Los facilitadores de difusión de cationes (CDF) son proteínas transmembrana que proporcionan tolerancia a las células frente a iones metálicos divalentes , como cadmio, zinc y cobalto . Estas proteínas se consideran bombas de eflujo que eliminan estos iones metálicos divalentes de las células . [ 1 ] [ 2 ] Sin embargo, algunos miembros de la superfamilia CDF están implicados en la captación de iones. [ 3 ] Todos los miembros de la familia CDF poseen seis dominios transmembrana putativos, con la mayor conservación en los cuatro dominios N-terminales. [ 4 ] La superfamilia de facilitadores de difusión de cationes (CDF) incluye las siguientes familias: [ 4 ] [ 5 ]
- 1.A.52 - La familia de canales de Ca2 + activados por liberación de Ca2 + (CRAC-C)
- 2.A.4 - La familia de facilitadores de difusión de cationes (CDF).
- 2.A.19 - La familia de antiportadores de cationes Ca 2+ (CaCA)
- 2.A.103 - La familia de exportadores de precursores de mureína bacteriana (MPE)
La familia de facilitadores de difusión de cationes (CDF, por sus siglas en inglés)
La familia CDF (TC# 2.A.4 ) es una familia ubicua, cuyos miembros se encuentran en bacterias, arqueas y eucariotas. [ 4 ] Transportan iones de metales pesados, como cadmio , zinc , cobalto , níquel , cobre e iones de mercurio. Hay 9 parálogos de mamíferos, ZnT1 - 8 y 10. [ 6 ] La mayoría de las proteínas de la familia tienen seis hélices transmembrana, pero MSC2 de S. cerevisiae ) y Znt5 y hZTL1 de H. sapiens tienen 15 y 12 TMS predichos, respectivamente. [ 7 ] Estas proteínas exhiben un grado inusual de divergencia de secuencia y variación de tamaño (300-750 residuos). Las proteínas eucariotas exhiben diferencias en la localización celular. Algunos catalizan la captación de metales pesados desde el citoplasma hacia varios orgánulos eucariotas intracelulares (ZnT2-7), mientras que otros (ZnT1) catalizan el eflujo desde el citoplasma a través de la membrana plasmática hacia el medio extracelular. Por lo tanto, algunos se encuentran en las membranas plasmáticas, mientras que otros se encuentran en membranas de orgánulos como las vacuolas de plantas y levaduras y el aparato de Golgi de animales. [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] Catalizan el antiporte catión:protón, tienen un único sitio esencial de unión al zinc dentro de los dominios transmembrana de cada monómero dentro del dímero, y tienen un sitio binuclear de detección y unión al zinc en la región C-terminal citoplasmática. [ 11 ] Una lista representativa de proteínas pertenecientes a la familia CDF se puede encontrar en la Base de Datos de Clasificación de Transportadores .
Filogenia
Las proteínas procariotas y eucariotas se agrupan por separado, pero pueden funcionar con la misma polaridad mediante mecanismos similares. Estas proteínas son transportadores secundarios que utilizan la fuerza motriz de protones (pmf) y funcionan mediante antiporte de H + (para el eflujo de metales). Se ha demostrado que un miembro, CzcD de Bacillus subtilis ( TC# 2.A.4.1.3 ) , intercambia el catión divalente (Zn2 + o Cd2 + ) por dos cationes monovalentes (K + y H + ) en un proceso electroneutral energizado por el gradiente de pH transmembrana. [ 12 ] Otra, ZitB de E. coli ( TC# 2.A.4.1.4 ), se ha reconstituido en proteoliposomas y se ha estudiado cinéticamente. [ 13 ] Parece funcionar mediante un antiporte simple de Me2 + :H + con una estequiometría 1:1.
Montanini et al. (2007) realizaron un análisis filogenético de los miembros de la familia CDF. Su análisis reveló tres grupos filogenéticos principales y dos secundarios. Sugieren que los tres grupos principales se segregaron según la especificidad de iones metálicos: [ 14 ]
- Mn 2+
- Fe 2+ y Zn 2+ , así como otros iones metálicos
- Zn 2+ y otros metales, pero no hierro.
Estructura
La estructura de rayos X de YiiP de E. coli representa un homodímero. [ 15 ] [ 16 ]
Coudray et al. (2013) utilizaron microscopía crioelectrónica para determinar una estructura con una resolución de 13 Å de un homólogo de YiiP de Shewanella oneidensis dentro de una bicapa lipídica en ausencia de Zn²⁺ . Partiendo de la estructura de rayos X en presencia de Zn²⁺ , utilizaron un ajuste flexible de dinámica molecular para construir un modelo. Una comparación de las estructuras sugirió un cambio conformacional que implica el pivoteo de un haz transmembrana de cuatro hélices (M1, M2, M4 y M5) con respecto al par de hélices M3-M6. Aunque la accesibilidad de los sitios de transporte en el modelo de rayos X indica que representa un estado orientado hacia afuera, su modelo fue consistente con un estado orientado hacia adentro, lo que sugiere que el cambio conformacional es relevante para el mecanismo de acceso alternante para el transporte. Especularon que el dímero podría coordinar el reordenamiento de las hélices transmembrana. [ 17 ]
La mayoría de las proteínas CDF, implicadas en la tolerancia/resistencia a metales mediante eflujo, comparten una arquitectura bimodular compuesta por un dominio transmembrana (TMD) y un dominio C-terminal (CTD) que se proyecta hacia el citoplasma. Un transportador CDF de Zn²⁺ y Cd²⁺ de la bacteria marina Maricaulis maris, que carece del CTD, pertenece a una nueva subfamilia de CDF sin CTD.
Reacción de transporte
La reacción de transporte generalizada para los miembros de la familia CDF es:
Me 2+ (entra) H + (sale) ± K + (sale) → Me 2+ (sale) H + (entra) ± K + (entra).
Véase también
Referencias
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