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ClearVolume [1] es una biblioteca de visualización 3D en tiempo real de código abierto diseñada para microscopios de láminas de luz volumétricas de alta gama . ClearVolume permi...

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ClearVolume [1] es una biblioteca de visualización 3D en tiempo real de código abierto diseñada para microscopios de láminas de luz volumétricas de alta gama . ClearVolume permite la visualización en vivo de datos de microscopio, lo que permite a los biólogos decidir de inmediato si vale la pena obtener imágenes de una muestra. ClearVolume se puede integrar fácilmente en el software de microscopio existente basado en Java , C/C++ , Python o LabVIEW . Tiene una interfaz dedicada al software de control MicroManager/OpenSpim/OpenSpin. ClearVolume admite la transmisión de datos 3D en vivo de múltiples canales desde microscopios remotos y utiliza un algoritmo de renderizado de Fibonacci de múltiples pasadas que puede manejar grandes volúmenes. Además, ClearVolume está integrado en el ecosistema FiJi / ImageJ2 / KNIME .

Véase también

Referencias

  1. ^ Royer, Loïc A; Weigert, Martin; Günther, Ulrik; Maghelli, Nicola; Jug, Florian; Sbalzarini, Ivo F.; Myers, Eugene W. (2015). "ClearVolume – Visualización 3D en vivo de código abierto para microscopía de lámina de luz" . Nature Methods . 12 (6): 480–481. doi :10.1038/nmeth.3372. PMID  26020498. S2CID  205423715.
  • [1] Sitio web del proyecto de código abierto ClearVolume con enlaces a la wiki, repositorios de código y seguimiento de problemas.
  • [2] Página del proyecto del complemento KNIME de ClearVolume.
  • [3] Página del proyecto del complemento ClearVolume FiJi.
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