima-coenzima en la adrenodoxina reductasa de unión a FAD y NADP: una enzima ubicua". Journal of Molecular Evolution . 85 (5): 205– 218. Bibcode : 2017JMolE..85..205H . doi : 10.1007/ s00239-017-9821-9 . PMID 29177972. S2CID 7120148 .  
  2. Abbas, Charles A.; Sibirny, Andriy A. (2011-06-01). "Control genético de la biosíntesis y el transporte de nucleótidos de riboflavina y flavina y construcción de productores biotecnológicos robustos" . Microbiology and Molecular Biology Reviews . 75 (2): 321– 360. doi : 10.1128/MMBR.00030-10 . ISSN 1092-2172 . PMC 3122625. PMID 21646432 .   
  3. Garma, Leonardo D.; Medina, Milagros; Juffer, André H. (2016-11-01). "Clasificación basada en la estructura de los sitios de unión de FAD: un estudio comparativo de herramientas de alineación estructural". Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics . 84 (11): 1728– 1747. doi : 10.1002/prot.25158 . ISSN 1097-0134 . PMID 27580869 . S2CID 26066208 .   
  4. 1 2 Lienhart, Wolf-Dieter; Gudipati, Venugopal; Macheroux, Peter (2013-07-15). " El flavoproteoma humano" . Archives of Biochemistry and Biophysics . 535 (2): 150– 162. doi : 10.1016/j.abb.2013.02.015 . PMC 3684772. PMID 23500531 .  
  5. Macheroux, Peter; Kappes, Barbara; Ealick, Steven E. (2011-08-01). "Flavogenómica: una visión genómica y estructural de las proteínas dependientes de flavina" . FEBS Journal . 278 (15): 2625– 2634. doi : 10.1111/j.1742-4658.2011.08202.x . ISSN 1742-4658 . PMID 21635694. S2CID 22220250 .   
  6. 1 2 Massey, V (2000). "La versatilidad química y biológica de la riboflavina" . Biochemical Society Transactions . 28 (4): 283– 96. doi : 10.1042/0300-5127:0280283 . PMID 10961912 . 
  7. Theorell, H. (1935). "Preparación en estado puro del grupo de enzimas amarillas". Biochemische Zeitschrift . 275 : 344–46 .
  8. Warburg, O.; Christian, W. (1938). "Aislamiento del grupo prostético de la aminoácido oxidasa". Biochemische Zeitschrift . 298 : 150–68 .
  9. Christie, SMH; Kenner, GW; Todd, AR (1954). "Nucleótidos. Parte XXV. Una síntesis de flavina-adenina dinucleótido". Journal of the Chemical Society : 46–52 . doi : 10.1039/JR9540000046 .
  10. Pandey, Amit V.; Flück, Christa E. (2013-05-01). "NADPH P450 oxidorreductasa: Estructura, función y patología de las enfermedades" . Farmacología y terapéutica . 138 (2): 229– 254. doi : 10.1016/j.pharmthera.2013.01.010 . ISSN 0163-7258 . PMID 23353702 .  
  11. Jensen, Simon Bo; Thodberg, Sara; Parween, Shaheena; Moses, Matias E.; Hansen, Cecilie C.; Thomsen, Johannes; Sletfjerding, Magnus B.; Knudsen, Camilla; Del Giudice, Rita; Lund, Philip M.; Castaño, Patricia R. (2021-04-15). "Metabolismo mediado por el citocromo P450 sesgado a través de ligandos de moléculas pequeñas que se unen a la oxidorreductasa P450" . Nature Communications . 12 (1): 2260. Bibcode : 2021NatCo..12.2260J . doi : 10.1038/s41467-021-22562-w . ISSN 2041-1723 . PMC 8050233 . PMID 33859207 .   
  12. Kupke, T; Stevanović, S; Sahl, HG; Götz, F (1992). "Purificación y caracterización de EpiD, una flavoproteína involucrada en la biosíntesis de la epidermina lantibiótica" . Journal of Bacteriology . 174 (16): 5354– 61. doi : 10.1128/jb.174.16.5354-5361.1992 . PMC 206373. PMID 1644762 .  
  13. Daniel, RA; Errington, J. (1993). "Clonación, secuencia de ADN, análisis funcional y regulación transcripcional de los genes que codifican la sintetasa del ácido dipicolínico necesaria para la esporulación en Bacillus subtilis". Journal of Molecular Biology . 232 (2): 468– 83. doi : 10.1006/jmbi.1993.1403 . PMID 8345520 . 
  14. Clausen, Monika; Lamb, Christopher J.; Megnet, Roland; Doerner, Peter W. (1994). "PAD1 codifica la descarboxilasa del ácido fenilacrílico que confiere resistencia al ácido cinámico en Saccharomyces cerevisiae". Gene . 142 (1): 107–12 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90363-8 . PMID 8181743 . 
  15. Zhuang, Bo; Liebl, Ursula; Vos, Marten H. (2022-05-05). "Fotoquímica de flavoproteínas: procesos fundamentales y perspectivas fotocatalíticas" . The Journal of Physical Chemistry B. 126 ( 17): 3199– 3207. doi : 10.1021/acs.jpcb.2c00969 . ISSN 1520-6106 . PMID 35442696. S2CID 248296520 .   
  • El menú "ciencia" del programa STRAP ofrece una colección completa de todas las flavoproteínas con estructura 3D conocida. Compara las estructuras proteicas para dilucidar las relaciones filogenéticas.
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