Hispanopedia WikiLa Colocalization Benchmark Source ( CBS ) es una colección gratuita de imágenes descargables para probar y validar el grado de colocalización de marcadores en cualquier estudio de microscopía de fluorescencia . La colocalización es un fenómeno visual en el que dos moléculas de interés se asocian con las mismas estructuras en las células y pueden compartir características funcionales comunes. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]
CBS proporciona a los investigadores herramientas de referencia para verificar los resultados de las mediciones cuantitativas de colocalización. [ 4 ] Funciona como una base de datos especializada de bioinformática de imágenes con imágenes simuladas por ordenador y valores de colocalización predefinidos y conocidos con precisión. Estas imágenes se crearon mediante un algoritmo de simulación de imágenes . Estas imágenes de referencia se pueden descargar como conjuntos completos o individualmente. Al calcular y comparar los valores de los coeficientes en sus propias imágenes con los de las imágenes de referencia, los investigadores pueden validar los resultados de los estudios cuantitativos de colocalización. El uso de las imágenes de CBS se ha descrito en varios estudios. [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]
Ejemplos
Los investigadores pueden enviar ejemplos de imágenes personalizadas en las que se utilizaron las imágenes de referencia para validar la colocalización. Las imágenes enviadas se publican en el sitio web del CBS junto con descripciones de sus propiedades y los valores de coeficientes como el coeficiente de correlación de Pearson (Rr) , el coeficiente de superposición (R) y otros. Se puede descargar una plantilla para enviar información sobre imágenes personalizadas desde el sitio web del CBS.
Véase también
Referencias
- ↑ Bolte S & Cordeliers FP (2006). "Una visita guiada al análisis de colocalización subcelular en microscopía óptica." J Microsc 224:213–232.
- ↑ Comeau JW et al. (2006). "Una guía para mediciones precisas de colocalización mediante microscopía de fluorescencia." Biophys J 91:4611– 4622.
- ↑ Zinchuk V y Grossenbacher-Zinchuk O (2009). "Avances recientes en el análisis cuantitativo de colocalización: enfoque en la neurociencia." Prog Histochem Cytochem 44:125-172.
- ↑ Manders E et al. (1993). "Medición de la colocalización de objetos en imágenes confocales de doble color." J Microsc Oxford 169:375–382.
- ↑ Wu Y et al. (2010). "Determinación cuantitativa de correlaciones espaciales proteína-proteína en microscopía confocal de fluorescencia." Biophys J 98:493-504.
- ↑ Zinchuk V et al. (2011). "Cuantificación de correlaciones espaciales de marcadores fluorescentes mediante reducción de fondo mejorada con índice de proximidad de proteínas y estimaciones del coeficiente de correlación." Nat Protoc 6:1554-1567.
- ↑ Zinchuk V y Grossenbacher-Zinchuk O (2011). "Análisis cuantitativo de colocalización de imágenes de microscopía de fluorescencia confocal". Curr Protoc Cell Biol Unit 4.19. Archivado el 28/11/2009 en Wayback Machine.
- ↑ Zinchuk V et al. (2013). "Acortando la brecha entre los resultados de colocalización cualitativos y cuantitativos en estudios de microscopía de fluorescencia." Sci Rep 3:1365 doi:10.1038/srep01365.
Enlaces externos
- Página principal de la fuente de la prueba de referencia de colocalización
- Bases de datos biológicas
- Microscopía
- Fluorescencia
- Imágenes médicas
